Os02g0319100
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Structured Information
| Gene Name |
Os02g0319100 |
|---|---|
| Description |
RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif) domain containing protein |
| Version |
NM_001053214.1 GI:115445798 GeneID:4329159 |
| Length |
7936 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os02g0319100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:12749934..12757869 |
| Sequence Coding Region |
12750773..12750806,12750883..12751026,12751101..12751564,12752969..12753127,12753208..12753324 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008395:12749934..12757869 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008395:12749934..12757869 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggagcagcgtgaggatcataccaaatcatcagaacctgcattcattccatccaaaaggactcatcagatgagaaacatatgggcatggggaggtccttcttcaactacagtcaacggatcaagtgacgcggtcttgttctccagctcgttgccatcagttctgcaatttggaaaactgccaggtaaagaaagggagtacaatgctcaaccaaaggatgatatgtttcccatgatgaagcagccaggcactaatgctagagtggctgaccccatggatgatgtagcacagcatttgattggaaatctgttaccagatgatgaagagctattggctggggtaattgaagattttgatcatgttaaactgagaacccaagttgaggaatcagaagaatatgatgttttccgcaatagtgggggtatggagctggatattgaccctctggaaagcatcacctttggtacagcaaaggctagccttgtcaatggtactggaagtagcactaatcagtacagcatccaaaatggtgctggaacagttactggtgagcatccttatggtgagcacccgtccaggacattgttcgttcggaacattaatagtaatgttgaagactcagaactgcgctcattgtttgagccatttggggatattcggtccatgtacactgcaacgaaacacagaggattcgttatgatatcttactacgatatccgtcatgcaagaaatgcaaagactgcattgcaaagtaaaccattaaggaggaggaaacttgacattcactattcaattcccaaggagaatccgtcagataaagatatgaaccaaggaaccctggtgatctttaatctggaaccagctgtttcaaatgaggaactccttcaaatttttggtgcatttggtgaagttagggagataagagagacaccacataagcgacaccatagatttattgagttctatgatgttagggctgcagaatctgccctccgttcattaaacaagagtgacattgctggaaaacgggtaaagttggaacctagccgtcctggtggagctcgccgaagttttatacagcattttaatcacgaatttgagcaagacgaaacaaagcataattcatttcagattggttcaccttctgccaactctccaccaagtttgtggtcccaacttggcagcccaacagatgaaaataaattaaatgcactcaatgaaactgcatttaatgggggaatgagccctttgggcagtaaccatctttctgggttctcttcaggatatcctcccatgaaatcacccgttgggaagagctcctattggaataaccgtgctgacaacatattccatgggtcaccaactttgcacaattcacattcgtttccagaacatcatggtggaattataagtgccagcccgcttgtgtcatccgcagcttcgtcagcctctactgcatctggttttactgcactgactggaacatcatttctctggggtaataacaataacttaagggatcatggccagccttcatctatccaatctcaagctcttagcaactcactttttcccaataaccagccacaacgccagagtaatctgtatcagaatctgcgtggttcctttggggcatccgagcacttctcccagtttaatgttgggtctgccccatctgttttcccttttgagagtaatttcggctatttctctgattccccagacacatcttacatgagacagggaaagtttggcggcacaggccccacacgtgttagtggaagcctcatgacgaactttggtgcctatccccgcattaatgttgcttccatgcaaaacggttcagttggttttgaaggtctgcttgaccgtggccgaaatcagacagttggaaactctgggtgtcaggaagatagcagagtgcaatatcaattagatttggagaagatcattgctggtaaagacaccagaacaacgttgatgataaagaacataccaaacaagtatacatcaaatatgcttttggaagtaattgatgaaactcatgaagggacttatgatttcttctacttgcctattgatttcaagaataaatgcaatgttggctatgccttcattaatatggcatctcctggttatattgtatctttctttaaggcatttgctggtcggaaatgggaaaaatttaacagtgagaaagtagtctcgttggcatatgctcgaatacaggggaaagccgcacttgtaaatcatttccagaattcaagcttgatgaatgaagacaagcgctgccgccctatgctatttgatcccaagcatactgaaaacaacaatcagatcctgttgaacggaatatttatctccatggcccagcaagatgccacacaagaaaggcatgacctccctgaaaacccaagggaagataatttcagttaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MEQREDHTKSSEPAFIPSKRTHQMRNIWAWGGPSSTTVNGSSDA