Os01g0773600

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os01g0773600

Description

Glycoside hydrolase, family 47 protein

Version

NM_001050936.1 GI:115440242 GeneID:4327149

Length

9508 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os01g0773600, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:34454880..34464387

Sequence Coding Region

34454909..34455085,34455755..34455874,34455970..34456062,34456785..34456871,34457416..34457506
,34458652..34458705,34459139..34459213,34459661..34459770,34460196..34460246
,34460742..34460830,34461106..34461187,34461268..34461381,34461603..34461682
,34462337..34462472,34462798..34462868,34462951..34463185,34463597..34463986

Expression

GEO Profiles:Os01g0773600

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008394:34454880..34464387 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atgcccacctcgggcccggacgcgatgcagccggcgctgcgacggcggcggcggcgccaaggcttcctcctccccttcgcctgcctctccgccgccctcatcgccgctgccctgctccccggcgccgctttcgccgatggcgtcacgccctccgaggcccgccggctccgcgacgaggtcaaagatatgttctatcatgcatttgatgggtacatgcaacatgcttttccacttgatgaattgcggcctttaagttgccaaggagaagattcacttggtggctatgcacttactcttatagactctttggataccttggctttactaggggataaggagagatttgatgctgccgtggagtgggttggtaagaatgtccgctttgatattaataaaactgtctctgtttttgaaaccaacatacgcattcttgggggtctgctatcagctcacctgattgccagtgattatgcaactggaatgagaattcaatcttatgatgatcagttgcttcatttagcggctgacttagctcaaagattgctacctgcatttgacactccaacaggtattccatttggatcagtaaatttattgtatggagtcgatgaaaatgaaagcaagataacttcaacagctggtggtggcactttgacactggaatttggtgtcctgagtcgtttgactaatgatagcgtttatgaacgagttacaaaaaactctgtgcgtggaatatgggcacgcaggtcgaaacttgaccttgttggtgcccatataaatgtatttactggtgaatggacacagaaggatgcaggaattggcacaagcattgactcattctatgagtatcttctaaaggcgtatttattatttggagatgaagaatatttgtatatatttcaggaggcttacaaggctgccatgcattatctccatcatgatccctggtatgtggaggtaaatatgaattctggtgctactgtttggccactattcaacagtctccaggcattctggccaggacttcaggtgttagctggagatgttgatcctgccattcgaactcatgctgccttcttcagtgtatggaaaaaatatggcttcaccccagaagggtttaatcttgctacatccactgttcagaatggacaaaggagctacccgctgcggcctgaattgattgaaagcacatattggctgttcaaggctactagagattataggtaccttgatgttggaagggatatattagcaagccttcaatatggtgctaaatgtccatgtggttactgccatatttcagatgtagaaacccaccagcaggatgaccacatggagagttttttccttgcagaaacagtcaaatatctctggcttctttttgatttagctgcaggccctgataatattgttgaaaatgggccatataaatacatatttagtacagaaggtcatctgttgcctgctactcctcagataaccttgttagatgagcattgcttgtatgctggagcattctgcaatggtactgcaggccatggatatggtaccggtgatagttctaataagcatcaaaatgcaaactctgttccgttcgatgatagtcgaacaccttccgatcaatctttatccaatattttgtctacgacaagagggtacatcaagggagtttgtccaggattaactcatgcccagaaacttggcatatcatactctgccgaggaggataactcaatacagcagaattctggaagtagtgagaatcttgatgaatcacacgtgatcaaatccagtgtccaagctcaatcaagttctgttatattgatatcgcatccagtcgcaagccaaactgaggagcctacgtcgggcagaagtcagtacaatgcaaacattgtggcaactgctgagtctgtagggactgatactgccggcgcctcatcccaccccgaggatcttgttaaggaaactgagagcgtctctgaacagaaagaaatcaatgacaaagagatcgcttctcagggtagtcaaccgaccgaaggaagatacctgacctaa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MPTSGPDAMQPALRRRRRRQGFLLPFACLSAALIAAALLPGAAF