Os03g0381100

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os03g0381100

Description

ab initio prediction with EST support

Version

NM_001056774.2 GI:297601002 GeneID:4332977

Length

8073 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os03g0381100, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:15657593..15665665

Sequence Coding Region

15657593..15657673,15657797..15657862,15658569..15658652,15659034..15659113,15659551..15659596
,15659694..15659804,15661253..15661327,15662291..15662414,15662755..15662856
,15662955..15663023,15665586..15665665

Expression

GEO Profiles:Os03g0381100

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008396:15657593..15665665 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggcggcggcggcggcgggaggcgatggtgaggcggcggtgatgcgggcggaggtcgccgcgctccggctccgcgtacaggagttggagagggagaaccagaggctgggtaagattgcttcgagatgcacctgcggcagctccaaggacgacagtgctgcttcctctccagtagttagtgaaagtttgtccagcagtaaacaagaaccacagaagaacgtaaagtcacattgtagaggttgccaagtgggggttgtaagtcactgcccaaagcgattaattgctctgaaaatcatgtactttggtcagagattttatggctttgcttcagaagcccacacagagcctacagttgagtctgagatatttaaagcacttgaaagggcgaagcttctggttggaagtaggaaagaatcatgttattctaggtgtggaagaactgataagggggtttctgctactggacaggaaatgcagaaggctgcattaaaattcattggcgaacatgactacaggaatttctgtaagatggatgcagcaaacatagttgattcattattggatattaccaaaactcctagaaaacctcaatacaagatggcatcagagattccattgattctgcgatcctgtctgtttgatgaggtcaactttatgtgttcatcagaggccagtcaagctttgattgagcacttgaaagatgaatatcatcagtatatgctccaggctgcaatattttgtgaggcattgtcctgtttatgttctccagagcctgatccatttgaacctcgtcacaagaagaggaatcatattcctctaatgtcacgacaaacagaacatttgattctttttgattcatatattactgacatgtctcgttgtttcgcctacgtcaggaacttccgtcatgacatgtga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAAAAAGGDGEAAVMRAEVAALRLRVQELERENQRLGKIASRCT CGSSKDDSAASSPVVSESLSSSKQEPQKNVKSHCRGCQVGVVSHCPKRLIALKIMYFG QRFYGFASEAHTEPTVESEIFKALERAKLLVGSRKESCYSRCGRTDKGVSATGQEMQK AALKFIGEHDYRNFCKMDAANIVDSLLDITKTPRKPQYKMASEIPLILRSCLFDEVNF MCSSEASQALIEHLKDEYHQYMLQAAIFCEALSCLCSPEPDPFEPRHKKRNHIPLMSR QTEHLILFDSYITDMSRCFAYVRNFRHDM</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..81#205..270#977..1060#1442..1521#1959..2004#2102..2212#3661..3735#4699..4822#5163..5264#5363..5431#7994..8073#atggcggcggcggcggcgggaggcgatggtgaggcggcggtgatgcgggcggaggtcgccgcgctccggctccgcgtacaggttcgcggaccagcgttcgttttttcctttttctcttcttgcgcggctgtttcggtggatttagtgaagttgtttcttctctttttttttctctactggtgaattataattgggtgtgattaggagttggagagggagaaccagaggctgggtaagattgcttcgagatgcacctgcggcagctccaaggtgagatttcttttatccttagtactgccattttcattcatctaatcggagccatttcgagctgtcctgaatggtgattgatagtttgacgattccatctagtcgttggtgcaccattgcttccaaaaaaactagcttgttctttgtagtttagtacatatatagtgaggtaaccttgtaataagagaggataacggtagctagaaatccttgtccggagaactgcacattttcgaggtgaactcatgcaagagtattgcctgtaattcttttttatcctaacacatcgattttctggtcacgaaaagatgatagaatagtaatgctttggttgctgtcatggattggatggatcacacttactaccagaaagttcccttttctatcttcccactaggattatattcctgattgttcaaatacatgctgaagtttggtttgaaataaaaattgataaatctagattacagtaccccaaaagtgtcactcagcaagttttatggcattagtcaagcatgaccccaccatatgctaacaaaaacctgcatctgtggctatacctttatagctagatatcttggagttttgatgatgttatcatgttgatatcatttctagaagaatgcttatgtactgcatccctcacctgttatcatttgtcatgaggttcttctctgttaacatttttcctgattttcttctgtaggacgacagtgctgcttcctctccagtagttagtgaaagtttgtccagcagtaaacaagaaccacagaagaacgtaaagtcacatgtaagtgtaacttcagaccataatgtcatattttaatttgatcagatggttccacaataacatctaccataatcacataatggagttttgctttcttatcttatctgagtcatatgcatacaatcgaattatagtgcaatggtattgtggaatacaatagttcatgcacatatgcaacttaagatacactaagtttctataggtaaggatagtcatttgtttactagaaggaactctgtttgttgtcatttttgcatgtaaatatattagatgtgtatgtctccattgagattaatggagcatatttttcacctatactaaaacattaattttctaagaaaacttctgtctaatattacctgttttttttcttgtgtttagtgtagaggttgccaagtgggggttgtaagtcactgcccaaagcgattaattgctctgaaaatcatgtactttggtcagaggtatgattttatttccaatacaaaaatcatgtgtttccttcatctgtgatgctttcttgcttaaactccgatacaatcccaatattgtgctagcttctatgtgatgaagataagaagattgcattaaaatcctgctactatgtgatcaaatataggcgtactatatgtgtatatgcaacagctttaagttaggaacctcttcactggtcacagatcaaactttgagtcaataatattaacacatgtttcttctgcaaaattgcaatatgttctcctggcacctgcaaaattgagtcaataatatcaaactttccaatccaagaacttctgctggcacctgcatccgttctctttactttgttagttcttattgctcgtggcctcgtgccttgtctcttttctcatttttttctgcaaatatgcttgttctcatgcagattttatggctttgcttcagaagcccacacagagcctacagttgaggtatattttttttcctacgaactacatatcagcttatttttgtttctctaagggcgtctaaggttttccattaatactcctaccttttctgttccagtctgagatatttaaagcacttgaaagggcgaagcttctggttggaagtaggaaagaatcatgttattctaggtgtggaagaactgataagggggtttctgctactggacaggtacttgaatgtgtatggtttgttcaatgctagatgattatattatgttttcttcttgtatataatataagcttatattactcatagtagtctcagatgtgatcacgaattatttttgtttctggttttatttttaagaagcactcttctggtctttctcatcagaaagtcatatttttcatgtgctactttcttgctactgactagtgattaatacaattatgtactgtgattaatacaagttcacttttctctgtcatggaaaataccgcataaaaaagttcataacccaaaatccctttttatacataaccatcaaccttttacattccacaatgcaacggttgacctcaaattttaaataatagcctgtaatggaagaaagaaatctatgtagaagtatcttcacaaccaatcagtatgtcattttgatgtgctcgatgttaaatttctgaagacatacgtcaaagatatttaagtgctactgcttgcatgcaataggtacactattttttaggaatctagatagtaattttgtattgcaatagtgtttgatgatttttgcatggtgcagaaatgagtgcaatatggaaaatgtgagatatgtctatgcactaaataaaatttgtttcctcatcctgcacctgcaacatgcaggtaatttccttatttctgcgatccaacataaaagatgccaaattggatgtactagacaacaaatctggtatgtttctgccttctattctttgcagctctctagcagtgaaaacagcatgtaattcagatttaatttgctgcttaactatactgtgaccctgctagtgggaaatttccctgaccttctcccaacaagagcatgtcttgtgttgttttcctatttctacctgtcatttcatttcaaatgtcaaacatcttggatcctgcctatgcttgcagtggtttcggcaaactaagagttgtgctttgttttcagaaattgattatgtaaaagtattgaatagaatccttccacacgatatacgtgtaattggctggtgtcccgttgcaggagattttcttgcaaggttagtttcagctctatgtatactttgtttttgttggaaatattaaaggcactctcactcaagtctcatcccattgataaatataagttctaagaaaagagattgcgtgtttatttgttgatttattcccttcttttgaagataaagcatttaattttttcttctattctactgtatcatcttgcactttatgttcctatgtctgatagaatcttatcttcccttactgctattttgtagattctcttgtttgggcagggaatataagtacctgttttggaagggcgacttgaatatatcggtaaatatgccattccttgatttctataattgttaacttgtccatgttgagttcttgacaagctgacttcaaactgtcaacaggaaatgcagaaggctgcattaaaattcattggcgaacatgactacaggaatttctgtaagatggatgcagcaaacgtgagtaactacaggcgacatattacagattttaatatttcagcctatgaccaaaggttaaatttgcattttaatcaaaactcttttatccataaatgtgtgagatgcttgccatacctgaattaaatcatggaagtgctttatatcttcaaggtctaactatgatgagctgtgggccatcacaatcaaggggagtgccttcctgtggcatcaagttcgctgcatggtagctgtgctatttcttattggtcaaggtcttgagacaccatgtgtaagtaaaatcgctcctaagcttttttttttctcttaataggttattgtatggtatattggtatatgccgttaaagttggcacagactttccctttgggccttaggtatgtaagctacatatctttaggcccatataggttcctatacttgcattgcatggatgatttcacttggcactgattggtgcaattttaggtctcttattatcttagccaatgcaagttcatggatgcacattgagttaacgagttcatggccaaccgccaaattggaatacacatgcaagtttaaagacctgatgtaaaagtattctttattacttggctggaatttttagggttaatcccctttagatatttcttattgcttaacccataatacaatataggctacctttatatactgaggtgtgtctagataggggaaacggaaacaaactagtaacctgatactactaggactctgttggactcttataacagaactaggaaactctaatagagagcttatttggattctccaaatgctacagcacttgccaatccgacttatctctattatgacactgctgatatactataccataacatccagccacaacaacaaagaaatctttcagacttgcacacgttttttttctttcgattattacatttgctgtttttccttttctttttatttttgcaacagatagttgattcattattggatattaccaaaactcctagaaaacctcaatacaagatggcatcagagattccattgattctgcgatcctgtctgtttgatgaggtcaactttatgtgttcatcaggtattcatactttggccatgtctgtctgaagttgtattgaaatatcatcag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External Link(s)

NCBI Gene:Os03g0381100, RefSeq:Os03g0381100