Os01g0928400

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os01g0928400

Description

Conserved hypothetical protein

Version

NM_001051811.1 GI:115441992 GeneID:4326963

Length

6820 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os01g0928400, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:42538850..42545669

Sequence Coding Region

42539144..42539254,42543598..42543673,42544179..42544229,42544633..42545246

Expression

GEO Profiles:Os01g0928400

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggtgccagctaggagccgcctgttccaccatgacagcagcagcagcagcaagaggggcggcggcaactcgtcgtcgtcctgtactccccaatactgcatcgccacccagctcgacgccgccgccgccgccgcgccggcgcgtagacgtcaccaccaccaccaccagctagccatggcgccgcccgaagacgacgcggccgccggcacgagctctcgtggcggcggtgcaggagacgacgacgacggcgacaaggactggctccagctcggcctcgccgccgcggcgccgaccgccaccgctccggcggcggcggcggcgccgtcgtcgtctacgcccacggcgccggagctggacgtgttcgccgccaagcagtacaacgggaggccgccgctgttcccgctgccgatcttgaggagctaccaccaccaccaccaccaccagtacggccacggcggcggccggtgtccgccgccgtcgttcttcccgttcgcgcggccgttgaggagctccggcgatctccccggcgtgatgagggtcatcagcccgccgcgaagagcggcggctgctgatgctgccggcttgtggctgacacttcaggcatcccctgatcaatttcgagagcccattttgccccagataccaaagagctaccttagaatcaaggatagcaacatgaaggtggaagtggtgatgaagtacttggccggcaagctaggactcacacaatctcatcttcagagggcagcttcttcctcccttcttgctggtcaaaaatgtcagagacagcatctggtgctcatcactgcgaccaagctgcagggaagacgacgacggcgacggcgaggatga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MVPARSRLFHHDSSSSSKRGGGNSSSSCTPQYCIATQLDAAAAA APARRRHHHHHQLAMAPPEDDAAAGTSSRGGGAGDDDDGDKDWLQLGLAAAAPTATAP AAAAAPSSSTPTAPELDVFAAKQYNGRPPLFPLPILRSYHHHHHHQYGHGGGRCPPPS FFPFARPLRSSGDLPGVMRVISPPRRAAAADAAGLWLTLQASPDQFREPILPQIPKSY LRIKDSNMKVEVVMKYLAGKLGLTQSHLQRAASSSLLAGQKCQRQHLVLITATKLQGR RRRRRRG</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>6416..6526#1997..2072#1441..1491#424..1037#catcagctagctagctctcctcctcttctccttgtctcttctccttcgagtttgctcccctacaggagagaaaaggattcatcacatctcatctcacaacccctttcatcgatctctcctagattatctctctctccaatttgctccaatctttaatttcctgcctttgaagctatagctacagccatggaggatgtctgtctcatccatggcgtgtagctagctagtttctttctttgcacttcttgagttcttgttaattactaaaggattgcggccatggatggagatggtggagctcgtcgtggtgtaatcggatgagtgcgtgagagacatgagacgtgcatctagctgcaggatcgaggtcagcagcagcagcaggttgtcgttgtcgtcgtcgtcgccgccgccgccgccgccgccatggtgccagctaggagccgcctgttccaccatgacagcagcagcagcagcaagaggggcggcggcaactcgtcgtcgtcctgtactccccaatactgcatcgccacccagctcgacgccgccgccgccgccgcgccggcgcgtagacgtcaccaccaccaccaccagctagccatggcgccgcccgaagacgacgcggccgccggcacgagctctcgtggcggcggtgcaggagacgacgacgacggcgacaaggactggctccagctcggcctcgccgccgcggcgccgaccgccaccgctccggcggcggcggcggcgccgtcgtcgtctacgcccacggcgccggagctggacgtgttcgccgccaagcagtacaacgggaggccgccgctgttcccgctgccgatcttgaggagctaccaccaccaccaccaccaccagtacggccacggcggcggccggtgtccgccgccgtcgttcttcccgttcgcgcggccgttgaggagctccggcgatctccccggcgtgatgagggtcatcagcccgccgcgaagagcggcggctgctgatgctgccggcttgtggctgacacttcaggcatcccctgatcagtaagtgtatatacatacatacatacatatatatatatatatatatatatatacatatatatttatttatttatttatttatttatttatttacatgtaagagatgtaatccatttccattattttaaaaaaaattacatgtaaacttcctcaaaaaaaaattgcatgtaaacttgtgatcattaacatgttgatccattccatataagattggttatatgcatacatgcaaattaaagtagctagtatatgcacctcatgacaacaatgcaaataagcccaatacagatatatgtgtagatattgtttatctgcacaagctagcttttatatatctaaatttatcttgtgtttgtaaccatttagctcttaataatgtctaatcttgttttcatgtttgcagatttcgagagcccattttgccccagataccaaagagctaccttagaatcaagtaagttaattatgtatatcttcaaaaaaaatcatgcttaattctctcctttaatttcaaagtacaaacttaaattaaatgcataacaatccatgtccatttagtttgcatatatattcatgtgtgagtaattttacggttcttgaggaggtaccatgaggtaccaaaaatttagtgtaaaatttggtacctcatggtatttaggtaccaatagataccaaatttacaataaaaaaagtggtacctcatgatacctcctcaaggaccataaaattgctcattcatgtgtagctatcatcactgtgtagcttgtttctgcaaggcatatatatctagctaactagtagtctttaagtttctatataggtcagtctagctaggtaccaatcaaataaagtttttctcttgatttataatgtcttatatggaattttcaaaggtcctagttacataaaacacacattaagataatgaatgaatatatatacttgcacatttttcacagggatagcaacatgaaggtggaagtggtgatgaagtacttggccggcaagctaggactcacacaatctcatcttcaggtacaataatccggaattagtcaacacctttcttcagctacaaattaagcatgcatatatactttccttttctttcactattaattaattaattactacaccttgattatataattttctctaaataaaatattaatgatgatgatatttaatttgcttgttgattgtcgcataaaatgattggaagaagcagcgatcgagtgatcaatagtgaatagtgagcagttgttgaatttgcactgcaaggtagctagtattctcttgtgctgagttgccgcatatataggttggcaattaggggggatcatgaaaggaacattatacctaatcgaaagtaccacattgagctaaggttgggatctctttgatttggtactagacaaaagcaataggtcacaggcccatatcagcatgcatgtagtatatagttaccaaaataccatcatgctgttctgtatatttgtatccatatgcatcatgcaagttcattaattcgatctcttagattcggtaggtaatttggaccataattagatcagttccctgaagaggccttatggctgaattttcatatagctttggcaaattttgaagaaaaaaaatatttgctccctccaaaggaaaaaaaaaacttaattttaggtgtttctggcttcaactcgtttgtgacgacaacatttatgtgtaggtcaatttttagcggtacaaattaattaatatttaccatggaaaaaatacatgtagctagtagcatcccacaaatgaaagtatgaaaccaatgctaaatacgtttattctgctgtttgtaaactttgtatcatccaaacataaaagagctagatcatgaaattaattttggacatgttttgtacaacagcaccaccctttagtatataacatttagttgcaaaaaaaaaataacttagacggcttccaatatttttttgaaccatttcacgaattcacaaaatatatttccactgcattacattgagattaaataactgatcattgagtaataagtaagtatacaatagcaacatatatatggtgtttatgttatatatgcatgagctgggtatagtattgttttctctctccacttccactatatacatttcccggcatgcatgcagaatatttgttctttttttctattgatatatactccctccgtttcgaaatgtttgacaccgttgactttttagcacatgtttgaccgttcgtcttattcaaaaacttttataaaatatgtaaaattatatgcctacatgaaaatatatttaacaatgaatcaaatgatagggaaaaaattaataattacttaaattttttgaataagatgaacggtcaaacatgtgctaaaaagtcaacggcgtcaaacatttcgaaacggagggagtacatgatatatgcaaaaacaagaaatatataggggagctaattaattacgaagtgtataataggtagccagctggttggtagatagtaatacatggacgtagcaacaatagaattaagtgtattaacattttgcaacattaactattattgggtcaaccacacaggaacaaaagcagaacagttgaactgtcaatgtatacgtgttgtacattatggcaatatggctgtagagccctcagctcgatccattacacgcagcactaaactagttctaccaacttattaattctcattattcactaggtgaaaaatctagatcacctccattaattaattgttcacagatataaagtgattttttgacatcaaaagtcaactagctctcactatttttttaatctaaattttatcgtcatctacccaaaagataccgaggggctcccatatttattatgacatgtttaattcgcattcatcatttttcatattaatttgcggctatgcactcaaataaattgtatgtcttgattgtatgaattcttcgtccacatgaaaaatatatataaataaaaaagggaattataatcttaataaaaggagggtttcaaatgtacaacatccacaaattatattatatatatttaccatagactttgtggaagtaattctttgaaaaggttttgttgaaaattaacgtttgaaaaccatatagggaataatcactcttgattggaagcctggaagggcatatgattttcgacatatatatatatttaatcatgttagttaaatagttgtctaatttaattaacagccggatatcgacaactcgatgtgatcgccttaattaccttttactatactatactaaattcatcattgggcgtgggagtataaggggaatatatttttttcttatattaattaatttatgcattattaataaggggaatatggtgagaccgagtagcaatacgtatatatgtcatcgtcatgctttcgtatatactacgtatcaatcacgttgcgttgtccatcatacatacagcaagtcagcaatgcaaacctccgttcttaaagaaatgctacgtcatataatacttgcatgtagtcgtcacatctcgaaatcttaaatcatcaataaaaaatatcggtattttaaagtatgaaaaattatatttggtagattaatttgtaaatgaaagctcttttactgtatagcttatttttaaatattgcttatacaaatataaagttttaggaagtgcatctacatctttcgagaacggagataggagtagcagttaattaggccgaccaattaattaacagaaaacctatgagacagtacctgatacctgatacatgttgtggtactacctgcatagtacccgatacctgttatccggtacctgtgatatctaggacttagatacatgtgatacgcgtgcaagagaatagttaata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External Link(s)

NCBI Gene:Os01g0928400, RefSeq:Os01g0928400