Os01g0780500
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0780500 |
|---|---|
| Description |
SCAMP family protein |
| Version |
NM_001050972.1 GI:115440314 GeneID:4327836 |
| Length |
5512 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0780500, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:34815044..34820555 |
| Sequence Coding Region |
34815198..34815254,34816113..34816223,34816534..34816596,34817277..34817310,34817841..34817963 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:34815044..34820555 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcggggaggtacgaccggaaccccttcgacgaggacgacgtcaaccccttcgcgggtggaagtgtacctccagcttccaactctcggatgccacctcttcctcacgaacctgggttctataatgatcgtggtgccacagtggacatacctcttgattcaaccaaggacatgaagaaaaaggagaaagaactgcaggcaaaggaggctgagctaaacaaacgggaaagcgaattgagaagaagagaagaagctgcatccagagctgggattgtcattgaagagaaaaactggccacccttcttccctattattcatcatgacatttcaaatgagataccaatccacctacaaaggatgcaataccttgcattttcttcattgttgggattggcggcatgtcttttctggaacataattgcaactacagcagcatggattaaaggggcaggtgttatgatctggttgctagccattatctactttatatctggtgtacctggagcctatgtgttatggtatcgccccctttacaatgcgatgaggactgagagtgctttgaagtttggatggtttttcctgttttacttgatccatatactgttctgcatctggtctgctgtggctcccccatttcctttcaaaggaaagtctctggctgggattttgccggctattgatgtcataggaaacaatgctattgtggggatattttacttcattggatttggactgttctgccttgaatcactactcagcgttgttgtcatccagcaagtatacatgtatttccgtggaagtgggaaggctgctgagatgaaacgtgaggcagctcgtggtgctatgagatcggccttttga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAGRYDRNPFDEDDVNPFAGGSVPPASNSRMPPLPHEPGFYNDR GATVDIPLDSTKDMKKKEKELQAKEAELNKRESELRRREEAASRAGIVIEEKNWPPFF PIIHHDISNEIPIHLQRMQYLAFSSLLGLAACLFWNIIATTAAWIKGAGVMIWLLAII YFISGVPGAYVLWYRPLYNAMRTESALKFGWFFLFYLIHILFCIWSAVAPPFPFKGKS LAGILPAIDVIGNNAIVGIFYFIGFGLFCLESLLSVVVIQQVYMYFRGSGKAAEMKRE AARGAMRSAF</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>155..211#1070..1180#1491..1553#2234..2267#2798..2920#3516..3578#3675..3768#3856..3901#4030..4097#4468..4516#4753..4818#5089..5175#attccaaacccactaggttacgtaaaagcggaagcccggaggccggagcagttggtcgccaccgtcacgcgcgttccccttccctcgccggagagagaaaccaccgacgcggccgcttccggaggaggaggaggagttggggtggaggggagctatggcggggaggtacgaccggaaccccttcgacgaggacgacgtcaaccccttcgcggtgagctgctgggttaggctgtagctgggtcggggggctaaaccccccctccgcgtcgcaatcgcgcctcctccttgcttcatctaggcatggagaagcttgtcctcgcgcctgtgtggatggggtagtcgagctgcgtcccggattggcatgtgttgtgctggttttctggccgtggccgcttcgtctggtcctgcacgcggcacgccatgtggggtgctttggatcagcctgagttgttggcgctagggttagtgatttaggatccgctgttagggggttggacttggatggcgcgaatacggccttttttgcttgtctatttgctagctgatcgcgaggcgtggcaacttttccccttgtattgttatacattttcataggagaaatgatgctcggattgaaaattggctcttaggttgtgttgggacgttatgtttctggttttacgagggaatatgtggtgcaatcgatatgtataacttgtgaaaatggtcggtctactcttagaattattggaaaatatccgtaaaatggggcagttcacacttgtttggttcagatcgtctataacattaggagattgaagattgtctctgccagtataaacatttagtgtcgtaagcctgcagtcagtttactctcagtttgctggatatgcacgtgtcagcgagtccataatcatgtgaattgtgcgtatgcgtgcacatgctccatctaggatttctaaactgtcaaattttgagctttcggccaataggcgtaaaaagggataacagagttggctgaatattctaattttagcagcctccttcaactatctgtttgtttcatttttaaatgtaccctgttctgcagggtggaagtgtacctccagcttccaactctcggatgccacctcttcctcacgaacctgggttctataatgatcgtggtgccacagtggacatacctcttgattcaaccaaggtacttgtatttccattgagcggtaatactacgtgctactatatttacaagttatgttctgtacctcagcgtgagaaaatcatactgtacttagctctttcactctgatattattactctgttagtgtgtaacaacagttgcatgcttcattttttgttatcttatctctttaaaaggctgaagaacacaattaatctagtaatgatggtttcactattccttggtttggatgtttgataccatatattcttttgttgctgtatttgtggttggttgcttatgcattgagtatgttcgtatgtaattcaggacatgaagaaaaaggagaaagaactgcaggcaaaggaggctgagctaaacaaacgggaaagcgtatgtgccttctgtagttatgcttgaaacttggaattttcaattgatcttttcatgagcaatgtgatttttaaccaatgtttgatgaagtaaaaaactattctaatgaatcaagttgtcaacttcccctggccaaagtcctaattcctaacctttttcctatgatgtattgggaagcacctatatattgtgttagtattgagtattgaactagtaaccattatgcaatgtgaaagatatttagctggcatggatttgacacaaagatccggcacccaatagacctcgctgatctaaccattaattgaatcattgacattgcacaattggtttgaaatgatgaacaaaacatggatatctatacactcaattatagcactttgaaaagaaggatggctgtttttttagataaacagaaggataccagcgtgctaatgcaaactaacattatcaaatgatttcatctagatatctcctcttttcataaaatattgcgcacgagaattacgtgtatagaatgctgaatctgtgagtgtgctgagttttactcatagagtaaaaatttgatccaacaagtttcacatgattggaggttaaaacaccctagatttgcgtacaagcatgctcttgtattttctttaaatacaccacctgattttttgtgattccctgatacgcaggaattgagaagaagagaagaagctgcatccagaggtatatttttttctcgcagctgagtacgtgtaatctttttgtttttgtgtttctaacaaaaaatattcgaagataggaaacagttgttcatgatatttgtgtcgattggttaattaggaagttgactagaaaactatagctaattttagatttagagcctgagacttaagttacactttgcaatataatgagatttgtaggcaagtatcccttgttgtacaatttagaaatgctcctgtttatgctatattattccctctgtcgcataaaaaaccaacctagtactggatgtttcacatcctatgatcctagtactacgaatctggacatatctctatccagattcgttgtactagaatgtgtcacatccagtcctagattcgtgttttttgggacggagggagtacattgtgttcgtctttcttgaaaaggctattcttgctaattttgtgcttatgtttgttctgttgcaatctattttccattttagttgttgcttctgcctttcaactctttcttttatttttcagctgggattgtcattgaagagaaaaactggccacccttcttccctattattcatcatgacatttcaaatgagataccaatccacctacaaaggatgcaataccttgcattttcttcattgttgggtaagtgttagttttagttttaagttttaactctctttttgttccctcatgttgggaaagctgtcacaagaactaaaatacctggtggaaccacaattctttatatccttttgcttaaacattgtgaataaaatactgcctgaatcactacatttactgtccaatcaatgaatttctgctgagtcaatgccagaagtgagtagtgacatgagaaaaacgtgcctactttgagacattttgatatcaatgaacttctctaatcttgacttatatatccaattaagagattcttttttaaaaaaatagaagttgcaacctgtgtcttttgagaaaaatagttattatcttcttggtgcagtaattatgtaagcctaataagcataagcatgtggtgtctaccctgttttgtagctgggctaaatgtctttctgtaaaaagattttcaaagcaacgctaacaatacttggcatcttgtaaaaagaagcactatttagtggactgaattttggttgtgagagctagtacctatttgcatgttggtgtagcattgctctacaaagctgcttcttattgtgcaaactttgatgtcatgcaggattggcggcatgtcttttctggaacataattgcaactacagcagcatggattaaaggggcaggtatggctgactgagtaccttactatatatttatcttatggatcagctgccatctgcactgacacttcaaactaatcctgcggttcaattcaataggtgttatgatctggttgctagccattatctactttatatctggtgtacctggagcctatgtgttatggtatcgccccctttacaatgcgatgaggttgtgaatatacttgtgtttttgttatttctgcacactatttcttcttatatttgacatagtgtattgttacaatgtatgttgcaggactgagagtgctttgaagtttggatggtttttcctgttttacttggtaagacccttaccttctggtaactgtaaggttaaaatgatctagtataagattaatggtttgccacactattggttgcaaaattgcagatattccgtgcagtgctaacagtgtttgccccctttcagatccatatactgttctgcatctggtctgctgtggctcccccatttcctttcaaaggaaagtctctggcgtaagtgttctgttattttatttaactaaacatacattttatttaagcagcaacattggagcactggatagtgtcttagtggctatgacttaaaagtgctttgagactttgttattcttcagttttagcatatatattagtatttggctcatagaggtacctgtgcaacagttctaggttgcttttacgtggcatttgcatagttattaggtgatggtgttaattgttagggtaatacctggatcactgctattgatgctctaaattgttacaaacttgtagcaattcaacttgcaggctgtccattttctctacttcaatttataaataccacttctctaattgcctctcccttttttttttgccacagtgggattttgccggctattgatgtcataggaaacaatgctattgtgggggtaagtctcactgtttacttaatgtttttcttctagattcaagttaatttgagatatcagggttagtatcttgggaggaccctatttgcatttttttaacagaccttttgcctcagtgagtaagcactgccgcactgggactctgggagttcgtgatgctttgcttaatttatttgattggcatgtctcatacaattgattgagtcatcaacattgttcacactttctttcgacagatattttacttcattggatttggactgttctgccttgaatcactactcagcgttgttgtcatccaggtgagttttataaaacttgatcttagccaaagccaaat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