Os01g0868300

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Structured Information

Gene Name	Os01g0868300
Description	Similar to DNA polymerase alpha catalytic subunit (EC 2.7.7.7)
Version	NM_001051455.1 GI:115441280 GeneID:4325052
Length	9347 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os01g0868300, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 1
Location	Chromosome 1:39381667..39391013
Sequence Coding Region	39382003..39382149,39382237..39382311,39382388..39382507,39382662..39382715,39382792..39383014 ,39383094..39383173,39383263..39383352,39383435..39383548,39383780..39383859 ,39383964..39384078,39384265..39384310,39384390..39384487,39384563..39384682 ,39385044..39385136,39385817..39385873,39385987..39386059,39386155..39386273 ,39387311..39387403,39387528..39387839,39387913..39388032,39388133..39388246 ,39388319..39388498,39388584..39388698,39388783..39388946,39389172..39389357 ,39389476..39389566,39389677..39389741,39389811..39389885,39389998..39390081 ,39390163..39390330,39390748..39391011
Expression	GEO Profiles:Os01g0868300
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008394:39381667..39391013 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008394:39381667..39391013 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>gagaaggtgcatcgtctgaatgctaagattaagacggaggacagccggaatggggatatggctagtgcaacagcagggtggatgaagatatgcggggatggggacaatgcaggaggtgagggagcggtggctgctaacagcaacaccggcgtggatgaaagctcagaatttgagctgaaggatggagcgctgccattctacatattggatgcatacgaggagccttttggtgctaattcgggcacagtatatttgtttggaaaggttgaagtaggcaagcggttccacagttgttgtgtggttgtaaagaatatgcaaaggtgcatatatgctattccaagcagttcaatcttcccaagggacaccatatcaaggctagagaagaattccactacttctgattcttctccatcacttcgagcaagtctacatgagttagcatcaggattgaagagcgaaatagctgataagttgtcagacttcaacgtgtcaaattttgcaatgactccagtcaagaggaactatgcatttgagaggactgatctaccaaatggggagcagtatgtcttgaagataaattacccatataaggatccggcgctacctacagaccttcgaggtcaacatttccatgcattacttgggacgaacaatagtgctcttgaattgcttctcatcaaaaggaagatcaaggggccttcatggctttcgatctccaaatttttggcatgtccagctactcagcgggtcagctggtgtaaatttgaagttacagttgatagtcccaaagacatatctgttttgatgacaagtaccacgttagaagttcctcctgtcgtggttgcagcagttaatcttaaaactatcataaatgagaaacacaatgtgcatgaaattgtgtcagcatcagtcatatgctgtcaccgtgtgaaaatagatagtccaatgcgttctgaagattggcagaaacggggaatgctcagccattttactgttatgcgcaagcttgaaggcagtatatttcctataggcctctccaaggaatcctctgataggaaccagaaggctggtagcaatgtgctggcactcgagagcagtgaacgtgcattgttaaaccgcttgatgatcgagcttagcaaacttgattgcgatgtacttgtgggacacaatatttctggatttgacttggacgtccttttgcaccgtgcacagacttgcaaagtaccaagcaatatgtggtccaagattggtcgtcttaggcgctcagtaatgcccagactcaccaaagggaacacactttatgggtctggggcaagtccaggaattatgtcctgcattgctggtcgtctcctctgtgatacctacttatgctctcgcgatctcctgaaggaggtgagttattctttgacacaacttgcagaaacacaattgaaaaaggagaggaaagaggtctctccacatgatattcccccaatgttccaatcttcaggagcacttctcaagctggttgaatatggcgagactgatgcatgtcttgctttggagctcatgtttcatttgagtgttctcccgcttacacgccaattgacaaatatcagcggtaacctgtggggaaaaactctccagggttctagagctcaaagggtagagtatctgctgttgcatgcattccatgcaagaaaatttattgtaccggacaagtttgcacgcagtaaagagtttaactctacaaaacgaaaaatgaaccctgataccgaggctgcaagacctgatgaagctgatccttcaattgatgacgagggacatcatgttgatcaaggtaaaacgaaaaaaggtccttcatatgctggtggcttggttttggagcctaaaaagggtctatatgacaagtatgtgctacttctggactttaacagcctttacccttcgataattcaggaatacaatatctgctttactactgttgaccgttctgctgatggcaatgtccctaatttgcccgcttcaaagaccactggtgttttgcctgagttgctaaagagtttggtggagaggagaagaatggttaaatcatggcttaagactgcttctggtctcaaaaggcagcagtttgacatccaacagcaagctttgaagcttaccgcaaatagcatgtatggctgcttgggcttttccaattccaggttttatgcaaagccacttgctgagcttattacactgcaaggaagagagatattgcaaaacactgttgatctggttcagaataacttaaatttggaggttatctacggtgacacagactctataatgatacatactggtctggatgacatctccagggcaaaaggaattgcaggaaaagtcattcaggaggtgaataaaaaataccgctgtctggagattgatcttgatggtatatacaaaagaatgctgcttctcaaaaagaagaaatatgctgccattaaagttgcattagatggtagcttacgagagaacattgagcgcaagggacttgatatggtcagacgtgactggagtttgctgtcaaaagaaattggagatttttgcctgaatcaaattttgtctggagggtcatgtgatgacgttatcgagtcaatccatagttctctcgtgcaggtgcaagagcagatgagaggtggccaaacagaattagaaaaatatatcattacaaagagcttaacaaaagcaccagaagattatccagatgctaaaaaccaacctcatgttcaggttgctttaagactgaagcaaaatggttattctgggtgctctgcaggtgatacagttccctatataatttgctctcaacaggattcagagagtacacattcaggaggaatagctcaaagagctagacatccagaggagctgaaaagaaaccctgacaaatggatgattgatattgactactatttatcgcagcagattcatcctgtagtttcccgtctgtgtgcttcgatccagggcaccagcccagctcgcctggctgaatgccttgggcttgattcatccaagttccaatcaagattgactgagtctgataatcaagatacgtctagcatgctcttgtctgtaattgatgatgaagatgagagatatcgtggttgtgagcccctgcgattatcatgcccaagctgttctactacctttgactgcccccctgtgtctagtctgattattggttctagctctggaaatgtatcaaatccaaatgaaggaaatgatgcttccattaatttttggcgtcggatgcggtgcccaagatgtccagatgacactgatgagtccagagtttctcctgcagtacttgcaaaccagatgaaaaggcaggctgatagtttcatcaatctatattataaaggtttactgatgtgtgatgatgagggttgcaaatactcaacgcacagtgtgaaccttagagtgatgggggactctgagagaggaaccatctgccccaactacccacgctgcaatggccacctagtgagacagtatacggaggcagatctatacaggcaattgtcatacttttgctatgtagttgatgcaactcgatgtcttgagaagttggaccagaaggcgcggcttccttttgagaaagaatttgcggcattaagccaaactattaacttggcattaatggaggttcagaaaatccgagacagatgtgcatttggctgggttcagttgaaggatcttgcaatatcaatctga</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>EKVHRLNAKIKTEDSRNGDMASATAGWMKICGDGDNAGGEGAVA ANSNTGVDESSEFELKDGALPFYILDAYEEPFGANSGTVYLFGKVEVGKRFHSCCVVV KNMQRCIYAIPSSSIFPRDTISRLEKNSTTSDSSPSLRASLHELASGLKSEIADKLSD FNVSNFAMTPVKRNYAFERTDLPNGEQYVLKINYPYKDPALPTDLRGQHFHALLGTNN SALELLLIKRKIKGPSWLSISKFLACPATQRVSWCKFEVTVDSPKDISVLMTSTTLEV PPVVVAAVNLKTIINEKHNVHEIVSASVICCHRVKIDSPMRSEDWQKRGMLSHFTVMR KLEGSIFPIGLSKESSDRNQKAGSNVLALESSERALLNRLMIELSKLDCDVLVGHNIS GFDLDVLLHRAQTCKVPSNMWSKIGRLRRSVMPRLTKGNTLYGSGASPGIMSCIAGRL LCDTYLCSRDLLKEVSYSLTQLAETQLKKERKEVSPHDIPPMFQSSGALLKLVEYGET DACLALELMFHLSVLPLTRQLTNISGNLWGKTLQGSRAQRVEYLLLHAFHARKFIVPD KFARSKEFNSTKRKMNPDTEAARPDEADPSIDDEGHHVDQGKTKKGPSYAGGLVLEPK KGLYDKYVLLLDFNSLYPSIIQEYNICFTTVDRSADGNVPNLPASKTTGVLPELLKSL VERRRMVKSWLKTASGLKRQQFDIQQQALKLTANSMYGCLGFSNSRFYAKPLAELITL QGREILQNTVDLVQNNLNLEVIYGDTDSIMIHTGLDDISRAKGIAGKVIQEVNKKYRC LEIDLDGIYKRMLLLKKKKYAAIKVALDGSLRENIERKGLDMVRRDWSLLSKEIGDFC LNQILSGGSCDDVIESIHSSLVQVQEQMRGGQTELEKYIITKSLTKAPEDYPDAKNQP HVQVALRLKQNGYSGCSAGDTVPYIICSQQDSESTHSGGIAQRARHPEELKRNPDKWM IDIDYYLSQQIHPVVSRLCASIQGTSPARLAECLGLDSSKFQSRLTESDNQDTSSMLL SVIDDEDERYRGCEPLRLSCPSCSTTFDCPPVSSLIIGSSSGNVSNPNEGNDASINFW RRMRCPRCPDDTDESRVSPAVLANQMKRQADSFINLYYKGLLMCDDEGCKYSTHSVNL RVMGDSERGTICPNYPRCNGHLVRQYTEADLYRQLSYFCYVVDATRCLEKLDQKARLP FEKEFAALSQTINLALMEVQKIRDRCAFGWVQLKDLAISI</aaseq>
Gene 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External Link(s)	NCBI Gene:Os01g0868300, RefSeq:Os01g0868300