Os01g0948100
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0948100 |
|---|---|
| Description |
ERCC4 domain containing protein |
| Version |
NM_001051925.1 GI:115442220 GeneID:4325837 |
| Length |
7500 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0948100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:43486037..43493536 |
| Sequence Coding Region |
43486158..43486360,43486874..43486971,43487102..43487180,43487333..43487419,43487509..43487634 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:43486037..43493536 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgccggaggcgaggcaactcaaggtgcacctccgggagaacgaggcggtcgcgcaatgcgtcctggagaagtggcgctcgatggaggagaagccgggcggcctcaaggagaacctggctcacacgctctacaaatcctaccgcaacgtctgcgccgccaaggagcccatccgatccctcaaggacctgtatcagatcaagggcgttgggaaatgggtcataaggcaactgaaaggatcctttccagagtctagtccagatttatctcccccggaaagtaatgcagcaggagaaaaggggaagaaagcaggagggtcaaagcgttatgtgccacagaagaattctgctgcttacgcgatactgatcacgctccatagggaaacaatcaatgggaagagtcatatgaagaagcaagagcttattgacgccactgaagcaagtggcctgtcacgaagtgcaattggtccagacaaaagtaaagcaaaaccaggggcttttgcaagttctcagaaggactggtacactggatggagctgcatgaaaacattgacatctaaaggactggttgcaaagtccggtaaccctgcaaagtatatgataactgaagaagggaaatcgactgctcttgaatgtctctcaaggtctgggttagatgatcatgcagcacctttggtgataaacagtgctcccgacacatctaatgcaagtcataagttgaataatatttgcatgacttcttttgttgagacatcatccggaccttctagggcaattggtagacccaaaacatctattgccaaccctgccactaagacatcaccagaagtgacatatttgacaagtcaagaatcactcaattacaactctgatgttagaactgctgagaactgtgctgaagaaatcattcttagtgactcagattctgaagaattatatacagagaactatcctctaataggttctgaagaatttactgagagggttgcccctccaatattgaatgcaagcaactctggcaagactactacaaattacagattctcagactgttcagcttctatttctcctcgttcgtctgaaggaacatttgagatgcagtcttctagtacaatgggtattgctgaattcaatatgctggacaatgatactgtatgtatggacaattctatactagccatgccacctcggcgatccagtaaaaattttcttgaagattatgaagttgtgttgatattggatgatcgtgaaaattttgggggtcgttcaagaaaaactgttgataacatacattcacaatttcgtgtacctgtagagataaagcatttgcctgttggggatggtatttggattgctcgtgatagaaagcttcacacagagtatgttcttgatttcattgttgaaaggaagaatgttgcagatttgtgtagttcaatcacagacaaccgatacaaagatcagaagttaaggctcaagaaatgtggcctaaggaagctgatatatctggttgaaggtgatccaaaccctcttgatacatcagaaaggatcaaaactgcctgcttcaccactgaaattcttgaaggatttgatgtccagagaacccctgggtatgctgagactgtaaggacatatggcaaccttactcattcaataaccgaatactacagcacacacttttctactggtgctaatacttctcaagtttgcctgacctatgatgagtttacgaagaagtgtgatgaccttaagaagataactgtgagtgatgtattcgcccttcaacttatgcaggtgccacaagtgacagaagaagctgcacttgctgtgatagggctctatccaactcttttctcacttgctaaggcgtactctatgcttgatggtgatacccatgcccaagagaagatgttgaagaacaagagcacgctgataaatgcaggggctagcagaaacatattcaagcttgtctgggctgaaggataa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAPEARQLKVHLRENEAVAQCVLEKWRSMEEKPGGLKENLAHTL YKSYRNVCAAKEPIRSLKDLYQIKGVGKWVIRQLKGSFPESSPDLSPPESNAAGEKGK KAGGSKRYVPQKNSAAYAILITLHRETINGKSHMKKQELIDATEASGLSRSAIGPDKS