Os03g0583900
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Structured Information
| Gene Name |
Os03g0583900 |
|---|---|
| Description |
DEAD/DEAH box helicase, N-terminal domain containing protein |
| Version |
NM_001057099.1 GI:115453926 GeneID:4333337 |
| Length |
14590 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os03g0583900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:22261132..22275721 |
| Sequence Coding Region |
22261305..22261667,22262169..22262447,22263994..22264407,22265296..22265505,22266292..22266488 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008396:22261132..22275721 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgggtggccccctcaccgccgccggaggtcgaggagatgggggcgccaaggcggtggaaccgctccggcctccgccgccgcccgacccgaagacaatggccagatggtaccagctggaggcgctggagcgggcggtgcgggggaacaccctggcgttcctggagaccgggagcgggaagacgctcatcgcggtgatgctgctccgggcgtacgcgcaccgcgtgcggaggccggactcgcgccgcttcgccgtcttcctcgtccccaccgtcgtcctcgtgggccagcaggcgcgcgtcgtcgagcagcacaccgacctcgtcgtcaagcagttctgcggcgagatgggggtcgacttctgggacgccgccacctggcgatcccaactggaggacggcgaggtgctcgtcatgacgccgcagatcctgctcgacaacctccgccacagcttcttccgcctccaggacatcgcgctgctcatcttcgacgagtgtcaccacgccaggggcaatacgccgtacgcctgcattttcaaggaattttatcacccccagttgaattctagtgcgtcagaccctctgccaaggatatttgggatgtctgcttcgctcatttattcaaaagatttgaatccgcacaattattcaaagcaaatttctgagattgagaatctcatgaattccaaggtgtacactgttgatagtgaatcagctttgtcggagtacataccatttgcttctacaaaaatagtggactttgacgattccaacatttcatctgagctgcatgccaatattctcagttgtttgaatagattgaataaaaagcatatagaagctctggacagaaaactacatggttcatctctggaaaacgctaagcaaaggatatcaaaattgcatcatacatttgtatattgtttatataatctaggagtatggctggcagcaaaggctgctgaggtacaatcatacgaggaaaacagcctatccttctggggtgaaacattggataaaaatgttgagggcttcattagaaactacagcgaagaagtacatagagaactttcatgtttcttgaagaatggtcatattggtgaaaaatttccagctgattctcaagatgggatattgacacccaaagttcattgccttattcgaactcttctgcagtacaggcatatgcaagacttaagatgcattgtgtttgttgagagagttatcacaagcatagtattagagcacctactttcatctattcatcaaatgtctgggtggaatgttaagcacatggcaggaagccgtcctggtttgctatctcagagcaggaaaaatcatacagaaattgttgaatcttttcgaaaaggaaaggtacatataattattgccacacaaattttggaggagggtttagatgtgccaagttgtaacttggtaattcgctttgatccatcagcaacagtatgcagctttatacagtcccgtggtcgagctaggatggaaaactctgactatcttttacttgtcggaaggggggatgtggaagctcaaactaatgcagagaagtttctcgcaagtgggcaaataatgcgggaggaatctctgagattgggatcaatttcttgtcaaccacttgagaacaccttgtgcgaggatacctattaccgtgtcgagtcaactagagcaattgtgacactaaactccagcgttccattaattcattttttctgctcaaagcttccatcggatgaatattttaatcctctaccaagattcgatatagacaaggcatctggcacatgcactctgcatcttcctaagagcagtcctgtgcagacagttaatgtagaaggagaaggttctattctcaaggagacagtttgtcttaaggcctgccaagaactacatgccattggtgcactcacagattctcttttaccagaattagatgttccatgtgatgaagaacctgacatcgttgttgagaacaaaattgagcagccttcttactttccagaagaatttgtggataattggcgctccttttctcgtcttggcatatattattgctataagatctcattggaaggatgtcccaaaacagcttctccaactgacatactgttagctttgaagtgtgatttgggatctgactttacttctagctcatttaaattgccaggtgggcaagacaatgctagtgttaccatgaaatatgttggcatcatccatctcaatcaagaacaggtaattattgctagaagatttcagacaactattctttcgtttcttattggtgatgaccatttggaggttagcaatggtattaaatacttccatgagatgcaagtgcctattggagtagtctatctacttctgcctttagtttctggcagaattgattggtgcagtatgaagttctcatcctcaccaatatatgaagctaacaacaaacatatgacacattgccattcttgtaaagatattgatttactgcagacaaaagatggtcctttctgcaggtgcatccttaaaaattccattgtgtgtacccctcataataacatcttttatgttattagtgggtttcttgacttagatgcaaattcctgtttgcctcaacatgatgggactgttgttacctacaaagattattttaagactaggcatggtcttactttgacttttgaaaatcagccgctcttggctggcagtaaacatgtgaaagtgcggaacttcctccacaactgctactctaaaaaagaaaaagaacctggtgatagatatagtgttgagttgccacctgaactctgcagaattatcatgtcaccagtgtccgccaataatttgcacatcttctcatatgttccttccataatgttccgcatccagtgcatgcttctttctgtgaaattaaaggtccaattaggcccaacagtgcagcagtttgacgtaccggttttgaagatcctggaagcattaacaacaaagaaatgccaagaagaattttcacaggaatcattagaaacacttggggattctttcctcaaatatgttacaactcggcacctttttagtgaatacaggcttcaacatgaaggcatattaacaaaaatgaagaaaaacttgatctccaatgcagctctgtgccagctggcctgcagcagtaatcttgtgggttacattcatgctgaggagtttaatccaagagattggatcatcccttgcttggactatgatgagcgtgataacaaaaaaatttcctttctggcacccaatggtatgtacagccaaaggaaaatgtctattaaaagtaagaggattgcggattcagttgaggccttaattggggcttacctcagtactgctggggaaaaggcagcatttcttttgatgaaatcattagggatgaatatagaatttcacactgaaattccagttgaaaggaaaatttcaatgaaagctgaagagttcattaatgtgaggagcttagagggaatgcttggttacaagttcaatgattctttattattgctcgaagcattgacacatggctcatatcagacttctggccctacttcatgctatcagaggctcgagtttcttggagatgctattttggatcatcttttcactgaatattactacagcaaataccctgactgtactccagaattgttgacagatcttagatctgcctctgtgaacaacaattgttacgcgcatgcagctgttaaatcaggattaaacaagcatatccttcactcatcatcagaactgcataggaagatgagctactaccttgaggaatttgggcagtcatttacaggtccatcttatggctgggaagcgggcattggtctaccaaaggttctcggggatgtgattgaatcaatagctggtgccatttatctcgacagcaagtgtgacaaggaggttgtttggagaagcatgaagcggctattggaacctcttgccacccccgaaaccatcgagcctgacccggtgaaagggctgcaagaattttgtgatcgtagatcattcaaaataacctacgaaaaaaaccatgttgatggagtctcatcggtcattgctcgggtgaaggctggagagactacatactccgcaacaaaatcaggtccctgcaagttggtggcgaaaaagttggcatcaaaggctgtgcttaaagatctgattgctggtcacaaagatacagaggctgctgcagtatag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGGPLTAAGGRGDGGAKAVEPLRPPPPPDPKTMARWYQLEALER AVRGNTLAFLETGSGKTLIAVMLLRAYAHRVRRPDSRRFAVFLVPTVVLVGQQARVVE QHTDLVVKQFCGEMGVDFWDAATWRSQLEDGEVLVMTPQILLDNLRHSFFRLQDIALL IFDECHHARGNTPYACIFKEFYHPQLNSSASDPLPRIFGMSASLIYSKDLNPHNYSKQ ISEIENLMNSKVYTVDSESALSEYIPFASTKIVDFDDSNISSELHANILSCLNRLNKK HIEALDRKLHGSSLENAKQRISKLHHTFVYCLYNLGVWLAAKAAEVQSYEENSLSFWG ETLDKNVEGFIRNYSEEVHRELSCFLKNGHIGEKFPADSQDGILTPKVHCLIRTLLQY RHMQDLRCIVFVERVITSIVLEHLLSSIHQMSGWNVKHMAGSRPGLLSQSRKNHTEIV ESFRKGKVHIIIATQILEEGLDVPSCNLVIRFDPSATVCSFIQSRGRARMENSDYLLL VGRGDVEAQTNAEKFLASGQIMREESLRLGSISCQPLENTLCEDTYYRVESTRAIVTL NSSVPLIHFFCSKLPSDEYFNPLPRFDIDKASGTCTLHLPKSSPVQTVNVEGEGSILK ETVCLKACQELHAIGALTDSLLPELDVPCDEEPDIVVENKIEQPSYFPEEFVDNWRSF SRLGIYYCYKISLEGCPKTASPTDILLALKCDLGSDFTSSSFKLPGGQDNASVTMKYV GIIHLNQEQVIIARRFQTTILSFLIGDDHLEVSNGIKYFHEMQVPIGVVYLLLPLVSG RIDWCSMKFSSSPIYEANNKHMTHCHSCKDIDLLQTKDGPFCRCILKNSIVCTPHNNI FYVISGFLDLDANSCLPQHDGTVVTYKDYFKTRHGLTLTFENQPLLAGSKHVKVRNFL HNCYSKKEKEPGDRYSVELPPELCRIIMSPVSANNLHIFSYVPSIMFRIQCMLLSVKL KVQLGPTVQQFDVPVLKILEALTTKKCQEEFSQESLETLGDSFLKYVTTRHLFSEYRL QHEGILTKMKKNLISNAALCQLACSSNLVGYIHAEEFNPRDWIIPCLDYDERDNKKIS FLAPNGMYSQRKMSIKSKRIADSVEALIGAYLSTAGEKAAFLLMKSLGMNIEFHTEIP VERKISMKAEEFINVRSLEGMLGYKFNDSLLLLEALTHGSYQTSGPTSCYQRLEFLGD AILDHLFTEYYYSKYPDCTPELLTDLRSASVNNNCYAHAAVKSGLNKHILHSSSELHR KMSYYLEEFGQSFTGPSYGWEAGIGLPKVLGDVIESIAGAIYLDSKCDKEVVWRSMKR LLEPLATPETIEPDPVKGLQEFCDRRSFKITYEKNHVDGVSSVIARVKAGETTYSATK SGPCKLVAKKLASKAVLKDLIAGHKDTEAAAV</aaseq> |
| Gene Sequence |
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