Os03g0213600
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Structured Information
| Gene Name |
Os03g0213600 |
|---|---|
| Description |
Conserved hypothetical protein |
| Version |
NM_001055899.1 GI:115451526 GeneID:4332047 |
| Length |
9068 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os03g0213600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:5973716..5982783 |
| Sequence Coding Region |
5973842..5973985,5975180..5975262,5976503..5977773,5978040..5978103,5978678..5978899 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008396:5973716..5982783 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008396:5973716..5982783 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgcacgcggcgcggccattgggtgggcgcgcgcgaaaccctagccccgggcccgctcggccgccgccgccgttcgcggcggcggatgctgccgccgccgctgacctccgcgacgcgccacggagggttgcgcggatgaaggatagagcttgtgcaacttgtggtgataaaattgattcaggaaatgtaatacgttgtcagtgcaagaaatctccagagcatgcaaagcatgaaatccatcatacgaatgatgcaatgcttgaggcaaagggatttgcaaagccaaactcttcaaataagtatgggatgcacaaatcttctggtggtacatattcaaaacctgatgcaagagtaaagataattcctgcagaagaaattacatatgtacgtcatggaaaactatgtggtaaaactgttggctcagatggattacagaaaaggcaacgcagacgaagtgtcaccccccctccgagttcacgtaaagtgtctcttgtgacacctacagtggttaatcagaggcctacaccaccagtctcaccagctgcctcgcgtatctctcctaaccggcctgggacagctaaaaatgttcactcagtcgttacctcatgtatctctccaaacttgaccgggaaagctgaaaatggtcactcacttgctacctcaggtatctctcctaactgtcctggggcagttaaaaagattcactcacttgctacctcacctatctctcctaactggcctggggcagttaaaaagattcactcacttgctacctcacctatctctcctatgtggcctgagacagctggaaatggtcactcacttgttgggggctatatcacaaattcctttacaacacaaatagcttatctttcacagcgtccatcaccattctgcagggctgttctttcacagccttctgggacacctcttggtactgatgccactgctcccaagaatcttagcagatcgggtaatagagaagcatatgtcaaaagttgcagttcacgcaccagaaccttctcatctgcgcatgcacattcaactgtagttcctcctggtacaaatgcagaaccttctgctgaaagtttttgtgcgcctggcaatgagaagtcatcccctatgagctgtaagttgggcacgttacaatgtcaaggcacaagaactgctgtggcgccttcagtgcaaaaaaagctaaccatggagcctgcattaccgagcccaaaatctgtgcttagtgaaaagtccaacgaggcatatcctgatactgctccaaggccttcttccagaccaaatttatttgatacaaaatgcaaggtgggctcaccgcaaagtgaaacaatcattcctccatcacaaagtccacagtctacatctcatgcacgatgtgttgaaccgcctgatgattttgaagcagttccatctactaagagccatataattacagaaaaacaaatgaaccaggaggcaccaatcaattgtaatgtatcttcaggtatcccagtaattttacatacaaagctgcacaagaagcattaccaaccagaagcctgctggaagggtaaatttgaagtgactggagagctaacacatatttgtgatggacttgaagcccatttccctttcgaaatttctgcccaagtatatgaggcttcaaaacaaatgcctgaaatattaaagctagaggctagacctctttctcatctgtggccgaaaacattcaagatgaaacctccagaaggacaagatattggactgtgcttcattagctctcttcaaagaccaaatgggagttctgaccatctcctgaaaaatatttcttcgcatattgggttacgaaccaagattggtgctactgagttgctgatattttcatccaagttacttacccaagaatatcaaagaaaatgtgataagttttacttttggggtgttttccgggcgctgcacagatcctataatcaaacaagtatgtcatttgatgcaacaggatgcaaagagattgagaggcacaaaaataaggaaactggcaagattttggagacacaagacaaaaaaacagagaaggaaaaatgtggggagattggtaataaattggattcggcagttagcagagaaagagataggatcaacgaatgcatgagaatgctgactcctgatccaaatgctgcggcaagctcttcagattttacttgtcaatctgctcctagagttcctgctggttctgaccttgttttggacacacctcccgggtttcctcatgatgaccctccaggcctcacaaaagcccattgtctcctccatacaggagaaaccactgagccttacatagactcatctccaagccttaatttgggcgtacctccagggctttctcttgatatccctcctggctttatgaaagctcattatctccctcatacaggagaaactactgagtctcacataaacccttctcacagtcacagcctttcttgggacacccctctaggattttctcttgatgttcctccgggatttactaaagcccatcgtctacccatagtatctactgctggatctgaaactgttgtttctgaaaagaaacccctcattaagttcactctgaatgttccaagggttgcacaaacagaagccattcctggatttattaaactgcttgcagtgaaacaagagcctgggttgcctgcaatctgtatggccacagagaaggcatcaactggaaaagaagatgaaattaaaagtaagcaggatgaggtagtaacagaacgggacgaaagctcagaggagcgtttgtttccaaagaccaggcttctttctgatattctgagctcttcggcggcttctaatgcgaacacaaatgcttcacccaagcctacaagcaagtttcatgatgcaccagacaaccaaatacaggacagaaagagagatcacccagaatcacccgagccttctcctgcagatacactcaaaaggctcagggtgaatgggcgcatagctctaaacagagtcatggatcgtcgaacattgagttcccaaccaatctcaagggaaggattagttgatatacaagtgtcaggtcctacagtactgacgagaagcaaatgctgtagttggcaacatttcaggtga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAHAARPLGGRARNPSPGPARPPPPFAAADAAAAADLRDAPRRV ARMKDRACATCGDKIDSGNVIRCQCKKSPEHAKHEIHHTNDAMLEAKGFAKPNSSNKY GMHKSSGGTYSKPDARVKIIPAEEITYVRHGKLCGKTVGSDGLQKRQRRRSVTPPPSS RKVSLVTPTVVNQRPTPPVSPAASRISPNRPGTAKNVHSVVTSCISPNLTGKAENGHS LATSGISPNCPGAVKKIHSLATSPISPNWPGAVKKIHSLATSPISPMWPETAGNGHSL VGGYITNSFTTQIAYLSQRPSPFCRAVLSQPSGTPLGTDATAPKNLSRSGNREAYVKS CSSRTRTFSSAHAHSTVVPPGTNAEPSAESFCAPGNEKSSPMSCKLGTLQCQGTRTAV APSVQKKLTMEPALPSPKSVLSEKSNEAYPDTAPRPSSRPNLFDTKCKVGSPQSETII PPSQSPQSTSHARCVEPPDDFEAVPSTKSHIITEKQMNQEAPINCNVSSGIPVILHTK LHKKHYQPEACWKGKFEVTGELTHICDGLEAHFPFEISAQVYEASKQMPEILKLEARP LSHLWPKTFKMKPPEGQDIGLCFISSLQRPNGSSDHLLKNISSHIGLRTKIGATELLI FSSKLLTQEYQRKCDKFYFWGVFRALHRSYNQTSMSFDATGCKEIERHKNKETGKILE TQDKKTEKEKCGEIGNKLDSAVSRERDRINECMRMLTPDPNAAASSSDFTCQSAPRVP AGSDLVLDTPPGFPHDDPPGLTKAHCLLHTGETTEPYIDSSPSLNLGVPPGLSLDIPP GFMKAHYLPHTGETTESHINPSHSHSLSWDTPLGFSLDVPPGFTKAHRLPIVSTAGSE TVVSEKKPLIKFTLNVPRVAQTEAIPGFIKLLAVKQEPGLPAICMATEKASTGKEDEI KSKQDEVVTERDESSEERLFPKTRLLSDILSSSAASNANTNASPKPTSKFHDAPDNQI QDRKRDHPESPEPSPADTLKRLRVNGRIALNRVMDRRTLSSQPISREGLVDIQVSGPT