Os03g0114300

From RiceWiki
Revision as of 19:27, 22 July 2012 by 124.16.129.48 (talk)
Jump to: navigation, search

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information

Gene Name

Os03g0114300

Description

Protein kinase-like domain containing protein

Version

NM_001055278.1 GI:115450284 GeneID:4331385

Length

9247 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os03g0114300, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:778380..787626

Sequence Coding Region

778523..778738,779523..779777,779848..779972,780066..780110,780552..780631
,781091..781161,781277..781447,781535..781600,782337..782405
,782535..782603,782995..783053,783310..783591,784097..784230
,784414..784508,784602..784646,784757..784816,785343..785444
,785550..785601,785676..785716,785859..785923,786706..786757
,787023..787094

Expression

GEO Profiles:Os03g0114300

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008396:778380..787626 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008396:778380..787626 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggtgaggagcgggagtgtgcggcggacggccgcgtcgtcgtcgcccgccgcggcggcggtgccgacggccttcaccgcctcgcccggcgactaccgccttctggaggaggtcggctacggcgcgaacgccgtcgtgtaccgggcggtgttcctgccatccaaccggaccgtcgccgtcaagtgcctggatctcgatcgtgtcaacagtaacctcgatgatataagaaaagaggcacaaacgatgagcttgatagatcaccctaatgtcatcagggcttactgctcatttgttgtggatcataacctctgggtgataatgccattcatgtcagagggttcatgtttacacctgatgaaggttgcatatcctgatggttttgaggagcctgttatcgcctctatcctaaaggaaacacttaaggctctagagtacctccatcggcaaggacatatccatagggatgtcaaggcgggtaatatccttatggacagtcctggtatagtgaaacttggggactttggtgtctctgcttgtatgtttgatagaggtgatagacaaagatccaggaatacattcgtgggaacaccatgctggatggctccagaagttctccagcctggagcaggatataatttcaaagctgacatatggtcttttggaataactgcactggagctagcacatggccatgctcccttctcgaagtatcctcccatgaaggttcttctcatgacccttcaaaatgcaccaccaggccttgactatgaccgtgataaaagattctcaaagtctttcaaggaaatggttgcaatgtgcctggtcaaagatcaaacaaagaggccaacggctgaaaagttactaaagcactcatttttcaagaacgcaaaacctccagagctgactgttaagagtattttaactgatttgccccctctgtgggatcgtgtaaaagcgctccagctaaaagatgcagcacaattagctttgaagaaaatgccttcttctgaacaggaggcactttctatgagtgagtaccaaagaggcgtaagcgcatggaacttcgatattgaggatttaaaggctcaagcatcattgattcatgatgatgatccacctgaaataaaggaagatgttgacaatgatagaataaatgaagctgataaggagccgttttctggcaatcattttggacaaccaaaaattttgagtggaaagcacttcagtgaacaaacttgtgtcactgcagtaagtccaggggggaatatgcatgagacaagcagaggattggtttctgaacctggtgatgctgatagtgaaaggaaagttgatggatatagaaaacaagggtcagaaaacgaatcgttaccctctacatcaaaacatgattctgaaggacaaaacagtagtagtgaagttaaacaaaaagaaaggacttgctctggcccaattctgtgttctggtgtacataataaatcaataactgaaagcagtcgcatttttgatagggaagcggcagttaagttggcatctgataaacaaaagagttgtacaaaaagaaccacaaatctcagtggtcctcttgcactccctactcgtgcttctgcaaatagtctgtctgctcctattcggtcttctggaggctatgtgggctccttgggagataagtctaagcgtagtgtggtggagataaaaggacgtttttcagtgacatctgagaatgtggatcttgcaaaggttcaggaagttccaacaagcggcatttcacgcaaattacaggagggatcttcactgagaaaatcagccagcgttggtcattggccggtggatgctaagccaatgtcgaatagtcatcagcggaaggaactctgcaatggttcagtatctgcgtccgttctgattccccatctacggaatcttgtacagcagaccacatttcagcaagatctcatcacaaacctcctaagtagcttgcaacagaatgagaaagctgacgcaacacagtatagacttggtaatatggatggtgatacagaggttgaaacgtctatttccgagggagaacggtcattacttgtcaaaatatttgaattgcaatctagaatgatttcattaaccgatgaactgatcacaacaaaactgcaacatgtccagctacaagaagagctaaaaatactgtactgtcacgaagaaataatcgacactagggaggtggacaatgcttga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MVRSGSVRRTAASSSPAAAAVPTAFTASPGDYRLLEEVGYGANA VVYRAVFLPSNRTVAVKCLDLDRVNSNLDDIRKEAQTMSLIDHPNVIRAYCSFVVDHN LWVIMPFMSEGSCLHLMKVAYPDGFEEPVIASILKETLKALEYLHRQGHIHRDVKAGN ILMDSPGIVKLGDFGVSACMFDRGDRQRSRNTFVGTPCWMAPEVLQPGAGYNFKADIW SFGITALELAHGHAPFSKYPPMKVLLMTLQNAPPGLDYDRDKRFSKSFKEMVAMCLVK DQTKRPTAEKLLKHSFFKNAKPPELTVKSILTDLPPLWDRVKALQLKDAAQLALKKMP SSEQEALSMSEYQRGVSAWNFDIEDLKAQASLIHDDDPPEIKEDVDNDRINEADKEPF SGNHFGQPKILSGKHFSEQTCVTAVSPGGNMHETSRGLVSEPGDADSERKVDGYRKQG SENESLPSTSKHDSEGQNSSSEVKQKERTCSGPILCSGVHNKSITESSRIFDREAAVK LASDKQKSCTKRTTNLSGPLALPTRASANSLSAPIRSSGGYVGSLGDKSKRSVVEIKG RFSVTSENVDLAKVQEVPTSGISRKLQEGSSLRKSASVGHWPVDAKPMSNSHQRKELC NGSVSASVLIPHLRNLVQQTTFQQDLITNLLSSLQQNEKADATQYRLGNMDGDTEVET SISEGERSLLVKIFELQSRMISLTDELITTKLQHVQLQEELKILYCHEEIIDTREVDN A</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>144..359#1144..1398#1469..1593#1687..1731#2173..2252#2712..2782#2898..3068#3156..3221#3958..4026#4156..4224#4616..4674#4931..5212#5718..5851#6035..6129#6223..6267#6378..6437#6964..7065#7171..7222#7297..7337#7480..7544#8327..8378#8644..8715#tctctctcttctcttcctcgtttcagtcaccagtccacccgcggtctcgtacgcgcgacacgagtcaacgaccgacggcgatcgccggaggtggggggcggcacggcggggggtctctgctcagcgtggggggtggggccaccatggtgaggagcgggagtgtgcggcggacggccgcgtcgtcgtcgcccgccgcggcggcggtgccgacggccttcaccgcctcgcccggcgactaccgccttctggaggaggtcggctacggcgcgaacgccgtcgtgtaccgggcggtgttcctgccatccaaccggaccgtcgccgtcaagtgcctggatctcgatcgtgtcaacagtaacctcgtgagctttctctccccctctctctctctcgatcgaaactccctcactcgttcgtgtcctagggattccggtggtgatcgctgttttgatcgggggatatgcggtcgtgcaggggaggattcgatgcagttgagctgtgtgtgttgtgtcaagttgggacaatttgatccaattaaagttgtttattctattgatcagtattgacgtggtaccaacttaagaattaggttgtggtaactgtgctttgcggagtcgggatttagctccactcacttatgctattcattttagcaaatttttagttcgatcgttcgtattgttcattttgtcggttactttttattaggttttgtggctatatcgagacaacgtggggttccttatccatgggcactttaattcatcctcggcctaacttcatagatagtggatggttaacttcacaaaggcctacatttaattcttccgggcagtgcatttgcggcttataggatgacatgcagttgtcttgggttactgatccagtaaattagatgtataggacgttgtggtatagcttgtttgcttgtagtacttttcacctttgttgcattggatcatgaatgcgtctatttttctttctatcttaatgctaagtagtaggattcatgaatattacctgcagtaaattaattatatacatttactgttataggctgatgtttgaggtctcttaatgatcctctccccaagttcaataatgtatttagcatctcatagtggtatatatacatattgtacccaggatgatataagaaaagaggcacaaacgatgagcttgatagatcaccctaatgtcatcagggcttactgctcatttgttgtggatcataacctctgggtgataatgccattcatgtcagagggttcatgtttacacctgatgaaggttgcatatcctgatggttttgaggagcctgttatcgcctctatcctaaaggaaacacttaaggctctagagtacctccatcggcaaggacatatccatagggatgtcaaggttagcttctacagtagtattcattttagctaactttgtcagttgctttgctcagcgtaatattatacaggcgggtaatatccttatggacagtcctggtatagtgaaacttggggactttggtgtctctgcttgtatgtttgatagaggtgatagacaaagatccaggaatacattcgtgggaacaccatgctggtaactggagttttcttacgttttctctgttgtatgtacaataagtgttctgcaaacctttaaacgtgttttctgctgtcatttggtctttaggatggctccagaagttctccagcctggagcaggatataatttcaagtacgttggtaatagcataaccttgttccgttagctaccagtatcctggttattttgaaaaagttaatttcaatatttagatattaatttcaatatttagataaaattgtgtttcttaaaatattttaccaggaaatatgtttcaaaccatttgtttaccaacttaatttggttatttaaaatttccttaagggtaagaactctaactaccataaaaatactgggaataaggtatattttggtatcaaatgcttcagtgaaccattggcagataactaaaacattctttttttcttctgtcgttgcactcaacatgtaactgcagtgctgcttgtgttcaaacattctgtattttctactatatatgtctttatattttacttggttgctattgtactgttgaggtgcacagtgcgctcacaactatttgtccttgtacagagctgacatatggtcttttggaataactgcactggagctagcacatggccatgctcccttctcgaagtatcctcccatgaaggcaatgaattattttatcttttgcaaattgaaacctttttattaaaagaaaaagagtgacagtctaattaacaagtgcatggtcagccaaatatctatgtgtcttatattcaaattttcacatggttagtgtttgctgccagggatgatgtttttgtgatttttgtatgtcatgttgggctagaaaacatatgtactttgcacttgcaatacatgttctgtcatttgtatacaattccatatactacatgcacatacattcttctcgtgaaattacttgtttggactttaaagttactgccgatgaacagcgttatccatgcagttagcaatatgcctgtagaacattcttgttcatagaaaacaatcttgggtttaggatcctacaaatacaaactttctgctgaactgaggatgtttatgttttgccagaatctgaggatgtttatgtggtctgtaggttcttctcatgacccttcaaaatgcaccaccaggccttgactatgaccgtgataaaagattctcaaaggtagtactagtcctttcagctaattcttggctagcgagtctatgttttatggcagtatctgcttgttttagcctcaatgtttacctcctaatgaaggcttttcagttgttatcagtctttcaaggaaatggttgcaatgtgcctggtcaaagatcaaacaaagaggccaacggctgaaaagttactaaagcactcatttttcaagaacgcaaaacctccagagctgactgttaagagtattttaactgatttgccccctctgtgggatcgtgtaaaagcgctccaggttttgctagtttactttccttttgtttttacttaatgatggaaacattatgccttaattaattcctgttatcctgtgcatttgcagctaaaagatgcagcacaattagctttgaagaaaatgccttcttctgaacaggaggcactttctatggtttgtgattttgatgtttcttttaagttccactttgttttgtgctgttctttcatttgagttcatgaaaatatgctagctagtttattttacccacaaacttctgaaataggctttatggtggtattatatatattcattttacaggcaaatcttctgctttgtttttaatttattatcactgaccataccagtcttaatgattttggtcagtagatgcagcttaaaaacaaatttgtagagggccagggtcaatttgcagtaacacaaatcccagcccttgcaaaatgaagttagaactgtggtattactttcatgcatggatatgttattggttgaacaaggactagcacagaatgatttaagatcccagcatattagactatgtttgatgcttttttaatttaaaaattaaaatgacgttaaatttttttatcacttgtatgctatggtgtcactatatttatgctaagaatatgatgtctaagacacatttcagccaacgcaatgatttgtacgagagatcactttagctagtccaccttacaggcagtagctaacttctatttttctttcacttgttagctccatggacgtaataccctaatgatttttgcacttctgttccacatacaaactaatattcatgataaacatagtttggtttattatagatatgtttgcacttttatttcacttacatgatagtttccttatcatctgaattatctaatagagtgagtaccaaagaggcgtaagcgcatggaacttcgatattgaggatttaaaggctcaagcatcattggtaaaacaaccagtttctttagttctatatcgaaatgctacattgctctctgattcattctgttacattgctaagatgtaaaatgactgtaatttagtcttataagtgagatttccaacctttttgcagattcatgatgatgatccacctgaaataaaggaagatgttgacaatgatagaataaatgaagctgataaggttagctgctctcgacttgattttgtttcagacgtaggcttgcgttctggtaagacagggtaataactgtagctagatgggatcatgagaaaactttatctagtgtgtcaaatagaagaagtatcacacatgtttaacttcaaagcacagaaaagagcttgccgtttatcaaatttgaaaagtcagggtcatttgtaatgccacaaatgcttctgtttaaatctggaagatgcttatgttctgatcctgttattgtttctcgctaattctgagtgctgcagaaacatttgcacaccatgttgtcatagcttattgatttcttgtaagtaagacaaaattatgtaccaaatatgattctgtttcaagtcatttatgattgctctgtttgcaggagccgttttctggcaatcattttggacaaccaaaaattttgagtggaaagcacttcaggttgaatcagtatgcaatatttttttgtggcaatgttttctttaaaagatatagatgttctatattgttccctagcttgtgattctcaacatcaccaatcgaagtatataggattcaagttttattttatgtggtgtagggtgaaattttggtcttataaattaaaacaagcgaaagattcagtgagccttgatgcatgcttttctgtgttactggtagtgtgttcataatgttccactcttttgttacatttcagtgaacaaacttgtgtcactgcagtaagtccaggggggaatatgcatgagacaagcagaggattggtttctgaacctggtgatgctgatagtgaaaggaaagttgatggatatagaaaacaagggtcagaaaacgaatcgttaccctctacatcaaaacatgattctgaaggacaaaacagtagtagtgaagttaaacaaaaagaaaggacttgctctggcccaattctgtgttctggtgtacataataaatcaataactgaaagcagtcgcatttttgataggtaagcctttcactgtttttttttcctattccaattttaatattacttggctgctacaatgttgtgcataccaataatttaatgcatgttttttttggactttcctgtttgaaatattacatatgaatatgcctcagaaatgaaacggtacagtttaagatgcttttttcccccttaaaatcggctaatatttgagctttcaagtgtcgttagttcttaaatgtttgacttaggtcatgcaataattgattttatagaaacaaattagtagttattcttcttgaatttgtatacctgagtttcctgtgagtactgttatgaagttaggaggtttcataatttttttgctgaaacaaattgctcaaaaaggcatttgcatacctgagtttcctgtgagtactgttatgaagttaggaggtttcataatttttttgctgaaacaaattgctcaaaaaggcatttgcattttaaaagcacttttggttattgttattccttgctgcagggaagcggcagttaagttggcatctgataaacaaaagagttgtacaaaaagaaccacaaatctcagtggtcctcttgcactccctactcgtgcttctgcaaatagtctgtctgctcctattcggtcttctggaggtaggaagcagccagtacttttttggatgcacatgataaacagcagtcacgtgttaatattattaacatagcaaatgaccacatttaaggtttacagacttttgtaacataaattagatcatttgaattcactgtggttatgaactgaaggaaagtatatgattatctgcctgttatttgcaggctatgtgggctccttgggagataagtctaagcgtagtgtggtggagataaaaggacgtttttcagtgacatctgagaatgtggatcttgcaaaggtaggtttcgttctgagcatacacttcaataggttgtgctccagactgagcaagatcactacaagggatactaattaaaatcttacttgacaggttcaggaagttccaacaagcggcatttcacgcaaattacaggaggtaagaatttgtgccctatccattttattgaaagctctgttgtactctacagtctacactacttcaaaacccacatccagccatcaagtgtcatgacttgagttgctcagggatcttcactgagaaaatcagccagcgttggtcattggccggtggatgctaagccaatggtaagcttttcaatgtcaataatgtaccaacttgtagaaactaattacttactgtgatttgatattcagacaaaaactgttttttttttcttggagagaatgctggttgggaatttcttagtgaaatgtttcctgcatctgaataaaaccttacaagttttgaatactagggtttgattaagggcattgttctgtacttctgtttctattgtcatgtcattgtctggatcttaatgttttctgaaaatactagtagtatattcttcatatcatttaagacacttatctccgatttttgagccactagatgatttagaaaggcaaccaaggttcaacccttttaacatatcattttagtattttcttttcagtgacacttgctacagaactatatatctctggctagtgcagctcatgcaattgcaatggccttcttgttcttatacagtttccactgcccttgtgccttctccatgctttaagattgttcacaatagataacatttttcccccatcgatgctgcagtcgaatagtcatcagcggaaggaactctgcaatggttcagtatctgcgtccgttctgattccccatctacggaatcttgtacagcagaccacatttcagcaagtatgggagtagcttaatctagtgacctctaagtatgggcagtataattaattgcagtattttgagtttttggcaaactaaacattctccatttccttcacttaggatctcatcacaaacctcctaagtagcttgcaacagaatgagaaagctgacggtaaatactttcctctgtatttgctgaaagtttttttcgcctttatttacgattaaatcgtttgttttctccagcaacacagtatagacttggtaatatggatggtgatacagaggtaagaagcttattagcttggtgtcaaaatttttcccacatatcattcttttctattagtctgtacatagtctgtacaaagaattctcaatactgctaccaaatgttcattaactcaaagtttgctcacaatcatttggcaggttgaaacgtctatttccgagggagaacggtcattacttgtcaaaatatttgaattgcaatctaggtaggtttgttacttgcaactgatatttaggggtggtaattgcatccttacatccgtggtgcttatgcccattcctctaccgtaaccatgctttcccagtcgtcacggactcaggtcaccaccttgtaccattgaagtacaagtgaatttcttagttttcctcatcaacttaagctttatattaagctggctggtgcatgcaactcataagtcatatgcaactcaacatgtgtgaatccaaagggagcctccacgttagagaggggtgcatggattgaagcatttgtgaagagttcattgttctccatcagtttaatcttttggatgaatttccaacctggtattcaatgttaccagctaccaaaacattgccttgtattcataactcaaccaaactggcaaacctcaaactattggatatagctgccatagtattatgtttatgctctgttttatgctcaaatcaagacttgaacatgacacgtttaaggcagtgggagtagtctagatagtgatgctcgctttagcgccgccggtgtaaatcgcggcgagctgtaaaatgtgcaggtccttagtctgtaggatgaccgaccagggcaagttgcctcaacaactctgttgttgttcgtaacatggctctccttccatcttaataaaaattgatcggcatttattccgctggcctggcgaaagaaaaaatggcgcgtgttattaaaacatctatttttcatgccaatggttgcctgatgatcaatgcagtaacatacctttctaccttgcagaatgatttcattaaccgatgaactgatcacaacaaaactgcaacatgtccaggtcagtaagtcatgtctgtttagttttcttcactgtattgacacctgaggtcacctacaataaggatcattctatttagaccatatggtactttactaaaaatgccaaattgtgggggagggggcaaaacctattttataaatatataggacaatagtgaacattaaacatggcacccatgaagttagtcaattttaatcctaacatggacaccatgtacatttgataatcattatatatgatggatctctatcatcactttcagctacaagaagagctaaaaatactgtactgtcacgaagaaataatcgacactagggaggtggacaatgcttgacatgttaaggttgagccagattctttttattagtacaagcagtattcaggcgactaaaagttttgcctgcactggctcatgcctggaggcttggctaatcggattccaacaaggtgtttgaggtgcgcttttaggaagggaggaaaactgagaggtgccatggattcgacttgggaatctgcatcgaactgttgaggagatgagagctctttgagatgcatagcaacaaaggctgctcgatgatggccagcttgggtttatgtatgtttgtgtatatttgttcgatctacttaattacttgggattatatttatttattcgggggactagtgtaaggtggttatgagagactgcggtatccatatagtatttcgggccgcacttatcattaagaattgagatggccatggatgccaatcttggccaatatagtatagaaccaatgagctgcgagactggattattgtatttatagaccaccagaatatattgtttatatgttgttaattagtacagtgtcagtattatagct</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os03g0114300, RefSeq:Os03g0114300