Os01g0957900
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0957900 |
|---|---|
| Description |
Armadillo-like helical domain containing protein |
| Version |
NM_001051984.1 GI:115442338 GeneID:4325385 |
| Length |
11093 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0957900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:44011822..44022914 |
| Sequence Coding Region |
44011895..44012452,44012527..44013049,44013831..44014076,44015065..44015153,44015469..44015679 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:44011822..44022914 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008394:44011822..44022914 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgaagcggaagcagaagcccgccgccgccgacgccgccgccgaagtcgacgccgacgagccctcccaagccccgctccctctcgaggccttctcgggtgacgtctgcgccgccctcaccgcgcgctacggccgctccaccgccccgcagcaccgccacctcctcgcctccgccgccgccatacgctccattctcgtcgacgacggcctccccgtgacgccagcatcctacctccccgccgccatctcggccctccaagccgccggctcggctgaccccgccgccgcttccgcccttgcctccctcctcgtcatcctcctgcccaatatcccctcgtccccatcgtctctcccgccagcgtccgcctccgaatctgcctcagcgctcgccgtcttcctctcctcgcccgatgcatcccagctacccaccggcaccgtgcgctcggtggtcaagtcccttggccatttggctttccatgtcgacgctgcagccgattggggctctgtggcctctcctctggaggctctccttgctgcttccgtcgaccagcgggccaaggttcgaaggtgtgcacaggagagtgtggagaagctatttgcgcacttgaaacaatgtggttgtgggaagaaagttagtaatgctgcaattggcatgtttgataagcacattgcatctgtgaaaaatcatgtcaatttgaattcagatgcttctgagggtaaggagatggaggctgcaaatatgctaagtgcaatggttgttgtagttccatacctatcaaagaaggcaatgaagactgtgttttcagaagtttatcagctgttaaccccttgttttagtccacttacaaggcatgtcttgaagcttatggagaccttgttggaccatctgaaggctgagaatgttgagtcagacttggtgaatcttatcccattgttgttggcatacctgaattatgatgaaaagaagcctgatgataccattgtcgcagcattgaagctgatgaaaaattgcttggcgaaactagttggtcgaccaaatttgtggatggaggttcttccatctgcatttgaggcagtttcaggatacctgattctggacagaaaatgttctgaagatatagcaggactgctacaagactgtattgattctcatattgaccggaatattattttgactggatcacagttatgcgatcgtgattatgagagcttaagtgatgcggctgctgttaaatcaatctgttcatcgattaataacatgctttgcgcatgtgcttctcctcccaatagtatcttaacaacggccttggttttgtttctgaaacttggggagagttcgtatgcctttatgaaaaatataatacttacattgtcacaaatcgctgcgaaaacagacaaagaatcagagcggaagaatgttgaagagtgcattggggcagctgtcattgctttggggccagataaaatcctttcactaattccaataggttttgatgaggaccggctaacatgctcaaatacttggcttctgcccattttagataagtatatctatggggcctcaccacaacaattcctagagcgcattgtacctctagcagaatctgtacaacaagcttctaacatggccaagtcagcacggaaatgtgaagacttgaaatcatgttccaatcagctgtggaatttgcttcctgccttctgccgctacccagttgatatatgtcagaatttcggttctctatccaagttgctactagagatgttgaaatgtgacaagtatctgtacaaatccgctgttaaagccctgcagcaacttgtagatggaactagaagattaagtagcagtgagcaaaacagagaaatatatgtggagctttctactttgttctcctcgaaaattattaacttaagctgcccaagctttgagaggtgctctaaaaaagatgctcgtaagaacatgaaagttctggcatcacattctgtgtatcttctttctactgtcacagattattttctagattcttcaccagagaagcgttctcatttgaaggatgcattgagatgtttggctcaactttctggtagcacgaacatttgcaaccttttcctttcactggttaaaagatttggtttagaagatactcagtcagagcaagagaatattgaatgccaaactaatgaggtagacaagaaggatgaagagggtactgatgtagatgaggagaaaaataaaaagaggtctcttgtaatggaacttatttcgacattcgctgaagctgctgacgaggatctgcttgatttgctttttggatttgtcaaatcttctttactgaacaacaagcaaccttgtgagggcaaagctctatttgctctaagcataattttgaaggaacacaatgaatattctttggctcggttggatgaaataatgatgcttcttcatggaataaaggcagacttggataatgaagttttagaaggccaattattatgctaccagtatttgttggttcacatgattaaggctaatgaagagaacacgagcaagaaggcgttcctgattctaaacgagttaatagtcgcgttgaagtccaagaaggaaagtagaagattggcatatgatgtactcctggctattagtaatagcttgagaagctctgagtcaaacagtgaagattcagatcttcaacgactattcacaatggtgatgggatatctttcaagtccagctccacacatagtgagtggggcaatagctgcactatcgctgcttatatacaatgatgctaacttttgcttggaagttccaaatctgataccatcagttttagttttgctgaagcataaagctattgaagtaatcaaggcatctttgggctttgtaaaggtgttggtaacatcattgcattcagaaaaactgttggaattgcaagcagatatcatgagcggcatattaccatggtcgtctgttacaaaacaccatttcaaaggaaaggttgtgttaataatggaaatactgattaggaaatgtggctttgatgctatcgacttagttacacctgaaaagtacaaggcttttgttagaagcgttgaagagggccgcaagggaaatcataatccagcagatggcgcagagtctgaggcacaacaacctacgcaacatgctgctaagagaagaaaacggtctgattctgatgttggaactggacaagagggaacacacactcgggcgccatcgaggagtttgccagctggaaagaaggaattcttcgttaaaggggccaggaatgctcgctctcctggtgtgaaaagccaacgaagcaaaccatcaggccgcaatggtgatagaactaatttcaaatccaaatctgaaccacggccaggaaatggccaaaataccaagggcgacaaacctcaaggtttcaacaaaagaaacagaactggtaagttcgacaagacacaaaatcgtgggggtaaagcatctgatcgctcttctagattcaagaagcctagaactgcagcaacaacatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MKRKQKPAAADAAAEVDADEPSQAPLPLEAFSGDVCAALTARYG RSTAPQHRHLLASAAAIRSILVDDGLPVTPASYLPAAISALQAAGSADPAAASALASL LVILLPNIPSSPSSLPPASASESASALAVFLSSPDASQLPTGTVRSVVKSLGHLAFHV DAAADWGSVASPLEALLAASVDQRAKVRRCAQESVEKLFAHLKQCGCGKKVSNAAIGM FDKHIASVKNHVNLNSDASEGKEMEAANMLSAMVVVVPYLSKKAMKTVFSEVYQLLTP CFSPLTRHVLKLMETLLDHLKAENVESDLVNLIPLLLAYLNYDEKKPDDTIVAALKLM KNCLAKLVGRPNLWMEVLPSAFEAVSGYLILDRKCSEDIAGLLQDCIDSHIDRNIILT GSQLCDRDYESLSDAAAVKSICSSINNMLCACASPPNSILTTALVLFLKLGESSYAFM KNIILTLSQIAAKTDKESERKNVEECIGAAVIALGPDKILSLIPIGFDEDRLTCSNTW LLPILDKYIYGASPQQFLERIVPLAESVQQASNMAKSARKCEDLKSCSNQLWNLLPAF CRYPVDICQNFGSLSKLLLEMLKCDKYLYKSAVKALQQLVDGTRRLSSSEQNREIYVE LSTLFSSKIINLSCPSFERCSKKDARKNMKVLASHSVYLLSTVTDYFLDSSPEKRSHL KDALRCLAQLSGSTNICNLFLSLVKRFGLEDTQSEQENIECQTNEVDKKDEEGTDVDE EKNKKRSLVMELISTFAEAADEDLLDLLFGFVKSSLLNNKQPCEGKALFALSIILKEH NEYSLARLDEIMMLLHGIKADLDNEVLEGQLLCYQYLLVHMIKANEENTSKKAFLILN ELIVALKSKKESRRLAYDVLLAISNSLRSSESNSEDSDLQRLFTMVMGYLSSPAPHIV SGAIAALSLLIYNDANFCLEVPNLIPSVLVLLKHKAIEVIKASLGFVKVLVTSLHSEK LLELQADIMSGILPWSSVTKHHFKGKVVLIMEILIRKCGFDAIDLVTPEKYKAFVRSV EEGRKGNHNPADGAESEAQQPTQHAAKRRKRSDSDVGTGQEGTHTRAPSRSLPAGKKE FFVKGARNARSPGVKSQRSKPSGRNGDRTNFKSKSEPRPGNGQNTKGDKPQGFNKRNR TGKFDKTQNRGGKASDRSSRFKKPRTAATT</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>74..631#706..1228#2010..2255#3244..3332#3648..3858#3932..4113#4240..4479#5358..5545#5897..5990#6074..6130#6219..6353#7127..7192#7412..7525#8516..8677#8760..8888#8990..9091#10095..10171#10267..10624#aggtaaatcaactccgccgccgccgccgccgcgtccaaaacccttctccggccggtgtgtcgcgtcgtcggccatgaagcggaagcagaagcccgccgccgccgacgccgccgccgaagtcgacgccgacgagccctcccaagccccgctccctctcgaggccttctcgggtgacgtctgcgccgccctcaccgcgcgctacggccgctccaccgccccgcagcaccgccacctcctcgcctccgccgccgccatacgctccattctcgtcgacgacggcctccccgtgacgccagcatcctacctccccgccgccatctcggccctccaagccgccggctcggctgaccccgccgccgcttccgcccttgcctccctcctcgtcatcctcctgcccaatatcccctcgtccccatcgtctctcccgccagcgtccgcctccgaatctgcctcagcgctcgccgtcttcctctcctcgcccgatgcatcccagctacccaccggcaccgtgcgctcggtggtcaagtcccttggccatttggctttccatgtcgacgctgcagccgattggggctctgtggcctctcctctggaggctctccttgctgcttccgtcgaccagcgggccaaggtgaggacgctaagagcttttgccacacatacttgaggaccatgctcatgtggttgtcactctttgcttggtaggttcgaaggtgtgcacaggagagtgtggagaagctatttgcgcacttgaaacaatgtggttgtgggaagaaagttagtaatgctgcaattggcatgtttgataagcacattgcatctgtgaaaaatcatgtcaatttgaattcagatgcttctgagggtaaggagatggaggctgcaaatatgctaagtgcaatggttgttgtagttccatacctatcaaagaaggcaatgaagactgtgttttcagaagtttatcagctgttaaccccttgttttagtccacttacaaggcatgtcttgaagcttatggagaccttgttggaccatctgaaggctgagaatgttgagtcagacttggtgaatcttatcccattgttgttggcatacctgaattatgatgaaaagaagcctgatgataccattgtcgcagcattgaagctgatgaaaaattgcttggcgaaactagttggtcgaccaaatttgtggatggaggttcttccatctgcatttgaggcagtttcaggtctgtgcatctacagtttcacctgtcaacatttcaatatgataatgcttcttttatgagttttcagttgacatacttgtgtttgagttattatggttatcattgatggggcacgttgaacctatggtcctcaaacatgtttcctccagttccattttgcactggtgcatctgagggggaaaaaacttatctctttgctctttcttgacaacgacagttaactaactttgagttaccacatgctaatgttgtatgctgcctttcttctaatgaatacttatgtttatcagataagagttggtattcctgcggatcaacccattttggtggatttagttcactgctattgttctgataagtgtatttagacattgtcttgtctatatatcatatatggttggaaccaataggtcaacatgcattgagctacatcacccgccaaaacaagaggcattggatcatcttcatgcttaatcacaaccatccattccgtagttactctctctcattaattagcatatatctcaatattcattgagtcacttagtgtagttatttctataaaaagtcatggcctcatccttttattaacacccttggatggtgcttttacaattcaaatcagtccataatattttgtgtgtgtgtgtattgaaattttgcaactgcattgcacagaacaatatcctgctgcaatgtgtggggtgtcatctagttcattatatgtattgtaatggataacagtcccagagctaacttggtaaaattttgaaatgggcaggatacctgattctggacagaaaatgttctgaagatatagcaggactgctacaagactgtattgattctcatattgaccggaatattattttgactggatcacagttatgcgatcgtgattatgagagcttaagtgatgcggctgctgttaaatcaatctgttcatcgattaataacatgctttgcgcatgtgcttctcctcccaatagtatcttaacaacggccttggttttgtttctgaaacttggtatggcttcaataatttcagtaaagtatcttttgcctataactgtaccagtgtatataataaccattcgagaatatgtagaagactagaactgtagaagtaataaccttctctgtaaagaacaatttgttatacatgaaacagtaggtacctctaatttttacttcctccgtttcatattataagtctttctagcattgctcacattcatatagatgttaatgaatctagacacacatatatatatgtgtctagattcattaacatatatatgaatctagacacacatatatatgtgtgtgtttagattcattaacatctatattcatatatgttaatgaatctagacacatatatatatgtgtgtctagattcattaacatctatatgaatatgggcaatgctagaaagtcttataatatgaaacagagggagtatatacatattctctataatctatacatgaaacactagataccatttattctatctcatgtgaattccagcatgcaccatttcgtaaaatatgtatgttgattataaataatcacatcttgcaccacaaaaaactaaaaaaaaattgtttaccgctccctttgttccaaaatataagcactcgtagcatttgaaattttaccaaaatataagcactcctagaatattacttgtcccatcaaccactcattcaattttcttcccatattacccccaaacatacctcatttaataaggggcatggtctttcctactcaaaccttaatctttgctaaaacacctagaaatgcttatatcttgaaatggagggagtatttactagtgcaagtacctacaaagctaatttagacatgaaatattgacacactctcccagtaccttttgactttctatattgtcatacattggtcgacttttttgatgtatgatattgcctgctttttatgattcatttgcttaattaactcatctatattgtttggttcttctccaggggagagttcgtatgcctttatgaaaaatataatacttacattgtcacaaatcgctgcgaaaacagacaaagaatcagagcggaagaatgtaagtttatttcttgattgttctcacatcaaagatagagcatctatttgcttctttgtgtgtactgcgtacatataccatgtacatgagcattgaaactatttcatggcaatgcttatgtttcagttcctcccatgggagaatccagacctcagaaactttcactccaaataggaagctagagccataatgcctgtgaaagtttaagtacagaataaaaacgagaagtttataagattattgtagtcatatcataactgaaaaaggcttgagcattgaattattgaaatttcatttaacttgtcgtgttttcaggttgaagagtgcattggggcagctgtcattgctttggggccagataaaatcctttcactaattccaataggttttgatgaggaccggctaacatgctcaaatacttggcttctgcccattttagataagtatatctatggggcctcaccacaacaattcctagagcgcattgtacctctagcagaatctgtacaacaagcttctaacatgggtaggtaaagccaattcattaggtcttaaatacatacgcaacatgatttcctaaccttctgctttaacttcagccaagtcagcacggaaatgtgaagacttgaaatcatgttccaatcagctgtggaatttgcttcctgccttctgccgctacccagttgatatatgtcagaatttcggttctctatccaagttgctactagagatgttgaaatgtgacaagtatctgtacaaatccgctgttaaagccctgcaggtgcagttttcatttacagatatactgcatttttcttatcttatctatactcattttctttctggaatttcgaactacaaggctgctccatgtcttctctcagacaacatgttttatttttctcagcaacttgtagatggaactagaagattaagtagcagtgagcaaaacagagaaatatatgtggagctttctactttgttctcctcgaaaattattaacttaagctgcccaagctttgagaggtgctctaaaaaagatgctcgtaagaacatgaaagttctggcatcacattctgtgtatcttctttctactgtcacagattattttctagattcttcaccagagaagcgttctcatttgaaggtgtgtcacttaatatttctaattattatcagttgatgagcatgttagatgtcttcaaaccaattaagtctaaaaaacccctacttaaatcagtcacggacggactcacatattgaaacattactgtattttctattatttggcatttgaagtttgattgatctatgcacattagagtaccactgatttaaatgaggttttgtgtcacaaacttgagaaaggcttaacgccgcttgatgcagcccaatattgactgctgcaggctgtgccctacacaattaaagagagattatattagtagaacatggt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