Os02g0139500

From RiceWiki
Revision as of 19:08, 22 July 2012 by 124.16.129.48 (talk)
Jump to: navigation, search

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information

Gene Name

Os02g0139500

Description

Similar to Cycloartenol synthase (EC 5.4.99.8)

Version

NM_001185864.1 GI:297720860 GeneID:4328254

Length

7986 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os02g0139500, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:2110965..2118950

Sequence Coding Region

2111095..2111241,2111496..2111579,2111803..2111883,2112138..2112251

Expression

GEO Profiles:Os02g0139500

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008395:2110965..2118950 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008395:2110965..2118950 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ttgctgctggaagaacgtacgagaactgtcctgcaatcagaaaggcatgcaacttcttgttgtcaaaagagcttccttgtggtggttggggagaaagccatttgtcttgcaaaggtttacaccaatcttgaaggagaacgtccccacggagtaaacaccagttgggccatgcttgcgctaattgatgccggacagggtgagagagatccagcgccgttgcaccgagcagctaggattcttatcaacctacaattagaggatggggagttccctcagcaagagatcatcggagcattcagcaaaaactgcgccatcagctactctcagtacaggaacatattccctatttgggctctcggagagtaccgctgccgagtcttgttaggcaggcaggatgcatcggtgaccggcaacactgctagctga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>LLLEERTRTVLQSERHATSCCQKSFLVVVGEKAICLAKVYTNLE GERPHGVNTSWAMLALIDAGQGERDPAPLHRAARILINLQLEDGEFPQQEIIGAFSKN CAISYSQYRNIFPIWALGEYRCRVLLGRQDASVTGNTAS</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>7710..7856#7372..7455#7068..7148#6700..6813#ggaggcgcagatacattcgccgccgtcgcgccaccaccggcggcggcggtatggcggccgcaccgccgccacggaggcttggcgcgctcgccagcgccggcctcctccacgggatcgacgcccagctccgacgcgtagctgagtacgtctctctccgcacttcaaattttcacgcatcgacgggtggatcgagccactgaggtgtggcgacgaacgccacgcatgtctgggctgtgggattggggtgacggggattcggtagctgtgcggagacgcacggcactgagatctgggcttgttaatcatctaggttttgatcgatgatgacagtcactctgtcactagtacaataaaatcgcaaaagttactactactacttagataaactattggagtactttgtttcaattattcatggaattgaactgccgtcacaatcgtggtcgtcattttgtggaagaatttctctgggttactatgcaatatatatagtggtaacttgttaataccattttgcaaattgcagttcactagatcgaatccctctaagctggagattcctggtatcaagctgggcgaggatgaagatgtcacagaagaagcggtgctgacctctttgaaaagggcgattcggcgttattctactcttcaggcacatgatggacactggcctggggattatgctggtcccatgttccttcttccaggcttggtacttccttttcactgctgtgggaaaatggatctgttgaaattcatccacatcgttattagctaaattcacaatttctttcatgaggtaaaacattccaaagcactgctcggagctagtatgttgctgttagcatccttgctttgatgttggttggtacttgctagagtactgcccaaagattcatgcttggctaaccattttttaattttgtagtcccttggttgtttcacttgcaatggctggccttttgtttgtgtttttcccttagaagagaacctgcatttctgtttaaaagcagttcacatcagacaagcatcaattttatcgccaagtgccagcatgcaatcgttgcatgtaatttgtacattttgtaaagaaaatatggatcacatacatttgtcttccttttgtctatataagattatctgtacattttacttctccattcctaactcagttttacccaggttatagtactgcatgtgactggtgcactaaatactgtgctatcaacagaacatcaaaaggagattcgccggtatctctataatcatcaggcaaggacataaaacttgcccaaataactctgaaaaacttacttagataaatctgtcatttcaatacacatgtgtgcttcggtcgtgataaaatcgtaaaatctgtttcaaaaatcatgagagatttgcatttgctgaagctgataatcggctgctgaactaatttgctcgtgcatttacttccctttgctgtcagactttggagaggttcagatgtgagaacatgttctcagtttctgttatcaagcccctaacgagaaattcattcctttttggcccttaaaaaaaatccatgtagaacatctttaaaagaatggaaagagagggcaacctttgaattcaaaagggcatacagtgcgtgtgtttcatgtccttctccatattgtatagctcattatgttgtgtaaagaaagtaacaaaaactttttaagtgcagaatgaagatggaggctgggggctgcacattgagggcacaagcaccatgttctgtactgtcttgacttatgttaccttgagattacttggagacgaatcagatggtggagatggagccatggtgatagctcgaaattggattttagatcatggaggagcaactttcacaacatcatggggaaaattttggctttcagtagggaacctacgcattttaatttccttttgtgtttttgctctggtccctatacaattctaccttgttttacaatcctagagaggtcctgctaatgtcttaattaactttcttaaggtacttggtgtctttgactggtctggtaacaacccattgcttccagaattgtggatgctaccttatttcctcccatttcatccaggtttgccttctccttacgttttatttctttttactctttaatcttaatttggtagagtgtaagttcatcatacaataatagagaaaattatcgtaggtactggctggagtgcatgctagtgcaggtattcactatatacaaacatggttctttggcagcttactttgaataagtgtgtaccgggttgctgccacgtacgtatattgcactagaatccatgttgtgggttgataaagtgttagtacaataggctatgtctccctttataaaagaaacaggggaaattagccccatttggaaagaatggatttatataattgcagaaacataaatacagaatatttttactctaatgatatgatagaaaatttatgaatatgctgacatggaattttcataaaacaaaaggaagaaggttcaggaatatgtatagattggttaaattcttcaaggtacgtgcctattctgaacatcataagcatatatttggtttaggaatgagttgggatgggttggactcatccttgtgtttttggatgggatggccctatctatctgtttggcatgagggatgaaatggtcccagttttaaggggatggctcacatgtcagcgagacaaagaagtgggttggattggtctgccaattttcaagggaccatgccaacccggatcttagaagaatattccctttcaggttcatcccatcccatctatctccaaaccaaataccttgaaaagtgagttcaatccaatccgacccattccatcccttgaaccaaacgcatgcagcatgcttaatctctaataattttttaagtgtatcaatccctatattactagattcatgcattgctcctccagccaatttgtttgagatagatcagcgaccatgttcttagggtgcctttacaacattctttttagtgttctgtaatctgtagaaaattttatcttacaatcagtatattttgtttgcctatgtccaggacggatatggtcccactgccgaatggtatacttgcctatgtcttatatttacggaaagaagtttgtcggcccaattacaccaatagtactgaccctacgaaaggagctctacaatataccctatgatgatattaattgggacaaggctcgtaaccaatgcgctaaggtttatgagctttatactttctttgtctttctgattgtgcacgggtcaaacagcaaggacataaaaaacaactttatcttgcaataccatagtgtctgttgctactcagttcttgttacttcaggtagacatgtctgtgtaggataagtttcttatttaataaagaaaaaagaattatgtattgcaggaggatctgtactaccgtcatccattagggcaagatatcctatgggccactctttacaaatttgttgaaccagttctatcgcattggcctggcagcaaattgagagagaaagctctgaagaatgccatgcagcatattcattacgaagatgagaatactcgatacatttgcagcggtgctgtacagaaggtaaattgaagacaatgacaactctctaaaaaaaagagctcttcttgttcttctgtttactttgatgcctttattactgattgttgtgattttttttaaatgcaggtattaaatatgctttcttgctggatagaaaatcctaactcagaggcattcagatttcatattccaagggttcatgattacttgtgggtcgctgaagatggcatgaagatgcaagtgcttatttcatatttgggactaatggctatcttttgaatccattttatttgctttcagttgaggtggttgtgtcaacagtaagcttatccacatatttgcttatcttaatcacattgcaaaattattttagcattttcagttgatacttacgtatttgcatcattctttttaactgactctatgcacaaaatctgtgtggtgtatggctcgatgtttaagtggaagttgtcacaatggatgcctactagtattggaagatactccctcgactatagatggccaaataggccgcccggaccgggcctgggcccgagatcagtcaggccagcatggcccaacctacatgttgggctaggctgagcacgcccacttgctgcaccaacggtccaagcatggcccaataagacttgggccgtgccggaccagcccgaaggcacgaaagcccattgtgcccctccttggaaaaagtctattttcctccctggaaaaagtctatttttcctccctcatctctttgggacgtgccttatatgcctggaataaggctattttggctccctcatctattttgccttcttgattgttggaccaggccgtgctgggccggcttatcgtgctgaggcagaggcctaggcacgagcccaacaccagtcaagccgtgtcgtgcttggaccaggccaaaaccctgtgccatgggccaggttgtcgggtctcgggcgttttggtcaactatacctctgtcccactcaccaaggcacgatcaaactttgcacggtcttcaaaattaatctttgactttaaatttttcatatactataatgtttgtagcaacaaaatcataatcatatgaaggtaaatttaaatgataatccaatgatattgttttcatcaaataaaatttaatttataataaactatttaatgatcaaatatttaaagagtttaatcttaaaatacgtgcacgccttagttagtgggacggagggagtattatgcatgaatattgtactgtgtttgtgcatgcatgcagcttactagcgtcaatgtcaataaattgtggtttggcttactgtagggttacaatggcagccagctctgggacacagctttcacagttcaagctatactggctaccaaccttatagaagattttggtcctactattaaattagcccatggctacataaaaaactcacaggtaaatgcttgatgtcagcttgtgcaaataggttaattcatcatttaattacttacatgttactccttgctgaaagcttcttcatgactgccccggagatttgagttaccggtatcgccatatatataaaggtgcatggaccttttctactgctgatcaaggttgggctgtatcagatagcactgcagaaggattaaaggtagttaatatgtgaatgaggttgtcagtattaacaacaacgatattttctttaagaaaccaactttgttcttgcagggtttatgaagtagaaattatcctatagtattaggcatcatagtattaccattatagccttcacatgtcacgtctaagtctaaccattatgttcttttgtggcattgatggcatcatttgaattatattttactaaatgtttgaatttctatctgatgtgattcctgttaattaccttcaggcctcattgttgttatcaaaaatttctctggaaattgttggtgaaccattaaaagtcaatagactttatgatgctgtcaattgtctgctgtcttggatggtacagatatcctaacttttgttttctttaatttcttatttaataatatccccagggtatttctgttccccttgtgacatgtcaaaagtctccgtataagctggaatagcaacttttttttattagagaaagtaaattggagaagtacgtagagtttatgaattgcgataacttatagagtaccaattaggtatttatcaaattttgcttcaaatcttgtacctcttgtctctaggtgccttaatcagtataataacttctgaattgtcaagttattttaatcaaactggctaataaattttctcatgctacatatttaatgcttctatgctcaatgttgtatatccattctgtggaatgatcaaagcctccagctgttgatttatgttatgatgggtctatcagtatgcttattgtctgtaattcttttggtacagaataacaatggtggttttgcaacatatgaactcacaaggtcttatgcctggctggaggtgagtggttgaattatattgtctttggttaactgtaaaaacactgtttgataggttcgctcctgtcaaacactgtttgacaacctgacatgttcttttgtacaattcagattctcaatccttctgagacctttggggacataatgattgattacccgtaagacactaagatgcgatagctgttttccttgttaatataatgctttatcaatctttgagagaaacagaaaatgtgaattgaattctactggcagttacgtggaatgtacttcgggggtgatccagggtttgacagcatttaggaagcactatcctggacaccgcagggaagaaatagacaattgtatccaaaaggctgatagtttcattcagagtattcagagaagtgatggttcatggtttgtaccccgaactcctttcagaagagaacatgtgacacattgcttttttttaaaaaaaaaatgtctgctcaaaagcagaaatagttactactgtcattctacattgtgaaaaactatccattcacaacaacaggtacggctcctgggctgtttgtttcacttctcggacatggttcggagcgaagggattaattgctgctggaagaacgtacgagaactgtcctgcaatcagaaaggcatgcaacttcttgttgtcaaaagagcttccttgtggtggttggggagaaagccatttgtcttgcaaaggtaaggtacacgatcatttctttctactaggtaatgcactaatgcctactaatgggtctccaaatccagcagtgcaatctggagatcgatcctatgttgataattaaggcgattatggaatataattggatcaaattaccagtgatgttacagcacaagtgtgtctgtaactctttaaattgtggctatatatatatatatatgcgaatacgttttaatgtagtaaacatttttgtaattctccacgaaaacaggtttacaccaatcttgaaggagaacgtccccacggagtaaacaccagttgggccatgcttgcgctaattgatgccggacaggtcttttcgtgtttgacattttctatttgtggattttagtatgcagtaacagattgtcccttggcaatggctctctaaccgtttgcgttgtataaccaaaactctgctttgttttaatatactgacgtactttttttttgcgtgttcacgaaaaaatatgcagtaacagattgtgtgtgtcgtttcccatttgacaataacatcttgattctcatcggagcagggtgagagagatccagcgccgttgcaccgagcagctaggattcttatcaacctacaattagaggatggggagttccctcagcaagtaagtcataactgctcttctcttatagcaaagtagtgagttttttgcttttggaccatttctcgatttgtgcgtgaaaaatgtacacagaaattcaggtgcagagtgttggccaatggctgggagggttttttttttgtttttaccctttcgaatgatagcttttcttatgcttaataatgttaagtgctgtccctgtctccggtagcttctgaatctgaatgaatttttgtgtgacttgaaaaaaacaacaggagatcatcggagcattcagcaaaaactgcgccatcagctactctcagtacaggaacatattccctatttgggctctcggagagtaccgctgccgagtcttgttaggcaggcaggatgcatcggtgaccggcaacactgctagctgatgatactgatgaagttattttctttttaaaaacaaaaaaaaaagaagtcaagagtgcaggtgttgcgtggctttctgtacctgaaacttactattaccataatagcagcattatggtttatttacagctg</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os02g0139500, RefSeq:Os02g0139500