Os03g0349000
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Structured Information
| Gene Name |
Os03g0349000 |
|---|---|
| Description |
Nucleoporin interacting component family protein |
| Version |
NM_001056641.1 GI:115453010 GeneID:4332834 |
| Length |
9017 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os03g0349000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:13152323..13161339 |
| Sequence Coding Region |
13152705..13152782,13153483..13153774,13153871..13154049,13154339..13155241,13155320..13155406 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008396:13152323..13161339 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggccggcgtcggcggcagcagcagcggcggcggcgacgtggagatgggcgggtggtcggagctcctccactcctccactaagctcctcgagcaggccgcccccaccccgcacttccctcccctccagaggaacctggaccagctggaggtgctctccaccaagctcaaggccaagacggtgcgcgccgaggcgcccgtgcagtcgctctccgccaccaggttgttggcgcgcgaggggatcaatgcggagcagctcgccagggacctcaaatccttcgaacttaagaccacatttgaggatgtttttccatctgaagcaactactgtcgaggagtacctgcagcagcttcatgaaatggcaatcgtctcatccattcaagaagcacaaaaggacaacttaaggagttttaacaattatatgatgcaagttctcgaggatgattggcagaaggagaagcgagacttcttgcagagtctaagccgactctctacattaccgaaaagaaacactaatctcatggccagtgggatttctcgtcctgctctgatgccatcttcagcttccagtccccaatcttcgtccggtctgccatctaaggaagtcatgcccatacctaacaaaactataattgaaaacaaatcttcagtttatgctgcagttgtgagagatcttaatgatgctagagggcgcagcctaccttttggtcctgctacagcattcagggctgcttatgagtctttatctgttggtgctattgggacaaaatcagtgaccatgcataaagtgtggcatttaattcaggcattagttggggaagggtcaactcatcgaaacatttcaagaaaaatgtcactagtgattggtgctagacgacaccttgagtggggtcatgaaaagtacatacttgagaccatcaatagccatccggctctagctgctcttggtggatctgttggcaatcttcagaagattcgcgcatttcttcgggtccgtttgcgggatcatggtgtgctagactttgatgcaactgatctgcgtagacagccaccagtggacacaacatggcaacagatttatttctgcttgagaaccggatactatgatgaggcaagacaagttgcccaatcatctcgtgctgcattcaactttgctcccctgcttgtagaatggattactactaatggtgctgtatccccagagactgctctgacagcttctgaggaatgtgacaaaatgctgagaatgggtgatcgacctggccgtcctggttatgataggaagaagttgctcctttatgccatgatctgtggttgtcgacgtcaaatcgacagattgcttaaagatctgccaacacttttcaatactatagaggatttcttgtggttcaaattgtcagctctgcgggagtacaccagtgcatcttcttctaatgtttcaaatgaaggcttggtgccttatactctggaggatctgcaaagttacttaaacaaatttgaaccatcatattatacaaagaatggaaaagaccccttggtctatccatatgttctgctgttaagcatccaattgcttccagcaattctttatttgtctaaagaagttggagaggaaggataccatgtagatgctgtgcatatttcaattgctttatctgatcatggtgttctccctgatggtgttgggtcaggccagaagatgggtatcatggatgcttgtgcagaagctgccagtataatacggcagtatggctctatttatttgcgtaatggtaaccttgatttggccttggagtattatgcacagtctgctgctgcaatgggtggaggagaggtatcatggattggtcgagggaatgctgatcagcagcggcagcgaaatctaatgttgaagcaactgctgacagagatattactaagggatggtggcattcaacttttgcttggtccaagtggaatgggggaagaaggagaattaaagaagtatatgatggattggagaagcaggcagcaattcttacttgaagctgcccatcagtgtcatgaggcaggcctctatgacaaatcagtggaaattcataaaagagttggagcttttgccatggcacttcagacaataaataagtgcctgtcggatgcaatatgtgccatggcacgcagtatgttagatggtgaaagtcgtgctgctgctctaattcattctggtaatgaaattatggaaactgccagatattcggaagccagtgttcaagacaaggacctcatatctgagcaacaaactgtactgagacagcttgaagctattctccatatctataggcttgctcgagctggacagactttagatgctttgagggaaaccatcaaactcccatttcttcatttggatcctcaggctccaaatgtgacagttgatgtgttcagaaacttgtcaccgcatgttcaagcttgtgtgccagatctcttgaaggttgctctaaattgtatggacaatgttagagatactgatgggaccttgcgtgcagtcaagtcaaagatcgcaaacctcgtggcaagcaacatgagcaggaactggccacaggatttgtatcagaaggtggcgcagtgcatatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAGVGGSSSGGGDVEMGGWSELLHSSTKLLEQAAPTPHFPPLQR