Os06g0720700

From RiceWiki
Revision as of 09:35, 24 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os06g0720700| Description = Conserved hypothetical protein| Version = NM_001188072.1 GI:297725274 GeneID:9271407| Length = 7034 bp| Definition ...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os06g0720700

Description

Conserved hypothetical protein

Version

NM_001188072.1 GI:297725274 GeneID:9271407

Length

7034 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os06g0720700, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 6

Location

Chromosome 6:31495054..31502087

Sequence Coding Region

31497019..31497222

Expression

GEO Profiles:Os06g0720700

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008399:31495054..31502087 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008399:31495054..31502087 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>gggacaggttgtgcccgatccatcactcagctgagagagccatatgtaccacctgaccaccagccaagaccatcatgctcggaggcgcaaagggcaccgtcggctgggtcgatctctggcgcgggcatcctcgtctgcgacgtgctcgacgaaatgtctccgaagaagctccgcgacatgtctccgaggagtggccaagcttga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>GTGCARSITQLREPYVPPDHQPRPSCSEAQRAPSAGSISGAGIL VCDVLDEMSPKKLRDMSPRSGQA</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1966..2169#gagctgcgaggagtggccaagcttgaccccgaaaagaacaccctctactccatgcgatgctaccttgcaactgggatctccaaacgcctcaacactaccacaggtacttaattaccgctcgtattccagaacaaatgcagcaccatgtgcatatgggtaataaaatgccatttaaggatctagggctgatcattatagttctttgtttatgatggtccgaatgaccaaactaggactagaatgtagtaactttatttagggtgataggcttgatatgttgatacaagggcagaacagtaccaagagtccttttggcagagtagtaccaatactcattatgcaatatactgttttgtgtgagtttcagacaaacgttgtgtttctgactgtacttgcaaaaacaaaacctgaactttgttaacagaataaagacacctccactaaaatgtcgacgactaatgcataaaattacttgcattcttcgtgaaaattcatagcagtaaatgtgtcgtcactcttgtttccttgtcattatgcgtgtaatatattttgctagcatgcatttaaatatgaagtaattaatcaaagtgcattcgtaccatgtcaaaagaacaagagaatagagcaagtaataataaggtagtacttgaccaaagcatacttgaaaaagtagtatattgctttaggttttgcttttcctgttgtactcaatgtggacaacatgaatgctcttcctcttgagtactaattcttgcttcaaggacattttatgagataatagctattttatttgatgtagacacaagagttggacgacctgaggaggatgcagaagccgccgagtagaatgtgcgaacccagtgacatatatgcatcatactgcagcctgcctggatgcaaatattatcgtatcagtggtttgttggcttgaatgggggttaaggagttgtgctgttgctgggcatatatagttttgtgacaagaatcttatccaggttgcttactttgggttgatgataaaagtaggagtagacgttaataacattaatatatgttggcttattttttgaggggatgttggcttatttatgtggcactaattgtctttatgcctttgagttaaacacaaaacaatgatccaactctttgaacctgtttgtttcaagtaatgagttaatgaatttttcaccacttggagtcctccctcaaactggatctgctccccgctgcctcaaactgttttttttttttgaacgaatgtgttttctaagttcattctcagaacaatgcccgccatcagattcatcgactagcatagcaagacagtataactttttaccaaagaaaactgattatatagtatatatagaatacttgtcttacacacagtgacaatccaacaatatctatgcaacaggaataatatgttagtgtgcagatcataccctctcaactctgaactcttctgcagcagggagttcaagatatattttgtacatagctgacagtgcaccattccggacagcgggacagagaagctccaatcaaaagtctccgatgttctgtcttatcttctaggttttcgggcttggctcaattggaaaggcccaattgattttgggcttgagtacaacccagcataaggcgccaccgattaggcccaagcccaacgttaagccttcaagcagagggagaaccaaaaaaaaaaaaaaaagttcacttccgatccagcgccatggccgccgccgccgcggagaacgcggccagcggcagcgtccgaggctacacctccgccggtaagaacgccaccaccgccagttcgagaacgagcaccggccatcccatcgaggtgcattctggaacgagccgccgccgcccgcctgccctctcccacttctccgtcgtccactgtcccgatcgcccggagttggacatgccaggaggtgtccgtggaggatccggtgagggacaggttgtgcccgatccatcactcagctgagagagccatatgtaccacctgaccaccagccaagaccatcatgctcggaggcgcaaagggcaccgtcggctgggtcgatctctggcgcgggcatcctcgtctgcgacgtgctcgacgaaatgtctccgaagaagctccgcgacatgtctccgaggagtggccaagcttgacaccacaaagaacaccctcacctccattcgatgataccttgcaacttccatctccaaacatctcaacactactacctgtagtatactcaattaattaccgctccttgttgtcatgtctgttatttgcgtgctgttctacgagagattaatctctttggcttaaatttctgtctcaattcttaacatgcataacagattttaatcggtcaatatataagttaggctaaactttgttgtgttcctttgcttgccggcatgtaagttccgaagaattttgtttaaactctacaatgtttggccaagaaaatttctcatatctagctaagaagaactaaaaggaaaagagctgctgctcttgttcgccagtaatctgcatcaatggatagtgtatactgatcattccggcgttgacatggcgaaaagtattttgtcaataggaaggaggagaatcacacgccaagtgcatgcatgatttttcaattcatttcaaggcaaagtttctagacaaagctaggttctcgataagccggccactttgatttgatgacaattaggttaattaaggcaatcttcttgcctttccttttctatcaatagtggacaaaggtgagagctgatatttattatatcctgttagccattcagaaagtgctttccatgacattccaaacgaaatgatatttttctcatgttcagtcggccatgcatcttcagtttaactaaacaagaccaaaaaaaaaaaaacttatatccaacataagatatatatgccctatgagcataaacgcactcagtgataaaatatactagtaagaggtaaagctaaggtgaatgctgacaagagacaagcccatctgtccctcaaagataacaaatactactactgactgaaacaaaattaaagcatgatagccacttctgaatttctgaatggctgaaggggaaaaaaattgaacaggatactgcatgctgatcgagttgaacaagtaagaaaaggtgttcatctttgcagagacaagatctaacacatttctaactgcagaggtagttcatagcatccatcgatcacctacacacaatatcctctctcatgcctgacccctgcacaaacgcacaccggattgcaaatacacataatttagatctttctaatgattttgtatcgtcaaataatcttgcttgttttggtcgaccttcagaattgagttgatgaagttcgtcgcagtgagctctttgtaggcatcaccagtgcagcaacctcctgtttcagctgtccaagcagaagtacaagtgctcgtcacatgaatgatcaaatcacaacatttcaaaagtaatgagttattatcaactactacctccatcccagaatataagaacctatggtcagatgggatgtttcctagcactacgaatctggacaaaaatagaaaacgcatcatccgattctagattcttatattctgagacggtggtagtaattaattagtgatgtgaagatcacttgtgaattgaattagtgatgagtacctctttgcactgcttcttgagattcaagttgtcatccaccagccggcgaacctctttctctagctcttcaacgtacgcctgcataacaaattacttcacaattaatacaatctgaatcgtattaatatgacagaactggattcattgacaagtaggcagtctgttttttttttggggatgcttattgcccttttggtaggtacaaatgcatggttagttctgaaatggagtacctctagagtctagagaggttagatggagacggtaaaaggagctcctcactagcagcaggtgtgatccaattaattcatagtgcagtcctattcagatgatagatagtcgagataatgccaagctagttttcatattttcctcttgtcccgatcaacttaagttctttatgcttatttaattagtccgtacctaacaagagaagtatatattagcgtgagactatctgttaaaatatctcaagcatacgaggaagactttttcttgggggcaggagtagttaattgtgatgtaagctgagtctaacgtggtgattatattttgggataccttgtgtcatgcatcgacccaaatatagttaatatcaactgggacattatgttcatttcttttttgcttagaaggttcgatttgtcgttgttaacagtctctatttaatctggaactcttacaaattcaggggcaccaattttctctaatgtttaatcaagaaagaggatacatgtagcaattagcaaatcattcaagaaaagaacataattgcacattcgttttttcgatggtaattgtgttaactacttaactttaggagtgatttgggatatttactattgatgatctattgagttggcctaaagggcatatatgcgtacaagggatggaaaatatatataatacccatgactacactactattgttaacaaattgcacattctttttttccgcacattctttttttattattatgtactattaattagtgatatatatatatatatcacaaatttccaatatgcatggagagacaagtagacaccatgtccacgaggatatcatacatatatatacactctctggtatgggccctttctgctggacttggaatcttggattaggtgaagctgacttaattttgatattaattatcacacaagtgcctgcttggatgatgatagactggtaataaaagaaagggcactaatcaaagaagagatatgcatatttaggccatattgactaaacattatcaacaggaacctatgcatgatgcaagagataacacactccatcaactttttagttctttaacaaattgaccaaacttggtcactatactcgagagtttcactccatacagtatctgcccaaggtacacacagatatctcctccatgcaccatcatcaaggatattatgtaaaatatatagactaactcctttatgaaatgtaatgaaatttgttcatatatattcagttgtgtaaactaaccagttcagctcagctcaaaaacttaacgatgaataacgacgtgactgcaatttactgataattcaatgtgcaaattatataatttcgcctgctacaaacttctattgaaaacctaattaattaaattatcgcattccaacaatgaccttataagtgatcgacttattagcagcattttatttttgtgaaagatccagttttaattaaattctaattatattcagtttttgaaaagagaaatttccatgttaattactccctccggacataattaagtacatgccggccgtttcagacaattaaattggcctgcgtttaatagaacggaattgctttgtcggaaagcacaagtaatattgatcggagagagtacatatgagaacatttgttgatgatcagtagtaattcataccgtacgttataaacacatacgtacataaatactgtagtatgatacgtataattatacgtatttggtattgtatatacgtacgtaccctcttgcgcgccctggagcgaagcgcggactcccggttcctcatcatccggatggtcctccggtcgtcgccgctgccgccgctctgctgccgcacctccatgtccacctcgtcgccgccgggggtactggcgccgccggcgatcccggcgagcgacaccggcgtggcgggcagcgcggcgccggcgaggcggacgccgccgccgtcgtcgtcgtccctcagggtggagatggagaagagggagctgcagccgctcatgatgctcagctgcgggctgtccggctccctcggccacgccaccgctgccgccgccgccatctggtagtactcctggtggtggtagttcgccatggccgcaccctgcacctgcaccttcttgcttgtagctgcaggatccttaattcgatcgccaacagctgcagttagtgctccttgcttttggttgttgttgctaagcttgtctctggctctctctctctctctctctctctctctctggatgtctacatatatatatatataaatcagacttaattaagctagcttcatgagacagctagctcaacagctgctagcttttaagcctttaagtaccaacagtgtcattatgcgtgtaatatattttgctagcatgcatttaaatatgaagaagtaattaatcaaagtgcattcataccatgtcaaaagaacaagagaatagagcaagtaataaggtattgaccaaagcatacttgaaaaagtagtatattgctttaggttttgcttttcctgttgtactcaatgtggacaacatgaatgctcttcctcttgagtactaattcttgcttcaaggacattttatgagataatagctattttatttgatgtagacacaagagttggacgacctgaggaggatgcagaagccgccgagtagaatgtgcgaacccagtgacatatatgcatcatactgcagcctgcctggatgcaaatattatcggatcagtggtttgttggcttgattgggggttaaggagttgtactgttgctgggcatatatagttaggctgtgttcgtttggacgttttcccagcgccctacagtgttttgcccctcgcgcacgcttttcaaactactacacggtgtatttttttgcaaaaagtttctatacaaaagttgcttaaaaaaatcaaattaatccatttttgaaaaaaaattagctaatacttaattaatcacgtgttaatgaaccgttccgttttccgtgttactgtagcgcgctggaaaaacgtccaaacgaacacagccttaatagttttgtgacaagaaccttgtccaggttgcttactttgggttgatga</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os06g0720700, RefSeq:Os06g0720700