Os02g0741500

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os02g0741500

Description

Ribbon-helix-helix domain containing protein

Version

NM_001054617.1 GI:115448604 GeneID:4330687

Length

8988 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os02g0741500, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:31911479..31920466

Sequence Coding Region

31915363..31915368,31915447..31915550,31915667..31915715,31916299..31916391,31916470..31916578
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,31919973..31920278

Expression

GEO Profiles:Os02g0741500

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atgccgctcttcatgtcggaggaggagctgcggctcttgggcggtgacgtggccgccgtcgccgagcgggccgacgccgccatccgcgagctccggcagcaggtggacaccgtccgtgccgaggccgacgcggcggccatcgcggcggagcagacgtgcgccctcctcgagcagcgctacgacactctctccgccgaggccgatcgcttccgggccgagctagccgagctcgcggctgcctccgagcgccgcgccgccgatctcgcctcttcccagtccgagatacaccagctccgcatccaagccattgcgaaggatggcgagattgaacggctgaaagtagaaatctcggaggtgcacaagtccaagtcgcagtcactggaactaattgagcagagggatgcagagataagggagaaggatggcatcatccagaactacctcgataaaatagtaaatctggcagactcttctgctagtaaaggggcaaggatacaagaagttgaagctaagtttactcatctgcaggccacatgtaaccgaattacgcaggagaaagatctgcttgaaaagcataatctctggcttgacgaggaacttaaagaaaaagtgaagaacttagctgaactaaggaaatcaaacatggatgaggaggctaggatgtcagcaaaggttgccgagcttgaaagagagacttctgaatcatccagttccttgaggcgaagcaaagaacgggtttctgaattggagcaaagggtatcatatatggaaaaggagttgtgctcaacaaaggatgctgcagctgctaatgaacaacgcctggctgcagagctttcaactgtcatgaaacttgctgaacttcacaaagaaagttctgaggaatggtcaaaaaaagcgggggaacttgaaggtgttattaaagcattggagacacatttgacccaggttgaagatgaatacaaggaaaagcttgagaaggagacttcagccaagagggaccttgaaatggaagctacctacttaaagcaaaagcttgaaaagtgtgaatctgatctggagaatacaaggaaatctagtgaattgagcttcactccattggttgcagcagacccttgtgatctagcaggctcaccgatgaaagaaatggcattttctgatccagcaaatcagaatgatctaatgattgtaccaaaagtacctactggtgtttctggaactgcattagctgcttctcttcttcgtgatggttggagtctcgctaagatctatgagaaataccaagaagctactgatgctttgcgccatgagaggtttggacgaaggcacgcggaagcagttctggagagggtcttgcatgaaattgaagagaaagctgagcttatcttggatgaacgagctgagcataggaggatggttgaagcttatgctctaatggatcagaagttgcaacaagcattgctggagcatgacaattttgaaaataccattaggaatctaaagagttaa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MPLFMSEEELRLLGGDVAAVAERADAAIRELRQQVDTVRAEADA AAIAAEQTCALLEQRYDTLSAEADRFRAELAELAAASERRAADLASSQSEIHQLRIQA IAKDGEIERLKVEISEVHKSKSQSLELIEQRDAEIREKDGIIQNYLDKIVNLADSSAS KGARIQEVEAKFTHLQATCNRITQEKDLLEKHNLWLDEELKEKVKNLAELRKSNMDEE ARMSAKVAELERETSESSSSLRRSKERVSELEQRVSYMEKELCSTKDAAAANEQRLAA ELSTVMKLAELHKESSEEWSKKAGELEGVIKALETHLTQVEDEYKEKLEKETSAKRDL EMEATYLKQKLEKCESDLENTRKSSELSFTPLVAADPCDLAGSPMKEMAFSDPANQND