NLDQLEVLSTKLKAKTVRAEAPVQSLSATRLLAREGINAEQLARDLKSFELKTTFEDV FPSEATTVEEYLQQLHEMAIVSSIQEAQKDNLRSFNNYMMQVLEDDWQKEKRDFLQSL SRLSTLPKRNTNLMASGISRPALMPSSASSPQSSSGLPSKEVMPIPNKTIIENKSSVY AAVVRDLNDARGRSLPFGPATAFRAAYESLSVGAIGTKSVTMHKVWHLIQALVGEGST HRNISRKMSLVIGARRHLEWGHEKYILETINSHPALAALGGSVGNLQKIRAFLRVRLR DHGVLDFDATDLRRQPPVDTTWQQIYFCLRTGYYDEARQVAQSSRAAFNFAPLLVEWI TTNGAVSPETALTASEECDKMLRMGDRPGRPGYDRKKLLLYAMICGCRRQIDRLLKDL PTLFNTIEDFLWFKLSALREYTSASSSNVSNEGLVPYTLEDLQSYLNKFEPSYYTKNG KDPLVYPYVLLLSIQLLPAILYLSKEVGEEGYHVDAVHISIALSDHGVLPDGVGSGQK MGIMDACAEAASIIRQYGSIYLRNGNLDLALEYYAQSAAAMGGGEVSWIGRGNADQQR QRNLMLKQLLTEILLRDGGIQLLLGPSGMGEEGELKKYMMDWRSRQQFLLEAAHQCHE AGLYDKSVEIHKRVGAFAMALQTINKCLSDAICAMARSMLDGESRAAALIHSGNEIME TARYSEASVQDKDLISEQQTVLRQLEAILHIYRLARAGQTLDALRETIKLPFLHLDPQ APNVTVDVFRNLSPHVQACVPDLLKVALNCMDNVRDTDGTLRAVKSKIANLVASNMSR NWPQDLYQKVAQCI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>8558..8635#7566..7857#7291..7469#6099..7001#5934..6020#5341..5424#5157..5210#4531..4662#4306..4401#3788..4057#1765..1854#1617..1676#557..623#324..415#78..206#gctccactcccccctccgctccgccgcaccacgccctacgacaccaaccaaaccctcctcctagccccccggcggcgatggccggcgtcggcggcagcagcagcggcggcggcgacgtggagatgggcgggtggtcggagctcctccactcctccactaagctcctcgagcaggccgcccccaccccgcacttccctcccctccaggtgcgccgccgctttcctctcccgttcctcccccccgcatctgcctcctcctcctccgccgccgccatagcttcttccgcctgacgtgttcccccgtgtgcttgtccccgcgcgcagaggaacctggaccagctggaggtgctctccaccaagctcaaggccaagacggtgcgcgccgaggcgcccgtgcagtcgctctccgccaccaggtcggtgtcttctccccggagccccccttcgatttgcctcggcgaggctcgcagcgcggttctccgcgtcgggttcgtcgggggtaggcggttgttgggggtttacgggggacttagggttttgggctttgctttctgcaggttgttggcgcgcgaggggatcaatgcggagcagctcgccagggacctcaaatccttcgaacttaaggtgatggccggcgagggatatcccatttcatagagtgatattatactaatctcatttgctgattatcagatcgagcagtttgtccggtttgagattagacattttactgtactgctggttaaaacctagggttatcacaaagtagggttaaaacgtaataaaattataacaagtcataagcattgccatgttttattccttgcaccaaattgttgaaaaacatcctttacaatttcaaatgaagaagtgaagatgatagtttggtgtttgttaccaatacatcatgtcttcttaaattggaagagcagtttaacttactagtaaatagtttagttcagtagttttgacgaaatgtttagttagtatctgtgagctagctttggtgaaatagttacccatgaactatgttgaaacaagaaacgactctagagttcgaggtgcagcaagatctcgttggtcctatactttcaattatactgctccagattagcgttcaattttctacttaaattgtagaagaaacttaacatacagttatctacttgagtaagaaattgatagctcatatttctatgctttatctatgcaatgttctctttgtgtatttaaatgcagctaatataacgatagcatgtattcattataataatagtgtaagaatcagtcctttcctattgggtaaatgctactattttttgcttggatcagcgggctcttgatataaaaaacttgaccggaaatcattactcaataacagcgcacgatttttcgcacttcaccttatatatccaccataactttactgttcactatgtatgccccatgtcccattctctaaaattcactcctaattcatcagtataccttaatacatttacaactctgttgctgtatgtgaatctgcagcttcttattgtatattttctgttttctactctatcttgctagactacttgaatatacatcatagtgattaaaattgaggttttgtagaccacatttgaggatgtttttccatctgaagcaactactgtcgaggagtacctgcagcaggtgcacacttcataccgtcatacatcttttacatgcattttctcctaatttcatggaatatatcctgaaacatgtcatgtgttttcagcttcatgaaatggcaatcgtctcatccattcaagaagcacaaaaggacaacttaaggagttttaacaattatatgatgcaagttctcgaggttgtttaccctttcctgctgctaacttcattacatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatactagcaaaagtgcccgtgcgttgcaccgggtgattacggagtgtgtatattgaccaaaagtgttgtttggtctagcaaaagtgcctgtgtgttacaatgtgaagcgtacagattagaaaaatatgcaattaattaaaatacaaattcgctgaaatatttggtatttttaagtaggtatgtgtataattaaataaatttacaagtaaagcaagtgtgagaaataaaatgacatggttaaatttaatttttttttttaaattctccatgattagttacgctctttgaaattatatttgaatttttcagagcttaattgttaattttattaatacaaacgtcatttaacaattatttacttggaaaaagaaagaaaatacttccttttaggtttgcttcgaaataaacacattcaataacttataattgtaatgcttctgaaaaaatgagcactaaaaatgaacttattctctttttttgggcctgagggacctaaaatagacttatttccggcccttgccggtcggtccacggccttttgtgcacgcgcaagtgcacttcccctccccaggccacaacctgggcttgggccagaaaagtggcctcactctcgatccctcttgggctgatttcggcctggacgacaccgatcgtccgatctttagggttttgatcggacggccgagcgtcgatatcggggaaacaaaacccctccttctcctcagccgccgaaaccctagcccatttccctccctcccatctcacatcgccgccctcccctccgcgcccccgagcggcggcggcggcgccctcccccacaaccaacggcgcggcgccctctccccgaacaacggcggcgtggaggcggctgcggcccggcgggagcgggaggggcggcgggccggacctcgcctccgccagatctggcggcatggaagcggctgtggtccggcgagggcaggagaggcggcggcgtcgtctctttctctctctctctgtgcatggtggggaggtgcggcagtggtggtggtggcggacgtcatggaacgctggttgggcctcgcctccgccagatccggcggtgtggaggcagctgcagcccggcgggggtgggaggggcggcgggccggacctcgcctccgccagattcggcggcatggaggcggctgcggtccgacgggggcgggagaggtggcggcgtcgtctctttctctctctctctgtgaatggtgtcggttctcctggtgatgctaaccgaataggacttggtataacagatgggagtttgtttcctatttttgtggaatcggacatattctttttttttcccgatttttcttttaccgcgttgatgaatcggattcgttccggttttttttcacccggtttttttgacggacgatggaagcacctcttattttttaagtagtagtagatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgatctggtttagttgttgcaagcctgtgggaagtgcttttcagattgcactttcttatatcatcttggtatatgttaaaagtttctcggcaaatttctgtatcatctgggggtttgtatatgttattacctatatgtattattgcattgcacattagaaaacaaaatcagttgtcatagggttgtgaacttgtgatttgatttaattgaacagtacagtactaccatttcaggtaactaagatgtctacatttttcagtgttatattggtcttgtactcctatgtcgctcagtggtgaatgtttcaaattattttacggtttggttctcaacttatataacatctatgttgtaggatgattggcagaaggagaagcgagacttcttgcagagtctaagccgactctctacattaccgaaaagaaacactaatctcatggccagtgggatttctcgtcctgctctgatgccatcttcagcttccagtccccaatcttcgtccggtctgccatctaaggaagtcatgcccatacctaacaaaactataattgaaaacaaatcttcagtttatgctgcagttgtgagagatcttaatgatgctagagggcgcagcctaccttttggtgtaagtgttaaactcatatgctatgattcaacatgttacttagtccctctatggacatttattcatttatagattgaatttgtggtttttgctatccatagttctattctccaaataatttaatttgagaaatagatcaagtgcctttttttttatgtagcctcgacatgttatcatcagagcataagcaaattctattgatgtacttgtagttctgctaatgcttattaaagttatcttttggttagcctgctacagcattcagggctgcttatgagtctttatctgttggtgctattgggacaaaatcagtgaccatgcataaagtgtggcatttaattcaggtaataaaattgatttttgtgtagcactcatgctgacatctgttggcccttttccatccaatatatatgatatatccttatctattattccctcatagctatactttgcttcttgtttgtcttattcaggcattagttggggaagggtcaactcatcgaaacatttcaagaaaaatgtcactagtgattggtgctagacgacaccttgagtggggtcatgaaaagtacatacttgagaccatcaatagccatccggctctagtgagtattttcacatactttttagttctgacatttctttcaaaattccttatgaaaatagaatataacatgtaagattctgacaataattttggtgttgatccaactgaactcttgagagttactacacctgttttcttatgttgcctatgggtattccactctt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|
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