KAKPGAFASSQKDWYTGWSCMKTLTSKGLVAKSGNPAKYMITEEGKSTALECLSRSGL DDHAAPLVINSAPDTSNASHKLNNICMTSFVETSSGPSRAIGRPKTSIANPATKTSPE VTYLTSQESLNYNSDVRTAENCAEEIILSDSDSEELYTENYPLIGSEEFTERVAPPIL NASNSGKTTTNYRFSDCSASISPRSSEGTFEMQSSSTMGIAEFNMLDNDTVCMDNSIL AMPPRRSSKNFLEDYEVVLILDDRENFGGRSRKTVDNIHSQFRVPVEIKHLPVGDGIW IARDRKLHTEYVLDFIVERKNVADLCSSITDNRYKDQKLRLKKCGLRKLIYLVEGDPN PLDTSERIKTACFTTEILEGFDVQRTPGYAETVRTYGNLTHSITEYYSTHFSTGANTS QVCLTYDEFTKKCDDLKKITVSDVFALQLMQVPQVTEEAALAVIGLYPTLFSLAKAYS MLDGDTHAQEKMLKNKSTLINAGASRNIFKLVWAEG</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>122..324#838..935#1066..1144#1297..1383#1473..1598#2701..2992#3430..3505#3586..3642#3747..3844#3975..4117#4974..5031#5507..5665#6200..6279#6430..6664#6769..6855#7059..7163#aaactcctccgaaacctcccacaaatggcgggctcttcctccccaacctgaaaccccaaaccctaacccccccaatccggcgacccccctccaccgcagcggcctctccagcccctcgccgatggcgccggaggcgaggcaactcaaggtgcacctccgggagaacgaggcggtcgcgcaatgcgtcctggagaagtggcgctcgatggaggagaagccgggcggcctcaaggagaacctggctcacacgctctacaaatcctaccgcaacgtctgcgccgccaaggagcccatccgatccctcaaggacctgtatcagatcaagtaataacatgtttcccgtgcctatcccttgttctattatttttctcggttgcgggggctgaaggttgcagtgcggctagggtttgattgattttggtttgggggttttcgattgggcggttttaccggaatggtgaactgttgcgtgtctaaattcgtcaagatttcaatgcggggacagggttatatcgtgagctgtaaaatcataatgttcgcatatgttgatcacctatatatggtaaaaatttgactcaatgcgtgtcgtcaaaccaattttagttgctttgaagtagataaataagcaagtgctgtaactgtaactgtggctttagtgtggattcatgtaggagtttacacttcggtttttgtttcataagttggatttagagaacaaatatctcgaacttcacactactatacatgtttttcttggttagtataatcaagcagcatataatgtaccactaattctcaaaagtattactgtgtttcctgttctatcactgttgtcaggggcgttgggaaatgggtcataaggcaactgaaaggatcctttccagagtctagtccagatttatctcccccggaaagtaatgcagcaggagaaaagggtaactgtttttatgattgattgcatgcctaccgaacatctcttttagggtacccttatcctttcttgtgggaagggttttttaagttaatctgctgtggtgagaatgaagatcactattatttctatagggaagaaagcaggagggtcaaagcgttatgtgccacagaagaattctgctgcttacgcgatactgatcacgctccataggtatgctttgcttggggatatatttttcattatttttgctgttcatcaaatgaaagtgttttctatctcttggcaaacaatgatatataaccataggaattagaacaggttcctacttgtaaccagacagtaacagttgattttccttctagggaaacaatcaatgggaagagtcatatgaagaagcaagagcttattgacgccactgaagcaagtggcctgtcacgaagtgcaattgggtacagttttcacagtatactcgcaatgttgctcattcctgctgctattttcagtgcattactaagtaggtaatttgcattatgaacagtccagacaaaagtaaagcaaaaccaggggcttttgcaagttctcagaaggactggtacactggatggagctgcatgaaaacattgacatctaaaggactggttgcaaagtccggtaaccctgcaaagtaatttcatcaaacttatcttccatgtctatgttaacttttccgctctgttactttagatgaaaaatgtttggttcctacagttgcaaaaaggttgactgttgtcagtggcagtgccacattcttgagtatggaatctatacacccactcacagttatttcttttgtgagaaagctcctacctatctaaaattccacacataatcttaagataaaaattttatgtgaatcagcaccaaaggtttttgtacgtgtattagatcatatgtactaattctgtctttactactagcttttctgatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatattcaacagagcatcactgctaagggctagctattaattgtgcatctttttaaaagagcttcattaagttataatatggaaatcaaatgaactgagtcatgaacacttgtattcataaacttggttacttttatcaaaatgttcatggggctattgtttatagtactagtgatttgcatcattggttatttgaggtttgggataagtttagcatcacgagacacaaaagctaggaaatttgacatgatgccaccttaagatccctgcagatgattggcagttttttttatgtccactatctccatgcactttatggaatatattgttttctgatattttgagctaattttgaaaggacacacttttagatttaaggatgcagttattctgtggcatagcaacaactctctatcgatgaatagaggcagagtgggagacatggccaattgtgagcttcttttgacctgttagtctacaatgtgaagcaacatgtacctactgatcttccacttgggatcatgatacagagacctatcatttgtttgtcgcataaactgtaacccacgtcttgatctctagtattactttaatccatttgttttcatttgtgtgatgggagaactgagtctattaagtttacatgcatgcatcttgttgggactatattattaagcaatatgtacttttttgaggtgctaagcataactaggggcttaacaaatgaatttctgtaggtatatgataactgaagaagggaaatcgactgctcttgaatgtctctcaaggtctgggttagatgatcatgcagcacctttggtgataaacagtgctcccgacacatctaatgcaagtcataagttgaataatatttgcatgacttcttttgttgagacatcatccggaccttctagggcaattggtagacccaaaacatctattgccaaccctgccactaagacatcaccagaagtgacatatttgacaagtcaagaatcactcaattacaactctgatgttagaactgctgtaagttctacctttactaacattgctttagaagctatttttcccaagctaagaatgtgacaaaagatccattggtctggttctattgtattatatagtttttcttctgatcaagttcttcaatttaatgatcacaatattcaatcttagcttctggttcagctgtttcagcataagcagaactgccattatttttgtatctcaataaagcaaagcctttttgtagctttgcgatgttgttgctgtctaatagtgctacaatttggtgaagtccaatcaggcacttttcctttttaggttttacgtggtttgggttgtaattagtgtacataattctgaattacaggctaggctttcggccatagttccatacttttctgtcatactagaattttagatgctgtagtataactcatagattctcttatcttttttaggagaactgtgctgaagaaatcattcttagtgactcagattctgaagaattatatacagagaactatcctctaataggtaaaattgttatttcgagctcacaaacaatttgttatattccttctgcgctaaaataaattttggtttcctaagtgcaggttctgaagaatttactgagagggttgcccctccaatattgaatgcaagcaactctggttgtctatcaatcttatgttttctattagaataatattgcatccaataaaagtattatttttactggccttttcaattaatcccaataaccttttttttccaggcaagactactacaaattacagattctcagactgttcagcttctatttctcctcgttcgtctgaaggaacatttgagatgcagtcttctagtacaatggtaacctgaccttttgtggttaaatccctaatccctaatccctattctgtaacttattcccttttgaagttgaagatgctgattactcaaagaaatgacggtactgctattacatcttttcaactaccagggtattgctgaattcaatatgctggacaatgatactgtatgtatggacaattctatactagccatgccacctcggcgatccagtaaaaattttcttgaagattatgaagttgtgttgatattggatgatcgtgaaaattttgggtttgtatgatcgtaccatactcttacatcttacaaaatttgtatctatggttgtatcatgggtattaggtaggggtctgaggcccacgatggtactgttcactcctaccttatcttaatctgttagccaacatataagcactcaaaatttacatagcttgtttgaaaaatcaatctattcattatggacagttacattacacaatgtttcaaggttatctggataagaggatgctagtttcaaggatttgattaatgtactgattatttgcattctatcctttccattgatttgcaaatatgagagaaatttattttactctttgcacactgttccgttaaagtaagacacatgatgatttttcaaataccattctttttcccttttggagcccattgcaatgcttaactaacttcattttcctgaatcttaaaacactttgaacccgtattgttttcagttaattttacctttaatgttgatgtttggtgcatctaactgtctatccttaaacttttgggtctcatgttaaggtctaactagtaacctctcaactcaaacagctgaaacgattggaacatgtgcttttatgttctagtattaggtttatgagaactatttgtcatgttccttttccaatattgctaagacagctcgatatttttctatgaaatttttcattactgaaattttaag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