Os03g0265700

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Structured Information

Gene Name	Os03g0265700
Description	Src homology-3 domain containing protein
Version	NM_001056186.1 GI:115452100 GeneID:4332351
Length	9870 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os03g0265700, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 3
Location	Chromosome 3:8826846..8836715
Sequence Coding Region	8826847..8826879,8827220..8827448,8827869..8827975,8828115..8828177,8828438..8828538 ,8829551..8829645,8829885..8829905,8830542..8830637,8830743..8830863 ,8830970..8831125,8831234..8831424,8831762..8832033,8832408..8832509 ,8832687..8832863,8832952..8833140,8833222..8833463,8833538..8833684 ,8834081..8834306,8834448..8834577,8834931..8835076,8835384..8835563 ,8835890..8835949,8836039..8836110
Expression	GEO Profiles:Os03g0265700
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008396:8826846..8836715 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008396:8826846..8836715 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>gtggatccttcggtggctccatctcttctcatgcttcatcagcaatgcgaggatagaaatgttctgcgctatgtatactattatctggctcgcatattgtcagataatggtgcccaaggtttaagcgctgctggtggcatacctaccccaaattgggatgctcttgcagacattgatgctgttggtggagtgacacgagcagatgttgtaccaagaatagttgatcagctctcagctgaatcaaccagcgatgatgttgagtttcatgctaggagacttgctgctctgaaggcccttacctcctcctccacaagcaattctgagatgttggaaaaactctacgaaattgtgtttggcattttggagaaggtggctgatactaaacagaaacgaaagaaaggtatatttactaagcaaggtggtgataaggagtctattatacggagtaatttgcagtatgcttctctaagtgccctgagaaggcttccacttgatcctggtaatccggcatttctgcaccgagctgtccaaggggttgaattttctgacccagttgcagtaagacatgcgttgtcaatagcctctgaaattgccgtgagagatccgtactctgtcgcaatggcactgggcaagaacgcacagcctggtggagctcttcaggatatccttcatttgcatgatgttcttgccagagtttaccttgcaaagctgtgccattcaatttctagggcacgtgtattggatgagagacctgacataaagtcccagtacagttctctcctttaccaacttcttctggacccaagtgacagggtctgttttgaggccatactctgtgtgttgggaaaagttgacaacacagaaagcacggaggagagagctggtggatggattaggttaacaagagaaattcttaaattgcctgaggccccttctgtagcatcaaagggtattctgtcaaaatctgaaaaatcttctaaagcaaggcgtcctcagcccctcattaaacttgtaatgagaagactggagagctcttttcgtagcttctctcgtcctgttcttcatgctgctgcaagagtagtccaggaaatggggaagagtagggccgctgcttattctttaggcgcttatgacgaggctgccaatcttcaatcttattctgataatgtcgagtctcttgattctgatcttaatgagaactcacaacctgaagctactcgaaaggctaacccactatcaaatggacatggtggaatggacacaatagcaggcttattagcatcactgatggaagtagtgcggacaactgtagcatgcgagtgtgtatatgttcgagcaatggtcatcaaagctttgatatggatgcaaaatcctcatgagtcttttgaagaattaaaatctattattgcatgtgagctggctgatccggcctggccttcttctctcctgaatgatgtcctattaactctacatgctaggttcaaggcaactcctgatatggccgtgactctgcttgagattgctagaatttttgctaccaaagttcctggcaagatcgatgctgatgtactacaactcctgtggaagacatgccttgttggagcaggaccagatggaaaacatacagctttggaagctgtgacaatagtccttgatctaccaccacctcagcctggttcaatgtctggatttgcatctgtcgatatggtatctgcctccgatccaaaatcagctatggcactgcaaagattagttcaagctgcggtttggtttctaggtgaaaatgcaaattatgctgcttctgaatatgcctgggagtctgcaacacctcctggtactgcactaatgatgcttgatgctgataaaatggttgctgcagctagctctcgcaatcctacgcttgctagtgctttgacacgtctgcaaaggtgtgcattcagcggtagctgggagatccgtattgctgctgtccaagccctaaccaccattgcaataaggtctggtgaaccttacagactgcagatatatgagtttcttcatgctttagctctagggggtgtacaatcaaacttttcagaattgcagctaagtaatggggaaaaccaaggtgctagtggtactggtcttggatcattgataagcccaatgctcaaggtcctggatgaaatgtatagagctcaagatgatctcgctagggatatccgtcagcatgataatagtaagcaagaatggaatgatgatgaacttaagaaactttatgagacccacgagaggcttcttgatttcgtctctttgttctgttttgttccaagggccaagtacttgcctttaggtcctaccagtgcgaaactcattgacatctaccgcaaccggcataacattagtacttcttctggtctaagtgatcctgctgttgctactggcatatctgatctcatgtatgagcccaaagatgtgcccaaagaggccactcttatacagactggaattgaccctgatctggctatggcctgggcagcaggtttggaagatgatgtttgggaaaacaacgcaccagctgtggataaagtaaaggatttccttgctggcgctggaactgatgctcctgatgtggatgatgaggaatacatgaattctaggccatcagtcggttatgatgatatgtgggccaagacaattcttgaaacatatgaagcagaggatgatgatggaagatcatctgggggatcctctcctgagtcaactggttctgtagaaacatccatatcgtcccattttagtggcatgaactatccgtcgttgttcagttcaaaaccatcaggatatggggcttcacaacaaacgatacgtgaagaaccaccatcatattcaacatcagttctacagaaacgtgagtcattcgaaaacccccttgctgggcgtggtggtcggagttttggatcccatgaggacgaagacaggagttcagggaaccctcaatctgggaaagcactgtatgacttcacagcaggtggcgatgatgagttgagtttaactgctggagaagatgtggaaatcgaatatgaggtcgatggttggtactatgtaaagaagaagagacccggaagggatggaaagacagcaggtctggtccctgttctgtatgtgaattcgtga</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>VDPSVAPSLLMLHQQCEDRNVLRYVYYYLARILSDNGAQGLSAA GGIPTPNWDALADIDAVGGVTRADVVPRIVDQLSAESTSDDVEFHARRLAALKALTSS STSNSEMLEKLYEIVFGILEKVADTKQKRKKGIFTKQGGDKESIIRSNLQYASLSALR RLPLDPGNPAFLHRAVQGVEFSDPVAVRHALSIASEIAVRDPYSVAMALGKNAQPGGA LQDILHLHDVLARVYLAKLCHSISRARVLDERPDIKSQYSSLLYQLLLDPSDRVCFEA ILCVLGKVDNTESTEERAGGWIRLTREILKLPEAPSVASKGILSKSEKSSKARRPQPL IKLVMRRLESSFRSFSRPVLHAAARVVQEMGKSRAAAYSLGAYDEAANLQSYSDNVES LDSDLNENSQPEATRKANPLSNGHGGMDTIAGLLASLMEVVRTTVACECVYVRAMVIK ALIWMQNPHESFEELKSIIACELADPAWPSSLLNDVLLTLHARFKATPDMAVTLLEIA RIFATKVPGKIDADVLQLLWKTCLVGAGPDGKHTALEAVTIVLDLPPPQPGSMSGFAS VDMVSASDPKSAMALQRLVQAAVWFLGENANYAASEYAWESATPPGTALMMLDADKMV AAASSRNPTLASALTRLQRCAFSGSWEIRIAAVQALTTIAIRSGEPYRLQIYEFLHAL ALGGVQSNFSELQLSNGENQGASGTGLGSLISPMLKVLDEMYRAQDDLARDIRQHDNS KQEWNDDELKKLYETHERLLDFVSLFCFVPRAKYLPLGPTSAKLIDIYRNRHNISTSS GLSDPAVATGISDLMYEPKDVPKEATLIQTGIDPDLAMAWAAGLEDDVWENNAPAVDK VKDFLAGAGTDAPDVDDEEYMNSRPSVGYDDMWAKTILETYEAEDDDGRSSGGSSPES TGSVETSISSHFSGMNYPSLFSSKPSGYGASQQTIREEPPSYSTSVLQKRESFENPLA GRGGRSFGSHEDEDRSSGNPQSGKALYDFTAGGDDELSLTAGEDVEIEYEVDGWYYVK KKRPGRDGKTAGLVPVLYVNS</aaseq>
Gene Sequence	<dnaseqindica>2..34#375..603#1024..1130#1270..1332#1593..1693#2706..2800#3040..3060#3697..3792#3898..4018#4125..4280#4389..4579#4917..5188#5563..5664#5842..6018#6107..6295#6377..6618#6693..6839#7236..7461#7603..7732#8086..8231#8539..8718#9045..9104#9194..9265#tgtggatccttcggtggctccatctcttctcatggtaagtatgccgtcctctactgttttagctctttttatggcttcatctttcacgtagacagcgtaattacttggtaaaagcagtaactagggtaattctcagaaaattcgactatgttagcaccacaatgcattgtcactatggtttgagtctctgaggagatcaatgacaaccttttcatgtttaaaacagaggaaaaaaagtacgagtacttaaatatgtgttgcaacttggaactgaaactgcacacatcgcataattcactgttagattaacctaacgagatcttgtttacttcagttaacttttctcttaatcgaatctggttctgtatttacagcttcatcagcaatgcgaggatagaaatgttctgcgctatgtatactattatctggctcgcatattgtcagataatggtgcccaaggtttaagcgctgctggtggcatacctaccccaaattgggatgctcttgcagacattgatgctgttggtggagtgacacgagcagatgttgtaccaagaatagttgatcagctctcagctgaatcaaccagcgatgatgttgagtgtatgcttttatactgtgctctcaatatacgttgaagttgtattatgcaaaacttgtattccaaaccaacctcttgtcactgttttacattttttcctcattggtactgctccccttttgcactgatcacacctcatgattagttctaccatattctaagcatgctatctcattttggtgaaataagtattatgttattttcttctgttttgcatcttagtgagaattatatttctagtaaacatctaattctgcataaatgataccatatgaccaaataagaatgatcacaatattattatgcatggctgagctaaaacaagatgctctttaatttcttgaaccaagcatgcttaattcttattaagttgcattgggtggttcttcatagtgctaaactatggattctggtctttgaagttcatgctaggagacttgctgctctgaaggcccttacctcctcctccacaagcaattctgagatgttggaaaaactctacgaaattgtgtttggcattttggagaaggttgataattgatatgcttttcatattcagattagttcctcaaagttttattgccctaagttcctttttggtatcccttgtttttggctataaaattgacgcttttcttctgtccatgatgtattctgaatcctttcaggtggctgatactaaacagaaacgaaagaaaggtatatttactaagcaaggtggtgataaggaggtactaaacagaacgaaagtactatttattgtatatgcacttaacccttttcttagaggtttcttatctcataccttgctgataatgggagttaagaatacacttattggaacattgtagttaacctggtagttttttcttgactagataacaaagtaggtgacaccacttcctgtttattttgagctggacttaaaattcctcactagtatcagtacaagctgtctgatgatgcctttctaatttgcatttctttgcagtctattatacggagtaatttgcagtatgcttctctaagtgccctgagaaggcttccacttgatcctggtaatccggcatttctgcaccgagctgtccaagggtaagtgtgaccttttttcctctggaaacttaagtttaggtttattttccatgtctgtttagtttaccagttatctactacctccatttcatattatatgatgttttggatttgtcctaagtcaaatttcttagatttcgaccaactttatagaaaaaaaaatcaacatctggaacaccaaattagttcatcatatccaccattaaatatattttaaagtacatttgctttgtgttgaaaatgttgctatgtttttctatagacttggtcaaacttaaagaagtttgacttaaggcaaacccaaaacgacttataatgtggaacaggtcgaataggttattgcttcttttgaggataaatgggggcatgagtattgttttgtggtatcttttatttgattatacaataatagtttttcttattgggagcctagtctaaactaaaagattagatcattgtgatgacattgctaatagtacggcgaaggaggattcttcagggtgtgcttaatggagaatgaatattcgacatctgttggtttgttaatataacctatcttgagagatctagaaaggatgctattctcgtgtctaccttaaactgcaataccgcattagtgttttttagacggatataagattgtgagagccgatgctctctttaggccttaatatggatggatatccagtgttcaagcaggtaagtgtaaagacggagttatcaaatggtaaacttcatcgaaaagaatttctccctacaaagattacaaacaactccttaagctacatatttgtattgaagtcttctttaagcaaattgatcatttcattgtgttgtctgaacataattatcaaatggacacctaagtttttgtctatctatttttatgaccacttgattctgcttctgcaacaaaattacagaggggtatagcctaatcaaaaagtatcatcaaggaacctgctgttgcataattatcattttattctcatcagacctggtacaattgcagggttgaattttctgacccagttgcagtaagacatgcgttgtcaatagcctctgaaattgccgtgagagatccgtactctgtcgcaatggcactgggtcagtttactcactgattgttgttcatcttatttattgttcttgcaagcagacaaaacatgggccattaactcgtggtgtagaacatacttgatcttttatgtgcaaggaattgtatagaatttcgactataaattttttaaaaactgtcagctgtgatatatttagtcaatatgcagtaaatttggctcatgccatttcgtagattctcattctcatgtttgttttttgttttgcaggcaagaacgcacagcctggtggtaatgttttttcccctttcttctgtgtttcatttgaacttaacttgattatgcatctgatttgtgttttagagttctagttgaaccgaccgagtttgtagaattaggatttctaatgatatgggctgtattctgcgaagaatcacgtgttaaatcgcattcatatattgttgtttgatttatatttacttgttgatgcactggcatgaaatgtaaaatataagcaataatctggggaaaaggcagtacctttctgtcagttgctaatgtaatacgtgctcaatgacaacaagaaatgccgtacatgtattctttgatcaccatatttagttcaatggtatttgagacctgggtgacttaatagcgcaaccttttgtttattgagtattttagtgtatgatatatggattttgagaggcatgaatcaactaatggtacggtaattgcatataaatagcttcggacaccatctgattgttgtgactgatcttgctgttgattgttttgaattccacaaaaaaggaatttacctgcttgtatatctgattgcttacaaggtgtttcttttttctctttgagtttgttctactttgatgtactcatttcctattattacgctgtgtcaaatttaaccaggagctcttcaggatatccttcatttgcatgatgttcttgccagagtttaccttgcaaagctgtgccattcaatttctagggcacgtgtattggatggtgagtgtaatttgtttttgtgcctgtcttaaatcaagatgaacatgtcatgattccagagtgaatgcatttaatcgtggttctggtcaaatttgatttacgcagagagacctgacataaagtcccagtacagttctctcctttaccaacttcttctggacccaagtgacagggtctgttttgaggccatactctgtgtgttgggaaaagttgacaacacagaaaggtactgatgaggtttcaccaatttaaatttctatataactttgtttcttcacttcagttcgacttgtacgtctgtgtttttccatataaattactatatcttgcagcacggaggagagagctggtggatggattaggttaacaagagaaattcttaaattgcctgaggccccttctgtagcatcaaagggtattctgtcaaaatctgaaaaatcttctaaagcaaggcgtcctcagcccctcattaaacttgtaatgagaaggtttgtatcttcattcaaatgttcaaatagtcggtctctctattttgatttccctgtatgttttctcttgttcatggatacctattgttcatttttctcttctgtcagactggagagctcttttcgtagcttctctcgtcctgttcttcatgctgctgcaagagtagtccaggaaatggggaagagtagggccgctgcttattctttaggcgcttatgacgaggctgccaatcttcaatcttattctgataatgtcgagtctcttgattctgatcttaatgagaactcacaacctgaaggtaccatgatattattgtagttttaattattcaattataaatcagcgtgaatcatatgcagcgtaaattttaattttatttaaagtaatggaagatggttccttcaaagcattccttattgggttggctggaaaactaggaaattagcagcc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External Link(s)	NCBI Gene:Os03g0265700, RefSeq:Os03g0265700