Os02g0227400
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Structured Information
| Gene Name |
Os02g0227400 |
|---|---|
| Description |
Poly(A) polymerase, central region domain containing protein |
| Version |
NM_001052887.2 GI:297598867 GeneID:4328790 |
| Length |
5343 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os02g0227400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:7174012..7179354 |
| Sequence Coding Region |
7174014..7174061,7174084..7174152,7174270..7174347,7174821..7174928,7176070..7176132 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008395:7174012..7179354 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ggcgggatctttcgtcgcggtcagggggaagcctcggtcgtccccgaagcggatccgcccttgtctctggccatgccgaccgtcgccgatctccacaagacggctgagttggagaagttcttggttgaagccggcctttatgaaggggaggaggagtccgcgaaacgggaggaggttcttcgggagattgatcagatagtcaaggaatgggtgaagaaggtcactattcagaaaggatatagtgagcaaatggttaaagaggcaaatgcagtccttttcacttttggatcttacagactgggggttcatgggcctggagcagacattgatgcactatgtattggaccctcatatgtgaaacgagaggaggaattttttgtcatgctatatggcgcattatcagaaatggaagaagtgactgaactgcaacctgtacctgatgctcatgtaccagttatgaaattcaagtttcgtgggctaccaattgaccttctctatgccagtgtatctcttccagtaataccaccagattttgacatctctcaaggatctgtactttgtgatgttgatgaagcaactgttcgaagtctcaatgggtgcagggtggcagaccagattcttcgacttgttccaaatgcggagatcttccggaaaacactcagatgtttgaagtactgggcacagagaagaggagtttattctaatgttactggtttgctggggggtgtcagctgggccctattggttgctcgtgtctgccaactttatcccaatgctgtgccaagtatgctggtttcaagattcttcagagttttcacccagtggcagtggccaaatcctgtgatgctttgtgccattgagaacgatgataaccttggctttgctgtgtgggatccacgtaagaatcctcgtgatagatcacatgttatgcctatcatcacgccagcatatccatgcatgaactctagttacaatgtttcaactagcacattgagggttattatggagcaatttcagtttggtaataagatttgtcaggaaattgagcttaacaaggctagctggagttctttgtttgagcctttccaatttttcgaggcatatacaagatatctagtggttgacattgttgcagatgatgatgatgatcttcggctttggaagggatggattgaatctcgattgagacagctgactctaaagattgagcgggacactaaagggatgctgcaatgccatcctaacccatgtgaatatgcagatccttcaatacagtgtgctcactgtgccttctacatgggcttatcaaggaaagagggaatgaaaatacgtggtcaaaaatttgatatccgtggaacagtagacgagtttatgcatgaaattggaatgtatacacagtggaaatccgggatggatctagctgtcactcatgtccgtaagaaggagatccccctttatgtatttgaacagggctgccagaaaactcgtccaccaacgccaatatgtgcagagcagcaagaccagtctgataaaaatgactctgaagtttgcacaacgacagcatctctggtgggtcagctcaagcgaaagtatcattctgttggaggtgctgacgttgactcattcaaatctgttagaagggcttcagttagcccggcttgtgaggaagcatcaattcagttgcatgatgatgcaaattttggactgactaattgctccacttcaccacatggatctgaggggtccactgtatcaggcaacagctgtgcagcagttggcactattggtttggttgatgaaactagctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>GGIFRRGQGEASVVPEADPPLSLAMPTVADLHKTAELEKFLVEA GLYEGEEESAKREEVLREIDQIVKEWVKKVTIQKGYSEQMVKEANAVLFTFGSYRLGV HGPGADIDALCIGPSYVKREEEFFVMLYGALSEMEEVTELQPVPDAHVPVMKFKFRGL PIDLLYASVSLPVIPPDFDISQGSVLCDVDEATVRSLNGCRVADQILRLVPNAEIFRK