Os01g0872700

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Structured Information

Gene Name	Os01g0872700
Description	Putative 5-3 exonuclease domain containing protein
Version	NM_001051482.1 GI:115441334 GeneID:4324952
Length	7797 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os01g0872700, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 1
Location	Chromosome 1:39600841..39608637
Sequence Coding Region	39601233..39601899,39601981..39602087,39602176..39602251,39602335..39602439,39602639..39602796 ,39602899..39602973,39603054..39603094,39603182..39603258,39603343..39603471 ,39603578..39603648,39603825..39603920,39604077..39604172,39604269..39604541 ,39605459..39605545,39605689..39605766,39605938..39606102,39606210..39606356 ,39606509..39606571,39606670..39606789,39606940..39607131,39607260..39607336 ,39607682..39607784,39608272..39608475
Expression	GEO Profiles:Os01g0872700
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008394:39600841..39608637 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008394:39600841..39608637 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atgggtgtgccggcgttctaccggtggctggcggagaagtacccgatggtggtggtggacgtggtggaggaggaggcggtggagatcgagggcgtcaaggtgcccgtcgacacctccaagcccaaccccaacggcctcgagttcgacaacctctacctcgacatgaacgggatcattcacccctgcttccaccccgaggataggccctctccgacaacattcgctgaggttttccagtgcatgtttgattatatcgataggctatttgtcatggttcgccctcggaagcttatgtatatggccattgatggtgttgctcctcgtgccaagatgaaccagcaacgctctagacgattcagagctgcaaaagatgctgctgatgcggccgcagaagaagagaggttgcgtgaagagtttgagagggaaggcagaaaacttccaccaaaacagcaatctcaaacatgtgattctaacgttattactccaggaacagagtttatggctgttttatcgattgctttgcagtactacatccatctcaggttgaattatgatcctggatggaaacaagttaaagttattctttctgatgccaatgttcctggtgaaggggaacataaaattatgtcctacattcgcggtcaacggaatctccctggatttaacccaaatactcgccattgtttgtatggcctggatgcagacctgatcatgttagctcttgcaacacacgaagtacatttctctatactgagagaggtagtttatacacctggacagcaggacaaatgcttcttgtgtggtcaggttggacatctagcagcaaactgtgaaggaaaggttaagagaaaagctggggagtttgatgaaaaaggtgaagctattgttccaaagaaaccttaccagttcttgaatatatggaccctccgggagtacttagaatatgagttcagaatgcagaatccacctttcccgattgactttgaacgcatcgttgatgatttcatcttcatgtgtttttttgttggcaatgattttcttccacatatgccaacattagagattcgtgagggagctattaacttgctaatggctgtatacaagaaggaatttccttccatgggtggctatctaactgatgcttgcacgccggatctgaataaagttgaacactttattcaagcagttggctcctacgaggataaaatatttcagaaaagagctcgtttgcatcagcgtcaagctgaaaggataaaacgagaaaaggcccaagcaaaacgaggggatgacctggatccccatgtcagggatgatcttattgtacctgttgcacgcttccaagggtctcgccttgcatctggacctgtgccttcaccatatgaacaaaatggatctgacaaaaacaatgggggaaaaaatagtcgtgctcggaaagctgcacgggtatcatcgtcaggttcaagcattgcggctgctattgttgaagctgaaaatgaccttgaagcacaggaacgcgaaaacaaggaagatttgaagacaatgcttaaagatgcacttcgtgagaaatctgatgtttttaattctgaaaatccagaggaggacaagataaaacttggagaaccaggatggagggaaaggtactatgaagagaagtttggagcaagaacacccgggcagattgaagaaatacgcagagatgtcgttctgaaatatactgaaggtttgtgttgggtaatgcactactattatgaaggtgtctgctcgtggcaatggttttacccttaccattatgctccttttgcttcggatttgagtggtctaggtcaactcaatataacttttgaacttgggtcaccattcaaaccgtttgatcaacttatgggagttttcccagctgctagctcccatgcactccctgtacagtatcggcaattgatgacagatgcaaattcaccaataattgatttttatccaactgattttgaagtagatatgaatgggaagaggtattcatggcaggggatagcaaaactgcccttcattgatgaagcccggttgctagctgaaattaaaaaagttgagcatactttgacgcctgaagaagcaaggagaaacagtatcatgttcaatatgctttttgtgaatggctcccatccactttcgccttatatctactccctcaacagcaaatttggacacctacctgacagagagcgaaatgaaattaaagaaaagattgatccttcttctagtggaggaatgaatggttacatctcactttgtagtggggatccgtgccctcctgtcttcaggtctcctgttgatgggttggaggatatcatggacaatcaagtgatatgtacaatctacaagcttccggattctcataagcacatcgctcgtccacctgttggtgtaatcatacccaagaagactgttgaagctactgacctgaaaccaccacctgtgctatggcatgaagacagtggtaggaggcctcatgataataacaacaggaggccttatgaaaacagcaacaggcaaaacccagctggagcaatatctggccgccaacttggggaagctgcccaccgacttgtggtgaacagcttgaatgctcggagtggcggacaatacaataccccatcgatgccatatcaaaccataatgaatggcatgccttatccaaatgggattccaccaaggatggagcagcctgctcctggctggcatgttcctggtgatctaccaaatggtcaggtaccaccagcttatgcatcatcatcaggtcattatcagaacgataggtctgggccttctcagtatggacgagataaccatggaaggtacccatatgcaagagacaaccaccatgattcaagaggaagggttccaccataccatcagagcggtggaaactcgtatcaatcacattctgctccatcagcaggtcctggacggtatgcgcaacccccaccatatgctggggggtatggtaggagctaccagcctgcaccgtatggaggtggtcagcagtggcagcagcagcagcaacaaccttatggctcctatgctgggtcagggccttatgggggtggggcacctcctgcaaggcctaattcacgaccacagcagtcgcagaaccgttacaataccttagataggaattctaacaggagacctccaccaggtcatgggcgacactaa</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MGVPAFYRWLAEKYPMVVVDVVEEEAVEIEGVKVPVDTSKPNPN GLEFDNLYLDMNGIIHPCFHPEDRPSPTTFAEVFQCMFDYIDRLFVMVRPRKLMYMAI DGVAPRAKMNQQRSRRFRAAKDAADAAAEEERLREEFEREGRKLPPKQQSQTCDSNVI TPGTEFMAVLSIALQYYIHLRLNYDPGWKQVKVILSDANVPGEGEHKIMSYIRGQRNL PGFNPNTRHCLYGLDADLIMLALATHEVHFSILREVVYTPGQQDKCFLCGQVGHLAAN CEGKVKRKAGEFDEKGEAIVPKKPYQFLNIWTLREYLEYEFRMQNPPFPIDFERIVDD FIFMCFFVGNDFLPHMPTLEIREGAINLLMAVYKKEFPSMGGYLTDACTPDLNKVEHF IQAVGSYEDKIFQKRARLHQRQAERIKREKAQAKRGDDLDPHVRDDLIVPVARFQGSR LASGPVPSPYEQNGSDKNNGGKNSRARKAARVSSSGSSIAAAIVEAENDLEAQERENK EDLKTMLKDALREKSDVFNSENPEEDKIKLGEPGWRERYYEEKFGARTPGQIEEIRRD VVLKYTEGLCWVMHYYYEGVCSWQWFYPYHYAPFASDLSGLGQLNITFELGSPFKPFD QLMGVFPAASSHALPVQYRQLMTDANSPIIDFYPTDFEVDMNGKRYSWQGIAKLPFID EARLLAEIKKVEHTLTPEEARRNSIMFNMLFVNGSHPLSPYIYSLNSKFGHLPDRERN EIKEKIDPSSSGGMNGYISLCSGDPCPPVFRSPVDGLEDIMDNQVICTIYKLPDSHKH IARPPVGVIIPKKTVEATDLKPPPVLWHEDSGRRPHDNNNRRPYENSNRQNPAGAISG RQLGEAAHRLVVNSLNARSGGQYNTPSMPYQTIMNGMPYPNGIPPRMEQPAPGWHVPG DLPNGQVPPAYASSSGHYQNDRSGPSQYGRDNHGRYPYARDNHHDSRGRVPPYHQSGG NSYQSHSAPSAGPGRYAQPPPYAGGYGRSYQPAPYGGGQQWQQQQQQPYGSYAGSGPY GGGAPPARPNSRPQQSQNRYNTLDRNSNRRPPPGHGRH</aaseq>
Gene Sequence	<dnaseqindica>6739..7405#6551..6657#6387..6462#6199..6303#5842..5999#5665..5739#5544..5584#5380..5456#5167..5295#4990..5060#4718..4813#4466..4561#4097..4369#3093..3179#2872..2949#2536..2700#2282..2428#2067..2129#1849..1968#1507..1698#1302..1378#854..956#163..366#cctcccctccccgcccgcgtggcctacccccttcgttagggtttcgcgccctcttccctctctcccttcccctcggccgtcggcccggctcctcgcggcggcggcggcggcggctcgctttctagggttagggttagggttccggcggcggaggaggaggagatgggtgtgccggcgttctaccggtggctggcggagaagtacccgatggtggtggtggacgtggtggaggaggaggcggtggagatcgagggcgtcaaggtgcccgtcgacacctccaagcccaaccccaacggcctcgagttcgacaacctctacctcgacatgaacgggatcattcacccctgcttccaccccgaggatagggtacgtcgatgttttttttttgggcgtttctgtttgcgtagctctggggtttgtttgggtgttcgtatggtgtccctccgctgtacaggtgatggatttgtgtatgcctgattgatgtacgacggagctgtggcagaggagatagtttggtgaaatgattttgtagcttcctgttttgtaatttacctgagcgttaaacataattttgcaaataaccacaaactgctaaattgccacatgagccatcttaggatgaggatgctgctgtagtttaatcttcaaactctgcatcgcaaatttgttaatttgcctttttgagttatgtttattttcattcggtggacgcaccagtttagactgcatgatgctactctgtcattgccctgcatttctcttcgaacaaatattttaatgtttactgattgctcaagtgctttctgatttctctgctgaccatgatttcttgctattgtgttatcttttacagccctctccgacaacattcgctgaggttttccagtgcatgtttgattatatcgataggctatttgtcatggttcgccctcggaagcttatgtatatggccattggtacgtataacatctgatgtgtaggaattctcttactacctttttccttcctaaaggattaggagtgtttagtgtcattgctcttttacctgttggtcatcatcatagaacagcttgccatactgccaactaatgcctttgttgaagttagctatatactatgacgagtcatttacatgagttttgaatcaggcataatcctcacccgtaaactatttatttggcagcatagtacctgtgcttgtaaacttttgctgtccagggtcctgttttttaccacatatgttttgttcttgtcgatggtttcttgttgatattttgtattatcttacaatggttttacagatggtgttgctcctcgtgccaagatgaaccagcaacgctctagacgattcagagctgcaaaagatgctgctgatgcggtcagtattctagtgaaattatcttcctttatgcagtgtatgataatatgtcgacatttaaattcccattcatcgacggcttcaaggggtagaattgcatttatggcttattatttttctatctccaggccgcagaagaagagaggttgcgtgaagagtttgagagggaaggcagaaaacttccaccaaaacagcaatctcaaacatgtgattctaacgttattactccaggaacagagtttatggctgttttatcgattgctttgcagtactacatccatctcaggttgaattatgatcctggatggaaacaagttaaagtaagcatggttttaagcctatcagttttgttttggcattacattctgtcagtatgttccatatgttaacttcacaaactctaaggtttacattgattggaaaggcaagtatgaaaaagtcatgtgtgttctggttaaattcttttgaaggttattctttctgatgccaatgttcctggtgaaggggaacataaaattatgtcctacattcgcggtcaacggaatctccctggatttaacccaaatactcgccattgtttgtatggcctggtatgttctataaacctattttttatatattttaattgggcaatgtttcttctgttggtcctgctaatgcatttttttatatatactcttgaatgcaggatgcagacctgatcatgttagctcttgcaacacacgaagtacatttctctatactgagagaggttagctctcctcaggacctagaatcaatgcctttttgtgtaaatacattttaccatgttatgctaactaaaagagcggattagttccttatgctttcttgtttatgttatttgttttctctctcttctgactatattttggtttcttgcaggtagtttatacacctggacagcaggacaaatgcttcttgtgtggtcaggttggacatctagcagcaaactgtgaaggaaaggttaagagaaaagctggggagtttgatgaaaaaggtgaagctattgttccaaagaaaccttaccaggtaatattgtctctttcctttgttgcaatttgtggtctaataagtacactttatgaatttgctgaggaccttgttttattttaattgctccttgtgtgacattgcagttcttgaatatatggaccctccgggagtacttagaatatgagttcagaatgcagaatccacctttcccgattgactttgaacgcatcgttgatgatttcatcttcatgtgtttttttgttggcaatgattttcttccacatatgccaacattagagattcgtgaggtttgttacctgttgtaaagctaaatgttttactggatatcttcgtttgaagctagtagctatgaaattatcagattactacttactagtaaattggatatttattttattcctgcttacagttctcttgtagatttgttattgcatgatgttaacttggcttttctgcagggagctattaacttgctaatggctgtatacaagaaggaatttccttccatgggtggctatctaactgatgcttgcacggtaattaaaaagccactcctattgaagttacccatttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtttgcagaaagtagtattttattccaactgatccaagttggtatttcagtattaacatgtttttcatctgttacattagccggatctgaataaagttgaacactttattcaagcagttggctcctacgaggataaaatatttcagaaaagagctcgtttgcatcaggtgattttattttattttactccttagccttttcaattcccttgttatcatgttatcatctggcacctaatctttatttttactccatgccactatgcgccaaggggttcaccattagctatcagttgaaatttctgtttgtatttggcaatgtaatttccttatttgcaaagttcattgagtgtttattttgatatactggtaatttcagcctgatgtactgcgttatatcttctatgacatgttgtctataaacttccttcaaattggaggtagtgattgtgaatttgccacctgccaccaatagtccaacacactgcatttcttactaattgctccgtgtattgttttaatattacaccgtatatcttctctatgctgctttcttcttagctagccttgtaaattcacaatataacatggaaaggttcacaatgaccagataatccttgacatgtaggttagtgtttttttttttacaatacctctaaagaagttaattctacaattagcatgtgtgaacactgccaatccttgaaaagaagtaaatgctatgctccgtagaaatcacattatgttttgaacaatattgagacatttttgattcccatttagctagtaaaatcagaaaaaccagttgattgttcaagtatcttctaaactagttatttgttcaaggttttctcccccatactttcccctagaatttaaatgttacccatggaaaacttctgcatgcagcgtaccacgtccgtatggcttaggcatgttccatcattatttatccttagttatgcaaagccttctgatatgatcaacatgaactcttgagaaataaatgtttgcaacactattctatatatctggcggtcaaatattcaacaagtcattgatgttaagttcatatccttgtgtagcgtcaagctgaaaggataaaacgagaaaaggcccaagcaaaacgaggggatgacctggatccccatgtcagggatgatcttattgtacctgttgcacgcttccaagggtctcgccttgcatctggacctgtgccttcaccatatgaacaaaatggatctgacaaaaacaatgggggaaaaaatagtcgtgctcggaaagctgcacgggtatcatcgtcaggttcaagcattgcggctgctattgttgaagctgaaaatgaccttgaagcacaggtagctcatttcatctggctccaggagaatttatatttgtttttgaagaaacatttttgtgattttatctgacacttgttcctgtatctttcttaggaacgcgaaaacaaggaagatttgaagacaatgcttaaagatgcacttcgtgagaaatctgatgtttttaattctgaaaatccagaggaggacaaggttagtgtttacacacaagtcatgccactgctgtgctggaccttattatacgtttaattaaagtgtttactttccttttattttaactcatttactttctattagctatttgtttaaatgttttcaatttagtcataacattgtttgtcttctcagataaaacttgg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External Link(s)	NCBI Gene:Os01g0872700, RefSeq:Os01g0872700