Os01g0834200
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0834200 |
|---|---|
| Description |
Similar to T-cell immune regulator 1 transcript variant 3 (Fragment) |
| Version |
NM_001051253.1 GI:115440876 GeneID:4327412 |
| Length |
11018 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0834200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:37488512..37499529 |
| Sequence Coding Region |
37488703..37488843,37490023..37490067,37491158..37491280,37491392..37491499,37491835..37491948 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:37488512..37499529 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>MGVFDRLPPMDRLRSEKMCFVQLIIPAESARLAVTYLGELGLLQ FKDLNEDKSPFQRIFVNQVKRCSEMSRKLRFFNDQINKAGVKSSVRPAMQPDIDLEEL EAKLREHENDLLEMNTNSEKLLQTYNELLEFKMVLSKAGGILASSHNHAAPAERELDE HIYDKEMDDGNAYLLEQGVHLGASENSGVKFVSGIILKSKAMAFERMLFRATRGNMFF NQAPAGEPVTDPISGEEVEKTVFVVFFSGDQAKAKILKICGSFGASCYPVPEEMVKQR QIFREVSGRLADLEATLDAGIQHRNKALESVGSQLWRWTIMVKKEKAVYDTLNMLNFD VTKKCLVGEGWCPIFAKSQIKDVLQRATLHSNSQVGIIFHEMDTIDSPPTYFQTDKFT NAFQEIVDAYGIARYEEANPAVYSVITFPFLFAVMFGDWGHGICLLLGACVLILREKK LSSQKLGSFMEMAFGGRYVILLMALFSIYCGLIYNEFFSVPFHIFGKSAYECREKTCS DAHTAGLIKVRDPYPFGVDPSWRGSRSELPFLNSLKMKMSILMGVTQMNLGIVLSYFD AKFHGNALDIRYQFIPQMIFLNSLFGYLALLILIKWCTGSQADLYHVMIYMFLDPSGN LGENQLFWGQKELQILLLLMAIVAVPWMLFPKPFILKKLHKERFQGHTYRFLGTSEMD PDSEPDSARSRHDDFNFSEVFVHQMIHSIEFVLGAVSNTASYLRLWALSLAHSELSTV FYEKLLVLAWGYDNLVVKLVGLVIFSFATAFILLGMESLSAFLHALRLHWVEFMNKFY HGDGYKFRPFSFALLADDED</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>192..332#1512..1556#2647..2769#2881..2988#3324..3437#3517..3690#3916..4053#4242..4349#4466..4573#4672..4820#5332..5485#6564..6724#7816..8022#8116..8299#8382..8465#9747..9940#10029..10088#10280..10484#cggtattggcagttgcgcactagcgctatagaatttcagagaagggagaaaaatagaattgttcggagaccgaacccgcggcctcagatctgagacaagccaccgggctccctctccctcctcgcgcgcgcggggccttcgcgaacctcctggaagcttccggaggcggaggcggcggctgctccggggagatgggggtgttcgaccggctgccgccgatggaccgcctgcggtccgagaagatgtgcttcgtgcagctcatcatccccgccgagagcgcgcgcctcgccgtcacctacctcggcgagctcgggctcctccagttcaaggacgtgagtctctctctctctatctctcgctctcggcgccagtcgctgcccgcatcagaggcccctctctccctcccggatctgtgtgatctagcctcgtgaatcgtgatctctaccgcgctcgcttatgcgcgtcgtgctatccgctcatgttggatctggtttttggcggtgctcagatcggaggactagttttttttgcctggtgtcactggatcgcgacggctcgcgtgtttctgtcgtctgagctggtttgggctgctacgttgattggatagtgggtggcggggttgttttagatcagagggaatgaatgcggtgttcatataaatgcattaggttagggagcgaatcaaacaatgtgctattgcgcgagattatcctatgataagagcaaggacaatagtgcgctataagctaactataagcttatgtggaagagagagagagagagagagagagagagaaatgagaagtgttggctctcatgcaagagctagcaacacaaaaaatagagtctatacatgttagtttagtatgagctaatagccaatagttagctatactattaaacttgctctaagcatgagttggagcggtgatggtttaaatacatttatgtgcttagctgatcctagcaggtctcattgttttgcggtctatgcatgaatctttgccttgtaatttgtaccattttatgccaaacatattatttgctatggggtatcattcgtggacagttacatgccttgctattcagcaagatttatttgatgaatcagttaatggaatagacaccgtatttttgtgagttgggtcttaaagtacaccagtacctgtatgtttagaaaaagcttatgaactcttagtttgattgcaaaaacggggttgcgtactctgttcactttatcccatagatgccgctgaaatcttgggacaatatgaaagaaaatcatgagagggagactaaatgttgaccgtcatcgttatagttgtgtactacagaactttgtgagcatggcatcatcctagcagagaacttagagaatgcttacatagttatgtttgaacttgttcttttttattggttgtgcttcctgctataatggtttaattgagatttgcaaaaaaaaggcccaattgcttatctctctttttaactttattcctctttatatgcagttgaatgaggataagagtccttttcagcgtatatttgtcaatcaggtattccaaccttttatcttcgatctatctttttttgtgaatcacatcattttgcatgaaccttgttttattccactatgctgatttctacctggatactattgttctgtggcgcccattattttttacttcacttggcctgctcgtacccaagatatttgtttgaatatcatgtccatgtggtactcatatactctcctgaaaatttaaggtggattttgtgtgtgcagaaatattacgatgattataaaatcaagagaacataactgaaaatgagcatgccatttttgtttacctaaaatgcctagggaattaatgaattatagagaaaatgattagtgagcattcaaagtatacatcggggaaaataaggtaaagcatcaataaatttgcatgcaagctctatattttaatagaactcagagaaaacagtatgccttatattttgatgagggagtaccaccattgtttacttgggactagtgaatggacaagtcaggcggttaccttgtttagctttaggaagcatgcagcggggattatcatgttgagaaatattttggaggaacttacttcttatgtcagactatattcatcgataccttgaatcgtgatccaatcaagttactacctctgtttttttaatatatgacactgttaactttttgacacacgtttgaccattcgtcttattcaaaatttttatgcaaatgtaattttttttaagtcatgcttatagaacatttgacgataaatcaagagacaataaaatcaataataaatatatatatatattttaaataaaatgaatggtcaaatgtatcttaaaaagtaaacggtgtcatatattaaaaaaaaggagagattatttcataatatatataactggttccttgcttttatttatttatgttccaccagaatataatagattgatgctgtaattgtgatattttttctgtcaactgtcacttctgtgcatgcacagatgcacattgacacctgtgtttcccgcctgacgcagagaattttctgctgaataacttttacgtagtttgatgttgttaagtatggttcaattctcctacaggtaaagcgatgctctgaaatgtcacgcaaactaagatttttcaatgatcagatcaacaaggcaggtgtaaagtcctctgttcgacctgcaatgcaaccagatatagatttggaggagctagaggtgcattactcatgtctttattaccgttcaattctgttatttctgaagctaatagctattttgaaggaaaaaatgaataatttgttaaggacttgccttttttcctttcaggcaaaattgcgcgagcatgagaatgatctgcttgagatgaatacaaatagtgagaaactactacaaacatacaatgagcttcttgaattcaagatggtcttgtcaaaggttgtatctcaattctttgaaaacatagaattaattcttccagttattctttgactgttaagatggaactaaaaaaatcagcaccagtacatgacaccttttgatgataggcatatggaactttctttataaaaaacatagaatttgacaagagcatgctgcttgtaactgatgagtagtcactttatttggtttaaattgtgaacagtaaccctgctcagcaatcacaagtttttattgtagctgctatctgtgccagtctagtaatatcgattgtgctcaacttcctcctttgtttgcttcctcccatattttcctcaaataacttcttgcaggcaggtggtattcttgcttcttctcacaatcatgctgctccagctgagcgggagctagatgaacacatatatgacaaggaaatggatgatggaaatgcctatttacttgaacaggtcttatatttaattttcgtacttaaacacttgaccttatttgattgaaaactgtaacacaaaaaaaaaatgctcacagggtgtgcatctaggggcttcggagaattctggagtgaagtttgttagtgggattattttaaagtccaaggcaatggcttttgagaggatgctattccgagctacaagggggaatatgtttttcaatcaggcgcctgcaggggaacctgttactgatcccatttctggtgaagaggtctgattgtcatggtttgctcttggtgattctcgtgttaaatgaaatctattgtttgtctccaattatatgcttattgtttttttgtccttgaaagctggatttatgaacaaaattaatgcttattgcagtactgaaatccaaccttgcatgtgacaatttcatccaataccttgaagccttaaagtttctcaatagtttcaacattcaattttactttgccaggtagagaaaactgttttcgtagttttcttttctggggatcaggctaaagcaaaaatattaaagatttgcggttcatttggagcaagttgctaccctgttcccgaggagatggttaagcagagacagatttttcgcgaggtactttaatttgcatatttggcacacaaattcactgcttgatttgaccgtgcttgttagaattttattggaagaagcttgagtgttatacttatctgacttattgttctcgttattttgtgtcataatgttaatatgttatctgctgagatattatgtagtagtaacggtttatgaaaatgtgttaggtatctggacgccttgctgatctggaagccactttggatgctggaatccagcacagaaacaaagcactagagtcagtaggttcacaattatggaggtggacaatcatggtaatgaagtaatataaaattttcattttctatttgtgcgttgtaatccctaaaatctcttatttatgtctgttctgatacatggatttctgaaccataacccccttttgtgttaggtgaaaaaagagaaagctgtatatgatacattgaacatgctgaattttgatgtcacgaagaaatgccttgttggggaaggatggtgtcctatatttgctaaatcacaggtcagaaatattacattcatttgaaggtctattcattgtgctcattctgtttaggatacttttaaggatatatatcttatctctactttgtacttcagatcaaggatgttttgcagcgtgcaacgcttcacagtaattcacaagttggaataatatttcatgagatggacactattgattcaccgcctacatatttccaaaccgataagttca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