Os01g0944200
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0944200 |
|---|---|
| Description |
Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold domain containing protein |
| Version |
NM_001051905.1 GI:115442180 GeneID:4326061 |
| Length |
9481 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0944200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:43305039..43314519 |
| Sequence Coding Region |
43312105..43312831,43313570..43314043,43314130..43314224 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:43305039..43314519 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgaaaactttcaaccaaagaacaaataacctgttgaagaagtctccacgctacctcagtgccctagatgtgaccacagaaaaggaaatcctgctggaagatgaatggactttgttccttgagcacatctttaaacatagggtcattgttgtagatgattggacaaagtgctacgggaccgttcagaccttcctccactcgagtgatgctgaatcatgcagtgattctttcaagggggagtgtgatgcttcattctgtgagcaaactggaaaggcaaaacttgcctttgtcatctttaaagagggtaaacttgtctgggctgaggttttccatgaggtaccttgcaagagtgttgtggaggcagaggctttggcagtcatagctctcctcttcaagcttattgaccttaacttgttaagagggactgtttggaccgacaacaaggtctgttataatgtgctgaatggtgaatatgagataaaggttgatgatcccaacaggtcgctgtttctgtttctgaggagtttgagaggtcgctttgagtccttgaccccggtctggaaacccagagaactactgctgatcccagatcgtctggttagtatggttgatgaccccctgatatcaaggaatagattggtactcagtatactggaaaaaacagttccaattcttagtcagccgcagttcaggatatcatggagcagctatctgcgaacaatttttgacaaacgtgatggtggaaaacaaatttctaacacaacaaatgaaattaaggaatcagatgaatccgaggattcaatctgttgggttaaggctgatgatgaagaagctgaaattgcttcctttcttgaaattatgaaaactttttcagcccatcgcttgcttattgtggttgacaactttgaagacaaatctcctcattatcaaaagttaattaaggatctctctcaaaagttttacacgtgttggatgagtaaagaaggcagtgtcacaattgtggagtatgactctcctaacactgaagagaaagagaccaaaagattggtggttatgtttggtgggacaatggcactggatgaatatatccaccaaaaaaatctctgtacagttgttttggtgaagacatctgagattaagctgctaagagatgctggaatcgaagaaataagtgctaagacacttctgagttttcgcaacatcaaagcaaaaccagttgtgccaaagaaacctcgggaggatgaggatctagagaaggggggggggggggggggggggagggcaggtggtgaatag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MKTFNQRTNNLLKKSPRYLSALDVTTEKEILLEDEWTLFLEHIF KHRVIVVDDWTKCYGTVQTFLHSSDAESCSDSFKGECDASFCEQTGKAKLAFVIFKEG KLVWAEVFHEVPCKSVVEAEALAVIALLFKLIDLNLLRGTVWTDNKVCYNVLNGEYEI KVDDPNRSLFLFLRSLRGRFESLTPVWKPRELLLIPDRLVSMVDDPLISRNRLVLSIL EKTVPILSQPQFRISWSSYLRTIFDKRDGGKQISNTTNEIKESDESEDSICWVKADDE EAEIASFLEIMKTFSAHRLLIVVDNFEDKSPHYQKLIKDLSQKFYTCWMSKEGSVTIV EYDSPNTEEKETKRLVVMFGGTMALDEYIHQKNLCTVVLVKTSEIKLLRDAGIEEISA KTLLSFRNIKAKPVVPKKPREDEDLEKGGGGGGGRAGGE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>7067..7793#8532..9005#9092..9186#gcacacgttgtactacaaccctagcagtcagctctgctttccccaacgcgttctcaaccctactccatcccacttcgttgtcatctctgatgaatcttttctctcctgctgcaggctgcgtgtgcgcggaggaaaggaatctttatggagccaaaatttcgcagagataggaatggaatccttacgaagccaaaatttcgcagagaggaggatatctgtttgaggaaaaaaaggacggggtctcccttcctgcaacagagtacggatgaagtccaacatatgattagtgaagtactactagtagcctatttgctctgctttcatttcttctctggtgtttgattgattgggtgtgttgatgatttctcatcgtttcaagatccagatgtggtgcacctacagatgcagtctagttgcaaaccctagctgctaggctgtgtttagttcacgtcaaaattgaaagtttggttgaaattggaacgatgtgacgggaaagttgtaagtctatgtgtgtaggaaagttttgatgtgatcgaaaaagttgagattttaaagaaaaattttgaaactaaacacagccctagtatcagatcgttagtgtttaatactactactatttcttctcgcccggcggttttatttttttgctttcatttggttgctcagttggaccgatggatttgccgattcatattcaacattattataagtactactccaagcatggcaacaatcagtctgattggttggtcggctggattgattgagctgtggtctgtggattattattatcattatcctatttttacttgtaacctatatttcccctggtttacatacacagccagtgcgcttttagcagtatgttttacatgctttactttacattaatcgtaatttttttttttttgcagaccgcgtgatgatgttaccgtttgatgtgacgtaccttagtttgtacgcgagattcaacaagatgaaggtaattaaacgaattacttctcttgtgctatgtctactactcctgtagtacatgtgttgcactgtattgcactgtattgacccagtaattggattgtgaatacgctccatatggggcgtccaatctgggggacaaaaacaggcgccccacatagctattcattcactcatttctctctcccgtatctcactcatctctctaacttatcttcctgctcgttttctctcctctactttactctttctctctctcaccaaggctttgatgtgaggacgagggcgcagcgtccccgtcactacttaaaaaaacgatttttcatgacgacacccttttatttttgccggcggattaatgaaacaaacgctagtaaaaacatatgggaggattctcgctcatgagccgccagcgaaaaccgattttcgctagcggaaacttaggaggtacgtcataaaaaataacactattttttaggcggacctcttaagtgtggcggtagagcaccgctcgtaaaaaaaaataaatcccattgccccaccacccacagcccaccgctcctaactacccaccgcgcattggtttcaattttcgcaaacagtattctgaccgcttgtggaaagtaaggattttcactggcctttacctgctggcgcgcctgtgcaaatgtttttaggccgtcagtaaaaatgttttttctagtagtgcgtagcaccgccaccgaagatggcgatggagaggacgcccgcagcagcggcaaagaggaggcgtggggcagcccatcgtggctaaggaagttgaagtacgtatcaccgggtcatcgcgttgcagcacttgaggttgtcgaaggaagcctgatccaactaacggagaggaggaagaagccagacctagccagcattgattttgtgaaatttccagtgtttcagtcaatgcatttttgatgtttcttttgttggattgaaatgttgtaccaagtattttaatgttgtttcattattttgtcttcgattcattgcagatgtgtagatatttttgattcactgcagatgtgttgatatttcaccaaattgaatttgaatgttttgtgtgagaccaaaatgtttcaggcctaaggccctaattgtagtgtatttttatcactatttctttcatttagctcgcaatctaaggctttaaaattcattaggtggaacgtcttgtttttgctgtttaagggcattagcattgcgatgcattgtgtgcacgtactactatgcatctatgccacacgggttgggtgcttttttatacaactagtaacatgtaaaagtgataagggcttagtatcacattccttgctgtgataattgcaaatcaaaccttgtatttttcgtgggctgtcctacagcagacaattccatactatggtacggtgcgctcgctcatagacgggtatcaatttgatttgttgtttttacgatgctgaacaattttatctatctgagttccaccgcataaatatgtaaatagagatgttatatctgtggatgggtaaccaacgaccacttccattcacgtgaagagttaaactaagtttaaattgtactgtcatgcatcaaaattaattgatcccccattacgtgacaccactttgaatcttctatcatgccgcaggggccggtgggcaaggcgtcacttatttgcggaggaaaggaaacccatgatgccaaaattttgcagataggagatggaggagattcagttcattgtgtgcaaaaaagacgactgatctccccctgcaaatgtgtacggaggaagcctatgattggtattacaactcgtattgatgagcactacaccatggtacagaggcagtaatatatccctacttctcttaaataaatttgctctgtttttgctgtgttcttttctccactgtttgattgtttctgctgatgatttttacatcttgcgtcccatggggaacccgtacgcctgcaaacgtccagtttctaggtagattaatactccgtccgtcccaaaaagaatcaacctaggttgagtttttttgggacgaagggagtactcccgatgaggtgcacctatatatagagcctgcttagtagagctctaactcctaaatttaactttaggagttgggtctagaggggagttgtggagctacctaaacccagctccacctctctagatcattttgtgagagctccacccagctccactccaattttaggtctccaattttaggtggagttgaaactgttttgttgagctctagctctagtgccacaatatacaatttctactaaaatatgacatgttttatatgatctgacatgtgggacgaaactctgatatgctcacataagtatggtcatatggtggatgaaagaactcatgaatcccccacgtgtcagatctgggttaaattggtcaattatttggtgttatgaaacagtagtgctaaaacttatgtggttttgtgtaacttggaccataataaataatactaacatcttcaatttgtcctaaaataagttcccaatgctccttcaaattgtctgaaaataagttcatctttaaagtaatcattgcattggaatatgcgaaagtagtgaataattgtattgaaagtagataaagcgagtaatagttgcattgggattttataaagtaggagtattgtagtctaaaataaacttattttgagatggaggcagtagtaatagcactccctatgaggtgcacctatagatgcagtctacatgccgtctagctggccatatatgagtgatttatattttttatagtttactattactccctttgttttattaaaatataaaaactcttgaagttataatattttgttaaaaaaagaacctactacttgtaaaaggtgatttttaccaccaacttacttaaaatgccttacccacactactacgaaagggtttttctgcaaaagggcgaaaagcatttttgcatgcggttgggccagccgcatgcacagaaaggtctgcgaaaatcgcgatctttgcatgcggctagggcaacagcatgcggttgcttacatgggccgcatgcaaaaataaaaatctaaaaatcgcaaaaaaaatcatgccggccacgcgtcggcgtcgtgggatcccgctgctcccaccgtttgctcccaccgctgcccgttcccgccgtcggatccaggcgggaggaggcccgccgccgttgctcccatcgaccaccagcgtcgtcgtggaagtcgcccacgcgtcgccgccaaccgctcctgccaacagatctaggctggaggaggctgagctgtcgccgttgccgccaccgccttgtcggcggcggggagggggggggacggagccggccgccgccaacggcgacagtgaggaggggatggtggtggtgccgccgcctactcgcctgatccgccgcccccgctgcgcgcccgccgtcgcagcagccgctccctagggcggtggatccaaccttcctgagggtggcgccgccaaatccgccgcccgccgacgccattgccacccgtcctgctcccggtcgtcgctgcccgctcttggagagagagcggggaggacataagaaaacgagagatagaagaggataggaagagagagagagaggggagactaaaatagagagagagagaggagatagaaataatttgaagtggtgggagggaaaagagagtggagggagatgaaaaaaaggggtgattttttttgtttgcgggtatcttaagtggtccgcatgtaaaaatgctaactcatttttccatgcgggctcttaagtgattcgcatgcaaaaacgagcttatttttacatacagacctcttaagagcccacatggaaaaaaaacgatttttccatatgggcgccttaaagagccgtatgcgaaaatgccgctcgatttttccagacgcgacaacttacggtccgtttgcaaaaatcat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|
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