Os02g0823000
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Structured Information
| Gene Name |
Os02g0823000 |
|---|---|
| Description |
Peptidase A22B, minor histocompatibility antigen H13 family protein |
| Version |
NM_001055100.1 GI:115449840 GeneID:4331193 |
| Length |
5608 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os02g0823000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:36228613..36234220 |
| Sequence Coding Region |
36228722..36228862,36229729..36229887,36229979..36230090,36230674..36230790,36230938..36231089 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008395:36228613..36234220 source=RiceChromosome02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgggcaccagctcgccggagatggcggccgcgctcttgctggtcatggcggctctggccggggtcgcggccggcggcgacatcgtccaccaggacgacgaggcgcccaagatccccggctgctccaacgacttcgtcctcgtaaaagtgcaaacctgggtcaataacagagaggatggtgagtttgttggtgttggtgctcgttttggccccactatagagtcaaaggaaaagcatgccaatcggacaggactattgttagcagatcctattgactgttgtgatccccccacacagaaggttgctggagatgttttgttagtgcaaaggggaaactgtaagttcactaaaaaagctaagaatgctgaagctgctggggcttctgctattataatcatcaatcatgtccatgagctatacaagatggtctgcgaccgaaatgaaacagatttggacataaatatacctgcagttcttctgccaaaagatgcaggcaatgatttacagaagcttcttacacgtggtaaagtttcggtgcagctatactctccagaccgtcctctggttgatactgcagaggtgtttttgtggcttatggctgttggtaccattctttgtgcatcatactggtcagcatggagtgctcgagaagcagttattgaacaagagaagcttctaaaggatggccatgaaagttcactaaacttagaggctggtggttctagtggcatggtagatatcaacatgacatcggcaatactgtttgttgttattgcatcttgcttcttgataatgctctacaagcttatgtctcactggtttgtggagcttctggtggtcatcttttgcattggtggtgtagagggtctgcaaacttgcttggtggctttattgtcaagatggtttaaacctgctgccgaatctttcgtgaaagtgcccttctttggagcggtttcataccttacaatcgcagtctgtccattttgcattgtgtttgctgttatatgggctgtttatcgccggatgacctatgcttggattgggcaagatattcttggtattgctctgattgttactgtaatccaaattgttaggatacctaacctcaaggtcggatctgttcttctcagttgttccttcttatatgacatcttttgggtttttatctccaagatgtggtttcatgagagtgtgatgattgtggttgcccgtggtgataagactgatgaagacggtgtgcccatgctgttaaaaatcccacgaatgtttgatccatggggtggattcagtatcattggctttggtgatatacttcttcctgggctgttgattgcttttgcattaaggtatgattgggctgccaaaaagaccttgcaatctggttactttttgtggtcaatggttgcttatggttctggtcttatgatcacgtatgttgccttgaaccttatggatggtcatggtcaaccagctcttctttacattgtgccttttacgcttggcaccttcatagcgctcggcaggaaacggggtgaactcaggaacctctggacaagaggacagcctgagagagtctgcacgcacatgcacatgcaaccttcaccgaaggacaccaattgtgatgctgtaagctcgtaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGTSSPEMAAALLLVMAALAGVAAGGDIVHQDDEAPKIPGCSND FVLVKVQTWVNNREDGEFVGVGARFGPTIESKEKHANRTGLLLADPIDCCDPPTQKVA GDVLLVQRGNCKFTKKAKNAEAAGASAIIIINHVHELYKMVCDRNETDLDINIPAVLL PKDAGNDLQKLLTRGKVSVQLYSPDRPLVDTAEVFLWLMAVGTILCASYWSAWSAREA VIEQEKLLKDGHESSLNLEAGGSSGMVDINMTSAILFVVIASCFLIMLYKLMSHWFVE LLVVIFCIGGVEGLQTCLVALLSRWFKPAAESFVKVPFFGAVSYLTIAVCPFCIVFAV IWAVYRRMTYAWIGQDILGIALIVTVIQIVRIPNLKVGSVLLSCSFLYDIFWVFISKM WFHESVMIVVARGDKTDEDGVPMLLKIPRMFDPWGGFSIIGFGDILLPGLLIAFALRY DWAAKKTLQSGYFLWSMVAYGSGLMITYVALNLMDGHGQPALLYIVPFTLGTFIALGR KRGELRNLWTRGQPERVCTHMHMQPSPKDTNCDAVSS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>110..250#1117..1275#1367..1478#2062..2178#2326..2477#2560..2742#3383..3417#3565..3721#3808..3861#3952..4044#4129..4271#4509..4579#4990..5073#5164..5300#aacagaagcggagaagaagaggaggaagaagtccatctccatccccatccccatccccatccatccctcgcggcggagagcagcgtggaggaggagaggtccggtggccatgggcaccagctcgccggagatggcggccgcgctcttgctggtcatggcggctctggccggggtcgcggccggcggcgacatcgtccaccaggacgacgaggcgcccaagatccccggctgctccaacgacttcgtcctcgtacgccccttcccagactttctaccatctcgcttgcgcggtttcttcgcttgcccttagtacgatgcgacccgaattttcggttccgagctgcacgggacgggagtgttcggttcaatttcagtcgtaggtgaagctagggtttcgagctattgatttgtgactttacagtatcagatcagggggacggtatagagcctgtccgattttgtcaattgtagacttcaccgatgttgtttgctgctcagaacaggtgattgataacttggggacacggactcgcggctttgcttagagtctcgactaaattagcctgcccgatttggtttgaattctgaagctcatcagtcaatcgttggagcgggctatagcctacaattaacgatctgctttggaggcttcggttgtaagctgaggacctgtcgttagttactagtttacttgaactgttgaacaactagttattagtgctattcaattagtgtttatagttgttaaactaagtttttagatggtcagtatagcatatggtattttgtagtctcttctatatggtgattgtcagtgtaggtttcaaaatggcgagttttagaattatcaagtttcgatgcagggagatatggtccttgcattacctgactcactggctaacccctgttgttgcaacctgcctcgggccctctccaggtgcctgtttggttgcaaagtaggaggcagggtcacaacacaggggcattagcttcatagcttcaaatttgttattttatacctaacaccttacagtgctactttattgataacaagtattcctacccatcatgtgaccattcttttaactatgttgttttccatcaccgtgttatcaggtaaaagtgcaaacctgggtcaataacagagaggatggtgagtttgttggtgttggtgctcgttttggccccactatagagtcaaaggaaaagcatgccaatcggacaggactattgttagcagatcctattgactgttgtgatccccccacacagaaggttagcttactggaaatgacaaattaatagtttgtgatttctcgatggtgtcctacattcctacccagtgactgattattcctttatctaggttgctggagatgttttgttagtgcaaaggggaaactgtaagttcactaaaaaagctaagaatgctgaagctgctggggcttctgctattataatcatcaatcatgtccatggtatgccttatttgtgaaattatttgtaaattcatacatataatgtcctttgctttatacctgcgttcagcagctgattagttagtagatcaagatgttgaaatagtcgaatagcataatattctcccttaccattttactatgcatatgcatggtggaccactataaaccttctatttaccattgccatcctacctgaaatctcttctgtgtcttacctttgttaaaagatcatttactatctattgtaagattacaaccattagtctctttaccctacataggcagatcaacatatattcttgccatgggtgcaaatagttaatgtgcgtgcgtgctcaagatacttcctaggttgttttatcattgaaaggtcaatgtctatgcatcacacccaaatttagttgcagtggttcatcacttcatattgtttgataagttagatacttacttttgactgtgttatcagatttttttcaaagttggacacatgtattgcaccagtccccacatgtttgtcaatataggtgagcactcataaatgtggttaacatgtgtcctgcactcctgcttccacttgcagagctatacaagatggtctgcgaccgaaatgaaacagatttggacataaatatacctgcagttcttctgccaaaagatgcaggcaatgatttacagaagcttcttacacgtggtaaaggtaaatcttcaaagccttccaccacctgaaatcttgtgccatgtcctatgtaggttttttttttgtttcaaattttgttttgtcttggaagttgttttttggccatagtatctaacatatgtatcgaatttgttttcaatttctcagtttcggtgcagctatactctccagaccgtcctctggttgatactgcagaggtgtttttgtggcttatggctgttggtaccattctttgtgcatcatactggtcagcatggagtgctcgagaagcagttattgaacaagagaagcttctaaaggttctgaacagaagcttatttgactattgttctggattttgtttgcttgaaaagagaactaacagtcatttggtttatgtaggatggccatgaaagttcactaaacttagaggctggtggttctagtggcatggtagatatcaacatgacatcggcaatactgtttgttgttattgcatcttgcttcttgataatgctctacaagcttatgtctcactggtttgtggagcttctggtggtcatcttttgcattggtggtgtagaggtgtgttcaatgccattccattttccctgtaattaattagctggatatctggccctaagatctttatactgtttatccattgaaacatataatctgtatgctttccaaatgctaaatttcacaaattgtgaggcagtactatatgaactactatgaaagaatcatgccaaactgagcaaggagctttgtggtttctctttaatgccaagcatgataacttttatcgaatagaagaataaggccctgtttgattcagcttaggattattataatttggattattaggagtaagctgaaacaaacaagtagattattatgatagattattataatctaataatcttctatggatgagctttttccagattattgagtggctaaagacccactacccttagatgcctctaataatccagagaaacaaacagctcacagcttattctatgtcagtttattataatctagtttatagtaatttgatttgataatctagattacaataatcttaagctaaacaaacagggcctaaattgaccttagttctgttagtcgatattcaaaactaatatttatgtttgtatgattgttgttcttacatttcttgagctcattgtgtgttctttattatttgtttatgcagggtctgcaaacttgcttggtggctttattgtcaaggtacatttgtggccctttgaaattgttttatgggctaggatttatatagtagacacgtctcagatgaatatttatatatcatggctgtgggctgtggccaagagaacataagaaagtttccttaccagtaatcatgtgatctttcagatggtttaaacctgctgccgaatctttcgtgaaagtgcccttctttggagcggtttcataccttacaatcgcagtctgtccattttgcattgtgtttgctgttatatgggctgtttatcgccggatgacctatgcttggattgggcaagatattcttgtaagtgaagtttcgtttttataccctcaccctcaattgggatgattaggaggttgaatgttaattaacatggtgcctgtcttcagggtattgctctgattgttactgtaatccaaattgttaggatacctaacctcaaggtaattattgtgccctgctgcttatgcttaccatatagtggggagtggggacttttataacaattcttgctctttttccatcatgatcaggtcggatctgttcttctcagttgttccttcttatatgacatcttttgggtttttatctccaagatgtggtttcatgagagtgtgatgattgtggtaggtacagatgactactttcatactgtgatgttctgcttctgcaacttgcgaaatgctaattgccctagcgtctgctcgtaggttgcccgtggtgataagactgatgaagacggtgtgcccatgctgttaaaaatcccacgaatgtttgatccatggggtggattcagtatcattggctttggtgatatacttcttcctgggctgttgattgcttttgcattaaggtcagtgttaaattctgcccatccgctttatctacaagtctttgcctaatcctgctatattaacgtgcaaggcttttgcatatttgtgaaaaaaaaatagcctaatcctggtgggctatcataaattgctcaggaggcttgagaacaatcagcataaattgttttggatttgcaggtgtctgagcacagtacgttattgagcactacactgatttttttttcaatctctctttgtaggtatgattgggctgccaaaaagaccttgcaatctggttactttttgtggtcaatggttgcttatggttctggtaagacgccacttcttacatgcacttccctgtgttttccaactctctaggtacagtttgccagatacagcttaaactaaattgtcctataatgggatacttttgatagtagaaacaaaattacaatgggacctttggtttatactcccctgttattttttatatgatgttggttagttcattttttaactaaccagcgtcatatatttagggatggacgtagtaccttttattttctgctggttgatggaaatg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