Os03g0403100

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Structured Information

Gene Name	Os03g0403100
Description	Similar to DNA-directed RNA polymerase subunit
Version	NM_001056858.1 GI:115453444 GeneID:4333066
Length	18438 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os03g0403100, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 3
Location	Chromosome 3:17057016..17075453
Sequence Coding Region	17057127..17057134,17057223..17057352,17057472..17057591,17057701..17057795,17058290..17058356 ,17058515..17058605,17058696..17058748,17058922..17058986,17060048..17060153 ,17062759..17062869,17063316..17063375,17063736..17063765,17063997..17064047 ,17064116..17064214,17064548..17064607,17064672..17064761,17065149..17065250 ,17065333..17065443,17065549..17065665,17066090..17066206,17066291..17066371 ,17067042..17067146,17067227..17067307,17067389..17067532,17067614..17067658 ,17067933..17068013,17068087..17068226,17068343..17068442,17068974..17069092 ,17069290..17069425,17069509..17069639,17070575..17070700,17070776..17070831 ,17071907..17071977,17073676..17073760,17073841..17073944,17074607..17074735 ,17075026..17075076
Expression	GEO Profiles:Os03g0403100
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008396:17057016..17075453 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008396:17057016..17075453 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atggaacgcactgaggaggaggaggcgcccgccgccaaggaccccaacgcgtcgctgccgtcgccgacgtacaggtcgctcgccgcgcccgtcaccaagcccgtcgacaagttcgcgctccttcctgccttcctcaaggttagaggcctcgttaaggagcacatcgactccttcaactacttcatcaccaagggaattaggaacattgtcaaggcaaacaatcgcatcgaagcgcgcaacaacccctctatttttcttaggtacaatagtgtaagggttggtgtgccctccgtacaagtacaatacatcgctgaaaaaatcacgccacacttttgccgccttaccgatcgcacatactctgctcctgtgttggctgatattgaatacacagttggaaagcagtatgagctgaaaaggaagcctaatttcatcattgggtacttgccaattatgcttagaagtcatgcatgcgttctgaatggaaaggatgaagctgaattagcaagatatggtgagtgccctcttgatcctggtggttacttcattgttaagggaaccgagaaggtcattcttatacaagaacagctatcaaagaatcgtattattatcgacaccgatagtaaaggaagggtgattgcatctgttacgagcagcacacatgaaataaaaagcaaaactgtgatttttatggagaaggagaaaatttatctacagttgaatcaattcactaagccgatacctataattgtggttatgaaagcgatggggatggaaagtgaccaagaggttgcacaaatggtcggaagagatccaagatatggagatctcctatatccatctattcaggaatgtgcctttgagagaatctatacacagaagcaagctctgcagtacatggatgacaaggtgatgtatcctggtgcaggaaatcagaaggaaggtcgttcaaaatcaatcctccgtgatgtttttgttgcacatgttccggttgaaagcgggaatttccgaccaaagtgcatatacacagctgttatgttaaggcgcatgatggatgcaatcttgaatgccgacacttttgatgataaggattatgtaggaaataagaggctagagctgtctggtcaactaatatccctgctttttgaggatttgttcaaaacgatgaactccaatgctgtggagcttatgaacaaaacaagtgaaaagatccattctagcccattggatttaagcctgcatataaaggaaaatatcataacccatggtttggagagggctatttccacaggaaattgggatattaaacgatttaggatgcatagaaaaggtgtatcacaggttctttcaagattatcctacatggcatctttaggctatatgacaaggataacaccacaatttgagaagacccggaaaacaagtggacctcgtgctttgcagcctagtcagtggggtatgctttgtccatgtgatactcctgaaggggaggcttgtggcttgacaaaaaatttagctttgttgacccacgttacaacagatcaagaggaaggcccactcatgaatctctgttatagtctaggtgtggaagatttatcacttctgtctggagaagaaatccatgcatcgggttcgtttttggtcatgttcaatgggttaatactggggaaacacagacaacctcagagatttgctaatgctatgagaaaattgcgtcgttcgggtataattggagagttcgtaagcatttttgtaaacgagaagcagcattgcattcacattgcctctgatggcggtcgtgtctgtcgcccacttataattgctgataaggggataccaagagtcaaagagcatcatatgaaacaattgagagatggtattcgttcgtttgatgattttctgcgtgatgggttgatcgaatatcttgacgttaatgaagaaaacaatgcattgattgccctgtatgagcatgaggatcaagatgatgttcaaagaagcagtatcacacatattgaaatagagcccttgaccattttaggggttgtagctggacttattccttatccacatcataaccagtctccccgtaacacttaccagtgtgcaatgggtaagcaagcaatgggaaatatcgcgtataatcagttattccgagcagattctctactctatttactagtgtatgcacagcgtccccttcttacaacaaaaactattgagttggttggatatgataagcttggggctggacagaatgcaactgttgctgtcatgagttatagtggatacgatattgaagatgcaattgtaatgaacaaatcatcccttgaccgaggttttggtcgttgcattgcaatgaaaaagtacactgtgacaaaggagaagtatgaaggtggttattcagacaggatcgttaagccccagagggataaagatggtgctctgttaaaacagaacatgcgggcattggatgaagatggatttgctgcaccaggtctaataatacgcaatcatgatatctatgtgaacaagcaaactcccagaaataccaagagagattctggtgctcatttaacagacagggactataaggactcgcctgctgtctacaaaggtgttgatggcgagaccactgttgtagatcgtgtaatgctttgttcagatacagatgagaaattaatcatcaaatgtattatccgtcacactaggcgtccagaggttggtgacaaattcagtagcagacatggacagaaaggtgtttgtggtaccattgttcagcaggaagacttccccttctctgagagaggaatatgccctgatttgattatgaatccccatggatttccaagtcgaatgacaataggtaaaatgattgaacttcttggggggaaggctggcgtatcttgtggtcaatttcattatggcagtgcatttggggaaccaagtggtaatgctgataaggttgaagatataagccgtactctggtaaagcatggcttcagctataatggaaaagatctcttgtactcaggaattttaggccatccttgtcaggcatatgtattcatggggccaatctactaccagaagttgaagcacatggttcttgataagatgcatgctcgagctagtggaccacgagtattgctgacccggcaacctactgaagggcgaagtcgtgatggaggcctacgtcttggtgagatggagcgtgactgtttaatcgcatacggtgctagcatgctaatctttgaacgtctactaatatctagtgatccatatcaagtacaggtttgcagaaaatgtggcttgttaggctattacaatcataaactgaaggcttcctactgttccatgtgcaaaaatggagaaaatatggccaagatgaggatgccgtatgcttgcaagcttttattccaggagctgcaagcaatgaacgttgttccacgattgaagttaactgaaggataa</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MERTEEEEAPAAKDPNASLPSPTYRSLAAPVTKPVDKFALLPAF LKVRGLVKEHIDSFNYFITKGIRNIVKANNRIEARNNPSIFLRYNSVRVGVPSVQVQY IAEKITPHFCRLTDRTYSAPVLADIEYTVGKQYELKRKPNFIIGYLPIMLRSHACVLN GKDEAELARYGECPLDPGGYFIVKGTEKVILIQEQLSKNRIIIDTDSKGRVIASVTSS THEIKSKTVIFMEKEKIYLQLNQFTKPIPIIVVMKAMGMESDQEVAQMVGRDPRYGDL LYPSIQECAFERIYTQKQALQYMDDKVMYPGAGNQKEGRSKSILRDVFVAHVPVESGN FRPKCIYTAVMLRRMMDAILNADTFDDKDYVGNKRLELSGQLISLLFEDLFKTMNSNA VELMNKTSEKIHSSPLDLSLHIKENIITHGLERAISTGNWDIKRFRMHRKGVSQVLSR LSYMASLGYMTRITPQFEKTRKTSGPRALQPSQWGMLCPCDTPEGEACGLTKNLALLT HVTTDQEEGPLMNLCYSLGVEDLSLLSGEEIHASGSFLVMFNGLILGKHRQPQRFANA MRKLRRSGIIGEFVSIFVNEKQHCIHIASDGGRVCRPLIIADKGIPRVKEHHMKQLRD GIRSFDDFLRDGLIEYLDVNEENNALIALYEHEDQDDVQRSSITHIEIEPLTILGVVA GLIPYPHHNQSPRNTYQCAMGKQAMGNIAYNQLFRADSLLYLLVYAQRPLLTTKTIEL VGYDKLGAGQNATVAVMSYSGYDIEDAIVMNKSSLDRGFGRCIAMKKYTVTKEKYEGG YSDRIVKPQRDKDGALLKQNMRALDEDGFAAPGLIIRNHDIYVNKQTPRNTKRDSGAH LTDRDYKDSPAVYKGVDGETTVVDRVMLCSDTDEKLIIKCIIRHTRRPEVGDKFSSRH GQKGVCGTIVQQEDFPFSERGICPDLIMNPHGFPSRMTIGKMIELLGGKAGVSCGQFH YGSAFGEPSGNADKVEDISRTLVKHGFSYNGKDLLYSGILGHPCQAYVFMGPIYYQKL KHMVLDKMHARASGPRVLLTRQPTEGRSRDGGLRLGEMERDCLIAYGASMLIFERLLI SSDPYQVQVCRKCGLLGYYNHKLKASYCSMCKNGENMAKMRMPYACKLLFQELQAMNV VPRLKLTEG</aaseq>
Gene 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External Link(s)	NCBI Gene:Os03g0403100, RefSeq:Os03g0403100