Os02g0603600
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Structured Information
| Gene Name |
Os02g0603600 |
|---|---|
| Description |
Similar to Phytochrome-interacting factor 3 (Phytochrome-associated protein 3) (Basic helix-loop-helix protein 8) (bHLH8) (AtbHLH008) |
| Version |
NM_001053899.1 GI:115447168 GeneID:4329910 |
| Length |
8022 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os02g0603600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:24501316..24509337 |
| Sequence Coding Region |
24507503..24507568,24508095..24508163,24508929..24508976 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008395:24501316..24509337 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008395:24501316..24509337 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>gaacggaggacgagaattagcgagaagctcaggaagctgcaggagctggtgcccaacatggacaagcaaacaagcacagcggacatgttggaccttgcagttgagcacatcaagggtctgcagagccagctgcaggctctgaagcatgagcaggagaagtgcacttgctgcagcaggccttga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>ERRTRISEKLRKLQELVPNMDKQTSTADMLDLAVEHIKGLQSQL QALKHEQEKCTCCSRP</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6188..6253#6780..6848#7614..7661#tgggcccgcacggcggcggcggcggcggcggcggagggggcggagggcatgggcatcagctgcaggacgggagcgtggacttgctggcgcggcacagcagctcgccggccggattcttctccaacctcatggccagcaacggtaagatcgatcgatcgattgcgctagccaacccattgttcgattttatttgttcatccgtgttcaatttggcgtcgcgtgcgtgcatagctagcccatcgtgtataggcgtatagctaattggttaggactactcagagtcacggatcttcaatttctagcttaattctgtcaggagagaacggctagctgtgcaaatgtcaacctcgtctttgccttcacatgccccatctctttctcgtcacacacgcacacgatcgaagtatcgatcgatcacatgaattgctgttctaggcttctagcaacaaccaccaaaaaaaacgaattccatcgatattattgttaatggtgttctttctctctcagtgtttcctccacactgtttcagattcttcccatacttatccgaaaccaaacgggtttgatcaatcgatcgatctctgtctacctggttcttaacttctatgcaactcccatcactactaactgccaaagccactagctcgctcggcgacgacgaaatgctgatgagctcgcgctatctagctaagctcgatcccttttgcaagttgcttctgcggcgcgcgcgtgaatcgatcatcgcgtgcgacttttcaccggtcctaactggttttttttttgggttaaaaagtggttttcgctaaggccgtcatgggaggagctagtgtgtatatcagactactatcagtatgcgttgtggatatccatggatgtgttagtctgcggctttttgctacgtgagttgccataaatagtatcatggagatcctctgtgcccatttttctactcagagccattagccataggctcctatatgtggttagtaacttttgtgtgataataatgcatgtttgccacagttagggtcaatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatataagctgttaattaaggatccaccatgagatgttatatccatgagattatgcggcttaattgttttcgtgataatgtaatatgagttcaagtttttaaggcatatgttattacgaggagtgcacaaatttggctcggcgtgtaagaaggacgatggaaaactatgggctacacaggaggcgggttttctcaagtagggtatcatcgatagtgaaatgtggggtctagggttttgaatacaccgcttttattctttttacgtacgctttttataatcgagtgtctctagattgtcttattttctattgcaacttgctataaatggcttagtttttttgccacttgcacctggtgtccctctctctcatttgatccattattttcagttgcaaagtcattgcgcatgacaatccattcttcactacaatagtagacatggggaaaaaaaacaatttgaagctatagtggagagagcaaagagatagatgtttttttttctaatttaatttgttcataataagactagaaaaccatgcattcatcttccaggatttgcacaaatatgtacatttgattaattagtatcaccattcaccaacctagctagctaaaacaagctctttttaaaaatgtttttggcaagtattctcatttcatataaaggatacctatatgcacctcatttgatgaaaatcattgcaaaattatgcaccatcattatttattccatgagtattaaattaattctgcgtcacaaatattcaacgttttagagcatacagagataataaccctttaatgaaaacttcaaaatatcatttattcaaaaattaggaataagtgtgtcaatatctttttgaaatgcagatcaatatgaacatagagttatgttataattaattttcacactacatatataccaacatctaaaatggccttttgaccgagcaacctgtatacaacaattggtaaggataaaaatagtaccagtagaaatgtcgaaatccacatataagtactacaccagtactaaatttagtaattatactttgatcgaggtaggaatagcctcgagtaaagtttaaaagagtcaaatgtctttcagtggagcccatgtagcagcatttctttcaatgcggcagccagttgcactctagattctgctctagatagaccaacttgcgcatatatgatcaattaattagtatcaagacagcaagcacaattaaattaccagtggatcttagtgcctcgaaccctagccaaggcaaaaagaaaaagatgagggcatttgattaatttgtggattaattaatttttgatcaatggattaattagggcgccacttgccttaatgtaaggcggggaccacgtgtgtgtcgccgcaacttggcctgcggggtgggccccccggtttgtccaggttcagctcctctgctgatggcctgacggtgacgtcacggtcttgcctcgctaaagatagtgacctacggtgcgttgagatggcatgcgtgattgctcggcttcttgatttggcgtttgctttctctcttggctgcgtctatgtcagcgtgcgaggcttgctcatatgcacgggccggcacgcggcatgcacgtgctagcgtgtccggtaggcttcaatataccatctgttcgcatcgtagtacaaaaaaaccgaagaaaccatccgattcaatgaagaaaattatccatattcttaggttgttgtattttgaaatggagagagtacttgttcttattaatttgaggagaataagatcgatcccctggaagtagtcgtaggtacgttcaaaataaatataaaataaatatagtgtaatgtgtgcatgtcagttcactggtcagaaaataattttcgcgtcattcgcagcaatttgactagaaatttacattgtggaataaaaaaatcgtggggccaaaatttcaatgtttttaatgaaaattttaggctagatcttgggattttcttttttaacacagtacagacacaaacatgcatatatacacatgcatactcaacgctctgaacatacacgcacaccctatcactatataagcacctttaaagaggaccgtcatgaagtcgtcacagacactgtcaacatattttaaaagttgataaccaaccattttgctaagggcctgtttagtttgcgaaaagaaacattttgggtgtcatatcggatgtttgaccggatgtcggaagggtttttcagatacgaatgaaaaaaataatttcataacttgcatggaaactgcgagacgaatcttttaagcctaattaatccgtcattagcacatgtgggttactgtagcacttatggctaatcatggattaattaggctcaaaagattcgtctcgcgatttcctccctaactgtgcaattagatttttcatttatttatagagagaatcccttatataccactgaaaattggtctaatcccttatatgccattgaaaattagttcttcccttatatgccattgatccaaatttgcacactctctcacgccactcccgtcagttgactatgtgttgaccgttaattcttaaggaaaaaagacgtatttacccttctgagtatagggcatgcctaacaactcagagagggcaatatgtcttttttacttgagagttaacggtcaacacacggtcaactgacggtagtgacatgagagggtacgcaaatttagaccaatggcatataagggaggagccaatttttagtggcatataagggatcagatcaatttttagtggcatatgagggattatctcttatctatatttaatgcttcatgcatgtgttcacaaattcgatgtgatgttttttgaaaaaaaatttagggaactaaacggggcctaagttaaaaaattcaaatactttttgggcttctattgggacccaatagtaatccaaaatttgaaacctttgatttgaatagcgatgtaactattgggcatacaaggtttgaaaaaatggttacggccggattgctaactttgatattattttcatccaaaacgaccaatactgaattggagggagtagaaattaagttgcaacacgtaagtacatgtttgacgatgtgcttataagtaactagtaatagctagtaaagatgaacgcaaatgcaaacactaattttaattgtttttgtctctttcatatatataatattcgtctcactaacgatctactactctttctaattaaggtggtcgtttgaactcatctttctgtaagtttcatattcttaatacttgtgaccactcaaaatagaccttacattttaaaatggatggagtacaactttctggaacatatggttctagtcacgagaatattcctctcatatactccctccgtttctaaatattcgatgccgttgacttttttaaacatgtttgaccgttcgtcttattcaaaaattttaaataagtattatttttttcctatcatttgattcattgttaaatatacttttatgtatacatatagttttatatatttcacaaaaatttttgaataagatgaatggtcaaacatgtgctaaaaagttaacggtgtaaaatatttagaaacggaggaagtatatcctgtatctatcgtgctattttgtgctggggcaactcggccgggccacttttaatttcgtagtgctagcttgtaattttttttaattagttagtagtgcatagtgttgatgaatggtaattgttgtggtttaagttatgtttaactataataaccggtgattagtcaagtttaatttgtacatggatttcaaatagaaatttggtagtgtttaattatgaaaatatttatagaacca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