Os03g0407400
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Structured Information
| Gene Name |
Os03g0407400 |
|---|---|
| Description |
Conserved hypothetical protein |
| Version |
NM_001186541.1 GI:297722212 GeneID:9269602 |
| Length |
5728 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os03g0407400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:17365305..17371032 |
| Sequence Coding Region |
17365305..17365340,17365719..17366105,17370922..17371032 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008396:17365305..17371032 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcggcggcgccccggcccaagtcgccgccggcgccgcccgacccatgcggccgccaccgcctccagctcgccgtcgacgcgctccaccgcgagatcggattcctcgagctgtttgtgcagagcaagtgcgtgctgcctcagctacctctcctggatctgctgctgcagcagcgccgccggcggctgctcatcctcctcctcctcctccttcaacctcaagaggccgagctgctgctgcaactgcaactgcaactgctgctcctcctcctcctcctcatgtggggcggcgttaacgaagagtccgtgtcgctgccgccgccgcagctgctgctgccgtcgctgctgctgcggcggcgtcggcgtccgcgcgtgcgcgagctgcagctgctccccgccgtgcgcgtgctgcgcgccgccgtgcgcgggatgctcgtgccgctgcacctgcccgtgcccgtgccccggcggctgctcctgcgcgtgcccggcgtgcagagcaagtataaaggtttatatggaggagagaggtaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAAPRPKSPPAPPDPCGRHRLQLAVDALHREIGFLELFVQSKC VLPQLPLLDLLLQQRRRRLLILLLLLLQPQEAELLLQLQLQLLLLLLLLMWGGVNEES VSLPPPQLLLPSLLLRRRRRPRVRELQLLPAVRVLRAAVRGMLVPLHLPVPVPRRLLL RVPGVQSKYKGLYGGER</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>5693..5728#4928..5314#1..111#atggcggcggcgccccggcccaagtcgccgccggcgccgcccgacccatgcggccgccaccgcctccagctcgccgtcgacgcgctccaccgcgagatcggattcctcgaggtacaatctatctctatctgtctatatcactaccattcatactccttcgatcttgcttcaaaacaaaaaaatatatatttcctacttcatattcatatacacacgtacggcttgctatctgtcgaattgtttgcttctgcatgcatgcatcactctcattgtaagtttttcccagcttaaaaccactccttttatcttcgttcttcttccttcttgtttttttttaaaaaaacaacaactcatttaatcttcatatagtgtatcatgcatcatttgcttctttgatcagttccccaaaaactgctcctctcttcccagccaaataattaaacttaagcaaacaagcaagttgaactgatgatccaataaaacaaaacaaaaccgatcgaataggaagtcaatggcatataccagctgctatagctgaagccacgaatgcttagcttagctctagtcgatccctgttgactgttcaacacactgcactaacacaccagttaatgagctgattaattaaaccattaaatgagcttaacgggcggctagcttcttcctctgggcccgtgccgatcgtaccatcggtttgcgcgtccctccacctaaactctctgccttgttattccctttgcctagtactacatgcatttgcatcatcatcccatcaccaatagtactacgtttcaactggattttggtggtgtccaaccatatcatatttggttttgttctctagtttactcctacattagtctctagcggttttgtggagtactaaagaaaacaactaatcagccagggtttaacgtttaatcggttggtggttttgttaattaatttcatctactattttagacttcacaggtcttcgagctataagcatcgattgccatgcatcaatcgatgctggtccacgctagtttctgagttctgactagctctcttaattgtgctttgacctactttaattaattaaccagtggctgcgtcactcattgaccaacattgtcatgttacccggactgattttttttttctttaaaaaaacaccggatatattattagttagtgtatatatatgtctgctcaagaagcgcatgcatatagtttctcgtcaaacaaaaaatgtactgtatgctcaaagcatctgttttggaattgtcatattcgcctttataattaaaataattaaaatggtgatgcccagctttttttttcctccaataatttatttattggcttgatttcctgtgctattaggagtaaaactactccgttttaattagcaccatttttaaagcttctaaaattaacctaagtaaagtacgacagtacttgctgtctagctttaaatgttttgggtgttaaaatatccctcagacatcacctgaaaagttgacaggctaaacacatgcccatctccctcgtttacttaaattaattcgaacaaacaactgtatatatatttcttgcagggtgaaataaattcaatcgaagggatccacgctgcctccagatgctgcagagagtaagccagcctgctgtttctttttgtactacttccatttcttctcgtctttactcttaccatgcattcacaaaatatacttacttaccccagtttttgatcatgaactttgaccgttatctttttaagcaacttcaataaaataggtttaaatgcaaatgttatgtacaccattgattataaaaccttggcaaatgaaagtaaaaaaccagcacatttaatttctgaacgttgggagtattattatttttatatcttttactatcatttaatcatagtatcgtgcaagctttttgagtgtaattaggttgcttaaggtaaaaaaatgtaactaggttacatttagtactaaactgaacatttaattagtaatgtttcgttaagtaactgtaatttcaatgcatgcatgtcctcccgtaagagcaagtttaatagtatagccaactactagctccaatttatttatagacaatctaatagctcattcatacaataattacatactacactattaatatctgatcccacctgtcatacacatactgcattttggagtccgtgctatagctgactacaaatctatagtccgctgctcttctctctctttatttatctccttaaaatatgtttgcagctggcttatagcctgctattgtacctgctctgaaaatagtgcagagactgttcaaaaagtcattgcacaataactattcacatggaactgtgaaaagtatatattggaacttactagctagatccttttgggaacatgggaaaagccaagtcacgtgtggaatccctattccctgtgttcttcagctagaagagtgaaaataatgtactactactatacggagatgaaattacagcaggagcagaaagcgggaaaaaaactttaaatcaattaaacaaacctctctctgcaaaattcaacaccagcaacgaacaactcatcaagttcttgtgttatgtaccggccggtaactaattgttgtttgcataagcgaaacggtatatttgcaaacaaaaaataatttatgaataaaacttttatatacatgttcttaattatctcaaaacaaaggttgaaaaataaacttcgatgaaaaaatctcaaaatcaattccaaatttatggtgaaaattttaaattttgtctgataaacataagtataagcaaaaaaaaaagtaaagcaatgtcactatgttaatggtattggtatatatacctttgagtttctgtctgtactttaggagtacatgctacgaacatgttttcttggcttctatttcgttggaattacttgcgtattgtgggccagacgcctggtgaacttcgtcgattgtgtggactaattaagctcacctgaaataagtggttgaaaacaaggctaaagatgattttaatcatggattttggcttggaaatttttttgtagggttgacgaattcatcggaagaactcctgatccattcataacgatgtatggattttcaggtcgagaatttgtctttaacttcgcacgactgttattttttttcttattaattctctgtttacaagcagttcatcggagaagcgaagtcatgatcattctcaccacttcttgaagaagtttcggtactcacttcattcccggatcttaatgtatatatgcatatctgcactgtgctaattggtgtacacattatgtgatcatcagtccaagttaattattacttacaaaactgaactaataaacactagaaaatatgtaacttgcaaagtacatattgaatcagggattcatatatagaactccacctgcagatttcttccaatatatatatgctgtcaccatgttttcacttgtcacctagtacacctttgactgggagactttccttgatgatcgacgtggtcatattcttcagattgatttaatttcagatagaaaaaaatattgtttacttagtttctctccttcagtaagagagatgtgcaagaccagcgatcaaactatatgaactgttcgtttcatgataaaaaaaacatgatatggaataactaggtgattcaacatataatggctgataatccctcgtttcaggagataccatcagttttctacttttctacttttctccatgttctctttttcatgtttgaggtggatcggagcttgtattagatgtttgctcagctcaattattgctgcagatttccctatatagcctccactgtatatatactccctccgattccataatttaatgatattttgaacaatgacgctgtctccaaaatatatctttcactttgttttcctattataatatatacaataaaaaaaatacatatttacttttcttataaatagtttcaaagacaaatctatatatgttgttatataactcttttaaactaaatatttttaaagttatagtcaaagttacaaaagttggacctcaaacatgtataaaacgtcgagaattgtatatctgatcaaccaataatttgtagtgcattgtcttaaaaaaattgcatttctagctatgtatctagataattacaagaaccaggtgaaatcacattttatttttactggaccacgaactcattgtttaattacttccagccttgcactaaataacaataattgaacctggcatcacctgcacaattaatttggacacaaagtaaacatgaatgcaacatacttcgtttcatattgtttgttggtgtaggatttaaattttgtgtcaaaatacttgccgttcttactacattcttaagcactttgagaactaaccttctcttcctacccttcatcaatacagtcatactaactaattggctcttatgccttgaaaaactaattaggatgtatttaatgagggtaaccatgtaatctgccaccagtgaatgcaattttggttcaaaatttcgggcccccgccctaaaaagtcattatctcgatagaatttttttgaatttagtcaaaatttattcaaatttagccaaattgtgttaaatttcaaataatttcagtctaaaaagtgctgaaaatcccgaaatttaggttctaccgaaatggccggaaattttcagcgaaaatcaaacatgaaaaccttgtctgccacatttgttagtttgtgtaaagatttgctagaacgataagtaatttgaagcggatgtatattatatatcccacaaaaccatcaacttgttaattacatgtatatttgtgcatgatgctttcaccactttgtggttgttaacgattaaatcacacgttttattttctcacagctgtttgtgcagagcaagtgcgtgctgcctcagctacctctcctggatctgctgctgcagcagcgccgccggcggctgctcatcctcctcctcctcctccttcaacctcaagaggccgagctgctgctgcaactgcaactgcaactgctgctcctcctcctcctcctcatgtggggcggcgttaacgaagagtccgtgtcgctgccgccgccgcagctgctgctgccgtcgctgctgctgcggcggcgtcggcgtccgcgcgtgcgcgagctgcagctgctccccgccgtgcgcgtgctgcgcgccgccgtgcgcgggatgctcgtgccgctgcacctgcccgtgcccgtgccccggcggctgctcctgcgcgtgcccggcgtgcaggtgctgctgcggcgtccctcgttgctgccccccctgcttgtgatcgatcgatcgattgagcgaagctgcactgattggttaattaattagttctcgatgatgatcgatcgagctgcgcgcgtacttaattagctagctaggttctggtgttaattagttcctcatcgatgcatatgttgattgccttgctctgcttgcggttatctgtaatttggctttgctgccatgatgagtacgtgattgctgatttattttacatatcctctgctatatatatctagctggtagtagctagttttgatctcacttgcaaaactattcatttcctgattttaacaaggtcaaatgacttggttgcctttggttcatactccttagagcaagtataaaggtttatatggaggagagaggtaa</dnaseqindica> 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