Os02g0717400

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Structured Information

Gene Name	Os02g0717400
Description	Tetratricopeptide-like helical domain containing protein
Version	NM_001054467.1 GI:115448304 GeneID:4330529
Length	11375 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os02g0717400, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 2
Location	Chromosome 2:30650483..30661857
Sequence Coding Region	30650750..30651232,30651687..30651755,30652149..30652256,30652333..30652642,30652897..30653016 ,30653140..30653180,30653254..30653310,30653658..30653816,30653955..30654023 ,30654096..30654245,30654335..30654466,30654715..30654801,30654884..30655054 ,30655128..30655328,30655716..30655784,30655878..30655986,30656255..30656373 ,30657044..30657148,30657745..30658123,30658390..30658518,30658591..30658726 ,30659163..30659264,30659352..30659545,30659678..30659837,30659972..30660112 ,30660200..30660389,30660468..30660529,30661247..30661475
Expression	GEO Profiles:Os02g0717400
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008395:30650483..30661857 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008395:30650483..30661857 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atggcggggaagtcgaagggcgcgaggaacaaggcgaaggcgcagggtggaagccaggccgccgtcgcggcggagccggaggtgccggtgaccgatggagtcgaggatgccaagcccgagatcgaggaagttagtgaacctgccgtcgtagagggcagtgacactggcgctgagaaggagcagggcgatgcagctggggaaacacaagccgcgaagaagccagctgaaggggaggttcatctctaccctgtttctgttaagacacagtctggtgaaaagcttgagttgcagctaagccctggagactccgtcattgatgtcaaacaatttctcttggacgctcctgaaacgtgcttctacacatgctatgatttgttattgcacactaaagatggctcaactcatgagcttgaggactataatgaaattgctgagattgctgatataactgctggtggctgttcattggagattgttgctgcgatatatgatgagagatctattaggtcacatctccgtcgtgtcagggaattgctatccctctctagtcttcatgtatcactttccacatcccttgctcttcagcaagaatctgcacaggaaaaatctgcagatactgcaggagattctgggaaaacggctaatcaagagcttgatgggttgaatttcatggaggacagtactggtgctgtcattaatttgttgccatctgtaccagcagagatcaaatgcgtgggtagcatagttttttcttcatttaatcctccgccaagttataggagattgcatggagatctcatttatattgatgttatgaccttagaaggaaacaagtactgtatcacaggaaactccaaatcattttatgtgaactctagcaatggaagtattctggatccaaggcctagcaaacaggctctggaggacagcaccctagtcggtctgctacaaaaaatcagtgccaagttcaagaaaggttttcgtgaaattttggatcgcaaagcatcagcccatccttttgagaatgttcaggccttgctcccagtgacttcttggttgggagcttatcctgtgccagaacatagaagggatgcagctagggctgaagattctgttgtgctgtcatatggaaccgaattgattggcatgcaaagagactggaatgaagaattacagtcttgccaggagtttcctcatagcaatcctcaagaaaggatattgcgtggcagagcactttataaggtgacatgtgatttcgttgatgctgcagttaaaggggcagttggtgtcattaataggtgtatacccccaataaatccaactgatccggaatgttttcatatgtatgtacacaacaatattttctttagtttcgctgttgactccgactatgagcaactcccaaaggaccagaagccaaatggtcaaaatggatctggcagaagtgtgataggctcctcagatccggggtctaagccaaataagaaccatgcagatcctagtggcacaacaaattcaaaaactgaagaacctaatggtgttttggacaatacttctgatgcatcggcagaggcacagatagcagacagtgaacaggctacctatgcttctgccaacaatgacttaaaaggaactaaggcataccaagaatctgatattcctgggctgtataatcttgctatggcaattattgattacagaggtcacagggttgtagcacagagcatcatacctggtattcttcaaggagacaagtccgattcccttctgtatggttccgttgataatggcaagaaaatatcttggaatgagtcattccattcaaaggtggttgaggctgcaaagcgactccatgtgaaggagcatgtggttttggatggttctggtaatcctgtaaaattagctgctacggttgaatgcaagggaattgttggaagtgatgacaggcattatattttggatctgatgagagtgacccctcgagattctaactacattggactacagcaccgcttctgtgtgttgaggcctgaacttgtagcctcattcattgaggctgaatccacaaataaatccactacacagaaagttgcagatgctcctggagaatctaatgggcaattggctacaactgcggaaggacctgccaaatctgatgaaaactctgttcctagacctgataagtttgatgaagactctggtcctagacctggcacatctgatgacagctctgctactaaaccagctgaacataacgagtcaactgcagaaatcctttttaatccaaatgtgtttacagagtacaaacttgctggtagtccagaggagattgcagcagatgaagcattggttaaaaaggttggttcgtatcttctagacacggtgataccaaagtttgttcaggatctctgctccctagatgtctcccccatggatgggcagactttgactgatgtgctgcatagcaatgggataaatgttaggtatcttggcaaagtagctgacatgatcaagcatttgccacatctacggggtttgttgtcttctgagataattgttaggtcggcaaagcatgtggtcaaggaaatacttaggcaaagcgcagatcatgatattggaccagccattgctcatttcttaaattgttttattggcaatgttttggcaccttccacaaaaggtagtgttgacagtacggatacaaaaacccaaaagggtcatgagaagactcaaaatcaaaaatctgccgagggacagaaatcaagcctttctgcttcttcaaagaacattgtgccaacattttcccatctaacatctgatgggatttggtctaacattaaggagtttgcgaaacataaatatctgtttgaagtgaccgatgatgctaagactggtgctaaaagagttgcagtactccgcaatctttgccaaaaggtgggaataacaattgcttctcgcaaatatgacctcgatgctgcagctccattccagccttcagatatcctgaatctccaaccagttgtcaagcattctgttcctgtatgtacagatgcaaggaatcttatggaagcagggaaaatccggatggctgagggaacattgaatgaggcctatgcactattttctgaagctttttcactacttcaacagattactggtcccatgcataaggatgccgcaaactgttgccggtaccttgctatggttttgtaccatgctggcgatataccaggagcaattgtgcagcaacatagagaacttatcataaatgagcgatgccttggtctagatcatcctgatacagcccacagctacggtaacatggctttgttctatcatgggcttaatcaaactgaacttgctctgcgtcacatgtctcgcacgttgcttttgctaagtttagcatcaggtcctaatcatccagatgttgcagcgactcttataaatgttgcaatgatgtaccaggatgctgggaatatgagtactgctcttaggtatcttcaggaagcactcacaaagaacgagaggcttctaggaccagatcatattcaaacagctatctgctatcatgcccttgccattgcattcagttgtatgggtgcattcaaactttcaattcagcatgaaaagaagacctatgatatactggtgaaacaattggggagtgatgattcaaggactaaggatgcagaaagttggttaaatacatttaagtcgcgagaacagcaggtgaatgcccagaagcaaaaaggtcagcagggtactaacccacctgctaatcctattgagttgttgaaggcaaatcctgatttggtgagagcactgaaggcagctgcgaaacaacctggtgaaggatcagcaaatgtcaaccgatcacttaatgctgcagtagttggtgaaggtgttcctcgagtaagaggagttgatgagcgggctgctcgggcaactgcagaagttcggaagaaagctgctgccagaggccttaatgtgcgaagcgggcaggcgcctgattacatgtctaatctatctcaaattctcaactatctgggctcggcgaaggcgcctactgcttctggtagcactccagccactgccgctgctacttccgctactgccagcactcaaaatgcatctgaaggtcagcaatcgaatggacccccacaaaacggcactgcagggaataccaacgggccatcgtctaaaaagtccggtggttccacaccagtaggattagggacttccttggagttgaagaagcagaaatcaaagcagaagtcatag</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MAGKSKGARNKAKAQGGSQAAVAAEPEVPVTDGVEDAKPEIEEV SEPAVVEGSDTGAEKEQGDAAGETQAAKKPAEGEVHLYPVSVKTQSGEKLELQLSPGD SVIDVKQFLLDAPETCFYTCYDLLLHTKDGSTHELEDYNEIAEIADITAGGCSLEIVA AIYDERSIRSHLRRVRELLSLSSLHVSLSTSLALQQESAQEKSADTAGDSGKTANQEL DGLNFMEDSTGAVINLLPSVPAEIKCVGSIVFSSFNPPPSYRRLHGDLIYIDVMTLEG NKYCITGNSKSFYVNSSNGSILDPRPSKQALEDSTLVGLLQKISAKFKKGFREILDRK ASAHPFENVQALLPVTSWLGAYPVPEHRRDAARAEDSVVLSYGTELIGMQRDWNEELQ SCQEFPHSNPQERILRGRALYKVTCDFVDAAVKGAVGVINRCIPPINPTDPECFHMYV HNNIFFSFAVDSDYEQLPKDQKPNGQNGSGRSVIGSSDPGSKPNKNHADPSGTTNSKT EEPNGVLDNTSDASAEAQIADSEQATYASANNDLKGTKAYQESDIPGLYNLAMAIIDY RGHRVVAQSIIPGILQGDKSDSLLYGSVDNGKKISWNESFHSKVVEAAKRLHVKEHVV LDGSGNPVKLAATVECKGIVGSDDRHYILDLMRVTPRDSNYIGLQHRFCVLRPELVAS FIEAESTNKSTTQKVADAPGESNGQLATTAEGPAKSDENSVPRPDKFDEDSGPRPGTS DDSSATKPAEHNESTAEILFNPNVFTEYKLAGSPEEIAADEALVKKVGSYLLDTVIPK FVQDLCSLDVSPMDGQTLTDVLHSNGINVRYLGKVADMIKHLPHLRGLLSSEIIVRSA KHVVKEILRQSADHDIGPAIAHFLNCFIGNVLAPSTKGSVDSTDTKTQKGHEKTQNQK SAEGQKSSLSASSKNIVPTFSHLTSDGIWSNIKEFAKHKYLFEVTDDAKTGAKRVAVL RNLCQKVGITIASRKYDLDAAAPFQPSDILNLQPVVKHSVPVCTDARNLMEAGKIRMA EGTLNEAYALFSEAFSLLQQITGPMHKDAANCCRYLAMVLYHAGDIPGAIVQQHRELI INERCLGLDHPDTAHSYGNMALFYHGLNQTELALRHMSRTLLLLSLASGPNHPDVAAT LINVAMMYQDAGNMSTALRYLQEALTKNERLLGPDHIQTAICYHALAIAFSCMGAFKL SIQHEKKTYDILVKQLGSDDSRTKDAESWLNTFKSREQQVNAQKQKGQQGTNPPANPI ELLKANPDLVRALKAAAKQPGEGSANVNRSLNAAVVGEGVPRVRGVDERAARATAEVR KKAAARGLNVRSGQAPDYMSNLSQILNYLGSAKAPTASGSTPATAAATSATASTQNAS EGQQSNGPPQNGTAGNTNGPSSKKSGGSTPVGLGTSLELKKQKSKQKS</aaseq>
Gene 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External Link(s)	NCBI Gene:Os02g0717400, RefSeq:Os02g0717400