Os03g0627500
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Structured Information
| Gene Name |
Os03g0627500 |
|---|---|
| Description |
KH domain containing protein |
| Version |
NM_001057242.1 GI:115454212 GeneID:4333505 |
| Length |
8548 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os03g0627500, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:24685816..24694363 |
| Sequence Coding Region |
24686582..24687048,24689646..24689892,24690702..24690850,24690943..24691227,24691325..24691519 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008396:24685816..24694363 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>gcaaatatggatggactggtagagaattttgacgcagatgatctcggcgaaatgcctcagaatcattataatgaagaacaactgatcccctacagcgatgtgtcacatccttacaacgaagaacccgataacatggacaacgtagaagaggggaacccatacattcagcaagtgagtttgtacagtgaagaaccagagaatcagtacaatgaggagccatcaaacccttatcaggaagagtcggataatgcatacaatggggaagtgaagcaacaggatagcttgccggtagaggctgataagaaatggcctggttggccaggagagagtgtttttcgtatactgatcccagcccagaaggtaggtgctatcattggccgcaaaggggagtttatcaaaaagatgtgtgaggagtctaaagctcgcataaaaatacttgatggcccgcctggtgtaccagaaagaacagtaatgatttcagcaaaggatgagccagatgcacctatatctccagctatggacgggttatttagagtctataaacgaataactgatggttcagatggtgattctggtcaacctgaaagaaatattagtaatgtaggaccaacacgactgctagtaccagcttcccaagctggcagccttattgggaaacagggagcaaccattaaatccattcaagattcttcaaagtccattgttcgtattgttgagactttgcctcttgttgcactaaatgatgatagagttgtggagatacaaggtgagcctgttggtgtccagaaagcactggaatcgatagccagtcacttaagaaaatttcttgttgaccgcagtgttcttcctctttttgaagggcaaatgaaaatgcacaatgcacagagggaacaagcaatggcagctcctcagccttggggcccacctcaaccttggggccctcctccaagccacctccctcctggtggtccaggttatggtggacatccacagttcatgcccccaaggccgcaagacaattattatcctccccctgatgtcccctctatggaaaagcagccacactacggtatttctgcctatggacgagaagcaccaactggtgtttctgcttctgggaatcaaccaccatcacatgtggcttctcaggttacacacaacatgcaaattcctctctcctatgctgatgctgtgattggagcagctggtgctagtattagctatattcgtaggcacagtggtgcaacagtaactattcaggaaagcagaggtgcacctggggagatgacagttgagataattggtagtgcatcccaagtccaaactgcccagcaactagtccagaatttcatggcagaagctcctcagggccctcctccgccagcttctaaccctccggctccagcagttgatctgagctacggttcatacccaccaccatatggcgcatcctacggatcggctgcttcaggagcagggcctgcacctcacaatggaggcagctacggtggcaccacctacccaagctatggatactaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>ANMDGLVENFDADDLGEMPQNHYNEEQLIPYSDVSHPYNEEPDN MDNVEEGNPYIQQVSLYSEEPENQYNEEPSNPYQEESDNAYNGEVKQQDSLPVEADKK WPGWPGESVFRILIPAQKVGAIIGRKGEFIKKMCEESKARIKILDGPPGVPERTVMIS AKDEPDAPISPAMDGLFRVYKRITDGSDGDSGQPERNISNVGPTRLLVPASQAGSLIG KQGATIKSIQDSSKSIVRIVETLPLVALNDDRVVEIQGEPVGVQKALESIASHLRKFL VDRSVLPLFEGQMKMHNAQREQAMAAPQPWGPPQPWGPPPSHLPPGGPGYGGHPQFMP PRPQDNYYPPPDVPSMEKQPHYGISAYGREAPTGVSASGNQPPSHVASQVTHNMQIPL SYADAVIGAAGASISYIRRHSGATVTIQESRGAPGEMTVEIIGSASQVQTAQQLVQNF MAEAPQGPPPPASNPPAPAVDLSYGSYPPPYGASYGSAASGAGPAPHNGGSYGGTTYP SYGY</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>767..1233#3831..4077#4887..5035#5128..5412#5510..5704#8066..8260#aaaagaaacagagagatctcccgtctcgtcgtctcctccgctccttccgcctccccaacacgagtcgcgccgccgatctcagcaggggaggggaggggaggggatcctggtgaggtgagcatccacatcctcttcctgattcatctctctcccaccccaccgggactacgtttgtctggaatttgctcgcgtccgttcgttaaaccctagcttctcttgtagatctggaagaagctcttctcttaattccagagccttaaccttaatactagtaacactttgtttgtttgttcccccaaaagtttgggggttcaactgtcccaggttggatccgcccctgccccctagccaaatgttttttttttttaaaaaaaattcaaagtcttgggtgttcatgtgccttaaatttatcatcggagggagggagtagtatgactcattgaacgtaaatgccattataatagcatacatacctgctaagtattcaaggaagtcttatctcctctaggtatcaaggttacctgcccattcaagcgtttaaacatgggctggccactcattaaaactgctatgaagtacacaactgtagaagagaatagaattctatgtgtaacacctcagaagtaataaggagtaaggtccacagtgggttttgcctgtcatacattacatacatgtctccctgataaacttaaattttgtatcttccataaatttgatatagcttgtggtttcagtctgacattcttgtttttttcgtgaccagcaaatatggatggactggtagagaattttgacgcagatgatctcggcgaaatgcctcagaatcattataatgaagaacaactgatcccctacagcgatgtgtcacatccttacaacgaagaacccgataacatggacaacgtagaagaggggaacccatacattcagcaagtgagtttgtacagtgaagaaccagagaatcagtacaatgaggagccatcaaacccttatcaggaagagtcggataatgcatacaatggggaagtgaagcaacaggatagcttgccggtagaggctgataagaaatggcctggttggccaggagagagtgtttttcgtatactgatcccagcccagaaggtaggtgctatcattggccgcaaaggggagtttatcaaaaagatgtgtgaggagtctaaagctcgcataaaaatacttgatggcccgcctggtgtaccagaaagaacagtaagttctctatgaaataaaaaatcgactatactcatttgttcaagtagtagcaccatatttcttatgatgtcatggtcattatgcgctaggtttaggcatgtccatgcatgaagtcatgtttcgttaattgttgactgcaacactaaattttttagtatttttatgctctcatctggaactaatcagctatagacttcatgttataaatctagaattgggatgatttaccaacatagcagcaattcaagcacctcatttcttcatcttactctttatatttagggagccaaagccacaagtttggcatgctcgatggctcaaatctaaagttgggctgtagcgctgtttggtggttgtttgttgcaacctggagggctcattgtaacagggggatatactcataagaaaaatagttagttgagcactggaagttcccatgctgaaatttaaaatactttactgaagtcctgttgaacttgcatgaattgtaagatgcggttactgattagatatgtggttaaactatgcacttaccatagccttatatggtattaaaattacattacatacagctgtaatgtacacagaggtgcaaataatgaagaatttatttagtttagtattgccagtgaaaataatggaggattggctgtgtaattttcaggtagcttagctgaattccggtcttgggtgtacttacatgtacttatattacccttaaaatagtgaacagttggtttatcttctgtgagtaacaactgtataatctactattgcaccttgaggatgattttataatgctttaggggaagctggccatcttagttatagttaataagattaaaatcaagcttcaatcgtgaaacataattattatcccattcctagcattggctaagttcacatttgtgaatacatcaatacaaaaggagaaaatatatgtcccgatgaatgatcaatgattttctttccctgtacaacttaaaatatttagtgtttcaataaaacaacttaaaatattttcatgcaatgttagtggaaatcgctaaacaaatataactagtaaaaagtaatctcagagcatgcatggcgacaagtgcatttgtcttggtcacataaaacatagttgtgaaaaagaaagctaaaattttccatggcattgttgccatgatgtttatggtccacaatatcagatggtttatcaaacatctgatatatctgctgtaccattaattcattctccactgcactttttaagttgcaagacacctagctatgagtttcttcgctttctaaacattcatttagtatctaggtgtaaagtcaatatgatatcaaatattagctgaacaacgctcagaaagtgcaggaaagtaagctctgcgcacacattaataataacggctctaaaactaataagactagaagatcaaactccaaaattgactacctttcataatagtaacacaaattaatgtttacaggttgtgactgcagtctaaggccccaaatcaaatcaccattcccaaaacgatgaacagacatggttttgaaagttgggattcgtgcttctgtgctgcaaatatgatctagtattgagtattggatgaagattcttttcaagacatgccacatattatctggtaattctacgacctatttgatcttttgactgaaaggaaatcacaatcccaccattggcacaaagtaaaagaacaaaaaaatgcaatttaaaattggactggatgatgaattagatactaatttataacctgacacatgaaaatgaatacaggtttttggtattccttctggaattagctaaagttttgtactttcatgctatttaaattatgaactagggaagaaattaaattttaaatcacttgaaaaaagaacaaaaatatatttaatctttcatcatctggctttacgattggatgaataatataatatgaccagtgtaaaatagtaaggtgaacaataaccatgggatgttgaatttggtaaagaagcatagtgactaaaataaaaagtaatggcgagtctcttggttgtgaatactccttgaattccgtctatgttgattgtgctattcaatgttttgtgtttcttgtttctgtagtcattttagcatgatatgatctgttgctgcgggctgaactgctaatttgactgctataatatggattaatataaaataagctgatgtgggagattatatctgatgatattcagcacccacaattaggtccttatttaatcctagcgtaacaaatattgattgtttagtttatatgtggaaagattctttgcctaaatatgtgcagagaacactttcagctattgggcattgtgaagtttacctagaagaacctagttatggtactgacaacattttatcgctcatgtttcagtacagtagtatcagcatagcatatttcacctgttctggcgttcttgagttcatcttggtctgcgtattgtttctcataccattttccagtacatctactatttagctttgcctttgtaaagttttttttccccttttttacattaatgtggtgaacaatattctttcccattttaaggtaatgatttcagcaaaggatgagccagatgcacctatatctccagctatggacgggttatttagagtctataaacgaataactgatggttcagatggtgattctggtcaacctgaaagaaatattagtaatgtaggaccaacacgactgctagtaccagcttcccaagctggcagccttattgggaaacagggagcaaccattaaatccattcaagattcttcaaagtccattgttcgtattgttggtaaggttttccatatttttctagacattatatttctttctctttctcatatatcatacaatacatacattggatccttgaggttatattctctgtcttgctattcctacatagagggcatgggagggaacatattttttggactgtcatgaagagaaaaccagtgatacatcttttaatgccaattttaactgacacaccaaattacaaattcacgcttcttcaatatgcatataagcatattagatctccattgcttcatgccattgcagaatttggtctagcaagaataaattagagcaatgttctgagctgttagctggtttcctgtgaaatattgaaaaccatattcaggtttttctttgtaaatattgttgttcttttgaatgctaattaatatcagaggaaataatattgtttgtgatgctttggcacatgtcagtgtaaaagtcttattttatctgtgaaccgaatgccatgattgttttttctgttagttgctatggtttgggacctatgttttgcttatagctgaatataattatttttttatagagaattgtgagctctttaccattatgttttattcaattccaattgttattgttacaacatttggttgtattattataagtttgattgctgttggttgatcatctgtattggcatgctgttatagcatatggggaattcttaattgatacgtatattgcatgtgcatatgtgataaatatgcaaaaggtagtgttaattatcagtcttatgcttataaaaaaatattattatattattccatattttcttttcagagactttgcctcttgttgcactaaatgatgataga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