VLFSSSLPSVLQFGKLPGKEREYNAQPKDDMFPMMKQPGTNARVADPMDDVAQHLIGN LLPDDEELLAGVIEDFDHVKLRTQVEESEEYDVFRNSGGMELDIDPLESITFGTAKAS LVNGTGSSTNQYSIQNGAGTVTGEHPYGEHPSRTLFVRNINSNVEDSELRSLFEPFGD IRSMYTATKHRGFVMISYYDIRHARNAKTALQSKPLRRRKLDIHYSIPKENPSDKDMN QGTLVIFNLEPAVSNEELLQIFGAFGEVREIRETPHKRHHRFIEFYDVRAAESALRSL NKSDIAGKRVKLEPSRPGGARRSFIQHFNHEFEQDETKHNSFQIGSPSANSPPSLWSQ LGSPTDENKLNALNETAFNGGMSPLGSNHLSGFSSGYPPMKSPVGKSSYWNNRADNIF HGSPTLHNSHSFPEHHGGIISASPLVSSAASSASTASGFTALTGTSFLWGNNNNLRDH GQPSSIQSQALSNSLFPNNQPQRQSNLYQNLRGSFGASEHFSQFNVGSAPSVFPFESN FGYFSDSPDTSYMRQGKFGGTGPTRVSGSLMTNFGAYPRINVASMQNGSVGFEGLLDR GRNQTVGNSGCQEDSRVQYQLDLEKIIAGKDTRTTLMIKNIPNKYTSNMLLEVIDETH EGTYDFFYLPIDFKNKCNVGYAFINMASPGYIVSFFKAFAGRKWEKFNSEKVVSLAYA RIQGKAALVNHFQNSSLMNEDKRCRPMLFDPKHTENNNQILLNGIFISMAQQDATQER HDLPENPREDNFS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>840..873#950..1093#1168..1631#3036..3194#3275..3391#3537..3688#4561..4652#4754..5431#5518..5680#5771..5855#5936..6004#6456..6635#7493..7591#gccttccgctcccttctctctcttccctctcaactcctctctctctctccttcgtcgtctcctcctccccctctgctcctccccctcgtggcgcctccggcttgccgcgcgcgcccgcccgcccgcccgcgcccaccggcgcgagccgagggtacacgaggagttcggcctttccggtttccggttgtgttgtgaggagtggcggcggcggcggcgaggcggcgacgaggcgacgccattgcggggtgtggcgcacaccacacccccctcatcgccgctggaccggtaagctctcggacctgctgggatggagtgggggattagcaaaaaagttaaggaaagataccaatatctcatattcccaggcatctctgcgtgtgattgtgtccgagaagaaagaggaagtcgtcgtgcgtgcgtcccctcggcgtcgactgctggtgagttcgcccgccgcctgcgcagatttcctccaatttgcgttaacccctttgcttgtttctcgtctagacatgggtcttcctcttaatattcgtgttagccttaataatactaataagtttgtttgttccccaaaaagtttggggggtttaattgaaccccctatgccccatgttagatccgcccctgatacggtttgcaaagatgagaagttatgtttcccttatttggaccctattgatgtcattcgtggtgatagtagtactagggtggttgactggttgtggtcctgttgtttctactacaattgtactatatgacaagggatttttgtacatcatgaattgttgtaaatcagcattgacatcattttgattctttttttcagtattgatgcgatggagcagcgtgaggatcataccaaatcatcaggtactttaataccactctataggtgatgaaaattttgctatactctaatccatttaatatttatgatgttgtacagaacctgcattcattccatccaaaaggactcatcagatgagaaacatatgggcatggggaggtccttcttcaactacagtcaacggatcaagtgacgcggtcttgttctccagctcgttgccatcagttctgcaatttggaaaacgtatggaaattttcttttctgttaaactacgatcaattcccatacatgagctcacatcatggtgtctcatgcagtgccaggtaaagaaagggagtacaatgctcaaccaaaggatgatatgtttcccatgatgaagcagccaggcactaatgctagagtggctgaccccatggatgatgtagcacagcatttgattggaaatctgttaccagatgatgaagagctattggctggggtaattgaagattttgatcatgttaaactgagaacccaagttgaggaatcagaagaatatgatgttttccgcaatagtgggggtatggagctggatattgaccctctggaaagcatcacctttggtacagcaaaggctagccttgtcaatggtactggaagtagcactaatcagtacagcatccaaaatggtgctggaacagttactggtgagcatccttatggtgagcacccgtccaggacattgttcgttcggaacattaatagtaatgttgaagactcagaactgcgctcattgtttgaggtatattcgtaagtccatggaggcttaattctgttgcttaatgttctgcatagtattttctggtaaaatattcttgaaatctagttatttaacatactttgtggcttcatatttctcctagtagaaaaaactatcagcactccaccaagacaagatgctatcctatgagctttgattggattctaatatgcacatgcatttcatgtcttcactgttgtccttttctttgggcatgccaacagactgcaagctgttcatgtagagaagcatggttacgctacatgttatgtttacttaacattttcctggttatccctcttatcatatgataataaacaacagtttttattgtattagtaatttaaaactcatttaagtttatccaaacaaactaatacctaaactcatgccttagttcattatcctaaaaagattttattgagcatatttctttgatactactgttattacatgacccaagtaatactgtgttgaaatagaataactcagacgaatacacagctataacttgggtgctgattagtctaaactttcagagatcataacgtggctattggcatgtagcatagatgaacctttattttgttgaatttatattactcaaaacatgtctgaagtcagttgttgtgttatctcacaataaaatgttggttgtgtcaaacaaactagcatgcaaaaacttttcactccacaatactacaaaagcattattagtattattctgttccgtttattgtttgttgcagttaagcttaggggtttcttcttttcttttttttatatacatagaaatgcaggtctttaatagtaacctttagggcatgtttggaaattgggttagggaaatgttatcccaccctccaaatataacttttaatcttagctatccattcatctcacctcatttcatcccaaccttccattcatttccatttctcaatcccaccctttataacccatttatccaaacgcaccgttatagtttagtctaacatagtaacatgtttatatgataaccataggcgctgaaaataccatttaacaaacattccttttataaaatattccatggtaataagatctctctttagtgaattaaggcgctacattattgtataataactgaggattactgtcttaagaatggagaaaacaaaatagaaagtagcaaggtattagggcacttcctctgttctcagttcacattttgttattataaatcatggaaccagtttgtaatagcttgttataatctgtctcaattgaatttgcaatttctcatgtgtagtaaaccttccacttttcatttcattaaggttattataacatgtacgtatattttatagtaattattattgctttgctaagcatacttattttcagccatttggggatattcggtccatgtacactgcaacgaaacacagaggattcgttatgatatcttactacgatatccgtcatgcaagaaatgcaaagactgcattgcaaagtaaaccattaaggaggaggaaacttgacattcactattcaattcccaaggtcaatacttttgtcagctattttaatatatcctattctcaatatcattctctgttgatttatttgatttttcttcacaggagaatccgtcagataaagatatgaaccaaggaaccctggtgatctttaatctggaaccagctgtttcaaatgaggaactccttcaaatttttggtgcatttggtgaagttagggaggtaaaaagtgttactctgtacctcctaactgatccaatcattgtgcaccgtatacttaggaacccatatatccttctagaaagctttgttaaaattaacttcaacagcatgttttacataattttgtgctttacgcctggtgcagataagagagacaccacataagcgacaccatagatttattgagttctatgatgttagggctgcagaatctgccctccgttcattaaacaagagtgacattgctggaaaacgggtaaagttggaacctagccgtcctggtggagctcgccgaaggtctgtattgctgtacatcacatgtcttttgtgttcgctaaataagattgtaccatagctgcttctgtgatttgcttggttgcatgctgtcatagtttttttcgctgagatgttgattttgtgacttatttttgtttgttcagttattgctgaaattctagatgatgttttagtgtgcatttaactttttatttagcattgaaaattactgcatgtgggctggcttaacatatgtactttgaatcccctaactcctgttgtacatagttactcactccattggaatttgttaggttaggcatgttgtacctcagcacagagtttaagaagggacattaaatgaccagattacatggtattagtgtttatgcatgcatgcaccataattcgtagtacagaaagtaatgggtcagggttggaaaatctacggaactttttccatgtctgctgtgtgccttacaattgtcaaactagaagagaaaaaaaatcaaaccatgctgaacaaattttgatggagggagtattctctatggtctgttacttgaatggcctttctgacatcaacatctagaaccgtcggactgagaacttcctgtcacttgtgtcctaaggagctttgttaattttttatttgcacttctgttatgcatcatgttatctagtataatgcatgttccaagttctgtgtcaatttgtctagtgatgtttcaaatgaaaatattcttgattggttgttgagggaaaaaaaatccaattgtggattcctctattatctgtttttgttatgcatttaactttcacttgtttggtattttcctttactgtatacagagtattgcacatattctcatggttgtattcttgttatgcagttttatacagcattttaatcacgaatttgagcaagacgaaacaaagcataattcatttcagattggttcaccttctgccaactctccaccaagtattataatattttatagcccttaatctacatcatttatttccttgttctcctatggttatattattacatttgttttaagtgtttcaatttgttctcaggtttgtggtcccaacttggcagcccaacagatgaaaataaattaaatgcactcaatgaaactgcatttaatgggggaatgagccctttgggca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|
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