Os02g0778200

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Structured Information

Gene Name	Os02g0778200
Description	Aminoacyl-tRNA synthetase, class I family protein
Version	NM_001054828.1 GI:115449026 GeneID:4330908
Length	10986 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os02g0778200, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 2
Location	Chromosome 2:33821025..33832010
Sequence Coding Region	33821160..33821183,33821298..33821457,33822620..33822774,33822854..33822955,33823387..33823454 ,33823603..33823717,33823910..33823978,33824310..33824417,33824885..33825029 ,33825613..33825844,33825935..33826221,33826319..33826455,33826888..33827035 ,33827832..33827963,33828607..33828735,33829075..33829202,33829279..33829443 ,33829830..33829955,33830456..33830529,33830653..33830902,33831243..33831422 ,33831496..33831738
Expression	GEO Profiles:Os02g0778200
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008395:33821025..33832010 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008395:33821025..33832010 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atggacgccgcctcctgctgccgcgtcttctcgacgcagagatgccgcttcccgctgcggaggctggcgccgccgatttcgcggcggccgttcggcacggagtcgacgagtgagctgttcgccgcgtcgacctcgaagcggcgctcccgggggcccgtcatggcggcgaagaaggccgccgagggtgctaaacaagaagaggggaaatacaaacacacggtggatctaccaaagacaacttttggcttgagagctaattctgttgtgcgggagccggagctccagaagttgtgggaggagaaccaggtgctcaagagggtatcagaaaggaacactggggctacatttgttctccatgatggtcctccttatgctaatggtgatcttcatatgggccatgcactgaataaaatcctcaaagatattataaaccgttacaagctgcttcagaatcacaaagtttcttttattcctggatgggattgccatggccttccaatcgaattaaaagttctaaagtcactggacaaggaaacattgaatgctctgacacctataaaattaaggcagaaggctgcaaaatttgctaaagcgacggttactacacaaatgaattctttcaagcggtttggtgtatgggcagattgggacaacccttatctaactctgtcaccagagtatgaagctgctcagctagaagttttcggccaaatggttatgaaaggatatatctaccgcgggcgaaaacctgttcattggagtccgtcatcacgtacagctttagcagaagctgagttggagtattcagaaaatcatatttccaaaagcatgtatgctgcattcaagatcaccaatctgtctaagcctgggttgctggaggaatttctccctaatttatgcctagccatatggaccactactccatggacgattcctgctaatgctgctgttgctgtgaaccctgagctcacttatgtagtagttgagctgcaatctgtactagaaagtgaatcaacatctggtggaaatcaacgaaagcttgggagtattttgagccctgggagtcagaaaccatttatcatcgtggctgctgatcttgtctcagctctagagtccaagtggggtacaaagcttataatccagaaatcatttcctgggtcagccttggagcactgcaggtatattcatcctgtgaatggcaatgaatgttctgttgttcttggaggagattacataacaactgaatctggcactggccttgttcatactgcccctggccatggtcaggaagactacataacaggtttgaaatatgggcttcctattgtgtctcctgtggatgatgaaggaaacttcactgctgaagctggacaattcagtggtttatctgttctgggagctggtaatgccgcggttgtgaattatctggatgaacagtgttctctcattttagaggagccttacaaacacaagtacccctatgactggcggtctaaagaaccaacaatattccgagcaactgaacaatggtttgcctcggtggatggtttccgtaatgctgcaatggatgcaattaggcgagtatcttggattccttctcaggctgaaaataggattgtggccatgacttcaagccgttctgactggtgtatttcgcggcagagaacttggggggttcctattccggtcttctatcatgtagactcgaatgaacctcttataactgaagaaactattgaacacatcaagggtatagtgtcaaagaaagggagtgatgcctggtggtatatgacaattgaggaacttcttcctgaaaaatatcgtgataaagcatctgagtatcgcaagggaactgatacaatggacgtttggtttgactctggctcctcatgggctgctgttttggcacaaagagatggccttaattttccagcggatatataccttgaaggttcagaccaacaccgtggatggtttcagagctcattgttaaccagcattgctactacaggaaaggctccatattctagtgttataacccatggttttgtactggacgaaaagggtttcaagatgagcaaatctcttggtaatgtggttgatcctgagaaagtaattgttggtggtaaaaattcaaagcaagaacctggctatggagcagacgttcttcggctatgggtttctagtgttgattacactggagatgtgttggttggtccacaaattttgcgccaaatgtctgacatgtaccgaaagctacgaggcacaatgcgattcctattgtcgaatctccatgattggaaaccagaaaattctgtgcgctacagtgatctaccgaaaattgacaagtatgcacttttccaactggaaaatgttgtgacttccatgaaggatagctacgagaactaccaattctataaaatataccagatcctccaaagatttgctattgttgatctctccaatttctatttggatgttgcaaaggatcgactctatgttggtggccgagttagctttacaaggaaaagctgtcagacagtcctcagtgcgcatctgctctatcttgttagagccattgcccccattatgccacatctagctgaggatgtatggcagaacctaccgtttcaacacacactggatgatggatctgttgctgagtttgtttttaatctaaaatggccagttaagaatgaagaatggctctcggttccaaaggatgatgttgattttctgagtgttatcctcgagttgagatcagaggtgaacaaaattttggagagtgctcgaacaggaaagctgataggctctagcttagaggcaaaagtttatctccacgcggaaaatgctaacacagtgtccaaactaaaggagctggtttcggcaaccaatgacgctgatgctctgcaccgcctgtttatcacatctgaggtggagatccttccttccgtaagctccgaaactacatctggtgtatcctacactggaacttttagcagtgagcgcaccggcaacatctggattggtgtgactcgcgccgatggcgaaaaatgtgagaggtgctggaattatacccgagacgttggatctttccttgaccatcctactctttgtgcccggtgccacggtgtcattgatctgccaccagttcctgctgccgcggctgtcagctga</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MDAASCCRVFSTQRCRFPLRRLAPPISRRPFGTESTSELFAAST SKRRSRGPVMAAKKAAEGAKQEEGKYKHTVDLPKTTFGLRANSVVREPELQKLWEENQ VLKRVSERNTGATFVLHDGPPYANGDLHMGHALNKILKDIINRYKLLQNHKVSFIPGW DCHGLPIELKVLKSLDKETLNALTPIKLRQKAAKFAKATVTTQMNSFKRFGVWADWDN PYLTLSPEYEAAQLEVFGQMVMKGYIYRGRKPVHWSPSSRTALAEAELEYSENHISKS MYAAFKITNLSKPGLLEEFLPNLCLAIWTTTPWTIPANAAVAVNPELTYVVVELQSVL ESESTSGGNQRKLGSILSPGSQKPFIIVAADLVSALESKWGTKLIIQKSFPGSALEHC RYIHPVNGNECSVVLGGDYITTESGTGLVHTAPGHGQEDYITGLKYGLPIVSPVDDEG NFTAEAGQFSGLSVLGAGNAAVVNYLDEQCSLILEEPYKHKYPYDWRSKEPTIFRATE QWFASVDGFRNAAMDAIRRVSWIPSQAENRIVAMTSSRSDWCISRQRTWGVPIPVFYH VDSNEPLITEETIEHIKGIVSKKGSDAWWYMTIEELLPEKYRDKASEYRKGTDTMDVW FDSGSSWAAVLAQRDGLNFPADIYLEGSDQHRGWFQSSLLTSIATTGKAPYSSVITHG FVLDEKGFKMSKSLGNVVDPEKVIVGGKNSKQEPGYGADVLRLWVSSVDYTGDVLVGP QILRQMSDMYRKLRGTMRFLLSNLHDWKPENSVRYSDLPKIDKYALFQLENVVTSMKD SYENYQFYKIYQILQRFAIVDLSNFYLDVAKDRLYVGGRVSFTRKSCQTVLSAHLLYL VRAIAPIMPHLAEDVWQNLPFQHTLDDGSVAEFVFNLKWPVKNEEWLSVPKDDVDFLS VILELRSEVNKILESARTGKLIGSSLEAKVYLHAENANTVSKLKELVSATNDADALHR LFITSEVEILPSVSSETTSGVSYTGTFSSERTGNIWIGVTRADGEKCERCWNYTRDVG SFLDHPTLCARCHGVIDLPPVPAAAAVS</aaseq>