ADGVTPSEARRLRDEVKDMFYHAFDGYMQHAFPLDELRPLSCQGEDSLGGYALTLIDS LDTLALLGDKERFDAAVEWVGKNVRFDINKTVSVFETNIRILGGLLSAHLIASDYATG MRIQSYDDQLLHLAADLAQRLLPAFDTPTGIPFGSVNLLYGVDENESKITSTAGGGTL TLEFGVLSRLTNDSVYERVTKNSVRGIWARRSKLDLVGAHINVFTGEWTQKDAGIGTS IDSFYEYLLKAYLLFGDEEYLYIFQEAYKAAMHYLHHDPWYVEVNMNSGATVWPLFNS LQAFWPGLQVLAGDVDPAIRTHAAFFSVWKKYGFTPEGFNLATSTVQNGQRSYPLRPE LIESTYWLFKATRDYRYLDVGRDILASLQYGAKCPCGYCHISDVETHQQDDHMESFFL AETVKYLWLLFDLAAGPDNIVENGPYKYIFSTEGHLLPATPQITLLDEHCLYAGAFCN GTAGHGYGTGDSSNKHQNANSVPFDDSRTPSDQSLSNILSTTRGYIKGVCPGLTHAQK LGISYSAEEDNSIQQNSGSSENLDESHVIKSSVQAQSSSVILISHPVASQTEEPTSGR SQYNANIVATAESVGTDTAGASSHPEDLVKETESVSEQKEINDKEIASQGSQPTEGRY LT</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>30..206#876..995#1091..1183#1906..1992#2537..2627#3773..3826#4260..4334#4782..4891#5317..5367#5863..5951#6227..6308#6389..6502#6724..6803#7458..7593#7919..7989#8072..8306#8718..9107#gcgtgctctgtatcattattaccatcccgatgcccacctcgggcccggacgcgatgcagccggcgctgcgacggcggcggcggcgccaaggcttcctcctccccttcgcctgcctctccgccgccctcatcgccgctgccctgctccccggcgccgctttcgccgatggcgtcacgccctccgaggcccgccggctccgcgacgaggtagtgcccgcgctcctcagatccgcccgctcctagctccagtttgttgtaagctagtttcgtgatcctgagctgcggcggaggcgttgtctagttcggatgttgcgtgttggtgctaatttgctggtgcataactcttcacgaaccgatttgggctggttttgcaatcgggcggcggcggactcggcgattcgaccggtttagttagtatgcttagttaattatcacatttccggttttgatcatactcaattattcatcgttacacggttactccaggaacgattagctatatacgccaggcattccgactgttagtagttcccactggtgactttgctgaaagcttttgactaaagttcagtgctaggttgattttgaatgtgtgtcacaacgagatatgctgtattataggatttttttagcacaaaacttaccacacttgaatttttggattttgtacaaccgagccaaattgactggtatagtagttatattaggttgctgtaacagaggtaatgcttgtggttctaagttttttttttcctctaattgatggtgagatgccaaacctcattaagagatatcttccacttcaacaagacgccatcttgtttacaattaacatgtgcagaatctagtattcatatggaaatgtcttttatgtaggtcaaagatatgttctatcatgcatttgatgggtacatgcaacatgcttttccacttgatgaattgcggcctttaagttgccaaggagaagattcacttggtggctatgcacttactcttgtaagcaattaaaaaactgcttcctcatgcacatttcctatcagtttttgccttcatgtattatcatgatttgtgaatgcttattcattaaacagatagactctttggataccttggctttactaggggataaggagagatttgatgctgccgtggagtgggttggtaagaatgtccgctttgatattgtaagtaaacaatttacaatttttttcactaattgcatagattaattaatacacaccatggtgacaccataactaattaaccattcaaccattattgacatatgataaatatacagtacttttttgcttgtatttcagtctgtcctatagattgaagcactttataatttaggattagcgtattacgtgaatattgaagcagataatatgccatgttgggtggtttcaactgacgtgccatattcattgattcagaatgaagaaacattatgcttgacagtttagagagattcttatttgtaccatagtccaatagatcagtcttgaagattggttatgttgcaaggctttcaatattgcctttctcagattaatttattatatggtgcttcttacagtatgactcacaatctattatggttggtgatagggatctcaatgcattaaggaataaatgttagtcctgttgcttttttttggtctaataacttttcactgtatgtttttttaacattcctttcgaaataccagttttgcatttgaaatgaacataatcttctagcaccaagtatgttatatgtgttctgtagatacatctatatatttgatctttctatttcttcttagcctacttattttacttgtgcgaagattgacgtgttcgcttacaacttacattcatgattctgtttcttaatcatgtttcctcgctgtatatgcagaataaaactgtctctgtttttgaaaccaacatacgcattcttgggggtctgctatcagctcacctgattgccagtgattatgcaactgtatgtttgtctggtccttttttttgccagtgtttaccacttctcttgttgattttcctgatgatctttgctaaatttctgttaatcttaaacacaaactttttaagtagaacttgaaaaattgtatgcaaaccaaatatactaaagtgggacatgaaaatctgattggagcaaaggaatacctgtgctgtaacacgaaaccacttctgaaagaccatattgataacgtgcaagcttattgacaccatgactgttgtgatgttaatggaggtgtggcatggtagaaaggtgcctttctgcctgttcaacatattgaccataataggttcttttcagaatacggctggttagaataattctttaatatggcacatacgattagttatatcttaaatatgatcatgctgatgtattcagttataacctacattcataagaaagtgcacaataagaagatgtctcaatcttcctaaccttctatgttactttctcaagatttactcaatgaagtgttccgatatttattttagcttcttgttgacagggaatgagaattcaatcttatgatgatcagttgcttcatttagcggctgacttagctcaaagattgctacctgcatttgacactccaacaggtttactacgttgtctattagttactttgtggactcacacatgtttctttgaaacaatggaatatcttaatatgttatgtatcatatcagaaatttgatcccccaatcaccaccgttctcaacccccagcccaccaaaacacacatcgaaccaaactcttctttttcagccaaagctgtttgtgtaacaaacttttccatggtttgggattataactggactactgaacataatgacaaaaatatcatgttccatcgcagtaaatacaccctcacatacaagctaaaacagatatccattaatcatatcttactatatagttgcaacccactaaatcctaaagctcaacatacaaagatgccacatcattctcaactaacaattattacatcttaaacatcatgcaagcatgctatattatctataattctatatttattaaattttagagctttaaaatgcaagaatgttaaatcatcccatataattcacataatatttaaatatatctctccatcattttttataatatctactatatacatatgtagttcatcctcacttagttaatgctatttcgctcttctctcattaagccatatcacatcaattgtttttagcccttagatgattaatctatggtccaaattatctttatcttttttttttctctttaagtcatatcacctcaattatttttagccattagatgattaatctatggtccaaattaactccctccttttcttctctcataaagtcacatcaccttatcatcattctatatactatttaaattactataaaccatatcaacttatgtaagcttatgtcgtctagctatcttacacattatctctacttatttgatgtaaacattatttctacttattgctatcatattaaactcctgcagcaacacgcggggttttacctagtatatgcacatatgcatgtacactagagcgcatgcacgttgcacgcttaataaaatatgccgacatttgagcatttcttttcgatggaaagtatcccatgagttattcaaatggcaaaggagtaatagaagagttttttcatccttttagcatcatgatatgttctttccttcctgttctgcttaacatgtgcagttctcgttgcaggtattccatttggatcagtaaatttattgtatggagtcgatgaaaatgaaagcaaggcaagcttattttgtcctacgttttgttgtttatagagcttgcaatcaggaacaggcccagagtttggactcatgttaattatggtcgatatggagattagcataattccaaattccaagtgtttacgctgttgcttaagtaactttggaatgatttaacttgaaatattctactgcttttgtaaccacataaataatatacgagaggcacacgcgcgtgcgcacacacacacacatttatcagacttctcaattttcttctgttcatttagaacttaaataccaagtactatcccatcaaccatgtctaatttcccatgtttatgcttggttcatcagtacaagcgttgaaagtagaaaattgtacctggctattagatggacataaacattcctgagattaattactgacacagcattttagtaataacagataacttcaacagctggtggtggcactttgacactggaatttggtgtcctgagtcgtttgactaatgatagcggttagtattgacaatatattatattgttgaagatctctatatcatgtattctacattattacacaactacaatagctaccatgtgctagaaaggtgcccctactttttttggtagtttatgttttaaaatctcatatattttttatggaattgaaatattatagttgaatagtctgaaagtatccttactggtacttaacaagtcctttaaggtgctgagtcgtgatgtcaacatctgtgtccattcgttgtgtgttagatgttcagaacaaatttatgcatatctttgaccatgaacttccctagtccccatagagatcatgtttattattattgttctattgtctcatgcttcattagttttggttgtttatcctctgaacactaatttagttcttatcgccagtctgttattctttgttaaactcactgattgtcacgatgcagtttatgaacgagttacaaaaaac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External Link(s)

NCBI Gene:Os01g0773600, RefSeq:Os01g0773600