Os03g0347300
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Structured Information
| Gene Name |
Os03g0347300 |
|---|---|
| Description |
Zinc finger, CW-type domain containing protein |
| Version |
NM_001056633.1 GI:115452994 GeneID:4332823 |
| Length |
9721 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os03g0347300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:13040939..13050659 |
| Sequence Coding Region |
13042562..13042759,13043952..13044112,13046107..13046264,13047769..13047929,13048024..13049462 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008396:13040939..13050659 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgccgtcaaatggcgggattatacctggacctgcaaatgcagcttctcttcctgcacctgttttgatagaggataattgggtatgctgtgacatgtgtcataaatggcgtctcctcccctacgggacaaacacttccatgcttccaaaaaagtggatatgcagcatgcttgactggctacctgggatgaacaaatgcgacattagtgaggatgaaacaacaaatgctctaaatgcactttatgtcactcaaatccctgccgctggtgtttcttcaggtggccctcacactgcgcatgcaagtgtagcagcatctagcacctacaatataagtggacaactgggacagagtaggaaaaggaaaaatgctctgaaagacgaaaactgttacgagcatgatcaacaagcccctgcaaaaatgactctcacgagcaatcaacaagcccctgcaaaaaatagagaagttgttgatagtgaacattatactaatgacagagatcctgtaagcacacatgatctggtgccacagagcaaatcagcttctgaaaggcataagtctaagcacaagagtcgcagtagccactcagatggaggagatcttacagaaaaatcgaagaagcattcaaaatcaaaaaacaggagaggaattgatcgagatgagcacaaaacatctaagaagacaaaaaaagaggatcgacattactttaacaaagattggaaaaatgaatacgatttagctggcaacaaagttcgtgatgaaaccaaagctttatctgcaaaagcaaaaatgtcaaaggactcatgtgaacaagatgagttttctttacgcaaggaaaaagcttcaaggtttgatattttggaaaaaacaaagagaattaatgatgatgatgtggcctttcatgagaagatgaaagaacatcgtgcaggcatagaaacattagatttgtctggcaaaaagaagacagtgaaggaatgggaggataaccggctcagttcaatggaccacacaagcaaagggggcgataatgagaatttgaacgagagattatcaaagataaagaagtccgaagctaggcctgaagaagttcaggatgcaaatgcattattttcttctgctggaaggcgtcaagataatgagctagttgctgacaacaaatttgttacttgtaaagaaggtccatcagaactatgggataatcaacctcccagacaggtcttgaacttggcggaacccactaggagggatgttgcctgtcttcagtcttctacggttgcaacttcaagctcttcaaaggtctcaagctctcggagaaacaaaaattctcgagaagcaaagggctctcccgttgaatcagtatcttcatcaccactgaaaaattcaaacactgataagatttctaaggccaggaaaactggaaaagatggagaattgaatgctgattcaagcatcttgcataccccaatgaaatatccaacccacgaagttggtttactacatactgggcagcaagctgtgggtgaagccattctgcgtggttctacaaataactccggtatggggagagtagataatcaattgtaccctggtgataaaaagatcttggatatgcatggccctacactacaacctgatcagcaggattgttttaacccgagggctacagctgattccactggacataaaagtaaaaatagtgctccttcacgccaaggtagaaatggatccagtaacttgatttcagagggaaataagcagatagagatgtcatccagaaaagagaaattacgtcctagtattgataatcaagatatgcaaaagtctattggtcaagataatcattctcatatgaaagaaggcaaatcagaggttcacaccactagagtaaaaccaggtgcttcaaaaaaccacacacaattaaggtccaatgttgaaaatggagattctgcgagtccaattaggagggatggtaatatgattgcatttgcactcaaggaagctcgggatctaaaacacaaggctaatcatttgaaggaaaaaggacttgaacttgaaagtatgggcctgtactttgaagcggctttgaagtttctgcatgttgcatctctttgggaaactcctaatctggacaattcgagatcaggcgatgttgctcagtcaatgaagatgtattctgaaactgcaaaactctgcagcttttgtgctcatgcctatgaacgatgcaataaaatggcttctgccgctttagcatataaatgtgtagaagtggcttacctcaaagcagcgtattacaaacaccctagtgcaagcaaggatcgacaagaactacagtcggttgtacagatagctccaggtgaatctccatcatcgtctgcctcagatatcgataatttaaatagccatggattgtcaaaggccctttcaaccaagggtggaaactcaccccaagtggctggcaaccatttgccactggccgttcgtaaccaagcacacttattgaggttacttgcctatacaaatgatgtcaattgtgcattcgatgcaactcggaaatcacaggttgctattgcttctgctgctagcagtcaggaaaggggaaaaactgtggacgatggtcttgcttcagtaagaacagttttagattttaacttcaacaatgtcaatgagctactgagacttgtccggctttctatggagttaatcaacacctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPSNGGIIPGPANAASLPAPVLIEDNWVCCDMCHKWRLLPYGTN