Os03g0102300

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Structured Information

Gene Name	Os03g0102300
Description	CCR4-Not complex component, Not1 family protein
Version	NM_001055196.2 GI:297600186 GeneID:4331296
Length	17258 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os03g0102300, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 3
Location	Chromosome 3:131141..148398
Sequence Coding Region	131141..131236,131743..132043,132125..132341,132440..132773,132883..132996 ,133065..133193,133293..133469,133555..133746,134844..134981 ,135327..135559,135900..136003,136633..136727,136817..137053 ,137801..137922,138252..138354,138750..138826,138909..139017 ,139107..139253,139953..140000,140292..140492,140589..140738 ,140917..141002,141088..141193,141278..141373,141759..141911 ,142647..142819,142923..142986,144056..144193,144548..144595 ,144690..144836,144907..144968,146540..146645,147357..147461 ,147548..147679,147765..147974,148070..148171,148261..148398
Expression	GEO Profiles:Os03g0102300
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008396:131141..148398 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008396:131141..148398 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atgatctccgaaatctccgcgacggaggtgcgcctcctcctgctccaagccgccgccgattctaacctcgattccgttcgccgccgcctctgccagttagtcgactccggtctggatggatgcattttgcttctccaagtttgtttggatcaagtgctcctcaaacctcaccagctggacaaatctaaacatgatcttttatctgccgttttcagatactgtatggataaaacatacttcaccacctgtttttgtgaggctcttggaccgatgcctgccacccatggcgatggcttcctcaaaaccttatcaaatgtcctggaactctcaccagctgagagagttggcattggacttgccctgtcagattctgaggattcaggcctcaagctcaaagggcaacagttttcaattgctcaaattgaggggttgtgtttaaatcttcttcaatcgccatcaaatgaccaaattcacgacattgtcatctttcttcaccagactgatgggctgtcaaagcatatggatacttttaataccattatatctctattcaaaaccaaagagacaccgttttttgctcctaccccatttaacaagtgcgatattcagtcaaggcatctggacatgtgctttggcagcatggattacgattctgagttgcttctgtctgaaattgagaaagaaattaccatggcagacatcgtaactgagttgggttatggatgcacagttgataccactcattgtaaggaaattctttccatattcgagcctcttgatgatgtagcagtatcaaagttggttggggcagttattggcactcataatgtccttgtggaggcccacaatacatatgctatgtttgtatcggctattagcaacatgaatgattcacctcaattgactacatggaacactgacgttcttgtggattcgatcaatgaacttgcccctagcactaactgggtgcatgtaatggaaaatcttgatcatgagggtttcaatgttcctgatgaagcagccttttgtttgctgatgtctatatatgcccatccttgcaaggagccttttccacttcatgctgtttgtgggtcattgtggacgaatacagagggtcaaatttcattcttaaagcatgcagtttccgttcctactgatacatttacattttcgcattgttcgaggaagctggcatttccggacttggcctgtcctattcaagacaatcatgcttggttctgccttgaccttatggtggttttatgccaacttgctgaagttggacacaccgtgtcagtacaatcaatgctggagtatcctctacaacattgtcctgaactcttaattgttggtcttggacacgttaatactgcgtataatctcctccaatatgaagtgcagtctcgtgtatttcctgccatactgaaggatgctacaaaaagcaatgtggtgaactatctctggcagattaacccatccctcactcttcgaggatttgttgatgctcattctgatccagattgtcttctgaggattgttgatgtgtgtcgagacctgaagatcctatctgctgtgcttgattctaccccttatgcattcagcattaaactggctgttgctgcctctaggatagaccatagccatcttgagaaatggttgattgcaaagttacgtgtctgcaaagacgattttcttcagattcttcagtatcagtcagggcatctcttgtccaatcaaaaattggatgaactaagaaaatcatatatttcttatgagttgagaaatcatgattctgttgtaagggggatccctacttcagataatgttgaaatagaggcagatgcttattttcaccagatgttttctggacagataagcattgctgcaattgtacagatgctatctcgcttcaaaaattctccagaaaaaagggagcaattgatttttaagtgtatgatatcaaatatgtttgaagaatacaagttcctcccgaagtatcctgataagcagcttaaactgtcagctcttttgtttggatctcttattaagcatcgacttgtgacccaccttgagctcggaattgctctacatgctgttcttgatgccttgcacaaatctgttgattcaaagatgtttatgtttggcacaacagcattggaacagtttatggaccgtcttatagagtggccagactactgcaatcatatattgcagatttcccatctttgtggggcacacactgaaatggtctcagcaattgagagagcccttgctaggatctcatcgagccagaatgagctcagcgttaacatctcagtctcttctgagcagcatgtcactggtttggcaccgattgaaccaatagagaggggtgaatgggcgaggccgaggctagttgtggtctacgggtcctcgttctttgctcttgcagctgatttccatgatatgacatcaatcacacatccacaccaccattcaccgagccatcggcttctgatcaaccatcttcattaccttcccctcatcaattgtccagtgtgccatctactatgcatgctactgttttttcacatcctcaaagttcctgctcaggctaaggcaaaagaatgtattgaggtactcccagaatgttattatccttggtttgcacaatccatggtcatgaaaagggcaagcattgaaccaaaatttcatgacttgtatttgaagttctttgtcaaagtgaactcaagattcttaaacaaagaagtactgaaggctacatatgagaactgcaagatattgttaagatcggatcttatcaaatctagttctgaggaacgctccttgctaaaaaatctgggaagctggctaggaaaattcaccatcgggaggaaccaggcattactagctaaggaaattgacccaaaagttcttattgtagaggcatatgagaaaggactgatgatagcagtcattccattcacttcaaaggttctgtttaagaaccttgatgtggatctgaaagatgtaaacccaacttccctccttaaggatagagtatgtgaagttgagggaaatccagatttttcaaacaaagatgttgctgcatctcaaacccaaatctcttcgggcatcagtcgctcaacaaaccatgtggaactgcagtcagttatcagtagcacttcccatgcttatgcaactcctcatcttccttcaaatagcatggtagaagatgacaatgttgctttcatgatgcctaagcatgtttcctcgcatactttgacccaggtttcaccatcagaaacagcattggcatcacaatctccattttctcttactcagcttgtgaaattgataccacatgatgagatacgctgcaaaataagttcgaaacttggctctcttggtcgacaattgcaatacagcaaaatcatggacacagctttggacaaggctattaaagagatattgtgccctgttgttgaaaaaagtgtgggcacagcaatccaaaatacaaaaaaacttattctgaaggattatgcactggagtcagataacaataccataaaatcttctgtacattcaatagccaggacaatagctggaaatctagcctatgctaattgcaaggaacctctttgtgttgcactaacagatcatcttcaaagtcagattcagacgctcactagtaacaacaaaactatcaagcaactaatcgatgttctaatcaatgataacctggatcttggctgcagaattattaagtctgttgcaatgtgcaaggctattgaaatgattgacgaagaaataacagagtcttttccactacaaaagaaacaaagggaggcagctggctctgcatactgtgatgcttttacccatgctcagggtcgatttgcacatgaacctgaagcactgcatcctaaacatgagcatctatctgttgcccaacaagtgactatgttcatgtatggcagagccatagccaacatgttgacgcttcatgttttggtcagtctggaacttgctgttaaacactctctagtccccaatcagattgttgctactggtggagtgtctcagaagtcatcacaacaactcaaaatttcatatttcccaattgattctttttcgaagcttgtagctatggtgctcaagtactcatctgctgaaacaggaccaaataaatgcagccttcttcccaagattttgttagtggcagttaggatcattcagagagattctgaagagaagaaagcatcattcaatccccggccatactttcggctttttataagtttgctatatgatcttatttcttctgacctccatagtgatggtgctaatttccaggttttgattgcatttgcaaatgcattccatgcactgcaacccttgagaattccttcctggagtttctgtgacatgattccttccagttgcattcaaatgcgcaatgtcattcttgatgctcatccacaagacatgagagtggtagatccagctagtcctaatttgaagattgatctgttaccggaaatttcaatggctccacaaatcatgtcggatgttgagggtgctctgaaatcaaagctgatgaagactgaggttgatgagtacttcaagaaatcagaaggctctttgtttcttagtgatctgaagcaaaagttattgctgccacaaaatgaaactagtgttgccgggacacgctacaatgttcctctcattaattcgcttgttctctatgtcggtatccaaggtttgcaacagcaacaaacggagtctagtgcatctggtccagcaatccatactgcccacatggatattttcagaactcttatggcagacttggacacagagggccggtaccttgttttgaatgcaatagctaaccagctgcgttaccctaatatccatacacactgcttctacttcatcatcctgcatctgttttcagaagctacccaggaaattatccaggatcagataatgagggttat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Protein Sequence	<aaseq>MISEISATEVRLLLLQAAADSNLDSVRRRLCQLVDSGLDGCILL LQVCLDQVLLKPHQLDKSKHDLLSAVFRYCMDKTYFTTCFCEALGPMPATHGDGFLKT LSNVLELSPAERVGIGLALSDSEDSGLKLKGQQFSIAQIEGLCLNLLQSPSNDQIHDI VIFLHQTDGLSKHMDTFNTIISLFKTKETPFFAPTPFNKCDIQSRHLDMCFGSMDYDS ELLLSEIEKEITMADIVTELGYGCTVDTTHCKEILSIFEPLDDVAVSKLVGAVIGTHN VLVEAHNTYAMFVSAISNMNDSPQLTTWNTDVLVDSINELAPSTNWVHVMENLDHEGF NVPDEAAFCLLMSIYAHPCKEPFPLHAVCGSLWTNTEGQISFLKHAVSVPTDTFTFSH CSRKLAFPDLACPIQDNHAWFCLDLMVVLCQLAEVGHTVSVQSMLEYPLQHCPELLIV GLGHVNTAYNLLQYEVQSRVFPAILKDATKSNVVNYLWQINPSLTLRGFVDAHSDPDC LLRIVDVCRDLKILSAVLDSTPYAFSIKLAVAASRIDHSHLEKWLIAKLRVCKDDFLQ ILQYQSGHLLSNQKLDELRKSYISYELRNHDSVVRGIPTSDNVEIEADAYFHQMFSGQ ISIAAIVQMLSRFKNSPEKREQLIFKCMISNMFEEYKFLPKYPDKQLKLSALLFGSLI KHRLVTHLELGIALHAVLDALHKSVDSKMFMFGTTALEQFMDRLIEWPDYCNHILQIS HLCGAHTEMVSAIERALARISSSQNELSVNISVSSEQHVTGLAPIEPIERGEWARPRL VVVYGSSFFALAADFHDMTSITHPHHHSPSHRLLINHLHYLPLINCPVCHLLCMLLFF HILKVPAQAKAKECIEVLPECYYPWFAQSMVMKRASIEPKFHDLYLKFFVKVNSRFLN KEVLKATYENCKILLRSDLIKSSSEERSLLKNLGSWLGKFTIGRNQALLAKEIDPKVL IVEAYEKGLMIAVIPFTSKVLFKNLDVDLKDVNPTSLLKDRVCEVEGNPDFSNKDVAA SQTQISSGISRSTNHVELQSVISSTSHAYATPHLPSNSMVEDDNVAFMMPKHVSSHTL TQVSPSETALASQSPFSLTQLVKLIPHDEIRCKISSKLGSLGRQLQYSKIMDTALDKA IKEILCPVVEKSVGTAIQNTKKLILKDYALESDNNTIKSSVHSIARTIAGNLAYANCK EPLCVALTDHLQSQIQTLTSNNKTIKQLIDVLINDNLDLGCRIIKSVAMCKAIEMIDE EITESFPLQKKQREAAGSAYCDAFTHAQGRFAHEPEALHPKHEHLSVAQQVTMFMYGR AIANMLTLHVLVSLELAVKHSLVPNQIVATGGVSQKSSQQLKISYFPIDSFSKLVAMV LKYSSAETGPNKCSLLPKILLVAVRIIQRDSEEKKASFNPRPYFRLFISLLYDLISSD LHSDGANFQVLIAFANAFHALQPLRIPSWSFCDMIPSSCIQMRNVILDAHPQDMRVVD PASPNLKIDLLPEISMAPQIMSDVEGALKSKLMKTEVDEYFKKSEGSLFLSDLKQKLL LPQNETSVAGTRYNVPLINSLVLYVGIQGLQQQQTESSASGPAIHTAHMDIFRTLMAD LDTEGRYLVLNAIANQLRYPNIHTHCFYFIILHLFSEATQEIIQDQIMRVILERLVVR RPHPWGLQMTLVELIKNPRYKLWSRPFIRCGPQIDKVLIEFVDMLDDPRLTSLYSSFR SIN</aaseq>
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External Link(s)	NCBI Gene:Os03g0102300, RefSeq:Os03g0102300