Os01g0771900
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0771900 |
|---|---|
| Description |
Similar to Exo-beta-glucanase |
| Version |
NM_001050922.1 GI:115440214 GeneID:4324619 |
| Length |
5428 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0771900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:34336562..34341989 |
| Sequence Coding Region |
34336907..34337018,34337142..34337625,34337781..34337982,34338503..34338685,34338920..34339024 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:34336562..34341989 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgatatgtcccaaaatttctttggcatgcgttcttctgctcctatggtttacctcaacgggagatgcagcatacatgaagtacctggatccaaagcaacccaccaacactagaatcaaggaccttatcagtaggatgactcttgcagaaaaaattggccaaatgacacagattgaacgtggggttgcatctgcagatgtcatgaaaaactacttcataggtagtgtattgagtggtggtggaagtgtccctgctccccaggctactcctgcagtttgggtgaacatggtaaatgaattccagaaaggcgccttgtcaacacgtctaggaatacctatgatctacggcattgatgcagttcatggtaataacaatgtctacaatgccaccctatttcctcacaacattgggcttggagctacaagggatcctgacctcgtaaggaggatcggcgaagcaactgctcttgaagtacgggcaacaggcattccgtacacctttgctccatgtattgcagtttgtcgagatccacgatggggccgatgttatgagagctacagtgaagaccacagggtagtccagcagatgacagacattatacttggtctacaaggagatatcccaataaatcataccaagggagttccttatattgctgggaaggataaagttgctgcttgtgctaagcactttgttggtgatggtggaactcataatggaatcaatgagaacaacacgatcactgatgaacatgggcttctaggcattcacatgcccccatattatgactctattataaagggtgttgctactgttatggtttcctattcaagcttgaatggtgtcaaaatgcatgccaatcatgatctggttactggctacctgaaatccaaattgcattttagaggatttgtgatatcagattggctaggaatagacaggataacgtcaccacctgatgcaaattatacttactctgtgcaagctggaataaatgctggtattgatatggtcatggtgccattcaattacacccaatacattgatgatgtgacatctcttgttaagaagggtattatcaatatgagcagaattgatgatgctgtcaggcgtatccttcgagtcaaatttataatgggcctattcgagaaccctttagctgatcttagcttcgcagatcagcttggaaagaaggagcacagagatttggctagagaagccgtcaggaaatcacttgttctattaaaaaacggcaactctcccaatcaacaattcctgcctctaccaaagaaagctagaagtatccttgtagctggaagccatgctagcaatttgggctaccaatgtggcgggtggtcaattgaatggatcggaggtagtggagatattactgtaggtacaacaattcttgaggccataaagtccactgtcgctgattcaacacatgttgtctactctgagaaccctgatgaaagcttcatgaaaaacaatgacttctcattcgctattgttgttgttggtgagcgaacatatgctgaaacaacaggtgatgacccagaactcaccatcctagaccctggtacagacacaatccgaacagtgtgttccacagctaagtgtgcagtggttatcatctctggtcggcctgttgtcattgaaccatatcttccaatgatggaagcgctcgtcgcagcttggcttcctggaacagaaggtcagggtgttgcggatgtactgtttggggactatggcttcaccgggaagctcccacgcacttggttcaagtctgttgaccagctgcccatgaatgttggtgacctacactatgatccactcttcccttttggttttggtttgacaataaattcatcgcagccagggttctctggtgctgacagactgagagataggaatggggggatgatatacgttgtgttgagtttggtactgtcagtaatactgatgcatgcttcgggcataggtatattttaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MICPKISLACVLLLLWFTSTGDAAYMKYLDPKQPTNTRIKDLIS RMTLAEKIGQMTQIERGVASADVMKNYFIGSVLSGGGSVPAPQATPAVWVNMVNEFQK GALSTRLGIPMIYGIDAVHGNNNVYNATLFPHNIGLGATRDPDLVRRIGEATALEVRA