TSMLPKKWICSMLDWLPGMNKCDISEDETTNALNALYVTQIPAAGVSSGGPHTAHASV AASSTYNISGQLGQSRKRKNALKDENCYEHDQQAPAKMTLTSNQQAPAKNREVVDSEH YTNDRDPVSTHDLVPQSKSASERHKSKHKSRSSHSDGGDLTEKSKKHSKSKNRRGIDR DEHKTSKKTKKEDRHYFNKDWKNEYDLAGNKVRDETKALSAKAKMSKDSCEQDEFSLR KEKASRFDILEKTKRINDDDVAFHEKMKEHRAGIETLDLSGKKKTVKEWEDNRLSSMD HTSKGGDNENLNERLSKIKKSEARPEEVQDANALFSSAGRRQDNELVADNKFVTCKEG PSELWDNQPPRQVLNLAEPTRRDVACLQSSTVATSSSSKVSSSRRNKNSREAKGSPVE SVSSSPLKNSNTDKISKARKTGKDGELNADSSILHTPMKYPTHEVGLLHTGQQAVGEA ILRGSTNNSGMGRVDNQLYPGDKKILDMHGPTLQPDQQDCFNPRATADSTGHKSKNSA PSRQGRNGSSNLISEGNKQIEMSSRKEKLRPSIDNQDMQKSIGQDNHSHMKEGKSEVH TTRVKPGASKNHTQLRSNVENGDSASPIRRDGNMIAFALKEARDLKHKANHLKEKGLE LESMGLYFEAALKFLHVASLWETPNLDNSRSGDVAQSMKMYSETAKLCSFCAHAYERC NKMASAALAYKCVEVAYLKAAYYKHPSASKDRQELQSVVQIAPGESPSSSASDIDNLN SHGLSKALSTKGGNSPQVAGNHLPLAVRNQAHLLRLLAYTNDVNCAFDATRKSQVAIA SAASSQERGKTVDDGLASVRTVLDFNFNNVNELLRLVRLSMELINT</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>7901..8098#6548..6708#4396..4553#2731..2891#1198..2636#658..1070#77..255#tgggccagcaaaaaaggagatcccttccagtgtaaagcatggcacatttccaggttcagaggaacagcagttgcatatgccgtcaaatggcgggattatacctggacctgcaaatgcagcttctcttcctgcacctgttttgatagaggataattgggtatgctgtgacatgtgtcataaatggcgtctcctcccctacgggacaaacacttccatgcttccaaaaaagtggatatgcagcatgcttgactggctgtaagttctagttcagtttgattagaattgcatttatccagtgttatgcctcaccatacatgcttgcttcaattggcaccttacatatgttaagttgtccttagtacatggttaaacgttgttaaatatagttatttgatctggaatttctttgtacaccttaaacgatttctgattagacaggtaatttgactagattctgatatctccccccgaacacccatccaccccgccttaaacaaaaaaaaaagtatttttaagtggtccataagctgtgcaaattcaacattgaggtagcactctaattcaagggtcatgcagttttctttctctgagtggtctgacaattggggaagaaaaaattccattactgaaaaatacaatccaaatttgtctttgcagacctgggatgaacaaatgcgacattagtgaggatgaaacaacaaatgctctaaatgcactttatgtcactcaaatccctgccgctggtgtttcttcaggtggccctcacactgcgcatgcaagtgtagcagcatctagcacctacaatataagtggacaactgggacagagtaggaaaaggaaaaatgctctgaaagacgaaaactgttacgagcatgatcaacaagcccctgcaaaaatgactctcacgagcaatcaacaagcccctgcaaaaaatagagaagttgttgatagtgaacattatactaatgacagagatcctgtaagcacacatgatctggtgccacagagcaaatcagcttctgaaaggcataagtctaagcacaagagtcgcagtagccactcagatggaggttctgctctctttcatgtttattgcttatatttagctgatatgtattatcttctgatatttttcagtaaatactgtgtttagttatttaaattgtttactgacatataattcctatttaaatacaggagatcttacagaaaaatcgaagaagcattcaaaatcaaaaaacaggagaggaattgatcgagatgagcacaaaacatctaagaagacaaaaaaagaggatcgacattactttaacaaagattggaaaaatgaatacgatttagctggcaacaaagttcgtgatgaaaccaaagctttatctgcaaaagcaaaaatgtcaaaggactcatgtgaacaagatgagttttctttacgcaaggaaaaagcttcaaggtttgatattttggaaaaaacaaagagaattaatgatgatgatgtggcctttcatgagaagatgaaagaacatcgtgcaggcatagaaacattagatttgtctggcaaaaagaagacagtgaaggaatgggaggataaccggctcagttcaatggaccacacaagcaaagggggcgataatgagaatttgaacgagagattatcaaagataaagaagtccgaagctaggcctgaagaagttcaggatgcaaatgcattattttcttctgctggaaggcgtcaagataatgagctagttgctgacaacaaatttgttacttgtaaagaaggtccatcagaactatgggataatcaacctcccagacaggtcttgaacttggcggaacccactaggagggatgttgcctgtcttcagtcttctacggttgcaacttcaagctcttcaaaggtctcaagctctcggagaaacaaaaattctcgagaagcaaagggctctcccgttgaatcagtatcttcatcaccactgaaaaattcaaacactgataagatttctaaggccaggaaaactggaaaagatggagaattgaatgctgattcaagcatcttgcataccccaatgaaatatccaacccacgaagttggtttactacatactgggcagcaagctgtgggtgaagccattctgcgtggttctacaaataactccggtatggggagagtagataatcaattgtaccctggtgataaaaagatcttggatatgcatggccctacactacaacctgatcagcaggattgttttaacccgagggctacagctgattccactggacataaaagtaaaaatagtgctccttcacgccaaggtagaaatggatccagtaacttgatttcagagggaaataagcagatagagatgtcatccagaaaagagaaattacgtcctagtattgataatcaagatatgcaaaagtctattggtcaagataatcattctcatatgaaagaaggcaaatcagaggttcacaccactagagtaaaaccaggtgcttcaaaaaaccacacacaattaaggtccaatgttgaaaatggagattctgcgagtccaattaggagggatggtaatatgattgcatttgcactcaaggaagctcgggatctaaaacacaaggctaatcatttgaaggttggtgacaccaattgtgttaaatgttgtctcaggcagcataattgtgctgtcaattttgcttggaagtatctaatgacaattttccctgcaggaaaaaggacttgaacttgaaagtatgggcctgtactttgaagcggctttgaagtttctgcatgttgcatctctttgggaaactcctaatctggacaattcgagatcaggcgatgttgctcagtcaatgaagatgtattctgaaactgcaaaactctgcaggtgagctacctgtgatgtccattgaataagtctataaagtttatatacttcgtttcagcaaaagtttatataaagttgtcataggtacaaaagaaagacacaccacgattcaccaagggatgaaaacagtctaggtatttaaaaatacgaaaaagtccactttactacctcaaactatttcataagtccacttcaccccctaaacatattgtaggctcacttttttttcccaaacacgcaggagatctgtgtatcatttcattaagcaaggaataaaaggtcggacttacaaaacaaaaacacgccatcacacccgctgaaaacacaaaaaagacccacccacattcgccccctcctagggcacaagtattgccttggccaacagctcttggaggttagaagctcccgccatacaccatagtgtgccctcattgtaggctcacttaaccccctaatctattaataccagcccacttagcaccctaacccagttttgttaggtggtattgccagcgtggagtggttttgatcagtcaagtcacgtcttgtgcgccagacgcagcctggctatgtccttgctgtggttgaagcttgaagggcagcaactgcgtcttcttcaatgagctgttgcctgttggtttctcacttggacttcgtcgtggttgtggtcacctgtaatttagagggacagttggcagcatgccgaaaagtgtaggatggatgatgtcacagtaacaggcccacagcatcggctgcatcgcacagcgctggtgcagctatggcaaccaaaattctgttacgcagcaacatccatctgatctgactattctttaaaactggatttaacatccatcttctgtatctgatgttgctgcaatggattattagttactaaggatgcggtagtggctgcgatcgctaggatggagaattggagacggttgacggtgggcaggaaccttgaccacagcctcgccacgtgagcaaatgcaactatctggaagcagaaatcagaaagccacgcgaagcatgaatgtcatgatctatcctacctttgctccgcctggcgcctgccatgacccttatactccacctcagcacatatgtgtggcgtggctaggtttaccggtaaaaactactcgacactggcaataccacctagtaccaggttagggtgcaaacatatgtctgcacaaataaactaagggattaagtgagcctaaataatgtttagagggtaggttggactgtgaaaatagtttgaggtagtaaagtggactttttttcaaacaaattgaagataaatctggctgttttaattaaactacactgaatgatgacgaattggatggttgcatctaatcacgtagtgaatactcatccatattaaattgatcagagttttcttcacgtatggttagctatgtctaactttgaaactatatgaactaagctttttaaatgcagtatactaaaatgcttttttttttatttgactgtccagcttttgtgctcatgcctatgaacgatgcaataaaatggcttctgccgctttagcatataaatgtgtagaagtggcttacctcaaagcagcgtattacaaacaccctagtgcaagcaaggatcgacaagaactacagtcggttgtacagatagctccaggtaattgatgtctaaaaaaatgtttgttctagcttgtaaactttaatttgaaatatttgaatcctttttattcctgctgagcttttctgggagttggaggctgcttctactatcctttgttccgcactgtgtcactcactggagttcgagtattaccaatttatttatttaggatgatgagcaatttggtccccaactttctcacttagctcatcaaaaggaccaattttgaccatcaattcagttgccttacactaaatgattaagatgaaaataaccgcttgctgcttcttgacttgtttatgcgaggtctgtgtgcatccaaacatgtagggactggatttggtattcatagagaat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