Os02g0693400

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os02g0693400

Description

Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2 family protein

Version

NM_001054336.1 GI:115448042 GeneID:4330388

Length

5685 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os02g0693400, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:29359427..29365111

Sequence Coding Region

29359686..29359742,29360399..29360482,29360617..29360676,29360766..29360840,29361451..29361525
,29361700..29361777,29362058..29362135,29362229..29362349,29362452..29362597

Expression

GEO Profiles:Os02g0693400

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggcggaccagaacggcgccgcggccgtgagcgaagcggaggccgcccctgttcaggttgaaactggtgctgaaagtggggatgctgaaagtgagcagtaccaaccatttttctccatgtgccagccgattcgctctgttagctattcaaattcctgggatatggtttgtgcccccacaattaagagtaacgaacacaatagcaacttggattcgatggatgataaatacatgctgagtgcaccttggcctgaaaatgagcagccccagtctgagaatgacatggatttgttagatggggatacaaatatgcagtctgaacccctcagcacagagcagcctagctccaatgatgaaatagatatctgggatgggaaaactaagcaagactcatcatcccttcttgacagcaagctgtgcaactccggcagcggcgctgaaccttgcaacatggagggccaacaattttctttgtccttttcccgcaacactcaatctcaattggtgggatctggtcttggcaatatggggaacacatgcttcctaaactcaattcttcagtgtgtcacccatacagtcccactttttctcaggcttcgttccactgatcactgtgctccatgctcatatgataaagatggtttctgttcattctgtgctcttaaagaacatattgatgaatcaatccgaaggtctggatctgttataaggccagtgaggttcagagataatttaaggagtatcctttgctctcgatttttccttgcagtttaa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MADQNGAAAVSEAEAAPVQVETGAESGDAESEQYQPFFSMCQPI RSVSYSNSWDMVCAPTIKSNEHNSNLDSMDDKYMLSAPWPENEQPQSENDMDLLDGDT NMQSEPLSTEQPSSNDEIDIWDGKTKQDSSSLLDSKLCNSGSGAEPCNMEGQQFSLSF SRNTQSQLVGSGLGNMGNTCFLNSILQCVTHTVPLFLRLRSTDHCAPCSYDKDGFCSF CALKEHIDESIRRSGSVIRPVRFRDNLRSILCSRFFLAV</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>260..316#973..1056#1191..1250#1340..1414#2025..2099#2274..2351#2632..2709#2803..2923#3026..3171#aaacccaaaatatttccgccccctcctcacctcccaaatcttcctttccctccttcctcctcctccttcccacccaacgatttgccctactttttttgctttcccccgccgctgctgcgattagtctccgatctcaaccaatcgaccaaccaaagccttcccctctccatcgattcagcagccgcgcgcgagcacgcaccaaaccgccacctaccgcccctccccgcgagcgaaaaccctagcgcgccctcgccctcgcatggcggaccagaacggcgccgcggccgtgagcgaagcggaggccgcccctgttcaggtgagatcctccggtctgcttgcttgtttttctgcagtttctggggggagggggggggtgcttggggtggggtttcgtctggtacggccgttgccagtggtaccttgcgtggtaagactggtcgctgttttttttttttgggtttactcagaacgcggttttagtcggcgggctggcttgtcgtgtggcgattacttgtgtttactgctcatttttgcaactcaggatgcgatcttagccaaacgtgtttgatttagatggttttggagttttgtggtgcgtttcgattgggttattgctgtggttctaccccaatattaagcagggtacatggcattcgtgtgctgggaatctggtagcaggtaggagtagcgcctcaccaccactttttattagtacataattattgggcaacactagtgacattcattcatggctagtagacgacagaaatcgtggtgactatcatgctgctttcccattttgtttgtgtgcaacgttccgcagtgtagttcaacaaactgaaacgatggtaatttcgacctgccttttaccttctgttttgtccaatttctgctagtacttgttacaaaaggaaatggtctgtagttttggatcatcgatacatggcttatttctgacaattgagttcttaggttgaaactggtgctgaaagtggggatgctgaaagtgagcagtaccaaccatttttctccatgtgccagccgattcgctctgttgtaagatgttaacctgacttccttgtacaaatatttgattacatgtgttatcatttctctttgaaacaacattacatgccttttttgtggctgctaattttttaactttgtcggtttcctggttttgcctgcagagctattcaaattcctgggatatggtttgtgcccccacaattaagagtaacgaacacaatgtatactcttatctattcttttttgcgattagcttgttgtcgctctgcttttggcatagttaatttaatatgcttcttctcatacgcagagcaacttggattcgatggatgataaatacatgctgagtgcaccttggcctgaaaatgagcagccccagtctgaggtatttgctaacctttctaagaatatgattgtcccagtcagtctgtttgggttccttaatgctgattttcaccaagtactgtttattaattttcactcagagcatttctgatacagtagataagaaagcaagttatgttcatgtcctttaataggtaatgaacccactttagtgcaacatctcatggaaaataacaatcaatggtatgaagcataagccttggtggtttgtttccctgatcatccctagggaactacgtgcctgttgtattttgtgctccgtgctcttatgtttcttcatgaaaaatacaattggtactctaattacttagtattttgccattttactatcttaatttgaagacttgcatgtagggcaccgttttgttgtgtgatatcgtgcagccctaattttttggactgcaggagttcaattgttagcttagactataaaaagttaatgtaatctaattttttagattaaaagattgggtgcccaagtgatttttatgttgcagctagctatgtattaccatgacatccctatacagtcggttgtatctaaaaatttgctaattttggctgttttttttcttgttcctttttttcagaatgacatggatttgttagatggggatacaaatatgcagtctgaacccctcagcacagagcagcctagctccaatgtaattttctatctatttgatcttctctggccctttgtaggcatgtgacccagttatatgtttaatggtgcacacaataagccttgaactgaaatatcttatccaactattctacataaactgtgataaccaggtgcctagagctccctaatattattgttggtggtgctgcaggatgaaatagatatctgggatgggaaaactaagcaagactcatcatcccttcttgacagcaagctgtgcaactccggcgtaagtggcttcacaatcacacctattactccctacaataaaatgaattgttttggggttcgtgcagtcaaactttgtaaatattagctgctaatgtgtctccagcagtattttagaaactatgcttataccatggcttaaaattatattataagtttataaccaaattaacagccaaagttatgttttagagactgttatgttcaaaacagttatgctaatgccattattttaatctttcttaaactgaacaaattggattgataaaaatgtttaacagagcggcgctgaaccttgcaacatggagggccaacaattttctttgtccttttcccgcaacactcaatctcaattggtggtatgttttatgcaatatcttcaaccctaagacttacgtatgctaatgacatattcaataattttgttatttttaaaatttcttcatatgcagggatctggtcttggcaatatggggaacacatgcttcctaaactcaattcttcagtgtgtcacccatacagtcccactttttctcaggcttcgttccactgatcactgtgctccatgctcatgtatggatagtttctgacagtaatgttttgctacctgaaaaatgtgttatctcattgccatttttgtttcatgataaaaaaaaaactgttggtctcctgcagatgataaagatggtttctgttcattctgtgctcttaaagaacatattgatgaatcaatccgaaggtctggatctgttataaggccagtgaggttcagagataatttaaggagtatcctttgctctcgatttttccttgcagtttaattttaccacatttgtgcacacatgctcagtaatatgacttgcatttttgacaatcattgggtgtttatgcctgaaaatttcaaggttaccccttatatgatttcataacttctatttatatgcttcctcagttctgtttcaatttcaatacatcttaatattcactgaatattgtgctgagatatatatcttctattgtatctgtctctggtacttcaaattagtggtggagttccttgacaagattacccagaattatcatcagattttagaccaggacaacaggaggatgcacatgagttcctacgttgtttgctggacaacctggataagtgcaccactgatcccaagccaaaggataagccctcatcttttgatgaagaaagtattgttaagcaggtttttggaggccgactaaaaagcaaggtattttactttgtcatcatgcttgttgtcttggcacttaaaagttgcaactgaattcatcctgtctatctagttgacttgctgtgagtgtggacactgctcggagacatatgagcccttcttggatcttagcctggagattgatcaggctgataaccttattgatgccttggaatcttttaccaagttggagcgaattggggatgctgaggacaagctgaactgtgaacattgtaatgcaaaagtttgtaagaacaagcaacttatgcttgatagatcaccagatgtcgttgccattcatttaaagcgtttcaccagccttgatagatctgttgaaaagattgacaaacatgtggtgtacccactagaacttgatttgaagccattccattgtgatcctgacatcaatgtgagtttttctactatctctatttttagcaatagctttaccaaaggcatgttttgatgttttacttgtcccaccttatgcagaaggagctgaaatatgatctttatggcgttgttgagcattctggttcacctagctatggccattatgtttgttctgttcgttcttcaccgagcacttggcatctaatgaatgactcccatgtatgtgtcacaagttacttgctattacttttttttaaattaaaaatactaccagggctttgcccagtagttatatatattaagagcaggatgtgtacagatacttgctattgcttttaggtttatcatggcatgaatcattaacctctgcaaacctttgttgtaggttgatttgattagtgaggcaagcgcgctgaaccaggaagggtatattctgttttatattaggcagggcaaatttcagtggttttcaagtttgctggagcaaaaggatgacctgcatcctgaaaatacgagtggtgcatctcccgtttcagtattggagaatatagatgtggattgtccaacatcctctggtgaagcaaccaacagttctggtgataaattagagaaagatgaaactagtcaatgcaaaacatctttccttgaggagccagctaagggatgcccgattgatggtatcaacaaggctgacctaaaagatgaaatcgtgccatgcatatcatctcatcacgattgtgtggctaataggtgtcctggtagtgctgctgacattaccaatttggacagaccctcaactccttcgccaaaacgcaagcgtttcttctctgatgataatgagtttaatgtgtttgagtttgaggacttcggtgacggtaagtcctacatcttggttccattttcttttgttaccaagttctctgcagcggaacagaagttcttacgcactaccctataactgcacactgaattattgtctagttatcatatcattggtgtaccactaatagagagattttaaattcattgatagacatactgttgctgtgctctgccaatgctgattacattagtttttcttttctgctaatttatcgggttcattgtcttacatggtactactgtacattgctttgctgattatcctttgaaaattgacgaggctgacatttctgcttgtgccatttgcagaagatgagacccctctgcttggaaaccttaaattcacatcaaaagctaagaaggctaaggttgaatcagcatctaaatcgacgaagggcccttgcatagataagaacgtaacacgattagtaaggagtatgccgtccactcggagaaaaggcattgtggactgcttgagccaactcaatgcagagcaggattctggaagctgtcctcggagtcaccctcttggcaaaaagaagctcggcatcccggttccaatcaaatggtagcatggtccgagtgccgaagcctttttttttccagctgtacatgttagtttagcatgcattttgttttatatccagaaccaacaaattttatctgcttgtcataacctgtatgaccggctagatggtgatagtgaggtacatttttgctgccttctgatgtggaatgcctcacctatatgtatggaacatgcactcggagtcccacttcatttgtgaaaaacagtggcaaagggaagagact</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os02g0693400, RefSeq:Os02g0693400