Os03g0448600
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Structured Information
| Gene Name |
Os03g0448600 |
|---|---|
| Description |
WD40-like domain containing protein |
| Version |
NM_001057006.1 GI:115453740 GeneID:4333230 |
| Length |
7233 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os03g0448600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:19819987..19827219 |
| Sequence Coding Region |
19820195..19820276,19820383..19820483,19820555..19820633,19820719..19820799,19824102..19824177 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008396:19819987..19827219 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgagcgccgccgccgccccagcagccgccgtcggcagcggcaaggagctcgccaacccgccgacggacgggatctccaacctccggttctccaaccacagtgaccacctcctcgtctcctcctgggacaagacggtgcgcctctacgacgccgacgcgaacgtgctcaagggtgagttcgtacacgccggggccgtgctcgactgctgcttccacgacgactcctccgggtttagcgccggcgccgaccacaccgtgcgtaggttagtatttggttcagcaaaagaggatcttttaggacggcatgatgctcctgttcgctgcgtggagtactcttatgctgcaggtcaagtcatcactggcagctgggataagactatcaagtgttgggatccaagaggtgtaagtggaccagagcgtacgcttgttgggacatatgctcaacctgagcgtgtatattctctgtcgttagtggggaataggttggttgttgcaacagcaggaagacatgtcaatatttatgatctgcgtaatatgtctcaacatgagcaaaaaagggactcttctttgaaatatcaaacacgttgtgttcgatgtttccccaatggaacaggatatgccctaagttctgttgaaggacgagtttctatggaattctttgatctatctgagtctgctcaatctaaaaagtatgctttcaagtgtcatcggaaatcagaagctggccgggacaccgtttatcctgtcaatgcaattgcattccatccaatatatggtacatttgccactggtgggtgtgacggatttgtgaatgtatgggatggcattaacaagaaaagactatatcagtattcaaagtatgcgtcaagcatagctgctttgtcatttagtaaggatgggcacctgctcgctgtggcatccagctacacttatgaagagggagaaaaatcccatgaacctgatgcaatatttatccggtcagtgaatgaagtggaagtaaagccgaagcctaaggcactggcagcaccttag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSAAAAPAAAVGSGKELANPPTDGISNLRFSNHSDHLLVSSWDK TVRLYDADANVLKGEFVHAGAVLDCCFHDDSSGFSAGADHTVRRLVFGSAKEDLLGRH DAPVRCVEYSYAAGQVITGSWDKTIKCWDPRGVSGPERTLVGTYAQPERVYSLSLVGN RLVVATAGRHVNIYDLRNMSQHEQKRDSSLKYQTRCVRCFPNGTGYALSSVEGRVSME FFDLSESAQSKKYAFKCHRKSEAGRDTVYPVNAIAFHPIYGTFATGGCDGFVNVWDGI NKKRLYQYSKYASSIAALSFSKDGHLLAVASSYTYEEGEKSHEPDAIFIRSVNEVEVK PKPKALAAP</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6944..7025#6737..6837#6587..6665#6421..6501#3043..3118#2043..2309#1213..1295#367..497#115..246#actctgcccgttgcaaattcaaatttggattccccttcctccccacacgctcccctcctcctgccgagccgaaaccctaacgatccaattcctcctccctttgggcctcccaccatgagcgccgccgccgccccagcagccgccgtcggcagcggcaaggagctcgccaacccgccgacggacgggatctccaacctccggttctccaaccacagtgaccacctcctcgtctcctcctgggacaaggtcagcgacgatgcgcgtccctctccgttccttgcggtcttggtggcccgtaagtaaaccctagcccccctttgatttggaagatctgaccggggtttggttccttgcgatctcttttagacggtgcgcctctacgacgccgacgcgaacgtgctcaagggtgagttcgtacacgccggggccgtgctcgactgctgcttccacgacgactcctccgggtttagcgccggcgccgaccacaccgtgcgtaggtcagccattttgagttaaccccgttctcctgcctcattcaactctttgcacgcggttgatttgacggttcaggaggtttgttctggatactgtcattttcaacaattgctcctttatatgcttgctcatgatggtttgggatagtactccctcgagtcaacttggagcatcagtactatcgtaaccagatttgagtagattttttttctcaatctcatgacactataattttatttagtttccaaattgtattgttatataaaatagtgcttaaagttgtctttcataagctgtgttaccgtccaacggccagaaaaacaaattgggatgcaattgacacagatgatagaaaatgttaagggttgttaattcgggatcctagttagaggctggagaaatggagtagattttatgctcaatggaccatgttacaatgccatggatgtatttccccgtataacaattaacatgtatgcacatatatgtatatattcaaatacatataatcagctactagcgtcattaagcaaccatgaacacatgagtgaactaaatgtttcttgtaaattcagttgtctaaactcaacactttgttgcttgtaaataggcttatattttttcttattgatatcatcattagctcatccttattatattctaccataacgtgaagacttggtaagactaacaagcaatggggcacgtgacttccaggttagtatttggttcagcaaaagaggatcttttaggacggcatgatgctcctgttcgctgcgtggagtactcttatgctgcaggtacttcgattttactgaacacacattcctgcattaaaatcttcaaccttaggagtttaactggctgtttactggagtaatcaagttctcattattttggatgtcatgcacattttctggctgaattgttatttgaattctatattgtactattagtttgtacttgagcatgaaaaaatcgatcatagtgcttaactctttggatagaggattcggcgaatgcccatgtcagtttgttgtttatgtttcatactaattctctatctggtagtgatgttggtgttcttacctgctttagtgctgagtgctgacttaatttctcgtgacacatcttgcagacatgattatcgaactttcaaatcttttgagtatcgatgtctatttgaaatcttttagagagaatgacctgcattactggtgggagtagcaagttagggtagcatccatttcttttaatttaagggcaaacaccagtcagcagatgattcatgaatgaatttcttcctgtcctcggttctgcttgttttagtgaatatgctatacagattggctaaagtaaccaaacttctagttggtaaatttctggaaattgtgcaaaacttgattctgtggcattgcatatattagcatgtactacgatctggttgtcatgtataatttgttacatcctaaaaacaatacagaaattaactattcatttgtggatattgaaattacctgttcatttatggatttttatctatgcaggtcaagtcatcactggcagctgggataagactatcaagtgttgggatccaagaggtgtaagtggaccagagcgtacgcttgttgggacatatgctcaacctgagcgtgtatattctctgtcgttagtggggaataggttggttgttgcaacagcaggaagacatgtcaatatttatgatctgcgtaatatgtctcaacatgagcaaaaaagggactcttctttgaaatatcaaacacgttgtgttcgatgtttccccaatggaacaggtaatatgctctcttttgattacttatgctgcaggacagtacatttccagttgtctcccatgtttcaaacactagctaaatgcccttatgcttgtgatggacaatttgattttgcaccaaacatgtccttgatttccttttttgttacaagagcatttgatggtgtttacatgtattacctatgaagttaactcatgcattacatataaactaagacatttttaacattttagagttttcctgggacttgttaaattatgattttagaaaaatacaaataaagatagaataacatataaatgatatattacgtaatattagaaaaaaatttggtagcaatctgtacaagatgtagtgggagctaatagggtgttagattcactaccaccatcaccactacatttaatgtaatgtgggggggggggtatagatgaatttccttctgtcttgatgctagataatatgtctattttgtctgtgcgtgtgcacagacaagatgaatagcattagataatctaagcttctttccatctattttgatttgagccttatggtataagttcctttagagtggctgttgatcttatacatggtttttttttgtgtgtaagttttggaatcaatacagtcaccttgcttttattctgtggattgcattgttcattattatttttcctactacagtgaaatatattttgttgactgaccttgatctttcttgtcaatgcttcaggatatgccctaagttctgttgaaggacgagtttctatggaattctttgatctatctgagtctgctcaatctaaaaagtatgttttctgcatcttagcttgcgttttaaaacatttgtttcttggagcatgttaattaagacttaatataatggactaagaatcttccatccaaacagcttttctgtttttacagaacaatttttagtttcctgtcctccattgcttcttctctacctattataaaaattgaagatgtttttgccgtagttttcgtacgtcgcctgcgtccgattgcgtctgatattgtctccgcgcgcgaagcagttcgcgtccgattcctgtgtataacacgcgacgccacacgttcgttgaagatttgcattgcctctgccctttttccgtgttgaccacgccgaccgaatccgtttctgtcaggaggcaagagacagcgatgggccagccaatccatctaccgcacggctcacgagaaggccaagcaaagttaattcgctgcccctgtcactctacagtgggtgattttctggtgaattgctacgtccacccaagcttgtgcaccagaagatttatagattgtcgcttcgtgcatgtacagggaattaattcatctgcattgctttcgttctgtttgggtaaatcaaatttaggttcagtttttgctaagctcatatgccagattactatgaggtttttatgaagatcaaaatacttcttttttcacccaaagtgcatcgcgtttctgctaggtttacgcaagtttataccaataaattcagaatttattcccaatggcgagtttgaagtatggtatacctcttatagattaagggtgttatggttttattgtccaagtgactatttcgcacacaatgattttgtcacatcatgagtttgtttggagattaaagatttttatgctacaagacgaaatttgtctcaaggtagagattgtgaaatatgttaactaaattttagcatacaatatattcgggttagttacctaataggactttgtattacatattaggactcatagatttctccttttatatatctcttgtatgccgcatgggaaggatgcgacaacactatgtgtcatctacgtttgtattcaactcctctatactgatcattgccgatcgtcgcccatagttttttcccataaggatttttcatataaaattcgtgtatccgttatgcatctattttcataacaaggaagacttaactatctaactggatgttataggttgtgcatggatgcaaaaaccatagcagggctcccattttcatcgagcaaataatggccagctccttttgatcaaccttgagcttagagtaggatatcttgaacttaagtaatatgtaagactaaaattcctgtaacccgttgcaatgcacgggtattttttctagttattataaaaacatgaaatatctaacatacataaagacatccagtttaaactggtagctagttcctagttgcaatcatgcgtacctcactttgggttgtgcaaaaactcaacattagaccataaattatgagttactttatctatcatttcaaaatttcttgataattttatttctgaacttgggacgttttggtgatctaagtgtaaccatttgtatccatggtttgatgaccaaaaagtagtcgtctgatcactactatgtggctgcattggagatttctaggtcaaaggaaatggtttttgtggttagaaacttgcgctgttctcagttctaaaggtgttacaaaaggggtgacttgcagtcctgatcaactagttgaccaactagtaaaccaaggttgtaaatatgggt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