TGIPYTFAPCIAVCRDPRWGRCYESYSEDHRVVQQMTDIILGLQGDIPINHTKGVPYI AGKDKVAACAKHFVGDGGTHNGINENNTITDEHGLLGIHMPPYYDSIIKGVATVMVSY SSLNGVKMHANHDLVTGYLKSKLHFRGFVISDWLGIDRITSPPDANYTYSVQAGINAG IDMVMVPFNYTQYIDDVTSLVKKGIINMSRIDDAVRRILRVKFIMGLFENPLADLSFA DQLGKKEHRDLAREAVRKSLVLLKNGNSPNQQFLPLPKKARSILVAGSHASNLGYQCG GWSIEWIGGSGDITVGTTILEAIKSTVADSTHVVYSENPDESFMKNNDFSFAIVVVGE RTYAETTGDDPELTILDPGTDTIRTVCSTAKCAVVIISGRPVVIEPYLPMMEALVAAW LPGTEGQGVADVLFGDYGFTGKLPRTWFKSVDQLPMNVGDLHYDPLFPFGFGLTINSS QPGFSGADRLRDRNGGMIYVVLSLVLSVILMHASGIGIF</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>4972..5083#4365..4848#4008..4209#3305..3487#2966..3070#2642..2885#2232..2377#1992..2081#1704..1909#1252..1471#ggtgcgcgttaaccaccggacaccacagcgagcagagcgccgctgttctcttccgcttctctccctgagctcggcctcgtgtcactgacgtcgtgtatgagaggaaggtggtgagctcagcagctcaggctcagctcgcagtagggagcagacgccggccgcatcgccccccttcgcgtttcgctgctccgaggtaaggggagcaaaaaaaccccaactttactcttctaacctcgcttccaagttccaagcaatcaccacggccgccggccacagctgctgcatgttgctcgccttcctagatcggttaatattgtactaggagtgagatttgggcggtgtcacttctcgcccttttttttttctactatggatttggcggtggccgtgacagtctgtagaagatactccggttggctatgggggaattctgtctttaaagaccaagggaatgtttttgacattgatggttttttggtcgctgggtcatgtccattgatctgttgagttagtttatttggggtttatttgagcacagcgacgggtgatgatgctaggagtatcaatttagcttttttaatatattttgctgggaagtgggaattagtgatacagttcttcacatgcatggtctgaaggtcacgatcattgacctgccgaaaacgccttttgtgcccagtgtagtacctgaggtacctctgttagcctgtttattgatgtttggacatgtaaaatgcacttgtatggatagtagttctgatttgggggtggggaggctaaagtgaatgcaaattctcaatgtacttacatctgtttttaagtgcattatggcacatagacctggaattgcacatgtatggacagtaatagagaggctaaaatgaatgcgatcgctccatgttttatttcccctctatggaagaccaagcatgcaaacagaatgcatgatatgtgactaatataagctggaagaactaaccgtattttttctgaattcaaggtgaaacggcaatgcatgattggtgctgtgtcagcctcagtccttgattatttccacagagaaaacgcataatgcgccttgtttctaggaagttagtcagggcttagtcctagttttgcaaattcacattgaggcacttcatttcccgatcttctttcttgattttagctttctgccatgctacttttgttgattttcaccaggacctatcaggttaagaattcgggagaaatatttggaaattctcaggcatgatatgtcccaaaatttctttggcatgcgttcttctgctcctatggtttacctcaacgggagatgcagcatacatgaagtacctggatccaaagcaacccaccaacactagaatcaaggaccttatcagtaggatgactcttgcagaaaaaattggccaaatgacacagattgaacgtggggttgcatctgcagatgtcatgaaaaactacttcataggtaagtcctttatcaactcttactaagtagatctgtacgtaagtgaactttatttgactgacatgtggaatatttgctgtcttgcttctgatgaggttgtttgaaatagaagaataatgattagtgaagccttcttctgacactattgagctaaagctaccattatggcattgtcatctgcaaagttgtggctatgcgcacctcaattataattttttgtgttgttttctaggtagtgtattgagtggtggtggaagtgtccctgctccccaggctactcctgcagtttgggtgaacatggtaaatgaattccagaaaggcgccttgtcaacacgtctaggaatacctatgatctacggcattgatgcagttcatggtaataacaatgtctacaatgccaccctatttcctcacaacattgggcttggagctacaaggcatgtgttctaataatctatactttcgtgtattcattttgttgtgtgagtgcgtgtcaaacattatctttctttgtattagggatcctgacctcgtaaggaggatcggcgaagcaactgctcttgaagtacgggcaacaggcattccgtacacctttgctccatgtattgcagtaagcacacgcacgctgtagtattgttgctgttatgcattggatcttcagtggagcatgttgcaattgcatgagtatatggctatatgtaccattcttgattcattaagagctttgttgaccaaaaatgcttcatacaatttggttcaggtttgtcgagatccacgatggggccgatgttatgagagctacagtgaagaccacagggtagtccagcagatgacagacattatacttggtctacaaggagatatcccaataaatcataccaagggagttccttatattgctgggaagtaagatattttttctcattggtgctataaatgatattgtagatgtaggccattgtatggagcatgtgcatgttgacctaaataagtaaagcttatcggcctaaatgagcaccttttattaacaatatactttttacatacatacgtatgtaatagttagtggcacatctacattgcaaaagctataggaaaataatcaatgtcaatgtcaagttgcaatgtgaaggttttctgtcttatgtctcagcttatggcttttaacagggataaagttgctgcttgtgctaagcactttgttggtgatggtggaactcataatggaatcaatgagaacaacacgatcactgatgaacatgggcttctaggcattcacatgcccccatattatgactctattataaagggtgttgctactgttatggtttcctattcaagcttgaatggtgtcaaaatgcatgccaatcatgatctggttactggctacctgaaatccaaattgcattttagagttagtattaataataagcaacttatttaaaattcctcttatgtgataaaaaactgactcttcatgctctctgatcgcagggatttgtgatatcagattggctaggaatagacaggataacgtcaccacctgatgcaaattatacttactctgtgcaagctggaataaatgctggtattgatatggtatgtgaatttctttcaagaagattagttcatattttcatactagctacaataagcatggtttagtttaattttagtcaacattcatatcatgatactggaagtggaactggtcttactactttttttttgtggggggaagtcttaatacttattataccaatattaagctggaagtttatttcgttctttttattcagaaaaaaagaatacatcatttcatctccataacaggtcatggtgccattcaattacacccaatacattgatgatgtgacatctcttgttaagaagggtattatcaatatgagcagaattgatgatgctgtcaggcgtatccttcgagtcaaatttataatgggcctattcgagaaccctttagctgatcttagcttcgcagatcagcttggaaagaaggttgataactacaacatgctgtatactccacagagtaaatttcacaaaactacaaatactttggttaaattatcacaaaaccatagatttaaagtgatgtaacacagaactacatatttaacaataaatttatcacacaactataagtttaaggctaagtatcgcaaaactacagatttaataataaaattattatcacaaaactacaaattttggggtttaaatccttagcactaatgttatgttggacttataattgttttaaattttgtgattaaattatcattaaacctgtagttttgtgataactttgttactaaatctgtagttttgtgatattctaccttaaatttgtagttttgtgataaatttagtgttaaatctgtagttttgtgatgtatcaagttaaatctgtagttttctgataatttgatcaaagtatctgtagtttcgtgaaaattactctacacaattgacaagtttggaaatcatccaagtaaatgagtaactaatttaacaggagcacagagatttggctagagaagccgtcaggaaatcacttgttctattaaaaaacggcaactctcccaatcaacaattcctgcctctaccaaagaaagctagaagtatccttgtagctggaagccatgctagcaatttgggctaccaatgtggcgggtggtcaattgaatggatcggaggtagtggagatattactgtaggtatgtgttttttctatatatcatatattcttttcttttaaaacgaataaatctactatttcaggttcttatttgctaaattcaactatacttaagaaaagctattttgattttttttccttactgtaataattaaatgcatttattctgttcaggtacaacaattcttgaggccataaagtccactgtcgctgattcaacacatgttgtctactctgagaaccctgatgaaagcttcatgaaaaacaatgacttctcattcgctattgttgttgttggtgagcgaacatatgctgaaacaacaggtgatgacccagaactcaccatcctagaccctggtacagacacaatccgaacagtgtgttccacagctaagtgtgcagtggttatcatctctggtcggcctgttgtcattgaaccatatcttccaatgatggaagcgctcgtcgcagcttggcttcctggaacagaaggtcagggtgttgcggatgtactgtttggggactatggcttcaccgggaagctcccacgcacttggttcaagtctgttgaccagctgcccatgaatgttggtgacctacactatgatccactcttcccttttggttttggtttgacaataaattcatcgcagccagggtaagtaatttcatcaatcatccacact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|
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