Os01g0779400
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0779400 |
|---|---|
| Description |
SWAP/Surp domain containing protein |
| Version |
NM_001050968.1 GI:115440306 GeneID:4326436 |
| Length |
10144 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0779400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:34755924..34766067 |
| Sequence Coding Region |
34756340..34756444,34756971..34757180,34757254..34757808,34758293..34758514,34758969..34759099 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:34755924..34766067 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:34755924..34766067 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggaggaagcggcggcggcggcggcggatttcgatggcggcttcggcggcgccggggaggacaacctgtccatgcccctcggcgacttcatggccttcctcgataacgaggactggaaggagcagcagcacgagggcaatcaaggtttagagatgccagtggacagcacaagttctgaaaatgcatttcaaaaccatgaagatccttcacatagtcagatggatgtaatggtggaacttaacaatggtggagaatcttttgatcactcagaggatacctcttatagattgcttagcaatgattttttggaaaattcaaggaatggtaatcctgagatgcatttaccaatggatgcattaaaccatgctaaaactgttgatgaagaaattgtccctccatatgaagattatacaaatggtttatactatgattcgggatgtgatatgttcgcagagcaatctggtttaagtgaagttaaatgtgagggcacaggtcccatgcttggtaattctgagcaggagggtaaccatttcacgtcagtgcctatgtttgaccatagtgctgttatacctgatattccttacaccgagttgaacatcggtgatgtgcctggaagcatgcagaatggaaatggcagttgcctaactgtacaaggagaatatctgcagggggagtatcaggagtatcctcagccagattatggatcgtttgatatggctaatgaaatagtgctgcatgatttgccacaaaacaatcagtcatatgagctggaacaattaccacagaatatatgtgaaagcagttcaatgcaagtgggctctccagatcaatattgtgatgatacatctctgtcggattattacatggatgatgtatcttcgatagagtcgatgtccagcgagcagaaccgatcagaagatatctgtttccggagtgagtctagcactgactcttctccggtgccctcaagcagaaactccaccactgaggatgctgataaatactttggagatgcaccaaaacatttgcagaattccatgtttcctgtcagtacccaacaccaacactcattcatgaactcaagtgatccaatgcatccaacttttcataaaaagtatgacattcctagaaatggcagctcttctattctgggtaactcatcaaggaattgcttcagtttagatagcaatcgtgattctgatttatgtattcttgagggtagtagaagtcttgctagtggacatgtgttgccaccccaaggattgcagcataactttcaacaatctgtgtgtgccaatcctaatcttcctcggtttggagggagatacaggccgcatgaggaaagaatgactttgcggcttgcattacaggatatttctcagccaaagtctgaggctaatccacctgatggagttttagcagttcctttattgaggcaccagaaaattgccttgtcatggatggtacaaaaggagagaaatggttcgagttgctctggcggaattcttgcagatgatcagggcctgggtaaaacagtgtcgactatatcactgattttgacagaaaggtcaccagttccatcttcagctgttaagcaagaaccatgcgaagctgtaacccttgacgatgacgatgaggatgacgatgctgagcctcatttgaagaaaccggcactagcacatctagcagatacatgtaaacctgaagcgacaagtagtaccattaagacagaaaatcctattgcaaatgttaaggctagaccagctgctgggactttggttgtttgccccacgagtgttctacgtcagtgggcagatgaactgaggaataaagtcaccagtaaagctaacttgacctttttagtatatcatggtagcaaccgcacaaaggatcctaatgatcttactaaatacgatgtcgtgttaaccacatattctatagtaagcatggaagtaccaaaacaatcaagtcctgatagtgatgatgaagagaaagggaagcctgacaggtatggtgctcctgttggctcctcaggcagcaaaaaacggaagacttcctcttctaagaagaacaaaagtggaagcacaccagagagtaaattgcctgagaaacctctcgcaaaagttgcatggtttagagttatccttgatgaagcacaaagtattaaaaattatcgaacccaggttgctagggcatgctggggtctgcgagccaaaagaagatggtgcttgtcagggacacctatacagaatgctgttgaggatctctatagctatttcagatttctcagatatgatccatatgctgaatacaaaaaattttgcttcatgataaaaacaccaatcagcaggaacccaattactgggtacaagaagcttcaggttgttctgaagacagtaatgctgaggaggacaaaagcaacgatgcttgatggaaaaccaataatctcattacccccaaagaccgtctctcttaagacagtggacttcactagtgaagagcgtgctttctataacactctcgaagcagaatcacgagagcagttcaaggagtatgcagctgctggtactgtcaagcaaaactacgtcaatatcctgctgatgcttttacggctcagacaggcatgtgatcaccctcacttagttcgaggtcatgagtctacttctagttggatgtcttcattggagatggcaaagaagctgcctgtagaaaggcagcaatcgttgctggtttgcttgcaatcgtgttctgcgatatgtgctctctgcaatgatgcgccagaagatgccgttgttactatatgtggtcatgttttctgcaaccagtgcatactggagcaacttaccggtgatgacagtgtatgtccagtgtccaattgccgagtccgactaaattcaacttccttattctcccgaggcacccttgaatgtgctctgagtagatcaacctgtgagtttctgtctgatgattcctgtgaagacatggtgcaagggaagcaacctagatttgattcgtcttatgcatcttccaaagtgagagctgccctggatattcttctctcgttgcctaaactggatttaacccatatgagtgatgacaaaaataaaattgtgcatcctgacaaaattaacgggaatagtactccctctgaatatgctggcaccaaaataactgagaaggccatcgttttctctcaatggactagaatgctggatttggtagaggttcatttgaaatcttctcatctatcttatcggaggcttgatggaacaatgtccgtcgcagctcgggatagagctgtaaaagacttcaacacaaatccagaggtttctgttatgattatgtctctcaaagctgcaagtcttggtctgaatatggtggcggcctgtcatgtacttttgcttgatctttggtggaatcctactacagaagaccaagctgttgacagagcgcatcgtattggccaaactcgacctgtcacagtgtcacggttaaccataaaagataccgttgaagatcgtattttggctctccaggagaaaaaacgggagatggtggcttctgcatttggggaagacaaatctggtgcccatcaaactagattgacggtggaagacttgaactatttgtttatggtttag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MEEAAAAAADFDGGFGGAGEDNLSMPLGDFMAFLDNEDWKEQQH EGNQGLEMPVDSTSSENAFQNHEDPSHSQMDVMVELNNGGESFDHSEDTSYRLLSNDF LENSRNGNPEMHLPMDALNHAKTVDEEIVPPYEDYTNGLYYDSGCDMFAEQSGLSEVK CEGTGPMLGNSEQEGNHFTSVPMFDHSAVIPDIPYTELNIGDVPGSMQNGNGSCLTVQ GEYLQGEYQEYPQPDYGSFDMANEIVLHDLPQNNQSYELEQLPQNICESSSMQVGSPD QYCDDTSLSDYYMDDVSSIESMSSEQNRSEDICFRSESSTDSSPVPSSRNSTTEDADK YFGDAPKHLQNSMFPVSTQHQHSFMNSSDPMHPTFHKKYDIPRNGSSSILGNSSRNCF SLDSNRDSDLCILEGSRSLASGHVLPPQGLQHNFQQSVCANPNLPRFGGRYRPHEERM TLRLALQDISQPKSEANPPDGVLAVPLLRHQKIALSWMVQKERNGSSCSGGILADDQG LGKTVSTISLILTERSPVPSSAVKQEPCEAVTLDDDDEDDDAEPHLKKPALAHLADTC KPEATSSTIKTENPIANVKARPAAGTLVVCPTSVLRQWADELRNKVTSKANLTFLVYH GSNRTKDPNDLTKYDVVLTTYSIVSMEVPKQSSPDSDDEEKGKPDRYGAPVGSSGSKK RKTSSSKKNKSGSTPESKLPEKPLAKVAWFRVILDEAQSIKNYRTQVARACWGLRAKR RWCLSGTPIQNAVEDLYSYFRFLRYDPYAEYKKFCFMIKTPISRNPITGYKKLQVVLK TVMLRRTKATMLDGKPIISLPPKTVSLKTVDFTSEERAFYNTLEAESREQFKEYAAAG TVKQNYVNILLMLLRLRQACDHPHLVRGHESTSSWMSSLEMAKKLPVERQQSLLVCLQ SCSAICALCNDAPEDAVVTICGHVFCNQCILEQLTGDDSVCPVSNCRVRLNSTSLFSR GTLECALSRSTCEFLSDDSCEDMVQGKQPRFDSSYASSKVRAALDILLSLPKLDLTHM SDDKNKIVHPDKINGNSTPSEYAGTKITEKAIVFSQWTRMLDLVEVHLKSSHLSYRRL DGTMSVAARDRAVKDFNTNPEVSVMIMSLKAASLGLNMVAACHVLLLDLWWNPTTEDQ AVDRAHRIGQTRPVTVSRLTIKDTVEDRILALQEKKREMVASAFGEDKSGAHQTRLTV EDLNYLFMV</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>9624..9728#8888..9097#8260..8814#7554..7775#6969..7099#5127..6024#4950..5027#4797..4868#3127..4067#2821..2949#2631..2729#2420..2486#202..336#ttcgtttccaccaccaccccccaccaccacgacgcggatggcatcttcgtcgtcttcgtcctagcgcgcggcggccgccacgcgaccctgtttgagagggggaaaggggggttccgctcggctaggcggaggaaggacgcagccgcccctgtcccgcggcgaatttggatgatcgaggcccgccgtcgagggtaaggagtgatggaggaagcggcggcggcggcggcggatttcgatggcggcttcggcggcgccggggaggacaacctgtccatgcccctcggcgacttcatggccttcctcgataacgaggactggaaggagcagcagcacgaggtgcgttactactcgccgccttgccctaattcgatttacgcccgggtgtatttttttttcttctgtgtgcgtcggatccgattcggtgcgcggggttgttggggggctgggcttgcgtctgttctagggtttttgattgcatcggggccggatgcgtggatttctcgagaagtttctgccttcaattaagcgatttaggatgtttggaggctaggcactgtgttttcccccacgagtgttgtgtcttgtttaggcgcgaatgatacaagcgtgatcaagcttacatgcggttttggtccggctactcagtttgaacaggtattttttttgttgttgtttcggataagtggagctctgggtgcctgaagaagagctaaaatcaagtccgttatgcagtttcattaaatgttggttggtcaatgacaataatctgacgacagatcttcaacaatcatcggtcgctgaaatgacgcttgatgtacagaggctcggttgctggtttattgggtctcatgtttgattcactgcccttgccgtggtttatactatgagaaagtgtgttgatgatggcggctggaagcgagtttactggcagtcgtggcgttgggggttgtgatgtggtacatgtatgctgttttcagtggcgatgggctataaatggccatcaggctgttgggattggagaaggtcaaacaggaagcagcttggtagtgagttggaagtgtgtttgctgccaaatggatacaatgatatgtgggcttttcgtgttgtcttttctgctctcactgaacttcaggcccctgtacacatgttctgtatgtttaccggtgggcatagatatacatcatgcagctatgaggtatccttatggcctgttaagaacacaggagttcagtatatttttcacttgaaacagttcgatttcctcatgaattggaaaaattctagtgttgcaaacggccaccttttcccctgaatcctaacacatgtattttagcagtagaaaatattgaatttgttgtgagcatgcagatagctaatagtctgacctcacaatatttattatgatggtcgatcctggtaaatgctttgtttttatgtgtgcttgaatgcttttagttttgcatttgctatgcctcattactaaagagatgaatcgtaaaactgaagtcatttcattaatgaaatgggagagtagatcctttctttctcaaacaaagaaaactaaagagatgaatcaaactgattttatttactgtgttgtgattgttgtgaccttgaatactttgggtgagtgctggggaaatataaaatttcttgccgcgttcagttctgtggcaaaataattggctgataccataccaagtgaaattgaatcttcattttttgtgctttgtttgaggaagtgtttttttgggaggttttgtcttttaattgtattttcaagttgttggttgctaggtcttgtatttaccaaccttgggtagtaatgtactccctccgttccaaattagatgtcgttttgactttttgcttgcaacttttgaccatttcgtcttatttaaaacattagtgcaaatataggaaaggataagtcatatatttaaagtacttttgataacaaagcaagtcacaaacaaaataaataataattccatattcttttgaatagatgaatggtcaagcattacaaacaaaaactcaaaacgacaagtattttgggacggaggtagtacttgttatgctcggaatttgtcatatggtttgtggtcagtaaccagtaaaactctacatttagttccagcatatgccatcataggctgttaactatgtgtggctaactggatatgttcatagatgtccaagtttccttgagtacaataactgggattgcattttttttcgtgtagctgatgctaattcttgtgtttattgtaagataagtcagttccttgccaggaatatctacctacttagctttgttgcatctatatatcatgccccttgtttagtctattatcttgtgttcccttgacaaatgtgcatatttgtaactaaagagctattatgttgtttaatacagggcaatcaaggtttagagatgccagtggacagcacaagttctgaaaatgcatttcaaaaccatgaaggtaccagaagatgctcgttttattttggtttctgctagatacacacttttcttttccgtgtccatttttttaatttttaaattttattaaaatgagcagaaatttttgagaataaagaaaattggtcaaactactcgcatacagatccttcacatagtcagatggatgtaatggtggaacttaacaatggtggagaatcttttgatcactcagaggatacctcttatagattgcttagcaatggtgagaaacacaagaaaggcttcaatctggaaaaaaaacatttttattttattatgtattatatgattttaattttggttttgctccacagattttttggaaaattcaaggaatggtaatcctgagatgcatttaccaatggatgcattaaaccatgctaaaactgttgatgaagaaattgtccctccatatgaagattatacaaatggtttatactatggtcagcattctatgcactccgacaatacacaagttagagtagataacaactttgagggcttggagccacacactaatacttgtatggcggttccctgctttgtaatatacacatacgtgtgtgctttcttagcgttgtaatataaagaaggcactaattatttgatatctcctgcagattcgggatgtgatatgttcgcagagcaatctggtttaagtgaagttaaatgtgagggcacaggtcccatgcttggtaattctgagcaggagggtaaccatttcacgtcagtgcctatgtttgaccatagtgctgttatacctgatattccttacaccgagttgaacatcggtgatgtgcctggaagcatgcagaatggaaatggcagttgcctaactgtacaaggagaatatctgcagggggagtatcaggagtatcctcagccagattatggatcgtttgatatggctaatgaaatagtgctgcatgatttgccacaaaacaatcagtcatatgagctggaacaattaccacagaatatatgtgaaagcagttcaatgcaagtgggctctccagatcaatattgtgatgatacatctctgtcggattattacatggatgatgtatcttcgatagagtcgatgtccagcgagcagaaccgatcagaagatatctgtttccggagtgagtctagcactgactcttctccggtgccctcaagcagaaactccaccactgaggatgctgataaatactttggagatgcaccaaaacatttgcagaattccatgtttcctgtcagtacccaacaccaacactcattcatgaactcaagtgatccaatgcatccaacttttcataaaaagtatgacattcctagaaatggcagctcttctattctgggtaactcatcaaggaattgcttcagtttagatagcaatcgtgattctgatttatgtattcttgagggtagtagaagtcttgctagtggacatgtgttgccaccccaaggattgcagcataactttcaacaatctgtgtgtgccaatcctaatcttcctcggtttggagggagatacaggccgcatgaggaaagaatgactttgcggcttgcattacaggtaatttaccctttttactcttggcggcacttgctcattgaagtaccataaacaaacaaggtggttttttttaaaccttttttagtccctttttttgcctaacccaaaggaacaggcaactaaactgcttgaggtttgatttgttatcatgtttctggtcactaaaacagaggagaatgtatgattttcttatgaagatatttgccttatatattttctgtagttgtcttgcaaacagaagaccattttgtgttaactagcaaaatgtccatgcttttctatgggtaaaattcccattctttgcttttccaatgcttattacaatatatgttattcacttaaatcaaacaaatattaaattattgcatatatcagaaaatatcagggaataatttgtaaaacatgcaaaattagtagtggtgggctgcggcagaaccacctccaccactagagtatagataactgctggtgcttatgttttcaaccttttctgcactgtgatgctgttaaacattgatttttgaccttttgtctgcattggatataactggtgactttgtgaatgttatttcatgtgatatatatgtggcatttagttccctttttttgttagccttgtgttatgctgtatgtgttgatacttttttagccattacttgatgcacctcttgcatccagtttgcttgtaagtttttcttcaatgtacttaaccaattggatgatgggcaggatatttctcagccaaagtctgaggctaatccacctgatggagttttag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