Gene Sequence	<dnaseqindica>136..159#274..433#1596..1750#1830..1931#2363..2430#2579..2693#2886..2954#3286..3393#3861..4005#4589..4820#4911..5197#5295..5431#5864..6011#6808..6939#7583..7711#8051..8178#8255..8419#8806..8931#9432..9505#9629..9878#10219..10398#10472..10714#gcttctccggtggttctcttctcttctcttatcccccggagacgccgctgcggcgccaccccctcctcgccgtggacctcggggtgggagcgtggcggcctgcacagccggagctcagctcgcccgccgcgtcggatggacgccgcctcctgctgccgcgtaagcgcgggcgcgctcccccgatttccgttctcgcttctcgaacgttctagagccttctacggtgggggatccgtgtggtgtgacccatcgtcgcttctctcgctctcgcaggtcttctcgacgcagagatgccgcttcccgctgcggaggctggcgccgccgatttcgcggcggccgttcggcacggagtcgacgagtgagctgttcgccgcgtcgacctcgaagcggcgctcccgggggcccgtcatggcggcgaagaaggccgccgagggtgagtcgacttgatcccattgctgtactgttcttatttttggttcaggttgagggtttggtgagggttttagtagggggattggtgtctatatgttggtatttcagtgatgtgagttttggctgtggagtaggtgcattaggcgtccgatttttcttgggattactctgtgtctgtggtcaatgtatatcgtacttgctctgtggattgtggggatgccagccatttttgtctggtgaggcgttggaggttgaagctggtctatggcctggagattttcgttcttgctgttcacgttttgatgggattgatcacagggtgaggcacatgattacagatattgaactcgtgtgacgtacagcttaaactggttggttaatttaggttcaaatatgtgattgtagtttccacttctgcaattgctataattattttcagcttaagcacgtagggcttattaaactcattaccaaacttgttttactgcagttttctgttacatttgtacttttatgattgatgtgtgttacttaggctcaatctgcttggtttagccttaagtatgctatgacctgggatttttgtaattggtgtacttttcagatttaagaatgtacacacctattggacttctcagttcgcaccaaaatgcacttattaggtctcaagcaccatggttggaagattattattgttttgcgtatcagattaagcttaattctcattttctccatttggagtagcatcaactagtgctcgaaagtcgaaacttgatgcttatgcttgttaggatgaaagctgtttaagcttaaatgtgttttgtatacccagaattcggtaatcagattgatttttgaaaataactttgttatctggtgttagttgaaactttgttatttcagtacattccattgagattcaaatgcagtgagaccctctgcttacttagtaggtgtcaatactgaagcttttactggcaaaagttatggtgtattttgtaatgaaaatctcgtagagacatgtaattaattttatctggctgttttataatgaatagtagttggtagtttgacaggttgagtcccagtttcaatttagtactgcttgcagagttaaattcattaagatataattatatatttagcttcttgattctggctaggtgctaaacaagaagaggggaaatacaaacacacggtggatctaccaaagacaacttttggcttgagagctaattctgttgtgcgggagccggagctccagaagttgtgggaggagaaccaggtgctcaagagggtatcagaaaggaacactggggtgagtatttcttcgagtaaagctaaaagtaaaattaaaatttacctgactttgttggttttcttgactgttggattaggctacatttgttctccatgatggtcctccttatgctaatggtgatcttcatatgggccatgcactgaataaaatcctcaaagatattataaaccgttacaaggtatcgtttactcttcaatctaatctgagtatttttctttaaaaaccattgatgtatttttcagggcaattactgatgcagtcatagtatgttgtcttattcagttcaatccataggatattctctgttctgagatcaatgttactgtacggatgattggtgcatagattttattgtcttttccaatgcagtgcaatttctgtcatttctttatcttaacatgtagagctctttagtgtagttgattgtgtacgagatttggatgattaatgaactttttgctaattctagtagttttttcctgataactctcttcgctgaaatgtctttaactttttttggctggatgactatgctttttatgttggtccaaaccaaaattgggaacataaatcaactgacaccaaaatttgcttttcttctgtgtgcagctgcttcagaatcacaaagtttcttttattcctggatgggattgccatggccttccaatcgaattaaaaggcaagttcatctttatatccaatggaaacaccctatgtttacaagaagttaggtaggggttggttttaacacaatgcttgcatgtgttagaccagccaagtaattattgaatatccttccaaatgtaaccattgactatttgctgcagttctaaagtcactggacaaggaaacattgaatgctctgacacctataaaattaaggcagaaggctgcaaaatttgctaaagcgacggttactacacaaatgaattctttcaaggtaaccatttctttattttaaagtactttagtggtgacatgatctaatagcaagttgcccttatctatgttttgtggtatttcctggtatgattgctgacttgcagtcatctaatatctggaattctgtctcatgttagcctttagtttcatatttctataattgtattaaccaatgacattgtgcctgcagcggtttggtgtatgggcagattgggacaacccttatctaactctgtcaccagagtatgaagctgctcaggtctgatcctattgtttatagtaattttgccattgcatcaaaacttatttatccatttcacatgaatgaaagcttggaggtttggaattaccttagttagatcattgatatcatcttggtcacattatagctgctagctctaataaaaaaaatagagctgtttactttcagttccttttagtccatttaccatcgttgatataaaatatataacgtgtatgcaaattttatgctgcgagaataaatactgatgttttctttttcatccttatcatatgtttttaatcaaggctaaccgtaacaactcttgttctccattttgatatgccagctagaagttttcggccaaatggttatgaaaggatatatctaccgcgggcgaaaacctgttcattggagtccgtcatcacgtacagctttagcagaagctgagttggaggtatgcttgaactttctacttgatgctattaatttgctgtcaaaggctttgttgtgcattaatttttaagtgactattaaatattcgaataaaaaattgacaattccgatttgtttcctgtttaatttcaataattttcttgtgcttcagtatgtcttctcagtgaaaagccactagatgtgtcacttatttcttcctgttaatattaggcctacactgctgcagaaaaactaccgagcttttttcatgaagtcctttcatgtttaagaacacttctcttactaaccaaccataagagcgctttatgtgtcttattacataaagcacattacttcgtacatgtagtctttcacttaattcatgattggtgatcttttattttttttctcccttttcatttatgttctttagatttcttttgaatttgattcctcatatcatcacatgcattccttctgttcttccagtattcagaaaatcatatttccaaaagcatgtatgctgcattcaagatcaccaatctgtctaagcctgggttgctggaggaatttctccctaatttatgcctagccatatggaccactactccatggacgattcctgctaatgctggtgaggtgatgccttgattgctttaatgtattcagtgagtgtcactcttataattggatttcatcagagccaacgtaattaatttcaaaatatgtggctaattttgaagctatatgcgtctgtacatggaaaatagcatattaagaaacagaaaacttcacatgttttgtagttcctagaacctgtaattcctagaaggctagaacttgattaagaaatactaagtaatatctacgttacagtgatataacatagtttgattgtaaatcatggcacacatcttgcttccaataaaaaaaagaaagctctttgccgatttatccctccatagcaagaagatgcttcatttcaagtatgggtaagatcgaataggtgatactggtatgctacacagcatttcatgtttttgtttcaccagcagaaacagtgtcttattgtctcagctattctggaattgtagtagatagcattatgtccctgtctattcttatgtgtctgctgcgcatactgtatggattcgcttcaactctttggtattctctacatattaacttgtctaagaagccctttcttctttaaccagctgttgctgtgaaccctgagctcacttatgtagtagttgagctgcaatctgtactagaaagtgaatcaacatctggtggaaatcaacgaaagcttgggagtattttgagccctgggagtcagaaaccatttatcatcgtggctgctg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External Link(s)	NCBI Gene:Os02g0778200, RefSeq:Os02g0778200