Os01g0858000
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0858000 |
|---|---|
| Description |
WD40-like domain containing protein |
| Version |
NM_001051393.1 GI:115441156 GeneID:4324762 |
| Length |
8605 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0858000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:38836136..38844740 |
| Sequence Coding Region |
38836136..38836410,38836480..38836699,38836788..38836834,38836992..38837164,38837749..38837826 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:38836136..38844740 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:38836136..38844740 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcggcgccgccggaggcgacgggggcgccgccccagactgaaggagaggaggttaaggatggcgtcgaggtctgcgtatttgacgagtcaccggaggtcttctccagagcggtgcacgccatctcggagctcacaaccggggagcacgagccgaacttccctgacgccgaagtcgagcggctcgcctcctcaataactttcctcagagaatggaggcacttctcttatgagccaaaaaatgttagtttcacttgtgacgccagatcagctccatccagagttgacacacacaagataaacttaccacagttctcgtctgcatctgtcccccagatcacacacctagacaatgggaaggctaaaacagacaggtcttctatgaaacacgagatgcgggacttgaatcttattttgaaagccctccaaacttgtttaaagatttcagtacagtctccaaaactactaagatatcttgctgttgctgctcaccctcctggttcttcttaccataaaattggcatgccgttaatcgggagaggtataattcaagtttggtgtctcctagcaccatctgaagagggtcatcctcatcagtcattggttgcatgcaataaatataatccatccaatcaaccaaaacaaaggggtagaccaagaaagaccatcacaacttctgatgatcacttggaaccaagtgtcaaaagaccaaggggcagaccaagaaaatatccactgccaattgccaaagtggaagattcatcccaaaacgacagaagtcaagagtttgctcttatttatcctcttgtcagtccagcagttgtttcatgtgacattgcaatagcttatcccatgccaactgttaatcctgtggaatcaactccaagaaaaggtagagggcgacctaggaaaaaacctgttgaaataaaaggtttgtctggcattaaactaacagaagacttgtctacagctctatctccaatagctttaacctgcatggagcccaagaaaaaaagggggaggccccgaaagtatcctgctccaagcaacagcaagcatcttccaggcactgatactgaattaggaaatgattctgtctgtcagcctggttcaattgattttggtttgggtcccactgaaaatactgggtctggtgctaatataactcatgctgcagttgatgcagcctccccagttccattgtcaggtcagaggggtagagaacagccagaaaaggaagtaattcatattgagaattccatgcaatctggacagtctgacataggatccatgttgcctacgtatattttacctgaatcaggcaacaagagtaactcaactggtctgaggcggaggggacgacctaggaagaaaccatttccgagtacaaccagttgtgtatttgttcctggtactgagaccccaaagaaaggttctactctgaccaattcaaataatctcgtggtcttggccaagagtaattgtgacattttagcaaatgatattggtccatcaagctgtgctatagagaacagtgtccatttgagtgttggaacatctcatgctgcaacaccagcacagggcatatgtcttgcaaaatgcaaggaagaatcaagtgccaagaagggtagaggcagacctagaaagcagccaatttcaacggaatgcggttgttctaaagcatgcaggggtgaagaacaaaaaactcagacaattcccaagtcaagcgacaatgcgtccttggttgaaaattgcaagaaagaatcatgtcccggaaagggcagagtgcaagataaaaagaaatctgtttcaaatgaaagaagttcagtagtgcttagtgttgaagcacagaacatggacggatcttctgcatcaactgcatatacttcatgttgtactcctgcttgtaactttgaaaacgcagagacaaatcaggctgtatctgttccttccgaaaacagtgctcaggttattgatgaactaaaagatacagaagtggctcgattcaaagaatcaactaaagatgataatatgatttgttctgcagaaaagaccctttctcgtgtcccaaaagacatttctctaccaagggttgtcttatgtttagctcataatggaaaagttgcttgggacgtaaaatggaaacctccttcagcaaatcagtcagaacataaatcatgtttgggttttcttgcagtactcttggggaatggctcgcttgaagtatgggaagttccatctccaagcatgattcagaaaatatattcctcttcttcaaaggagggtactgaccctcgatttttaaagctgaagcctgtgtttagctctgccaaagtaaagtgcgggaacagacaaagcattcccttgacagttgattggtcaccctctcatgatatgatattggcgggatgtcacgatggaacggttgctttatggaagttctctgcaaacctgtcatttcaaggttcaaaaccttttatgtgtgtaactgctgaatctgctcccatcagaaccgtgtcgtgggcaccatctgtgagtaaggaaaacgtgaatacctttgtcactgctggagaggatggtctgaaattctgggatttaagagatccatatcgtcatctttgggagttaactactgctccaagggccgtaataagtcttcaatggttgaaggatgcaagaggtgttgtcatatcattggaagatggcacattaaagttcgttagcttgtcaagaatcgcaaatgatgttccttttactggaaggccatttgttggaacgaaaactcagggtgtttctacctatcaattgtctgaatatttgatctggagtgtccatgcctcagaaattacaggctatgcggcttattgtgtggctgatggaactgctgtttgctttgagcttactccgagattctgggaaaaggaacctgggaggaaccgtgtaccatattttctttgtggttcattatcagaggagggaacaaccattaaaattggtatcgcattaccaaactctcctttgtcaaatgttcctctggggaccaaacgggctactaaaacttgcaaagatgtagctcaattgcatgttatagaagaagggaaacttcttaccaactcagaatacaatggtgctataaatccgagcatcagagatggtcaacaagatgaacctgatgaaggacaagaaaccggtgccatagttttagctgctccttcaatgcaagagaattttgacacaagcaccagcaggggtagtgaatcccctgaaaattttgaggtctttcctcctaaagctgtagcattgcatcggttgagatggaacatgaataaaggtagcgagaaatggttgtgctatggaggtgctgcaggcattatccggtgtcagaggatctaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAPPEATGAPPQTEGEEVKDGVEVCVFDESPEVFSRAVHAISE LTTGEHEPNFPDAEVERLASSITFLREWRHFSYEPKNVSFTCDARSAPSRVDTHKINL PQFSSASVPQITHLDNGKAKTDRSSMKHEMRDLNLILKALQTCLKISVQSPKLLRYLA VAAHPPGSSYHKIGMPLIGRGIIQVWCLLAPSEEGHPHQSLVACNKYNPSNQPKQRGR PRKTITTSDDHLEPSVKRPRGRPRKYPLPIAKVEDSSQNDRSQEFALIYPLVSPAVVS CDIAIAYPMPTVNPVESTPRKGRGRPRKKPVEIKGLSGIKLTEDLSTALSPIALTCME PKKKRGRPRKYPAPSNSKHLPGTDTELGNDSVCQPGSIDFGLGPTENTGSGANITHAA VDAASPVPLSGQRGREQPEKEVIHIENSMQSGQSDIGSMLPTYILPESGNKSNSTGLR RRGRPRKKPFPSTTSCVFVPGTETPKKGSTLTNSNNLVVLAKSNCDILANDIGPSSCA IENSVHLSVGTSHAATPAQGICLAKCKEESSAKKGRGRPRKQPISTECGCSKACRGEE QKTQTIPKSSDNASLVENCKKESCPGKGRVQDKKKSVSNERSSVVLSVEAQNMDGSSA STAYTSCCTPACNFENAETNQAVSVPSENSAQVIDELKDTEVARFKESTKDDNMICSA EKTLSRVPKDISLPRVVLCLAHNGKVAWDVKWKPPSANQSEHKSCLGFLAVLLGNGSL EVWEVPSPSMIQKIYSSSSKEGTDPRFLKLKPVFSSAKVKCGNRQSIPLTVDWSPSHD MILAGCHDGTVALWKFSANLSFQGSKPFMCVTAESAPIRTVSWAPSVSKENVNTFVTA GEDGLKFWDLRDPYRHLWELTTAPRAVISLQWLKDARGVVISLEDGTLKFVSLSRIAN DVPFTGRPFVGTKTQGVSTYQLSEYLIWSVHASEITGYAAYCVADGTAVCFELTPRFW EKEPGRNRVPYFLCGSLSEEGTTIKIGIALPNSPLSNVPLGTKRATKTCKDVAQLHVI EEGKLLTNSEYNGAINPSIRDGQQDEPDEGQETGAIVLAAPSMQENFDTSTSRGSESP ENFEVFPPKAVALHRLRWNMNKGSEKWLCYGGAAGIIRCQRI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>8331..8605#8042..8261#7907..7953#7577..7749#6915..6992#6340..6402#6192..6264#5964..6003#5785..5851#5524..5655#3681..5434#2431..2527#2075..2112#1806..1932#1..209#atggcggcgccgccggaggcgacgggggcgccgccccagactgaaggagaggaggttaaggatggcgtcgaggtctgcgtatttgacgagtcaccggaggtcttctccagagcggtgcacgccatctcggagctcacaaccggggagcacgagccgaacttccctgacgccgaagtcgagcggctcgcctcctcaataactttcctcaggtgagaaactccctccttgctctgtctaatccggtacctaatcaccgcggcaaaattggtaactttctgttgttggcctatttagctgggtggagtggacgaatttgtgtttaatagtagcgtttatcagcaaagcattaatttgttagtcattgatgcaatttcacggagctttcaatgggaaaatttatgtggcatgtaagctctctgtagtttattcattgccttatgtgccacacacggtggcaaattttattggaatttgttaatttagatcctaagacatcgctgccacacaaacagaaaaaaagcagttgtcacaggaatgctttggtgccgtttcattattcctgttgtggctattagaattcatttggcttttgccactgcaattggccatattcttacttccagtgtccttaggtaacaatattagctcaatgcacaattctgtttttctattgattagaacgatacaaggattttttttttcatgtcatgaacaaaatgcagttgcactgttacttgttttattactaattcactaagtttaagtcacttttgttctggtagatatatttccttaatctgtactcatttgttgtttgatgactctgatcgatgatcatttatgcacattgtgactttctagcttaccatttgatgttatggtttaaggcacagaggagtagcgaaacttgatcccctttatctataagtcactaagtcagtgagccccacctttatttgtgcagactacttgttagctgttactttgtattcaggattggcagtttcagtaacagctttagttattagcaacctatagtagcatgctataactagttagtactctttgatttaatcaccaattaaagtagaagaaaaaatttatgtgcccagtgttcaccagaaagatttttttttttaaaaagcaccactcactgtgttttagcacccaccaatataaggatgttaaactcaactgagactgatcagctggtacagccatacaaaggctgctcagaaccttagctttctagtatcatccatctcactgtaagctgatttgcatcaattggaactgcatagtttcaacgtgctgcattgttggttctcctccatgcccattttaaattttactgactaaaatttctacattgtcacatatacttgctccctaagtgcaatgcattggtttttatccaaatgtgtcaagtgtcaactattagcagttcacattagataaattatctgcatttattataaccattagccttttgtccaaacagactatctgcaatgattgaatttgtccactgatagtgttagaccactttccttggcatagtatagtctatagttgggtcagattttaggttcgccgtgttcagctcgcttatgcacatgaggacgactcctttcagcaccaagagtaacagattgtggaaagttctaacagtcattctgagcatcaattaaatggaattcacaagctgctttttcatttgtctaatctgattgccttctttttttttaaaaaaaaaatcaatattatttagtacctaatctgctagttatttcatatctttgcagagaatggaggcacttctcttatgagccaaaaaatgttagtttcacttgtgacgccagatcagctccatccagagttgacacacacaagataaacttaccacagttctcgtctgcatctgtcccccaggttattactcagttgctgttggtgccttgcgctaagttcttgaggctatttttttgttgtgttcagctgaatgagatttcttatatcatcttttgttccttttggaccatattctcataattaagttcggatcacactgcagatcacacacctagacaatgggaaggctaaaacagacaggtattgtttatggagttctttctgtactactttagaatcttgtcaatctagttatcttgttgtctgttttttccccatatttgtcaataaaggtcatactgttagtggagataggctatgttaagtttctcagttgatattaggaataacccaagatgtctgcttatgtattattttagctcctttggcaattcactagttgataatttgctgtaacatgaccaataagcagactaattgtcaacatatattgtattcctgctattggttagtagttttcaggtttcagggaatacctcctttgatctctttgagtaggtcttctatgaaacacgagatgcgggacttgaatcttattttgaaagccctccaaacttgtttaaagatttcagtacagtctccaaaactactaagagtatgctagttattaaggtttcttaaattgactgcacacacttcaaaactactaaccacatcaacttgggagtagtgggtcattcttttggtccagaagaacaatcgtacattgggtttggcaaacgtgccaaaccttcttccttttctttttttggggttgggggttgtggggggttgctttttttttttgtgattgatgaaaatagatctgatctaatactatttttgtgcctttgcacttctcattttatttagtacctgcctcacagtgtgataaacactgttaatacttttttacctgccatgtatatattctttcacttctccttgcttttcatacccatttgactctatgaagccatcttgattaaattatgtttaataattttttagcttttgcagctcagatttcgttatatttgccggaggcaatgtttgggcgttggactggtgccctaggttgtgtgacaggcctcattctcccataaactgtgaggttataactatgataatactgaaagttttctcttgttgtggcttcaaaattgtttatgcatcagcatattttttgttccaatatccactacttgctgtgactatgagtatgatgagtgctctttagttcatatgtcaatgggaaaattaacatgtttcactgagtgacatactttatggtgacatgaatttaaagacatctcttgcagtactccccacgtttacttttattaggcatatttggttttctgtatttgtttttcccattttagatgctcacaggaatcaaagtaaaatttctcatcttttccaactcttgttaaagcagtgaatctggttcaacatttccagttctatgtgctgtgcattgcaggacgataaaatggcagtttacttcttttttacttaataaaaccttgcgctgagataaagcatgtataagaaaatgaccgaagggagttcttcccaaggacatctttgcatgcagactaattgcatgattgcattgaatgtgcggtgtctatgaaattagtattatgttctttttatggtttatatcttcaagtatttgctggtttttgaaaaaaagtatatgactaagagtacaagttattgagagctgataaccttatttgcacgtctcctatacattgcagtatcttgctgttgctgctcaccctcctggttcttcttaccataaaattggcatgccgttaatcgggagaggtataattcaagtttggtgtctcctagcaccatctgaagagggtcatcctcatcagtcattggttgcatgcaataaatataatccatccaatcaaccaaaacaaaggggtagaccaagaaagaccatcacaacttctgatgatcacttggaaccaagtgtcaaaagaccaaggggcagaccaagaaaatatccactgccaattgccaaagtggaagattcatcccaaaacgacagaagtcaagagtttgctcttatttatcctcttgtcagtccagcagttgtttcatgtgacattgcaatagcttatcccatgccaactgttaatcctgtggaatcaactccaagaaaaggtagagggcgacctaggaaaaaacctgttgaaataaaaggtttgtctggcattaaactaacagaagacttgtctacagctctatctccaatagctttaacctgcatggagcccaagaaaaaaagggggaggccccgaaagtatcctgctccaagcaacagcaagcatcttccaggcactgatactgaattaggaaatgattctgtctgtcagcctggttcaattgattttggtttgggtcccactgaaaatactgggtctggtgctaatataactcatgctgcagttgatgcagcctccccagttccattgtcaggtcagaggggtagagaacagccagaaaaggaagtaattcatattgagaattccatgcaatctggacagtctgacataggatccatgttgcctacgtatattttacctgaatcaggcaacaagagtaactcaactggtctgaggcggaggggacgacctaggaagaaaccatttccgagtacaaccagttgtgtatttgttcctggtactgagaccccaaagaaaggttctactctgaccaattcaaataatctcgtggtcttggccaagagtaattgtgacattttagcaaatgatattggtccatcaagctgtgctatagagaacagtgtccatttgagtgttggaacatctcatgctgcaacaccagcacagggcatatgtcttgcaaaatgcaaggaagaatcaag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|
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