Os02g0571300

From RiceWiki
Revision as of 19:17, 22 July 2012 by 124.16.129.48 (talk)
Jump to: navigation, search

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information

Gene Name

Os02g0571300

Description

Terpenoid cylases/protein prenyltransferase alpha-alpha toroid domain containing protein

Version

NM_001053725.1 GI:115446820 GeneID:4329728

Length

10012 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os02g0571300, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:22711442..22721453

Sequence Coding Region

22711663..22712256,22712346..22712487,22712566..22712781,22712878..22712973,22713065..22713194
,22713314..22713526,22713640..22713737,22713852..22713972,22714076..22714293
,22717766..22717946,22718057..22718342,22719038..22719099,22719904..22720012

Expression

GEO Profiles:Os02g0571300

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008395:22711442..22721453 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008395:22711442..22721453 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atgatacttcctatgagttcagcatgcttaggacaattcctcagagcttcaccccgtgggatgatagagcagttcaacagagcacctcctcttcgtgtgagcataagaggagctgcaggtgttgagaagagcctgggattagggaggaatgcgggaagccaacaaggcatgcagaagaaccaactgcaggataagataaggaagcaacttcgggaagttcaattatcaccatcttcatacgacacggcatgggtagccatggtgccagtgcagggctctcatcaaactccacgcttcccgcaatgtatcgagtggatactgcaaaaccaacatgatgatggatcttggggcacaaacctgccaggttcggttgtcaacaaagacattcttttgtgtacattggcatgtgttgttgcactgaaaagatggaatactggacgagatcacatcagcagaggactgaattttattggaaaaaatttctgggttgccatggatgagcaaactattgctcctgtgggttttaacattaccttttctggcttgcttaaccttgccactggaacgggtttggaattccctgttatgcaaacagatattgatgggatttttcacatgcggaagattgaattggaaagggatgcttatggtacagcttcatcaagaagagccttcatggcatatgtgtctgaagggttgggcagcctacaagattgggatcaggtaatggcatatcaaaggaagaacagatcgattttcaactcaccttctgcagctgctgctacagtaatccatggccacaacgatagtgccctctgttacttggattcacttgtaagcaagctcgatggcccagtcccagtgatgtatccgcaaaatgcttactcacagcttggcatggtggatactcttgaaaagatgggtatctctaataatttttcttgtgaaataagtgatatattggacatgatatacaggttatggatacacaacgaggaggagctaatgttggacatgggaacatgtgcgatggcatttcgcctactacgtatgcatggttatgacatcagttcagatggaatggctcaatttgtggaacaatccagctttgatgactcaattcatggatatctaaatgatactaaggctttgctggagttgtacagaagttcacaaattcgttgcttggaagatgatttgattctacaagatattggttcttggtcagcaagagtactacaggaaaaaatatcttccaaaatgacacacaaatcagaaatgctagaggtggagtatgccttgaaattcccagtctatgccaccttggaaaggctagagcagaagaggaacatagaacaattcaagaccaaggaacaactaaaaattgagggcttcaagctgctgaaatcaggataccgtggcgctattacacatgacgaaattctagctttggctgttgacgaattccattcctctcaatctgtctaccaacaagaactccaagaccttaatagttgggtggcacagaccagattggatgagctgaaatttgcaagattaatgccatcgatcacctatttcagtgctgctgcaaccatgttcccttctgaattatccgaagcccgcattgcatggacccagaactgcatcttgacgaccacagtcgatgacttctttgacggtgatggatcaaaagaagaaatggagaacttggtcaaattaatagagaagtgggacgggcacggtgagattggcttctcctccgagtgtgtagagattctattctatgctatttacaacacgagcaagcagattgcggaaaaggccgtgccgctgcagaaacgcaatgtcgtggatcatatcgccgaatcgtggtggttcacagtgaggggcatgttgaccgaggcagaatggaggatggacaagtatgtgccaacaacagtggaggagtacatgtcagctgccgtggactcctttgctctaggccccaccatcacctcagcggcattgttcgtcggaccagagctctcggaagaggttttcaggagcaaggagtacatccacctaatgaaccttgcgaacactatcggccgccttctcaatgacatgcagacatacgagaaggaaatcaaaatggggaaggtcaatagcgtcatgttgcatgctctttcccacagcggcggcggccgcggctcaccggaggcatcgatggaggaggccaagagagagatgaggagggttctccagggtagtaggtgtgacctcctaaggctggtgactagagatgggggggttgttcctccaccgtgcaggaagctcttctggttcatgagcaaggttttgcacttcgtctacatggaaaaggacgggtatttcacggccgatgggatgatggcatcagcaaatgcggtgattcttgatcccctgcaagtgacacttcttccatctggtttgggaacgctgtga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MILPMSSACLGQFLRASPRGMIEQFNRAPPLRVSIRGAAGVEKS LGLGRNAGSQQGMQKNQLQDKIRKQLREVQLSPSSYDTAWVAMVPVQGSHQTPRFPQC IEWILQNQHDDGSWGTNLPGSVVNKDILLCTLACVVALKRWNTGRDHISRGLNFIGKN FWVAMDEQTIAPVGFNITFSGLLNLATGTGLEFPVMQTDIDGIFHMRKIELERDAYGT ASSRRAFMAYVSEGLGSLQDWDQVMAYQRKNRSIFNSPSAAAATVIHGHNDSALCYLD SLVSKLDGPVPVMYPQNAYSQLGMVDTLEKMGISNNFSCEISDILDMIYRLWIHNEEE LMLDMGTCAMAFRLLRMHGYDISSDGMAQFVEQSSFDDSIHGYLNDTKALLELYRSSQ IRCLEDDLILQDIGSWSARVLQEKISSKMTHKSEMLEVEYALKFPVYATLERLEQKRN IEQFKTKEQLKIEGFKLLKSGYRGAITHDEILALAVDEFHSSQSVYQQELQDLNSWVA QTRLDELKFARLMPSITYFSAAATMFPSELSEARIAWTQNCILTTTVDDFFDGDGSKE EMENLVKLIEKWDGHGEIGFSSECVEILFYAIYNTSKQIAEKAVPLQKRNVVDHIAES WWFTVRGMLTEAEWRMDKYVPTTVEEYMSAAVDSFALGPTITSAALFVGPELSEEVFR SKEYIHLMNLANTIGRLLNDMQTYEKEIKMGKVNSVMLHALSHSGGGRGSPEASMEEA KREMRRVLQGSRCDLLRLVTRDGGVVPPPCRKLFWFMSKVLHFVYMEKDGYFTADGMM ASANAVILDPLQVTLLPSGLGTL</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>9198..9791#8967..9108#8673..8888#8481..8576#8260..8389#7928..8140#7717..7814#7482..7602#7161..7378#3508..3688#3112..3397#2355..2416#1442..1550#atgcgtgttgccctctttcatgcaggcacggccgatagctgatcaacgataagctgctagctagttcctcctgcccccttggtctctctcgttcagagatcgagctgcggcctagctagcctaccctgttctgccaggttttgcttctcctgcgtcctgcctctctcgtttctgtaaggtgggtttctttctccgatgaatctaaacagactgccccttttaaacatccgtgtcctttcagtgctctacactttgcttcgtacaccaccgtttgtgttctgatacagaaaataacctcgtttgacgtagtgtcaaaacctgtgctgttaaggcttactctctccatccacaagagtaaactatttcatattttattttttttttctaaataagttgtttctattggtagtctttattcatctaaaatttaaatagagaggtaaaattaaatgtttgatcagaatccgagtagtcatattaatactcattgttgcatgcgtgtatatacttcttgatttttgttagatacaatatgagttaacttctacttaattttggtgacgaaagtaatacgtacgtacataacttttgtggaatagagtatattacttgttccttatgctttattctatttgtttgcacagatctctcattgcacaaaaacaatatgacatcaaacaactgatacatatttccgtagaaaaaacaaacggattcaaacttctgcatatttcaattaatatctgacacgttctcccgatttgcatgaaactttttttctctctctcttcctagttctttttttatatttttcttcttctcgtggtgtacatgtgagtggcagtgcagccagtcataaattcagaatgcataatttctcaaacccaagtcctcaagggcgtactgtacgtacgcacgtgctgaatgctagctagcaataatcaaatcgtttaacttgacttggaagatagtactccctcccaccctaagttgctatactatgggacggatggagtataacacaagtacacagttaatatttcatattagtagaacaacccaccgtctatcccacaggcttagaaatggcacaggtaagaaacgagagactgcataaagtttactttgcaagatttggttatgtatcaagatagcttagccctaaaccacctaaaatagggtacgagggatttaagagtccggattaaatatatgagtggtgtattttttttctttcataattgaagaggttaattattgtactttttgtaatagttgaggtggtgaactggacctacgatgaaagggagtgatatagatagctgaatcataaactagatctagatgacttcgcttatattattattactttttcagcataaacccatgttgcatgtaacatagaatcatattgtgtagtatcgttatagggtagttgtggatgatacttcctatgagttcagcatgcttaggacaattcctcagagcttcaccccgtgggatgatagagcagttcaacagagcacctcctcttcgtgtgagcataagaggtatgaggtacctcccaagcgctacaaaatatctcatatgatttattgtatatatatgtatgtatgcatatgtatatgtgtatacatacacatatatataggacactcatatgggacaccatggtatgaaatacacaaatccgctcaaatttttcaaaaatttcaaattgtgagtatatacctagttataagtattcgattcatacctatacctatcaacaaaacaactcaaatttaactttatttcacaatccaatattacatacctaactaattatatgtttggatgctatatacctagaatcgaattctaataaaaacatgtttaaattcagttaaaacttgttttgaactagtcagtaaagtagttaatattaatacctaaccatttaaaaaaaatcataatcatttgaattgagtacacacatatatatatacctctttgctactccctctctatttcatattataagtcgcttgatttttttttctaatcaaactttgttaagtttgatcaagtttataaaaaaattagcaacgtctaaaatattatgttctaacattgaatacattatgataatatgtttgttttgtgttgaaaatactattatatttttctataaatttggacaaactcaaagaaatctaactaagaaaaaagtcaaatgacttataatatgaaactgatgggagtatttgagagtacagttgttgaggttgttactagacagataaattttattgtctatcacaatccttacaagtgcaaagaggtatctcacgcatattcttcgctttccccaggagctgcaggtgttgagaagagcctgggattagggaggaatgcgggaagccaacaaggcatggtaggacaaatatatacatggttcagtttttaatatataatggagtaattaatggtccattttttaatacataatggagtaattcattaaaagaaactatcgacctccgtactaactagtgactagccagagatgcgcactgccaaaatcagtagaaaaaccacaacaacatgacaaaatatgaaaatgcaatctgaaagatgaaaagagaatacatgaaggccatctatgcaaacgaggcactctccaagagactgcgatagtaccttcctaaagaaaatatcatatatatatgtttaccatattgtcctatcaaaaagttaggttttcaccacaacaatttcaagacaacacctttcataagggattagatcaataaacgtacatcgatattgttgatcaagctaaactagatctacaatgttttcacccagaaaacagcaaaacaatctcacttcagaactctatgtacccatccatgaccaaagaagctcagtggtggcaaaaaaagaagaaggaaaaatgccaccaatgacttcatcgcattaaagcttctaaaaaaccagactcgattagttgtgatcatcaacagattaggctagatcgaacagcagctgagtattgtaactaaacctcgtgcattgaattgtgaaacatatcgatggttgagtttattattctgatgggatatgcagcagaagaaccaactgcaggataagataaggaagcaacttcgggaagttcaattatcaccatcttcatacgacacggcatgggtagccatggtgccagtgcagggctctcatcaaactccacgcttcccgcaatgtatcgagtggatactgcaaaaccaacatgatgatggatcttggggcacaaacctgccaggttcggttgtcaacaaagacattcttttgtgtacattggcatgtgttgttgcactgaaaagatggaatactggacgagatcacatcagcagaggtacaaatcaataattgcatttatgttgttgttgtttttaatatattgtctagatatttataatgtagggtgaaacattcttatatagctacgaaaaatggttttggcaggactgaattttattggaaaaaatttctgggttgccatggatgagcaaactattgctcctgtgggttttaacattaccttttctggcttgcttaaccttgccactggaacgggtttggaattccctgttatgcaaacagatattgatgggatttttcacatgcggaagattgaattggaaaggttagtcgatttcaaaatccaagtgtgaatatttgtatttatttgttacttttagctttgtatttacgtgacaactaatattggtggtgacacagccagacatgtagggcttgtttatgtagaagaaactttccaaccctttctcattagcttatgaactaatttggtacactagagtctggtgcatatagatcaatcttctatccttaatacaaatgaggcaaaattctcatgcatttaaaatactccctctgattcatattataagttattttgactttttttctagccaaatttcttttaagttttaaccaagtgtatagaaaaatatagcaacatttttttcacaaaacaaacatattatcaaaatatattaaaagttagttgtaatgaaactaattaggtgttttagattatgctaatttttttcataaactcgataacaaaataaagtcaaaagcgacttataatatgaaacagaaaagtagctcgcaagtgctttttgttgtattctccctataaactaatagtcatctatctattatatactaaaattttattaaactttctagaaacgctcttaatccttacattgcacttcaacaaatgctactaaaccgtcatgtggcactctaataaattacgaaaaattcttaaaaaatttaaggagaaacaaaacaatggactgttggtttacatttacattattaaattattgatgtgcccattactttttaccatcatattaggtgtttgtttaagtgagcttctggcagctgcaacttttcctagaatctcttggtaccataagttcccccccaaagtctagattttaacctagattctaaacagctgtagttacaatccataaaatgaattaagaagctagaagttggatttgtcaacttctccagattctcaccaacggcttctcagaattttaaactctcccaaataaggcctagatctatctaacaaatttgtccctcctaaatgccggcgaggaaaaacagtgcgtaggtaccaacagcacacctattaagaaaataaataaaatgtatgtacgtacttacaggaaaacaaacgtacttatttacagacgataggacaactattaatccttccctcctaatcaatttttaaaattaaaactttgttatgtttggacatacatacatacatacatacatacatacatacatacatacatacatacatacatacatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgtatatatgccattagtccacccccggtgatacctttcacttagggtgtggaaatttctccgttagaaccgaggacctgccacaggtgagaattctcacccgctggtgagcaggaccggggccctacatattttcgggtgcggggcggtgattgaaagcaaccatcaggtgacccgacgagggtcccgggtgtgcgctactcctctaaaacagcccatttgaagtgtgtaagcccagttgatccattccaacttctccatatataagctaaaatcccctcacactctccctcccagccaccagccccaagcaatccaccacaaggcgacagctgctcctcgacgctagatcctctcccctcactctcttcctcaccctgctgccagccccaggccgcccatcacgacgcgcgattgccccaatgcagtcacagcaaaaggccggaggcggctgctcctctgtgccggatccactccacaccagctttgactcttcaccgcggctcctcacctcctcttctctgcgtctctgtgccttctcgtcggtcgtcgactcttcaccgtgttgccacgctgtcgtgctttcttgtcggccactgactcttcacttcggcacatggccacattgttgccgagtttccttgacaccacacctccagccaccgtctagcccctagtcacctttgcaaggactcaaggctcttgatgtggcacttctagtatgatgctacagaaaatgttttgctgctatattgattttagtgtgagattgggttttctagattctgttgtaatcagatctgggttttcccctaatttaaaaatctgtgttgtttatctccactttgaagtgctattattgtaaattgtgttgtgttgtttgaagggtgatttgattccatatgggggcctgtcaggttgcgaggccctagaggggccgagagtagggattgatttcgccccgttcattcttctggggcccgggccaaggaaacccgtaggaaagcgggggcggggacgtttctgtccaactcaccccccgccttgccccgttgccacccctactttcacacatctttcattttctacaattcctaactaggatatacgtaaattaggcctataacacaacaaaaaatgttgcatctcagtatgttaactatattttgtttttaaaaaaaaatcgcatggaactagcgttattttatgtctttctccaaataatatttttttagtaaaatactactagccaagaattacaaaacttgtaaccagttaagaacaatagaggttagaatatcatttaacgtacaaacatgtagaaaaatctcattcctaaaaacatcaaaccaactcttaatcaggcaagacgttgtcgtaaacctttcgatttgtttgtttccaaataggccaacaagcaaaagatatgttctcaagaaaaccctttcttctaaactatagccttgctactagcatttgacagattcccaaattagtattccacctaattccaagatgatcctagtagctcttgctaaagaaacatgaaaaacaaatgcattaaggtttctcttggccccacgcacaaagcacaagatagatctacatcctcctgggcataatgctttctgtccaacttttgtcttgtgttcaatttgtcccttagaagtagccacatattaaaaaaatcacatggaacagtattcttttggtactgtgggggcggtggtgggaggacggggtgggattggttcatccatttgggatgttggagttggagcacccaaaacacaaaataatgacttggtactgaagattcttattgagaatttgcaagagatgttctaagcccttgtattccgggagaaacttcgaacttccaaaagtacttatattttggaatggagtatatttacttatcatacttcccttattaaagggttaggtttggagtatatttacttattatacttcccttattaaggtgttaggtttgttgttaatggcatttgcaataagatgttttctttccttactatgaggttttacctataacaaggtaatagattatatcacccattggatcaaacaccaatgaactgttcaaatatgcttggagctccttaaaaagtccttatattttatttagaattttcaatgttatcatttgacgatctccatggtcagggatgcttatggtacagcttcatcaagaagagccttcatggcatatgtgtctgaagggttgggcagcctacaagattgggatcaggtaatggcatatcaaaggaagaacagatcgattttcaactcaccttctgcagctgctgctacagtaatccatggccacaacgatagtgccctctgttacttggattcacttgtaagcaagctcgatggcccaggtgtgctcccccccccccacccccctgcccaagcaagtgaccaagaatgtcaactagatatatgagatatcaaatatactaattggaaatgagtgttttccagtcccagtgatgtatccgcaaaatgcttactcacagcttggcatggtggatactcttgaaaagatgggtatctctaataatttttcttgtgaaataagtgatatattggacatgatatacaggtaacagcaactcataaaaaatgacctaattaaaaagttataggatgggctaatgatggcaatttgatgtgcctttgtacctactactttatttctattgtattctgttcgcaggttatggatacacaacgaggaggagctaatgttggacatgggaacatgtgcgatggcatttcgcctactacgtatgcatggttatgacatcagttcaggtattgcatggagctttaggacacttaaatttgaatatcctagttttttttccgttttgcagtacaaactctcatttggaaatgttaataatcatttcggaactattgagcagatggaatggctcaatttgtggaacaatccagctttgatgactcaattcatggatatctaaatgatactaaggctttgctggagttgtacagaagttcacaaattcgttgcttggaagatgatttgattctacaagatattggttcttggtcagcaagagtactacaggaaaaaatatcttccaaaatgacacacaaatcagaaatgctagaggcaagtactaaataaataacctcttagcgaactaatgttcttgaataattaaaaaacatctcagccatgcaaaagagaaggcaattatttctcataatgccattatcatactttcgcaggtggagtatgccttgaaattcccagtctatgccaccttggaaaggctagagcagaagaggaacatagaacaattcaagaccaaggaacaactaaaaattgagggcttcaagctgctgaaatcaggataccggtagatatcattgttacacatcacagccgtacaatttatttctttactgttatagttgtctaaattgtgaacctattataacttggatcagtggcgctattacacatgacgaaattctagctttggctgttgacgaattccattcctctcaatctgtctaccaacaagaactccaagaccttaataggtgcaaaatctatctatatatgatatacctatccccgattcatccattgtgataagatgtttttgataccattgactaatattgagcatatgacagttgggtggcacagaccagattggatgagctgaaatttgcaagattaatgccatcgatcacctatttcagtgctgctgcaaccatgttcccttctgaattatccgaagcccgcattgcatggacccagaactgcatcttgacgaccacagtcgatgacttctttgacggtgatggatcaaaagaagaaatggagaacttggtcaaattaatagagaagtacaacacacctgtacactatgtcttttgtacaactaatatctattagtcccgttgtgatcatatcgtgttgtacaggtgggacgggcacggtgagattggcttctcctccgagtgtgtagagattctattctatgctatttacaacacgagcaagcagattgcggaaaaggccgtgccgctgcagaaacgcaatgtcgtggatcatatcgccgaatcggtaaatctctctcttcatgtgtgtgagtttccacttttaaggcttctaggttttacttttccacgatataatatataatctatttgcagtggtggttcacagtgaggggcatgttgaccgaggcagaatggaggatggacaagtatgtgccaacaacagtggaggagtacatgtcagctgccgtggactcctttgctctaggccccaccatcacctcagcggcattgttcgtcggaccagagctctcggaagaggttttcaggagcaaggagtacatccacctaatgaaccttgcgaacactatcggccgccttctcaatgacatgcagacatacgagaaggaaatcaaaatggggaaggtcaatagcgtcatgttgcatgctctttcccacagcggcggcggccgcggctcaccggaggcatcgatggaggaggccaagagagagatgaggagggttctccagggtagtaggtgtgacctcctaaggctggtgactagagatgggggggttgttcctccaccgtgcaggaagctcttctggttcatgagcaaggttttgcacttcgtctacatggaaaaggacgggtatttcacggccgatgggatgatggcatcagcaaatgcggtgattcttgatcccctgcaagtgacacttcttccatctggtttgggaacgctgtgaccaaacaaaacctgaaatttgtactgtgttaagctgcctgaaagtgtttattgctcgtgtagctttcctgcaaattataactactaggtcgaaataagttacttgtaatgtctatcactcaataattcttggtctagaaagcatgtagtgtattcaaacgttcaacgttttactcgtaagtatgaaataagttgcttgtaatgtatacaactactcttttc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os02g0571300, RefSeq:Os02g0571300