TLRCLKYWAQRRGVYSNVTGLLGGVSWALLVARVCQLYPNAVPSMLVSRFFRVFTQWQ WPNPVMLCAIENDDNLGFAVWDPRKNPRDRSHVMPIITPAYPCMNSSYNVSTSTLRVI MEQFQFGNKICQEIELNKASWSSLFEPFQFFEAYTRYLVVDIVADDDDDLRLWKGWIE SRLRQLTLKIERDTKGMLQCHPNPCEYADPSIQCAHCAFYMGLSRKEGMKIRGQKFDI RGTVDEFMHEIGMYTQWKSGMDLAVTHVRKKEIPLYVFEQGCQKTRPPTPICAEQQDQ SDKNDSEVCTTTASLVGQLKRKYHSVGGADVDSFKSVRRASVSPACEEASIQLHDDAN FGLTNCSTSPHGSEGSTVSGNSCAAVGTIGLVDETS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>3..50#73..141#259..336#810..917#2059..2121#2202..2363#2790..2903#2982..3044#3157..3489#3568..3732#3881..4486#atggcgggatctttcgtcgcggtcagggggaagcctcggtcgtccccgaagcggagcggcggcggcggcggcgcggatccgcccttgtctctggccatgccgaccgtcgccgatctccacaagacggctgagttggagaaggttatttatctatccactgttagtaattgattatgtgttgcggcgtaggtgtatgcatatgttatttactagtgatagatgttgcttttgtgtcactaagaaaactttgcttttcagttcttggttgaagccggcctttatgaaggggaggaggagtccgcgaaacgggaggaggttcttcgggagattgatcaggtaattaagttgcttccactcttacttgctatcaatggctagtgctagttatttgttaacccaatgtaacttgatatctctgaatattatacgagttaggcggtgggcgcagaaggggatatgtaattatcgcttaaattcatgcactttgttgccggactttgcttaggcagcattgctttcatgcgcttgtgttgtttcggttttatattattctaaccaaaatgatttactgtgcatgaatgtgttgatgcctgcgtgagtacgatataccaattgctagtgcttcctctggggcacaaaagtcctaactaccaatatatgaacaaaatattcttgatttggagcttgccattacctgcgcatggtaatgcagattaactttgtatatgctcacatgttgttttctttgtataagaattagccctttcttgttgttttatgaggtcttctctgcgtctgtgatattgcagatagtcaaggaatgggtgaagaaggtcactattcagaaaggatatagtgagcaaatggttaaagaggcaaatgcagtccttttcacttttggatcttacagactgggggtaaatgcttctttttgttcctttttccttctaccacagttaaatgatcatgttgatgtttctttctagagtgagtcaagcacaaccaattcgttatcacctgaaattgtcagtctttttagcttccatttagatatatatacaacttgaatataactatggaagtactgttgttgctgatacttggtttcttgatttgttcaagcagaataacataccctagcttggttctttggagctagcaactattttcaaattgtgcagcttttactggattgatgatagactggagtagaacaatatctgataattattatttgagacaagagctgtgtagaaagaatttagagtctgttcatttgtggttcacaatctattgcataggtagtagatgctgcttggttgatggtagcttttttcctgtaaggaaacctgatagtgtggacaactcctgttttttgggaaagatccatatattcatttccttccgtttgtccactacttagctgaacctaagcaaaagatgtccaagaggctgacatcaaagaacaaataacacccataaaaaataaagaaagaaagaataaaaaagtaatcttcagtggataagaagaaatacgattcttatttcgacacaaccacccaagggtagagaaagaccttttgcaccaaaacagaaaaaaccccacaaacgaaactagctccatcacgtactaatgtattttggaagctcttcctatggtttctataactgattaataactagaaatctctcttgtccttcactggataggtctaaaagcctaacatgccaaaacaggaataaaatttgctatatttatgcagtttaaagtttttcatccttttctctaacaatacattcctaatatactgtttagtgcaataataatctcacaaattgctgagaatcattcctggtcatgtttggcacaaataaaatcatagatacctattaaagattattaaaccgccaaaattgaaaagtggtgtttctgtttatcagcgggaactcacggtaacaagagtgtgtatttaataatattttttggttgctgtaagtactttcctagtagatcaattttcctttgtgtactttatgaatagtggcctcttttgttaggttcatgggcctggagcagacattgatgcactatgtattggaccctcatatgtgaaacgagaggtgaagtcttctttttgttgcatgctgtctatggattacttaggtcttcatgatggacattaacagtattatttctccaggaggaattttttgtcatgctatatggcgcattatcagaaatggaagaagtgactgaactgcaacctgtacctgatgctcatgtaccagttatgaaattcaagtttcgtgggctaccaattgaccttctctatgccagtgtatctcttccagtaataccaccagtaagttttcatttcctaggatttcgtacatgaactgaaatgcatgctatgcataataacacacgcttgagatggtgttttatgattgcctaatccaacatctgttagtttgcccatttccattctcttcattggttgcctatcccattagtttctgcaactatggatggatctgctatgttgaaactttttatcaaccaatgtgttgactatgtaaggctgctatttggaagtgttgttgaaggacatatataatgtctaagctaactttaatagcattagcagctatagcctataggtgacgccaaaggcaaaagttaatttgccagcttatacaatgtttacattaatctgtatggtttacttcatgagggagttttaacttgttaaattgtatatttattattttttaatgtaccattgcaggattttgacatctctcaaggatctgtactttgtgatgttgatgaagcaactgttcgaagtctcaatgggtgcagggtggcagaccagattcttcgacttgttccaaatgcggaggtaatttaattatgatatcaccatttctcttattatacagtccaaaccatgtcattgtaataaatatatgctatgtagatcttccggaaaacactcagatgtttgaagtactgggcacagagaagaggagtttattctaatgtaagcctggttttatcatctatgatacacttaaatgtgtttgtgcttggatcaaaaccattagcatcaaaaggtgctgaatcgttatgacgccaaatggtttccttgttaggttactggtttgctggggggtgtcagctgggccctattggttgctcgtgtctgccaactttatcccaatgctgtgccaagtatgctggtttcaagattcttcagagttttcacccagtggcagtggccaaatcctgtgatgctttgtgccattgagaacgatgataaccttggctttgctgtgtgggatccacgtaagaatcctcgtgatagatcacatgttatgcctatcatcacgccagcatatccatgcatgaactctagttacaatgtttcaactagcacattgagggttattatggagcaatttcagtttggtaataagatttgtcaggtgcattatctatgcctcaactttatgcctcagagcactaaattctgcatatggtctcattgcctatctttgatgcaggaaattgagcttaacaaggctagctggagttctttgtttgagcctttccaatttttcgaggcatatacaagatatctagtggttgacattgttgcagatgatgatgatgatcttcggctttggaagggatggattgaatctcgattgagacagctgactctaaaggttgctgtattgtagtagcagtagtttcttattactcctatatatggataaactacaatttttatattatttgaagtgaacattaaaatgaggtctatgaatattccatacttagaaacttatgcaagtttgtctttctaacatgcagattgagcgggacactaaagggatgctgcaatgccatcctaacccatgtgaatatgcagatccttcaatacagtgtgctcactgtgccttctacatgggcttatcaaggaaagagggaatgaaaatacgtggtcaaaaatttgatatccgtggaacagtagacgagtttatgcatgaaattggaatgtatacacagtggaaatccgggatggatctagctgtcactcatgtccgtaagaaggagatccccctttatgtatttgaacagggctgccagaaaactcgtccaccaacgccaatatgtgcagagcagcaagaccagtctgataaaaatgactctgaagtttgcacaacgacagcatctctggtgggtcagctcaagcgaaagtatcattctgttggaggtgctgacgttgactcattcaaatctgttagaagggcttcagttagcccggcttgtgaggaagcatcaattcagttgcatgatgatgcaaattttggactgactaattgctccacttcaccacatggatctgaggggtccactgtatcaggcaacagctgtgcagcagttggcactattggtttggttgatgaaactagctgacctggctgcttgatgcccaatgttgaaaatgatccaattcaaacaattttagagcaggcgccttcagaaagtgtggttgagaaggatgaaagaaaactagaaggaattgaaagcttggcaagtagcaactgtactgaattcatggaggttgcagaagtggtcgctgggacgatccttactgagaatggtgatatacgcttaagtggacatgaagtgatctgaattggccttccagatggaggttttgctttctgtgcactcactctgtactgtgcttatcctttcatttcgttctgcttaaattgactgacctataaatatgaatatggtgttggattggtttgcaaagatcttttcaggtgtggaaccggatgcatcccaggtttgaaag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|
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