Os03g0651100

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os03g0651100

Description

Rhomboid-like protein family protein

Version

NM_001057325.1 GI:115454378 GeneID:4333592

Length

6944 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os03g0651100, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:26039748..26046691

Sequence Coding Region

26043765..26043822,26043924..26044007,26044097..26044129,26044960..26045263,26045762..26045927
,26046444..26046467

Expression

GEO Profiles:Os03g0651100

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008396:26039748..26046691 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atgcggcccaacgtcatcacggaggctgggatttcaactaggttgaatcagtggtggggcagcataccattcattacatccggtgttatcttgatatgtggagcgatttatctggtgtgcttgttgactggctatgactcctttgccgagatatgcttcttgccttctgtagtagcatcacgctttcaagtgtacaggttctatacatctgttgtatttcatggttctttgcttcatgtgctattcaacatgctggccttggtacccttgggcactgagttggaaagaattatgggatcagtccgtctcttgttcttgatgtttcttcttgctacgactaatgcgatttttcatctcatcattgctttcttggcggcttacaatccgctctatcctctccactttcttgtggatgaatgctccattggcttttctggagttatattctcaatgattgtcattgagacaagcctgagtggggtgcaaactcgaagtgtctttggcctcttcaatgttcctgcaaattggtatgcgtggattttgctggttctctttcagtttctggcaagcaatgtttcgttgctgggccacctgtgtggcatcttgtcaggatacttatgggctgttcaactacttgcttcctggaccatcattttattcttctattga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MRPNVITEAGISTRLNQWWGSIPFITSGVILICGAIYLVCLLTG YDSFAEICFLPSVVASRFQVYRFYTSVVFHGSLLHVLFNMLALVPLGTELERIMGSVR LLFLMFLLATTNAIFHLIIAFLAAYNPLYPLHFLVDECSIGFSGVIFSMIVIETSLSG VQTRSVFGLFNVPANWYAWILLVLFQFLASNVSLLGHLCGILSGYLWAVQLLASWTII LFFY</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>2870..2927#2685..2768#2563..2595#1429..1732#765..930#225..248#ggtagatttgacagatcgatccctcgaaccttcgctaagctaattccgcgcctactccacccgtcacgtgcctccgaagcaagcaacggctcgtttcgtttcctctcgcgctcgcccccaaaaccctcgagatctctgccctcactcgcgcaaacctcctcctcctccgaagcttcgatcccgacacgcctccgccgccgccgcccgccggaggcgagcccgagatgcggcccaacgtcatcacggaggtgcgaatttctcccggttccccaccccccaaatttccagttcctgcgcggttctccccgcgtcccatctccggatctgggcgccgctagcctcaaatcgctagggaattcgttggttcgaagcactcgtgatgttgtggagagggggaccccgggggatctaggtcttccggtgagagcttaggagccccgcgccaccatggtggtggtggtggggtagcgtggggggcttggtgttgtttttatgctgttagggtttgcgaggtgcgtggcggtttgaattgagctaggaatggggcgctttacatgttctggatgaaattatgctgtggctttgtgaggaggattgttttccctgggtttgctatgcttgtttattagctgcaaggtttataggaaattgatggggtagctcttggagcaggggctctgcagtacgtatttgatggagatgacattggtaaatgtgatggcttataatgtggtttatgtttgttattgtgaaatgtgatgcaggctgggatttcaactaggttgaatcagtggtggggcagcataccattcattacatccggtgttatcttgatatgtggagcgatttatctggtgtgcttgttgactggctatgactcctttgccgagatatgcttcttgccttctgtagtagcatcacgctttcaaggtctgtctcatgcttacctttccgtttcttttgcagagcataaatcaggattgcttttatgacactgaatatcaattttgttctgagagatgaatatatactttatgagcattcatattttgttagtgctcatatggtttaattgtactgtggcaagtctgaaaagtgtgaaagtcaaaatcacacccatggatttaatatgagaaaacaatctgttacatgacatgaattcattttccatttatatgctcttctgtaaatattaccttataaaatgttcgggagcacttaaaagaacaaaagaagactacaatagaattgcccctcttaaaaaaatatgaatactaaagaacctccagattgtgcatttctcaattcaaaatgtctgatgtgcatgttctatatctttagcttctttcttcccacctgtgaatactatctcatatttttgtttttctttgggatatctagaactaatatagtttgtatctacttcagtgtacaggttctatacatctgttgtatttcatggttctttgcttcatgtgctattcaacatgctggccttggtacccttgggcactgagttggaaagaattatgggatcagtccgtctcttgttcttgatgtttcttcttgctacgactaatgcgatttttcatctcatcattgctttcttggcggcttacaatccgctctatcctctccactttcttgtggatgaatgctccattggcttttctggagttatattctcaatgattgtcattgagacaagcctgagtggggtgcaaactcgaaggtgcattgcttcttgatgctaattgtacattttactcattttgatgaatgattattcatatgatatttgatacttcattttatgtaaatttggagggaacgagtatacacctctatgttgaaaatgcttgcatttcataacgtttttattcatgcataaaataaatgtttaacctgttttccgaagtgttgaaatttgataacatgttgtatgataatgtcgtagcactatttggctagtttagacatgcatatgcttagttcagcattgtatttagcaacgtctgttgcttttttatttgccagctgtgactaagccaggagaattactctgttacaagggacatatctactgctaactcatatattagatcattagatggaattatgcattcaccaacatgaactgtttggcaagggatagatggatcacatcttatgggtttagttagagaagatgggaacacaaacatacaattttgtacattggggatttggatggtttattcataaaaatgctcatttgagtctctgatatccataaacctgatcatgactgcactcaaatgcgaatttgcactattatttcgagcaaatccttctcttgtcttttctcaccattgatacaatggcaagaaccttttttttttttaaaaaaaaactagtatctaggaaggtttaattcagaatttctggaagtttagaaagaatttatcctttttcctacttgtatgtccattaatggtctttattgttttttcaacttactgaaagttattagttctttctatttttatacaatgacatttttccttgatgtcttattcacagtgtctttggcctcttcaatgttcctgcaaattggtaatcgctctatgcatctatttttgttctcaatttcttatttattggatagtcttacaaagaaatgtttcaaatgtgcacaatatcaggtatgcgtggattttgctggttctctttcagtttctggcaagcaatgtttcgttgctgggccacctgtgtggcatcttgtcagggtttgcatgtttgtcccttttacccattatttatgaagccttaatgaactgcattagttattatcatattccttgctaatcattattgttatttccatcagatacttatgggctgttcaactacttgcttcctggaccatcattttattcttctattgagggcttgtcagtgctagtaagttttgaacaatgatttaagttgtcttgttatgtcattgttcatgtaacttagggagatgcttcttctatgatgcttattctcttgagatattggatatcagtctgtttgtgtaaggcgtcctggcttcattctgtgtactggagggactacatatggccagcttcctacattttctaacacatctactgcaccaaggtattttagatattatttccatattgatattgatttcaatttattcataggactaatgtattaaatccttgatttgcagcgctctgattaatgcaaatttcttaagaaatatttcttcatggataccaagcaggcagacaaccaccactcaggggaatactcaggtgaatataaagaaatcatggatgccttttattgttttactgtactcatctttgcaagtataaattttctgttgatgtactgatgacatgggcagaggacaaaaaatgtagcagtaattgattttgttgtgaattttgtacaacatgattcagatgtgtattcctttttgatagaaacactagttacagttgttagtacatggattcttaaaagatgatttcaaaggttatagttgtatactagtagctctgttcctactttcatagactgcattttggttctcgatcaattatgttttttgaaacctctatcctggtttttcgggtagttgactttatcccctttatgatagttcaattcaagtttatagcagttctcttttgttttgtttgtgcacactggggtgatgctcttccaagaaaatatatgtgcctaagctcactggattgtttgttttcatttgctcaatactttgcatggatctgaacattatatcccagaaatatgtgttgagatgaacaccatactgaatattctcttataggaacaagatcccaggtttccagggagagcacggacacttagttctgctggaactgaaccaactgcaagggaggcaagtgcaaatttgcatgctagcttgttggatagcacaactccaagtgatccgcttacgagttcacagtaatgcattttctacttggcatttctttaatacggtagacatctggtgaatatcacctatgcattggaaccagaagctcatatgaagcctgaataacttgaatatacaaaacgatcttttctaaaacagtacttaatagtttaaataaataattggtttggtcattggtactccatagcattttgttggagcaccttctgttgtgttctttttctatatcagactaaacattttgttagctctaattagcatttaccaagttctgtttctttagtcagtttgaatgtttgcattatgcaattagcactattcgtcccagtaataagtccctgttcaattagttagtaaaatgatatgttttgcaaaggtaagctcaaagttttgaaattccgcactacacaggtgagaactgagcagtgctcaagtgatccttgcttggctagtgcaccacctcaagttctgctcaatggaagctacccaaattgagcttggttcagatgcattcatggttgatttatcattaataggctaatcttgctatacgaaattgtaattcttgaaatagtgtacttaaaatcaaactccataaatctcgccgcaaacttgcagtatccaaagaagagtatgatataaaaggtggagataccaaaaaaataagcttatgatgactcaaatttgcatgcaaatgatttccaagaccccagatcgtgccaattggtaccctcaattcaggattgttgttagggctcataataggaacagttggtattcatttctggttataatcttttagaatatattggctttgattttgaactcaaggcagacttgggatatgcacactttccttttgagttgagttaatttcgagcatatcaagagaagcgcataaactttgacttcttgcccacaaacatgagtcatctaaca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External Link(s)

NCBI Gene:Os03g0651100, RefSeq:Os03g0651100