Os03g0652100

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Structured Information

Gene Name	Os03g0652100
Description	CCR4-NOT complex, subunits 3 and 5 family protein
Version	NM_001057330.1 GI:115454388 GeneID:4333598
Length	10607 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os03g0652100, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 3
Location	Chromosome 3:26094677..26105283
Sequence Coding Region	26094705..26094795,26094969..26095102,26097006..26097122,26098582..26098632,26099053..26099142 ,26099245..26099391,26099499..26099609,26099698..26099766,26100168..26100908 ,26101231..26101395,26101767..26101833,26101971..26102095,26104105..26104374 ,26104456..26104590,26104707..26104888,26105060..26105135
Expression	GEO Profiles:Os03g0652100
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008396:26094677..26105283 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008396:26094677..26105283 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atgggcgccagccggaagctgcagggcgagatcgaccgcgtcctcaagaaggtccaggagggcgtcgacgtcttcgacagcatctggaacaaggtctacgacaccgagaatgcgaaccagaaggagaagttcgaggccgacctcaagaaggagatcaagaagctgcagcggtacagggaccagatcaagacgtggatccagtccagcgagatcaaggacaagaaggctcttatggatgcccgaaagcagattgaacgcgagatggaacgatttaaggtttgtgagaaggaaactaaaacgaaggccttttccaaggaagggttaggtcaacaaccgaaaactgatccaaaagagaaggcaaaagctgaaacaagagattggcttaacaatgtggttagtgatttggaaaaccaaatcgataacttcgaagctgaggttgaaggactttcaattaagaaaggaaagcaaagacctcctcgattggtacatttagagaaatctatcacacggcataaagctcacataaagaaattggagtcaatattaagacttttggataatgatgagttgagtcctgagcaagttaatgatgtgaaagatttcctggatgactatgttgaacgtaaccaggaagattttgatgaatttagtgatgtggaagagctctatagcacattacctatggagaaggttgaagcactagaagacatggtttcacttgccccttccagtcttgtcaagggtgttgcttctgtttctactactgcagttttgagtacgaagagttctgtagcaacttcacctactcaggctactgtatcagcagctccttcgctaagtgtatcacaagatcaagcagaggaaacggcttcacaagaaagcaatcctgaatcggcaccacagacaccaccttcaaaagttggaagtcaaccttcagtgccagtcgtgccgactaccatcagtactagtaccgctgctgtctctgtttcagctgaaaccattagttcccctgtacgcccaattgttcctaccacaacagctgcagtacttcctgcttctgtcactgctcgaagtgctccagagaacataccagctgttacttcagctcctgcgaactcatctagtaccttgaaggatgatgacaacatgagctttccttcacgtagatcatcacctgcagtcaccgaaattggccttggcaggggtattactcgtggattaactagtcagggattaggttcagctccaataagtataggtccagtatcagggaatggatcagttagtgcacttactgacttgtccaaaagaaacatgttgaatactgatgagaggattaacagtggtggtatttctcagcagttgatttcaccacttggtaataaagctcaacctcagcaggttctgaggactactgatacaattagctctgattctagtaacacaaatgagagtactgttcttggaggaagaatcttttctcccccagttgtttctggggttcaatggaggcctcaaaacactgctggtttgcaaaatcaaagtgaagcgggccaattttgtggaagacctgaaatttctgcagatcaaagggagaagtacctgcaaagattgcagcaagtacaacaacaaggcagccttcttaatgtttctcatataacgggcataagtcagaagcaatttccatcacaacaaccaaacccgctcttacaacagtttaactctcagagttcctctatttcctcccaagcgggtattgggcttgggcaggtacaagtaccagaatctgggcatacaaaaagtgaggaacaacaacaaagttttgcagaagatgttagtgtggaatccgttgcaacagctggagcaaacaaacacatgagtgaagatgatacaaagattccattttcgaatccgtcagcatccataacagaaggtactcaactatctagagaccctgatctaccagctgggcagcctttgcaacctggcatgtcatcatctggtgttggtgttatcggccggaggagtgtatctgatcttggtgcaattggtgataacctcagtgtagcttctgcaagtactagtcatgatctgctttataatctgcaaatgcttgaagctgctttccataggcttccacaaccaaaggactcggagcgagtcaaaaattatattccgaagcaccctgcagtcacccctgccagcttcccgcaaattcaggcacctgtagtatcaaatcctgccttttgggaaagaatgggtggcgattcattatctacggatttgttgttctttgctttctactatcagcaaaacacataccagcaatttttaagtgccagagaactaaagaagcaatcgtggagatttcacagaaagtacaatacttggttccaacggcacgtggagccacaagttacaactgatgagtatgagcggggatcttatgtgtactttgatttccatgtcatagatgacggcacaggatcaggatggtgtcagagaatcaagaacgacttcacatttgagtacaacttccttgaggatgagctgtcagtacagacaaattag</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MGASRKLQGEIDRVLKKVQEGVDVFDSIWNKVYDTENANQKEKF