Os03g0227300

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os03g0227300

Description

5'-3' exonuclease domain containing protein

Version

NM_001055979.1 GI:115451686 GeneID:4332131

Length

8037 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os03g0227300, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:6725633..6733669

Sequence Coding Region

6725946..6726044,6726372..6726603,6727313..6727392,6728171..6728209,6728747..6728765
,6729638..6729694,6730274..6730401,6730486..6730554,6730958..6731043
,6731127..6731236,6731902..6731952,6732444..6732502,6732795..6732839
,6732974..6733048,6733156..6733272

Expression

GEO Profiles:Os03g0227300

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008396:6725633..6733669 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

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Protein Sequence

<aaseq>MACCCLRASTAPRFLLFRAAARRAPLPVAVSRKGFSEQSVLPIT DMIENFQGPSMENIPRIPLYDDSLPSSLLTTSPNPSDSVAHADPSKSRIMLVDGTSVM YRSYYKILAQLQHGQLEHADGNGDWVLTIFKALSLVLDMLEFIPSHAAVVFDHDGVPY GHYTAMPSKECHMAKGMTFRHMLYPSYKSNRIPTPDTIVQGMQYLKASIKAMSIKVIE VPGVEADDVIGTLAVSSVSAGYKVRIVSPDKDFFQILSPSLRLLRIAPRGSGMVSFGV EDFVKRYGALKPSQFVDVVALSGDKADNIPGVEGIGDINAVKLITKFGSLENLLKSVD EVEEERIKQALISQSEQAMLCKSLATLRSDLPSYMVPFKTSDLVFQKPKDDGAKFIKL LRALEAYAEGSSADLIIRRAAYLWNKLNS</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>314..412#740..971#1681..1760#2539..2577#3115..3133#4006..4062#4642..4769#4854..4922#5326..5411#5495..5604#6270..6320#6812..6870#7163..7207#7342..7416#7524..7640#gggcggagaaaatcctgagcatcacaagtcgcgacctcacagggaggggcggcggcgctcgccgtgaggcgcgggagggggcgcgctcgcggtggtccacggtgaagtgcggcttgctcgccgtggggagtgcggtgaagagtggctcctcctcatctagcagtctctgctccagtcgtctggttccccccgccagccgccactcgcgcatttcgtcgaacgccttcgcctccatcccctcccaccaatcaatccacgtgctccagaaccctaaccctcgtgggggcgacgggggagaggttggcatctggcgatggcgtgttgctgcctccgtgccagcacggcgccccgcttcctcctcttccgcgccgccgcgcggcgagccccattgccggtcgcggtttccaggaaggtacatgctatagcgcccccttctcttccttctgatcccttttccttggggagtgcacgaatcgaaaacaatcagcatattagctagacgcaatgaggtttggggcagcgcacagccattccaccaatgcttcaatgacattgccaatgtttgttgttcatcgggccactgttgtaatgttatgctgcaaattagactatccaaacatttttttctcttattatagatgatagttattcaagggttatatacggtcacactgtcattcaatccaatgatttgaatgtaagataattaatgttactgaaattttctatgtaatatcagggtttctcggaacagtccgtattgccaatcacagacatgatcgagaattttcaaggaccatccatggagaacattccacgaattccattatatgatgatagcttgccctcaagcttgttgacaacttctccgaatcctagtgatagtgtagctcatgctgacccttcaaagagtagaataatgcttgttgatggaacctcagtaatgtacagatcctactacaagatattgggtaaatgtttcctgattctctttgttacatctgtattggtatattatgtttggcttctcctccttatcaaggtaaatgcatgtttagaaaataagtgttttgatatttatatttaaactaaattccactggcatgattaatacatgggaactgaacatttttattcttcctataatgtgaaggcacaacagaatgttgcaatatgtcctagatacacacagacacatgcacaaagggcaaaagaagttgtacatgtgcccacacttgatgttttatttcatgacatgaaaacattttctcaatttattctcataatttgggcatgatcttttgataaaaaaaatatgggcatggttttttgtggtttaacttctctgctgctttcctaccctgagaacacccatccattatctcagtatatatctgtcttgttgaactgtgctatgctgtcatagcatcttataagcagcagaaagtttcattattggtttccggtagtatgttcctttctaattcctttaggataatcatgtcaaaggcactcaaacaaaatcatgttttgcaaaactaccatagtatttttctgcacaaaactggttcagctgctcacattaaagagcactaaaatccagggttaatttggagttaggtgcccaattgcattaattgttggattcaacagctttattttttttcctcatgtatgcagcacagctgcagcatggtcaattggagcatgctgatggaaatggagactgggttttaactatatttaaagctctgtcactggtaagtatatttttttatagatttttttgtggcatacttgttaataagcttaaatttattcatagttcgttttccgggtccctttaatgatagtccttttttttggttgcttcacctaatgttcgtctgaaacgcatcttctaggcttctagcacaatggtcttcatctgtgtttctagttaaggttgactatggtacatgtgtttgtattttgttctcattacaaatctatcatcgtacaagtaggaagtgcaacattgttgaagtggagaaatattaagcaacgtcttttgtagataagcaaggttttcaaactgctatgttgcaaaacgtggattgggtagtgaaattttgacacacatgctgtctttaagtggcattgtttaatgaaccagcatgagataagacttacttgcgatgaataagtgtgatgacagaagatacacttttttctttagtatgcttgagatgaactgttggtatttggagttgttggaaactgatgatttactaaaaacatcgcctgtttgaaaaaaaaaggagtatatgttagcctcataagtttatccccggttgacatctgtcctttgtggatcgttatagatttttatcatgtggcggtgttacaattcaacatgttaaccttctgcctctacacagaatcttcttttctcgttgtaatattttatgacatgcgttcctttgttgtgattccacttgattttgtttataacatgtgtgatccctattataactacattgctttttatatctccaggttctagatatgctggagttcattccatctcatgcagcggtacgctcatcttttttgtagcctaaaattatatggtcttgttcatatctgtcatttttctcatggaacttttgttaaaataaagtgttttagaacattgttggatgaatcatagagaatttttaaaacccttatatataactaagatcacagacaccccttgcaattccaatcatatttcttgctaacaaaatgtgaaagtttcatgtctatccttaggaactggggagcattaacacatggtgctaaaccatggtaatgagaagtgcatataagcaacttaaattgtatgtttagcccataattaaggattcaagggccaatgcgccaaaggagtatttattttaccattatactggaacataatacttaatatttccagaatatttagaggttactggcttactgctaggaaaccaataaccaggtgcagtgtaagcatcatttgtagaaaccacagtttgtttctgtatgtggttttatgttttatgcctcttagcattccttttccttatggtactttgaacacatatgcaggtggtgtttgaccatgatggtgagctttttcaattggataattctcatattcactgagtaaactttcactttattattttagtattttgctgtgattgtttgttgattgctctctgcagcaaacacttggtaaatttttctctgtaagctttgagcatacgtagcatgagatcttgtcctgtctgcaacttgttaaatggcaacggatggtggcagtggtcagcagtgcctgtaatgggaggtctagcctcctggaaacagagctcaaggaatcttgagtctctgtcacctcttcatataatgtcaaatctgtccttaaatcctggcttaaaacatacatgctcttgaagaatttcttgtgcttcttgtgtatgtaactcatatcaagacagagtagtagctgagaaataatatgaatcaggaaagaaacaaaaattctccatctgtctttttaagaaatgcaatatattaagacaaaaccttcctctttcctgctcatatatcccattctctgatttgttcctttaattgctgattggaacaactggctttttcctcactttcttttcttactaatccttgttgaagtgtactatgatttccctttttttttctgcacaaaggatagtatttgtagattttgatatgacaacaaataaatgttattggcctcccatgtgattttatctaatatagttcaattcaagatgcatggcttaagtttaaatccatataaatgtttctgtggagggattctacttgtttggatctacatcccctgatttattagatcataagaaaaatcccggcatctttactacgaaatttgaaatgatacatttccttaaaattcttagagtaacaaataagtggccaaacttttcttttcaggagtcccttatggtcattatactgccatgccatccaaagaatgtcacatggcaaaaggtaagagtgatatactgaagtaacttgataggatcatgggattcatgggagaatgtaaccgttggattcatctaagattttaggcataaccacatctttatgtgatggatgtcctggatttatgtcgcactttatgttagtccattacttagccaagtatcaaagcagtaggagtgatttaacatgaccttccaaatgcctgcctttcatttcttttatgacttttagggagatactgcttatttctgatcctatttcaaatcatccttttcttttcccctagtagaataatacgatgatatttcattttatatttgggaatgatagtttaatactatatatggtttttacacttgtgtaccctggctcatctgtatttgctttggggcttctggagactggacttgtttctagcctgctgggctggaacaatccatcttacttatttcccattttactttccttttctattactcttatatagttgtacactgaagaacaattaaaatttcaattggaagtaatgtcttgcaatgttttcaatcctataaaagcatgaaactgtcttttttttttcaggaatgacttttcgtcacatgttatacccttcctacaagagcaaccgcatcccgacaccagacaccattgtccagggcatgcaatacttgaaggcatctattaaagcgatgtcaatcaaagtgattgaggtaaaagatatattagcaagtgtatgattggcattatattctttattatatattttcatttgagttcttaaatgatggttgtaggttcctggtgtcgaagctgatgatgttattggcacactagctgtcagcagtgtatctgcaggctacaaggtaataaaactttctactgtgattatttgtgaacattttattcatgaattgttcttcaatattctcaatggatatttcataagtatctctcttcatgaatcgttctccagtgccgtctttaatctttcacatcatttacaaaagttagtacttataaactgctgaggtgttatagattcactgaaactgtttttatttgttttgaaatgattgatattttgtaaaagttgattcataactaacttttccaattgcacatgacaaaactgaatgtctggaattaagtcataggtatgttgaattttgtaacaaaaatgcaagaaatacagtgtaactaaaatgtgatgccgttgcagtgtgttggatatgatatcttattgtgtactctggtccttatttgaaggtacggattgtctcccctgataaagacttcttccaaattctttcaccttctttacgtttgctgaggattgctcctcgtggttctgggtaagtgtacttggttttttttgcctttcttgcatgcttactggaatactctaatagctaatcgtttttatttggacatggaggatggtttcatttggagttgaagactttgtcaagagatatggagcactgaaaccatcacagtttgttgacgttgttgcgctttctggagataaagccgacaatataccaggtaccctttatttctattgtgccttatgctacacatctgttctgacatccattcttctttcagactaatttttgttggtagctatgaaaactatgagagaaaggatactaaactttggtctgcattgggttgtatttatttatttatttctcgcaataaattcttgtgcttggctacctttgtttttcttgtccaatatctttcatttcagctctaaaacagaaaaatggaccacagttgcacacgattttgatgtgtcaaagtatttttaagttgataatgtgatagaaaataaagttcatacactgtatataatgtgcttgccgaagaaaatggtggttgcatgatctatagacatagtgatttcattttggttcttctacctatttatttattatttattatgtgctgtaatcttactgtttgataaaaaccttaaatcaactcatcaaatatgttatggaccctatgaagtctactgtcccccatctttttaaggggaaaaacatgattctcatgtctgaaaattatttcatgttatgatatatgtttgtacgttaccaacacttcaccagtgcaatgcagattcgtaagctaattttctatatatggtagtctatcgaccaagttgtttatgatgtgaccggaaccatgttctttttcaggagttgaagggattggagatattaatgcggtaaaactgataactaagtttggtatgttcttctctttaaagtttttttttagattgtcgccttggtgcgaaccactcgagctaaacacattctgttctaataaaggactgcttgtatacactcaaactactcaagattgaaaagttcatgatttccctgtgatcaatctacctgtttagtcttggttattaagttctactcccctaaaaaatataagtagtttttagctttctcaagtctttcctaaatgtaagtcatcctaaacttctagccaccttttactcctccctttcttccgtgaataattcacattattcaatgtggtataagtaaagggtaacaaggtcgtttgatgtactttattatccctgtacataaatctagaataacttatatttggaatccaagtattctatgttttgagtttggaaatagtgggcatattagctgtcctgataatcctgcaattctccaaaagttataactttgtcattttattggtactcacataggttccttggagaatctgttgaaatctgtggatgaagttgaggaagaacgaattaaacaggtatcattcttaatattatacattagatgagatatcccctcttcgcatttatcagcatgcacttatgcacagaaatgccaagatacagaaactgggttgcatgacgcttttgtttcactagaacagcgcaatacaatgaccccattaaatggcattgatattttaccctttagtataatatgattatcttcttgaatgttgattgcacatactctcttgtcaaatatatcattttttatcttatgacttctcaaatggttgagcaaatcatatttggtgtggtcctttacaggctttgatatctcaatctgaacaagcaatgctttgcaaaagcctggtaatcttttttttatgttgctcaaaagtcctttctattgtcttgatgaatcatgaaatgcaatcatcttccatattatattgtgagattctatctcaaccagactcttctcattgaatttacacttcttgtaggccacattacgttctgaccttccatcctatatggttccttttaagacatcggatcttgtgtttcagaagccaaaggtagcaattgtagcatcatatatttatgaaaacaactaaaccattactaaagtttgtccctctgattcctgcttacactgttattcttgcccgcaatgcttcttcaggatgatggagccaaattcataaaactcttgcgagctttggaagcatatgcagaaggctcgtcagcagacctaatcataagaagagccgcctatctttggaacaaacttaactcatgactatgctgatgtttccagcagtgacaacatacgaacttttcaagcacaaaagttccacctgagaagataggtgccttggtgctatgtttctgtcaaatttggtgcgagcggctcgctgtgctttctggcacaaaaggtggacggtgcatgtttagacaggctgtgcataccatgaaactgataattagttagttttgtagataaaagcacgtcatggctcatgcaatctacagaacatgatattttttacactctaatgaatggtggctgctggctggaaggtggaagaatggcatgtaggtacctgaaagcttaatcattcgattatgtgcaacttcgtagaaatattatctagtgacatgtcactattcatatgcacaatgataccaagttggtc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os03g0227300, RefSeq:Os03g0227300