LMIVPKVPTGVSGTALAASLLRDGWSLAKIYEKYQEATDALRHERFGRRHAEAVLERV LHEIEEKAELILDERAEHRRMVEAYALMDQKLQQALLEHDNFENTIRNLKS</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>5099..5104#4917..5020#4752..4800#4076..4168#3889..3997#3344..3480#3171..3248#2995..3084#2632..2697#2461..2553#2260..2388#1977..2075#587..733#189..494#gtttgcgtttcctccgcctcctcactccaattccattcgccttccgccaccaccacccttggctcctcccctccccgcggggcgcgcgacaaaccctagaaccttctagaggctagagcggtagagccatccgcgagggccccgggcgggctaggggcgccgcctacccgaccccgcacgcggcggcgatgccgctcttcatgtcggaggaggagctgcggctcttgggcggtgacgtggccgccgtcgccgagcgggccgacgccgccatccgcgagctccggcagcaggtggacaccgtccgtgccgaggccgacgcggcggccatcgcggcggagcagacgtgcgccctcctcgagcagcgctacgacactctctccgccgaggccgatcgcttccgggccgagctagccgagctcgcggctgcctccgagcgccgcgccgccgatctcgcctcttcccagtccgagatacaccagctccgcatccaagccgtacgaaccctagtttttatttgggttcagctcagtttttcggcttagctgaggtcacactgatcactctgtgctgctgatggggtttgcagattgcgaaggatggcgagattgaacggctgaaagtagaaatctcggaggtgcacaagtccaagtcgcagtcactggaactaattgagcagagggatgcagagataagggagaaggatggcatcatccagaactacctcgataaaatagtaagccatcctgaccattttgtactcccacttctagtgatgcacagcatccagcaaaattggaactccatatctaaggtgatgtgcgaatataggatcatatggataagttgttatccagtgcaatgcctaggttgctactgtcgacaaacagaggacgggggttttatgatgttctaagacttgaagtagctttccttttaaccctagtcagagggtaggtcagttgcttgataggttttacaacagaaattttgtggcttcaataggccacaaaatttgttttcctcattttgcatgttacttggcagaagttgagttgcatgtgtatgagacacaactgcattttgtatgagttgttacccgaacgtcagacatgattttaactcgatttacctgtagttttacgtctgtctccatacttttttattttacatgtagtagcaagttgaatttttattttatttatgcatcagaggtcatccttatcggatacttcaaatgaaaaatacacatttaaattatttttcgtaatatcagttactggcattctatttcagttctttgggcattgcttagttgatatgccgtttcaataaataaaacgtaccatatgaattataatgactttgcaattttaaataagttgttgctttgttgtagtgttctgatcgtataactttacatgctactttttttttgtgcctatcatgaacattcatatcagtctagactgtttaagatactcaattgtgtatcgtaccttacatgttatgtatcattccttgcatgttgcgatcaacttttgagtgtcggacttattgtatgtaagatatctgcgatactgttagatctcattgcctagtttggagtattggagatttccccgattcgatgtaggaatattcatttatttccgtaaaattcatttgttccaattggacccatactttttcttaaaatttactctgtagtttttctgttggataattttgaccttattaatgtgtcactattgaaccttctgtataatcaaggaattcatgtgatttggtatgcttatattcaatatcattttattagcaatcgcaagcgctaggccttattcactctagttggtaagtcctttagtttttcgcatttttgagatatctatgccctttcatcctgggaactgggaagattttgttttgcattttgttgcataaattaactgtagttgttgaatcggtcttcctgtcaggtaaatctggcagactcttctgctagtaaaggggcaaggatacaagaagttgaagctaagtttactcatctgcaggccacatgtaaccgaattacgcaggtatgctataaacaatttggtgttattttgctgcgtaagattgtagtataaggtgatgcaaagtctttcttgagttgtagactactacctaatctgttatccatggagttttactttaattgtacctattccatatgtttgcacagagcaaccgttggttcttatttagtactttcctgtttaggagaaagatctgcttgaaaagcataatctctggcttgacgaggaacttaaagaaaaagtgaagaacttagctgaactaaggaaatcaaacatggatgaggaggctaggatgtcagcaaaggttgccgaggtgagtcctattccaaccttgacatgtgacataatgcaagcagaaagcaaaacctgattatgttggtttcagcttgaaagagagacttctgaatcatccagttccttgaggcgaagcaaagaacgggtttctgaattggagcaaagggtatcatatatggaaaaggtaaattgtcagatttgttagcttttgtattattgccatcatctaatttttgctttgctttgcttttatgatctaaaggagttgtgctcaacaaaggatgctgcagctgctaatgaacaacgcctggctgcagagctttcaactgtatggtttacctttattcccattaacccccccttgtttatttcacccttactgctcccactccctgcttgtttaaattttagaaaggaaatggaagaaaatgtgtgctgagctatttgtactagaccagcagatcagtccatcgttattgtatatgcacacggcacaccacaacttaacccatctagtgtatctaggatatttctttttttttaatggaatgcactgatgttcctctctataagccaagtcgatgacgcttttaattattgccttttgttctgtttcccttaaaaggtcatgaaacttgctgaacttcacaaagaaagttctgaggaatggtcaaaaaaagcgggggaacttgaaggtgttattaaagcattggaggtaatgcctttacttgtatttaattttgccccgctcatgaacatgaaaatctaattattcttattatttttttcggtgtaaaccagacacatttgacccaggttgaagatgaatacaaggaaaagcttgagaaggagacttcagccaagagggaccttgaaatggtatattgattattattttggatggttttcttattgaaaaatcagtttgatattgtgagtttcttagttgatcttttggctttcatgctattcaggaagctacctacttaaagcaaaagcttgaaaagtgtgaatctgatctggagaatacaaggaaatctagtgaattgagcttcactccattggttgcagcagacccttgtgatctagcaggctcaccgatgaaagaaatgtattatttctgaaactttatacttttagtctagcgagatatctaaagcaggcgctattagcatagctaagtaacactttctagagagcattgttcaaggctttttgatattaattgtgttttgctcattaaagcttatcttattgaatgatgttaacttctgtttgtgctgtaccgttgtaaacatgatattatctttgtcccaacaccaatagttcccaaacattttgtagtcattccttattgtgttgataagtcactgatcatatctagctggtgctagggaaaaccatgatatgcaatgttttacaaatcataacagaaacacaggaaggagtatgatccaattattaaacaagaccttaattttcatctattttgaaattctttttgtttcctatttggcagggcattttctgatccagcaaatcagaatgatctaatgattgtaccaaaagtacctactggtgtttctggaactgcattagctgcttctcttcttcgtgatggttggagtgtatgtccaatctcctctatactgtttaatctgtgcatttacgtttcaaatattacctgattaccttcactgtgtcagctcgctaagatctatgagaaataccaagaagctactgatgctttgcgccatgagaggtttggacgaaggcacgcggaagcagttctggagagggtacagttctgttctcgtcagtttatctcttaatttgtattaatctctactctctttcccatgatcccatcatttccactttcctaatagatgttttagacatcaaaagtcaaaacagctttaaatacaaactttcaaccgtgccatattctatctatgtaaccacatggaagtagtccctcctctgagaaggttgaaatgcagatttgctaagttttgattacaaactcaccataatatggatagtcaaaatttcaaataatcggattatacgcattctaaaatgacatttttttgagatggagggagtacatcaattttcgcagatttacatttatttgagatggagggtgaacattaattttcactgatattctccaaggtttcaaatttatgattaatagttgatggtgtgagaagtgtttgtaaagtgcatgaagtaaacgcacatgtagtcctgtatcatattttgtgctaaatgggtaatcgtacttgtgcagggatgctctgttgcttttctcattgattcatttctgaagtgtcctattcctgttggattactgaattatcttttgttcaacaggtcttgcatgaaattgaagagaaagctgagcttatcttggatgaacgaggtaatgtgaaatgcatacattgcttcattgcctgat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External Link(s)

NCBI Gene:Os02g0741500, RefSeq:Os02g0741500