Os02g0106800

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os02g0106800

Description

TMPIT-like family protein

Version

NM_001052165.1 GI:115443700 GeneID:4328022

Length

6047 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os02g0106800, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:397365..403411

Sequence Coding Region

397406..397609,398483..398561,398648..398742,399289..399393,399496..399575
,399832..399922,400021..400128,400529..400615,400862..400927
,403039..403188

Expression

GEO Profiles:Os02g0106800

Genome Context

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Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008395:397365..403411 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggcgaccgacggcgacgccctcgagtcccaggcggcggcggcggccgaggcggcgcgggagctgcgcgaggccgccgcgtccctcgtcgcccgccgctccgccgacgaggacgcgctccgccgccgcgccacggcgctcgacgccgacctccgccgcctccaggcctccctctccaccctcgcccccaccacgctcgacaaggttgaggaggaactggagcgtgccagggtaacaatctcagatagtgacgtggctgcatttctcccaagcaagcggaatgggaagttcctcaagacctttgttggccctgtaaatgtgcgggtggcgagaaaagaagataagctcagagtgaaggacgagtacaacaactacagggatagggctgcctatatgtttctattgttcccatccattctcctcctacttagatggtggatatgggatggatgccttccagccttggcagttcagatgtaccaggcttggctactattcctttacacaagttttgctctgcgggagaatgtgttgattgtaaatggaagtgatattcgtccttggtggatataccaccactatttagcaatgctaatggctctcgttagccttacatgggagataaaaggacagcctgattgttccagcaagcagaggggggtacaacttttcctgcggtgggcaatcatgcaaggaattgcaatgcatctacagaataggtaccagcgtcaaagattgcgcacccggatagctctaggaaaggctaaaagaatggatgttgttgctggagaaacagctggtgtggaagggcagctcttgctactttacccggtccttttcacattacaggttttcgaaggatatgttggagtattacttcttaagacggctttgcacgggcttgcatcggaatggcaggttgtagtttgtgggatcttgctggtggtaatggcagtcggcaactttgtcaacacgatggagactttgatgttaaaattgaggttcaaagcaaaaatgaaaagagcaaagagcaggcaggatctcagtcgccaacaccaaaattga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MATDGDALESQAAAAAEAARELREAAASLVARRSADEDALRRRA TALDADLRRLQASLSTLAPTTLDKVEEELERARVTISDSDVAAFLPSKRNGKFLKTFV GPVNVRVARKEDKLRVKDEYNNYRDRAAYMFLLFPSILLLLRWWIWDGCLPALAVQMY QAWLLFLYTSFALRENVLIVNGSDIRPWWIYHHYLAMLMALVSLTWEIKGQPDCSSKQ RGVQLFLRWAIMQGIAMHLQNRYQRQRLRTRIALGKAKRMDVVAGETAGVEGQLLLLY PVLFTLQVFEGYVGVLLLKTALHGLASEWQVVVCGILLVVMAVGNFVNTMETLMLKLR FKAKMKRAKSRQDLSRQHQN</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>42..245#1119..1197#1284..1378#1925..2029#2132..2211#2468..2558#2657..2764#3165..3251#3498..3563#5675..5824#accaccgctcgtctccaccgcgagcgaaacccaaaaaggcaatggcgaccgacggcgacgccctcgagtcccaggcggcggcggcggccgaggcggcgcgggagctgcgcgaggccgccgcgtccctcgtcgcccgccgctccgccgacgaggacgcgctccgccgccgcgccacggcgctcgacgccgacctccgccgcctccaggcctccctctccaccctcgcccccaccacgctcgacaaggtgactgcatctcgttcttctcttctactcatctccctcttcctcttcctctccccgcgcttgcttccaattcgatctctctctctctctcactcacgcgtcgcctcgtacgggtttcggcggcttggaattgaaacctacgagctgctagtacgttagatcgtgattcgtttcgtgattatctcgcaaagcagaacgcttacgcgcttcacgccttcgcctggaggattgagatgtaaagtttgcacgcccgcgatctggtgctcgtcaaacactggatttgttgcgccatctccctggagatgtctccaatttacatgcttcctattggttttcaaagttaggaatctgaggcgtgtgcatcgagctggatgctggccatggccaacgattattattgttgttttttgtattgaaatctcgaggcagtttaggcaaactatagattccgtcagaaatctgtccccatcctttactgctccgtttagagatccttggaatattcgctctccctcatgcttgtgcaaatttgtaatgcatccactaggttgctcagtacctggattgagaaacattgtccactgctccgtcgttgctaagccaaaaggtttaatctcaacctagagaattattacaacctatctagatttaatctccactgtctcccatgcatttctttagcacgcacaagtgacaaaatttgacctgtttctaaattgatataagagtctccgtccgcatgtccaagtttatcgcactcctttttagattttctacttaccttttgtacctcttttctaatatatagttttcttctgtacttctgttgtgtcatctgtgagaattgtctcattctgccatttatctatataggttgaggaggaactggagcgtgccagggtaacaatctcagatagtgacgtggctgcatttctcccaagcaagcggaatggtatgctatgatttatctcaccccccatgcccgtctcggggaaatataactgttatttatggaattcacttctccttgaaatttagggaagttcctcaagacctttgttggccctgtaaatgtgcgggtggcgagaaaagaagataagctcagagtgaaggacgagtacaacaactacagggtagattttagatgcttcttcgataatttttttttagaaagcttatgcatttactttggatatgatttcttggaccaatttaataaagctatctgtactttttattacttttattttgatgacttaagcattctaaatttccaatgattactccaattggtgtattctttaaattttgatctgtgataagaatcactattgaagagaactactaccattttctacaaaaatctaagtaaatttcagattatcaaggtcaacgagtatggtgtgtattcaatctcagacagcatgctgataaaaccttgaacctgttttgtatgtcatatggtttaattagtaaatacgggaaacatgcaattctggactaatactctagaaatcatgttgaaaggttatgtaagtgttccttttcatgtcgaattcaagcagtcctttctaaattgaacatagtggcttaactggtagagtatacttggtataattttcgctactataaatttttatgtcatgcctgacagtattgatggtttcatttatttgcaggatagggctgcctatatgtttctattgttcccatccattctcctcctacttagatggtggatatgggatggatgccttccagccttggcagttcagatgtaccaggtatttagtgccgtgcagtgattgaccctgaatatattttctctatgtatgactttgctgtccagcagaaacgatctaaagtttatttgttccacttaacaggcttggctactattcctttacacaagttttgctctgcgggagaatgtgttgattgtaaatggaagtgatattcgtccttggtatgtgtctgaatttcattgcttacagaaactgtcaactgcagcactcaacaattttatggcaaatacccatttttaatgcacggacagacaaaagtgcttgatttttttactatatgcgacttataatttgttggtatgggaaagatcttatatcaaaacatcttttaatgatattcgtaaaacccatgtttcgtttgttcacttaatctagcaaaatcaattcctttcttagaatgcattatcatcttttcaggtggatataccaccactatttagcaatgctaatggctctcgttagccttacatgggagataaaaggacagcctgattgttccagcaagcaggtaaatgatcatttttcagagaaaactagcactcactttgtcatcaaaccttcaaatttttggaacgctgaactcagacactatggctttcttttcagaggggggtacaacttttcctgcggtgggcaatcatgcaaggaattgcaatgcatctacagaataggtaccagcgtcaaagattgcgcacccggatagctctaggaaaggtaaggttctgtggttcacgtcttgcttcaagacagtactcaacaacatattcttttagtgccaagtgaaggtgtacaacatgttccaataataagattcaaatgagtatcatcttcaaatgatatgtatacaatgcagatgcttatcaaaagcaatttaatgcactaatttgcttgatgtttgttgatatttgcatatcagctaagagttcggaatatcactgaaactaatttagagaagatgctctggtcttttaatcaaactaagtcttataggcaatggttgttcatacagctcaatagactgttgaaatgatgctgtatattgtatcatctatgtacctttctcaagttttatcggtgttgttatttattctgtttcatatttaattgcatgcaggctaaaagaatggatgttgttgctggagaaacagctggtgtggaagggcagctcttgctactttacccggtccttttcacattacaggtatgtgtaaatgtgtcttgtgagctgaaagcatggcagatccaagttgttagtaattgtagccccccacccagaatatgttgtctcacgttgttggttcttgatattttagtcacttgtttcttttccttgatgaagtttgcttccgatttctggatgttagcacaaagatgattaattaaccattatatatatcttccatattctgcactaatgcgcttaatcttggatgctatgtgttgtcaggttttcgaaggatatgttggagtattacttcttaagacggctttgcacgggcttgcatcggaatggcaggcaagaattatcaactatgtaatgtttgcagttgatagttaatcagatcttcatgagacttaggctgagtttgtttcttagagttcccaattccccttattttccgcgtgcacgctcttcaaactattaaactgtgtttttttacaaaaaaaattctataggaaagttgctttaaaaaacaaattaatccatttttcacgtttttttagctaatactccctccggttctatattaattgacgttttgaacaatgttgaggtcaaacttttataactttgaccatcaataactttaaaaatatttagtttaaagaaactagaacaatatatataaatttgtctttcaaagcactataataaaagtaaacatgcatttatttattgtatatattataatagaaaaactagcatggtggcccgcgcagattgcgcggctagcatcattatattttctatcatataatagcatatatgttttctcattatattattcaaatatattaaaatgacaacataattttaaattttgcaatatgtgtaatattcatattatattttatatacatgttagttattaattatttttaatatcaatttttagttatttgtaaattatatatattcctatatggactctagactcgtcttttaatatttcctttttttaattccgaattttctgtaaattgtatttctatatagactctatgctcttctttcaatattatttatttttatttctgaattttcatattatattttatatacgtgttagttattaatatcaaattttagttatttgtaaattatatatattcctatatggactctagactcgtcttttaatatttcttttttaaattccgaactttttgtaaattgtatttctatatagactatgcttttttttcaatattatttatttttatttctgaatttttattatttctaattgtatttctatgtggactctaaactcatctttcaatattcttcaatttttaatttcgaatttcagttactaataaattgtattcttatgttgaccttaaactcttcttcccatatttttcttaatttcgaattttagttatttgtaaattgtattttttatacagactctagactctacttttaattttattatgtttattccaaattttagttagttttaaattcctatatggactctatactctacttctagtatttcttttttaaattccgaatttctattttttttcttaattgtatttctatatggactctatactctacttctaatattccttatttttaatttcaaatttcta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External Link(s)

NCBI Gene:Os02g0106800, RefSeq:Os02g0106800