EADLKKEIKKLQRYRDQIKTWIQSSEIKDKKALMDARKQIEREMERFKVCEKETKTKA FSKEGLGQQPKTDPKEKAKAETRDWLNNVVSDLENQIDNFEAEVEGLSIKKGKQRPPR LVHLEKSITRHKAHIKKLESILRLLDNDELSPEQVNDVKDFLDDYVERNQEDFDEFSD VEELYSTLPMEKVEALEDMVSLAPSSLVKGVASVSTTAVLSTKSSVATSPTQATVSAA PSLSVSQDQAEETASQESNPESAPQTPPSKVGSQPSVPVVPTTISTSTAAVSVSAETI SSPVRPIVPTTTAAVLPASVTARSAPENIPAVTSAPANSSSTLKDDDNMSFPSRRSSP AVTEIGLGRGITRGLTSQGLGSAPISIGPVSGNGSVSALTDLSKRNMLNTDERINSGG ISQQLISPLGNKAQPQQVLRTTDTISSDSSNTNESTVLGGRIFSPPVVSGVQWRPQNT AGLQNQSEAGQFCGRPEISADQREKYLQRLQQVQQQGSLLNVSHITGISQKQFPSQQP NPLLQQFNSQSSSISSQAGIGLGQVQVPESGHTKSEEQQQSFAEDVSVESVATAGANK HMSEDDTKIPFSNPSASITEGTQLSRDPDLPAGQPLQPGMSSSGVGVIGRRSVSDLGA IGDNLSVASASTSHDLLYNLQMLEAAFHRLPQPKDSERVKNYIPKHPAVTPASFPQIQ APVVSNPAFWERMGGDSLSTDLLFFAFYYQQNTYQQFLSARELKKQSWRFHRKYNTWF QRHVEPQVTTDEYERGSYVYFDFHVIDDGTGSGWCQRIKNDFTFEYNFLEDELSVQTN </aaseq>
Gene Sequence	<dnaseqindica>29..119#293..426#2330..2446#3906..3956#4377..4466#4569..4715#4823..4933#5022..5090#5492..6232#6555..6719#7091..7157#7295..7419#9429..9698#9780..9914#10031..10212#10384..10459#ccggcaacctcccccccgcggggcagccatgggcgccagccggaagctgcagggcgagatcgaccgcgtcctcaagaaggtccaggagggcgtcgacgtcttcgacagcatctggaacaaggcactcccccactttccccctccccacggcggcccgacccccccccccctccctcgttttctcctccgtcgaattcgtctccccctcctgatgctgctttcggagaggttttggtttgtccctctgagattttgtttttttgtttcgctgctgcggcggtggggcttgtacaggtctacgacaccgagaatgcgaaccagaaggagaagttcgaggccgacctcaagaaggagatcaagaagctgcagcggtacagggaccagatcaagacgtggatccagtccagcgagatcaaggacaagaaggtgagccctcttaacttcttagccgtagccggtagcttctctttagctccaggggatgcggttcatggtgcaatgcactgcctcctgtgcttagaattatgtatgttctgctgttctgtccagttaattgtacggagaaactgatgattttagaagaaactccattaagttacgccatacgtgcagtgattagttttgttgagtgaagacttatatgcttgctgattggtcagtacaaacactgatctgggaatgctctttattttacctgattcagttaacagaactctaggtgcctatcagctttcctagcgagttatgtattatacattatgtggtctgcggggagtgcgtgaaaatatatttgaggttactgttggtatgcaacgccttttctcttttcgtgtttatgctgttagtagctgcattgttgtgtagcttcaatctcgatgtgatgctattgccactaagatgggatgctgattttgtggtttgtaggcttttcttttcttgttgtgacaaggaaatccattcttaagtaagttttcagtagatgtttgtaagcctgttgtgatgctaaattatttggcagaattatgaatagtttttggggataggttagtaaagatgatgagaactgagatccacttttcaatactatccatggttgacatttgtatccatatttactgtggtgtttctaaatctcaattaagagtgagtatagaacattcctgataattctgaatgatgatgtagttatagttggctcttattggctcactgcggcattcatacttttggtaactaattttaaaatgttttcagttgcattttatggaactacataaaacatatctgtacttaaagtatgtaactgcagcattagttgcagtagggaagtaaagaggaatctggatgatgtattagatgctgttaatcaggagatccagtagatgaacgactctggtacaacagagcattttggaaattatttttggtcttcagcccaaaacatggcttatatggcagtctggtgacacagttttcaacttatgctgcaattgttatatgactgaaatacttgatcaaggcgtgcaacctactgtattgagaagatattttgttttaaggcatcctcttcacttagactactgtttgttgcagtatgtctcaaatcaatctgtacagatggccaccggaatttcagaatttacctgaaggccatgctaaacttcaaggtcacacaagcttagggacaaattcactgaatctattgcatattgattctccttgaagctctttttgttgcttattttccttgtaaattatttttgaaggtttttgtttgtaaaccagatgcactgttatttcaataagtccatttttttcattcttaataagtagtccctctgtcccaaagtgtagttacctttaccattcaaaatttgccccaatcacaaccatttcccatttaatttctccacctatttcctcatctcaaccaatcacaacaatcccttgttttatttaacttttctccttaatactagtgcctgactctaaaagttcttacattttgggggcggagggagtatttgcttcatcttgctgttggtacttgttaaccttggttaaccattctaattatgaatactacgaaacatattttaccatgaacatatgggagtgttccaataaagaaatggagcaggattcacgattatagttttaaaagcagtattctgttcttcccctctgaatttcttcttcaatcatgttttttttttgtatgatatattttgccgttgcaaatgacttttttgttaacattacttactgttctgggtttaacccatttataatatatgtgttgacataggttagtgcctcttatgagcaggctcttatggatgcccgaaagcagattgaacgcgagatggaacgatttaaggtttgtgagaaggaaactaaaacgaaggccttttccaaggaagggttaggtcaacaaccgaaaactgtaagaacttgccctcctctgtttgcatcatacttttcctggttttggttgtaactaatttgaattgttatttaaacgctttgttcgcaagaggtgaaggctgaaggttctgattataaattcttgctgcattatgcttgttgtaatcttgtaacggagtgttcagattttgtgctaactctatctttatgtgataggcattcgtcgtcttagaatattcaaactttgaaagcaacttaagttaaaactagctgttgctatgatttttaaaacaatactattgtacgaaataagatgtccaaaatccaactaatgccattgtgaattcgagatggttatctagctggtaattggcacttccctagcagatgccacacaacggcaagttttagttttcattttgcacaacatgcctacgaccataactccgtttccatcttccgggatggattgatccattggctcagtcagctgatggcctgttagccatgaccctgtgggaaagctgcagcccacactagtgggctatggttagaccactgctcaactgcctgctcattcatgatatgtttcctcttcccctctgcttccttccttactgctctccaatctgccaaacaccccagcaacaacaactcaatccactactggtgactgcacagatcttacttgctgcatggatgctgggttaaggcgagcttgatgaggtgcatggcacaaaaggtggaagagatatcgatggtagtgctagaggatgggctcatgagggtggcacagggtgttgaaaatgcggtgccgtgttgaggggcagttgtgcttgcgcagggtttaactgcaccatcaagagcttgccgctgttgctgaactgtcactaccgtctgccagcagtatcagccttcaggttgggtagtacaagcgtgattgagtggatttctgctataattttggggatttggtgaagggagaaggtgacattaggtcgctgacacttggtcccgcacatcaggttgttattggtggtggcagactcacaacaccagtaccaccccccttctatctaaacgagtaaagataaatcgaagcctgaggctctgaactgattgttcataaccttcattggaattacaatgatgctactgacgtcttttagaaagtaaatttatctcaagctattaatttactccaaaaactaggagatgcagtgaccatttggctgttgggaaaatttatggtttttttaaaaaaatatccaacttagatttgagcttgtattttgtatctggtccaagtttccattgcgagccttgtctgcttagttatggccttatttcttaattttacacagcagtcttagaaagtgagtcttgatttatcaattatcttttttgtcagtttctgtgtatgttgcaggattttgcagctcccctttagtctaatggtttattttcaatttgtgcaggatccaaaagagaaggcaaaagctgaaacaagagattggcttaacaatgtggtatgttagaaacataatctgtatgctctgtctcgtgcgtgtatgtcttcacgcccttccaatattctgtaaatcattctgaagcaaagaacaggtttgcaaaatacggtgtattttgcgttttgacagttctcattgtcatgagttgttagggcctaaagacatagttgatttttttttccagaagacatggggttctttagatacaatctctcagcagctgtcatccttgattataaatattttctttgatctgatcactgttatcaattgcattatctttgatttgataacttttattgagaagttgactgtattaccatgttatttgtgatgacttctgcttataacatttatacttttttcctttgttgtacatgcacgtgacatatctaattatattctttatcttgtttacaggttagtgatttggaaaaccaaatcgataacttcgaagctgaggttgaaggactttcaattaagaaaggaaagcaaagacctcctcgattggtatgatcaattgagtcagagtgcaaaccgatcatttttgcgtgtttgtgagaaatatttccaataatatctagaatagaggaagtaactttgcatcatcaggtacatttagagaaatctatcacacggcataaagctcacataaagaaattggagtcaatattaagacttttggataatgatgagttgagtcctgagcaagttaatgatgtgaaagatttcctggatgactatgttgaacgtaaccaggtgtggctgtattcctatttatttgtgtcaatattttcatccgatttagtttattgctatgttcgcagaacacattcttattatgtc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External Link(s)	NCBI Gene:Os03g0652100, RefSeq:Os03g0652100