VLTRSKCCSWQHFR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>127..270#1465..1547#2788..4058#4325..4388#4963..5184#5753..5874#6232..6513#6613..7184#7972..8095#8592..8842#gaggaggcccttctcggcttctccttcctttttccctctctctcttcatatcaaagagacgcaccgaacaagaagcacaaaacccactttcatcaattctctctgcggcgatcgccgagggatccaatggcgcacgcggcgcggccattgggtgggcgcgcgcgaaaccctagccccgggcccgctcggccgccgccgccgttcgcggcggcggatgctgccgccgccgctgacctccgcgacgcgccacggagggttgcgcggatgaaggtgatcatcgggcggactctgcttttttagtttttttttttacccccaacatttctggcgatcgcggttgctttattaaggttttctacaggcgatgttttgcggggtggaatagttggttgcgtgtgcgttttgcgtatgtgctgctttgctctcgataagcgttagtagcaatcgcctagttcgcccccttttgggtattttggtccgattttgtcgcgtgagaaagaaaagaggggtttttggggtagggcgtgcattccgctttgcagagctttgggtctaattactgtttggttccatagattttgcggaacccttgtatgtgtgttttactttttgttgttatgaggctatctattctcttactttgcggggattgctctgttctaatcgttgcgcaatgtcacccagtttaatttgtaaagctggtagtagtagcagtagcacttgtgcttgttcagttgttctgcactagctagtatactacctagcacccggtgcttcacaatgtctgacctcgtttgatctaatatacgggtacttatgtgggccatttctttttcaaacatgccatgaaagtatgaaactaccagtgcgatagcgtttaccacattgagtacacacgacatctctatggttgattcttttttacatttgtgtggacatgctcttaggacgtgtttgttggtttcctgcatagcaccttagtttcatcttgtcggcctaatctttgtgacgggcatatatatgcatgcatatatataacagccttccaatcaactttcacacttggattaggatttctagagtcaagagtccaccctcattatgcctttcttgtaatcttgttacatggggaatctggtagtaggggtcttccaacatgttgagacaggcccaacaagccctacttcataagatcaaaggcaaggtgtgagtgtttggtgggagcgtttgtttaaaccagttcattcctgggtaatctatactctatagtgtgtcattgggcctttagcccatttttttcctttttcttattttcttaccgtttgttcaattgttctttaaattctggttctgcctaatgaaattaaaataaattatgcctttaccagattattgtttttatttccatacagagacacctaaatgtgtaactttgttttgttttgttttgttcaactactgcaggatagagcttgtgcaacttgtggtgataaaattgattcaggaaatgtaatacgttgtcagtgcaagaaatctccagagcatgcgtaggtccctttgtttgtcatttgtgcttatttagttatattaaacaaagataggcttgtttttacacctttgtcatgtgcattttacctaaagaattttttagaagcttgccatttatcattgtaatttgcatttatgtccacaaggataatgctgaattgttttcttcaaactgtaatgtggtctgttctctttttggtgccaaaaaacttttcaacaatttactgaaagtgtccaaactactcgtaataccaaggtagcttgtctgtttaacatgcataaatgtccatagattgagaaacttaacccatattcctaacccaccaatgcgtataataaataattaaatattggtaaaggggacatatctagtgcaaccaatagctagatgaaatcatgcagactttacatgttaaccaacatatgttggataaatgaatggatcaaattttcagggatttaagggtcatgtggtggataaaattcttaataagccactcaattcatagatggttaattattagaatatcactgcttccgcctggtccggggtagccattcattcatctttcatccaacgggtaattattggctatgtgaggttttatgtgattgcacctatttattaggctttcactagaccccttagtattattttttcttgcacatgcacaaatatggatcataatgacccaaaggaatcgggcaatagaaagaagctgtaaatttgaatttaattgagttgcatataagtttatataatccaattaataacttgatacatgtaaattttctacacacaaaaaaaaaatatttcacatctgatatcaagtcagtgttgcaaaattagaatgagatgatgtcattctgagcataatactttcgataagataaggtgtattggctgaagctttttttttttttaaaaaaaaatctatatctgttgaccattgagtattcatgtgtatatactagactactggcttccttattttgtatggcatcctatttctcataaaagtggatatttgttattacagcattatgtgaggcatgcatacatttttttggcttgtgcaagctcttgacagactataaaatcctctgttacctggattgtattcaaatgtcgtgcacatttttatacatgacagattctgcaatatttatgtgttaattctagtcctattggttttataattaatagtagtatttttttgctgttttgggccatctcagaaagcatgaaatccatcatacgaatgatgcaatgcttgaggcaaagggatttgcaaagccaaactcttcaaataagtatgggatgcacaaatcttctggtggtacatattcaaaacctgatgcaagagtaaagataattcctgcagaagaaattacatatgtacgtcatggaaaactatgtggtaaaactgttggctcagatggattacagaaaaggcaacgcagacgaagtgtcaccccccctccgagttcacgtaaagtgtctcttgtgacacctacagtggttaatcagaggcctacaccaccagtctcaccagctgcctcgcgtatctctcctaaccggcctgggacagctaaaaatgttcactcagtcgttacctcatgtatctctccaaacttgaccgggaaagctgaaaatggtcactcacttgctacctcaggtatctctcctaactgtcctggggcagttaaaaagattcactcacttgctacctcacctatctctcctaactggcctggggcagttaaaaagattcactcacttgctacctcacctatctctcctatgtggcctgagacagctggaaatggtcactcacttgttgggggctatatcacaaattcctttacaacacaaatagcttatctttcacagcgtccatcaccattctgcagggctgttctttcacagccttctgggacacctcttggtactgatgccactgctcccaagaatcttagcagatcgggtaatagagaagcatatgtcaaaagttgcagttcacgcaccagaaccttctcatctgcgcatgcacattcaactgtagttcctcctggtacaaatgcagaaccttctgctgaaagtttttgtgcgcctggcaatgagaagtcatcccctatgagctgtaagttgggcacgttacaatgtcaaggcacaagaactgctgtggcgccttcagtgcaaaaaaagctaaccatggagcctgcattaccgagcccaaaatctgtgcttagtgaaaagtccaacgaggcatatcctgatactgctccaaggccttcttccagaccaaatttatttgatacaaaatgcaaggtgggctcaccgcaaagtgaaacaatcattcctccatcacaaagtccacagtctacatctcatgcacgatgtgttgaaccgcctgatgattttgaagcagttccatctactaagagccatataattacagaaaaacaaatgaaccaggaggcaccaatcaattgtaatgtatcttcaggtacagtgtggatcctgacagtaatctcttctattctttcatctacatatttaaaatagctgacattaatagtactgtagcatccagacatccctgcatttagcccttcaattattatgcttattgaaaattgaaaaggtgaaaaaagtgaaagcagcggtactaagttttagccatgggcatgccattttaccttgtggagatttattgatgaaaaacttattttgagaacactgctgtagtaacattggtattggtgcaaacaggtatcccagtaattttacatacaaagctgcacaagaagcattaccaaccagaagcctgctggaagtaagtaatttacttcatgcattagagtatttttgaattatcaatagaatttatttttatcacactgtattttaccagttacatgccctatatttatctgaccggataagctgtagctactgtgttgtataaaaaattgttttgggatcaattacaaactcaaagttatcaaaagttgtcctcaaatttgatgtactaatggatgaaattggcattcttgtctaaaaaagagcattgtttttttttcacttgcattataagccttgaatcttgtctggtatggatgaagctaatcagcaaatatagttgattagcagagtatctgcagaattatcttgagcttttttgtgccagtgataatgtggtaagctatatagtatctcagaacaattttcacatgtatgataagtgatgctgcttctgtttttggaattattatgcaatttggaagtgttgaacttttatccaatgctgaagttaagttataatg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|
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