Os03g0654500

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os03g0654500

Description

Conserved hypothetical protein

Version

NM_001057332.1 GI:115454392 GeneID:4333603

Length

5052 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os03g0654500, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:26272516..26277567

Sequence Coding Region

26272837..26273153,26273391..26273551,26273630..26273727,26273853..26274014,26275098..26275190
,26275300..26275362,26275940..26276085,26276195..26276352,26276424..26276616
,26277256..26277484

Expression

GEO Profiles:Os03g0654500

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008396:26272516..26277567 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggcccccgccgccgaagtctcctcgtcgtcggcggagaccaccggctcctccgccggtagcgcgccctcgaccgccgccgccgccgccacctccacctcccattcgtcgtaccggcgcacggctcccccgctcctgctcctagcctcgctcgccgcgctcctcatcatctccaccggcgatgacaccgcggccttcgattccgccgccgtggggcggtccatcaaagatgttagtctggaaaatccagaggtgacttttgttccttcatccctgggtggacagttttgcgagcgagttcgcttgtctggaataccgaagttacatattggaagctatgcaaatcaaatacgagtcaaaatgaatgtttcccaatcaatgcctgaaaagttccattggaaaatagaaatttgctttcatgggaatgcttctatgggattatgccaatgtgagacaggtgaatggcaaaatttgcaaaatggcatgtggaatgctgtaaagtctccatatggaaacaaatatgttgatgttaaagtggctgataagacatctactaggttcagtatttccattcaagaagagtttcagaaatggcgtctagcttgcctcggtattggatttattctgctattcctatcacccattgttagcaaatgggcgcctttttactatagcagttctatggctcttggggtcctgcttgttgttctgattgtccttttccaggggatgaaattgttaccaatgggcaggaaaagtttattttacctcacaatttatggatctgtggtaggggttggctcctatgctgtacattatttctccacattggttgcttctattctggaaaattttggtttgagtgaagagatgcacaaccctgtatcaatcttcctgctggtagcaattgtcttgactggcgctggttttggttattggatggtcagaagattcatcctttcaaaagatggtagtgttgatgctgggatagcacagtttgtgaagtgggctatgcgtgttgttgctatatgctttgttatgcagagcacacttgatcctcttctagcgttattcgcgctggccgctagttggtggatttgttctgtgttcacagcatatagagctccaaagtcaatgacactgaagcaaaagcaatcaaaggcttctactcagccaatgtataataaaggatcacctaaccctcgccaaatccaattcttaagcccatccaagagggatattggaagaaccacatcaaacagttcagccacacagtatggctggagcaatttagccaatggaggactggtgtctccaacacttacaaagagggtggtacccgataatcaagatgaagaccactactccaccttccacaatatccaaccaaggaaatattcaaaggaagaatgggatgacttcacccagaaatccaccagaaaggcacttatggagtgcacggcaaccccagagtttgctagatgggttgctgataatgctcaccggctacgagtagagcagcaagatgacgcctcggaggacgagctcatcgagagttcctcaaattcatccgaagaaacagcacaggaagctgataccgggctgttcaggtggtattga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAPAAEVSSSSAETTGSSAGSAPSTAAAAATSTSHSSYRRTAPP LLLLASLAALLIISTGDDTAAFDSAAVGRSIKDVSLENPEVTFVPSSLGGQFCERVRL SGIPKLHIGSYANQIRVKMNVSQSMPEKFHWKIEICFHGNASMGLCQCETGEWQNLQN GMWNAVKSPYGNKYVDVKVADKTSTRFSISIQEEFQKWRLACLGIGFILLFLSPIVSK WAPFYYSSSMALGVLLVVLIVLFQGMKLLPMGRKSLFYLTIYGSVVGVGSYAVHYFST LVASILENFGLSEEMHNPVSIFLLVAIVLTGAGFGYWMVRRFILSKDGSVDAGIAQFV KWAMRVVAICFVMQSTLDPLLALFALAASWWICSVFTAYRAPKSMTLKQKQSKASTQP MYNKGSPNPRQIQFLSPSKRDIGRTTSNSSATQYGWSNLANGGLVSPTLTKRVVPDNQ DEDHYSTFHNIQPRKYSKEEWDDFTQKSTRKALMECTATPEFARWVADNAHRLRVEQQ DDASEDELIESSSNSSEETAQEADTGLFRWY</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>4415..4731#4017..4177#3841..3938#3554..3715#2378..2470#2206..2268#1483..1628#1216..1373#952..1144#84..312#atcagataataatagcaataaaacaaaaaaaaaagaagaagaagagtcgcttgaatttgcagcgtcgccgccgcccgcgcgagatggcccccgccgccgaagtctcctcgtcgtcggcggagaccaccggctcctccgccggtagcgcgccctcgaccgccgccgccgccgccacctccacctcccattcgtcgtaccggcgcacggctcccccgctcctgctcctagcctcgctcgccgcgctcctcatcatctccaccggcgatgacaccgcggccttcgattccgccgccgtggggcggtccatcaaaggtataatcgtgcccgctgtttggtgcaccatgggccggatttgggactgctgctgcgtttgcacggggatcgtagcgccgttctatctagggtttaggggcctttggggtggtttggggttttcgctgtaagatgcgtctggtagctgcttcatattttaggttttcatggggcttagttatagaatagggttttggagttggtttgtggaggggtgattggaaagttgcaactcttttgtcgcgaataaatctgcagtaacatgcctctccttttacttcagaaccaatgcatttttgataatgtctcaaaatttgttttgtattcagtggtttcggccttggctgaaggataagtattgtcattttgaagtatacagatggatgatttttacctgaataacatctcttaatagctagaccgtacccactttgttccgattcacctgtgtgtttggtatgagcttcttttcatgtatagcccttttacttacatgttccttttagcacaacacttggatttttgtatgataatccccttgtaggtttgcctatatggttccaatgtcctattattattatttttttgtgttccaatgtcttctacctaacatgctggtctaattgattacttccgcagatgttagtctggaaaatccagaggtgacttttgttccttcatccctgggtggacagttttgcgagcgagttcgcttgtctggaataccgaagttacatattggaagctatgcaaatcaaatacgagtcaaaatgaatgtttcccaatcaatgcctgaaaagttccattggaaaatagaaatttgctttcatgggtaagtcatactgtccaaagtgtaaatatacacatgcttcgggaaagaaatgagtcaattttcctttgcaggaatgcttctatgggattatgccaatgtgagacaggtgaatggcaaaatttgcaaaatggcatgtggaatgctgtaaagtctccatatggaaacaaatatgttgatgttaaagtggctgataagacatctactaggttcagtatttccattcaagaaggtgtgtattattcatgaacctaatatttgttctaccagtcatacaatcaagagcatctatgtccattccttccctataattactgttcttgttctgtgtatttatgcagagtttcagaaatggcgtctagcttgcctcggtattggatttattctgctattcctatcacccattgttagcaaatgggcgcctttttactatagcagttctatggctcttggggtcctgcttgttgttctgattgtccttttccaggtattctcaatcaaataattttgtatgtttctttttatcattgttggtatagacacttcgtattgtggctggccagcagcaactgcctaaatagttcctagacaggctaggtgcttgctaagggaacaccaacttactgttcaataaagactcatattgaaagacatgaaaatacaacattgttaagttaactggctgcattttgttattggggcacttccaccaagtttattattaaggagtaatatacattgttaacttactgcatttcgctaaaacacctcactcttgagtttattcataatattttcaagtctaaacttagatctcttgctctaattagcgaagatagttttatttttctcttagtttcctgtaaaatagagcatgaagcaactctaaattctgtgacaagaccaagaagtaataacattttcttttgataaggaacgatcagtgactcaattttaacaagtattttattttgcttatggaaaaatgtgttctatcaaattgattgatggtctgtcctggcgaaaaaaaattgattgatggtctgacctatttttcgttataggggatgaaattgttaccaatgggcaggaaaagtttattttacctcacaatttatggatctgtggtaagttacctatgcccacaacttcctggtattaattttattgatatactcttcaggaaattgcaattaattcttcttacatgtttatcattactattctgatgttcaggtaggggttggctcctatgctgtacattatttctccacattggttgcttctattctggaaaattttggtttgagtgaagagatgcacaaccctgtaagtcattcctcttgaatgtgtcaatgatatcaattaactgatccgtttattacttgacatagtatatttgcttgctatctgcttgcttataatttctgttccatagggcacaaagcacatcatctgttgttaagttgtaatgactaataaaccacttcagaaaaatatgaatttgaaaaatgaattatagaaataataatgcatttgtattaaagctaaagtaaagtgttcttggttctttattttacttttgtcctgtctaagctgaattgtaactaccagtaaagtttattttgtgttttcctgttcattttggtgttcatactttatccttattttctccagtagtaaattgacttgaaacctctctctaaattgtcccctaagatttgattcaaacagtgccctattgaatgattcaatagtaagtgttgggactaacatgagatgactacaaactataaaagtaatcaataataatgcgtgatttttctagggtaggaaatcatacggtagcatagttattaatgttgggttggaacatcagtaatttgatttacagggcagggcttatattttgtgaaaagacgctgatttcaagttctactgctcagattcagtgttatctggacactgacacgtgtcaggttctgtctcggatttccatgtccaattcgttttttaaaaaaattggatgtgcgaaatactacctggaatccaccacaggtggagtccaatttcggactctgggattttttctccttgttattgatgttttgatgctaaaaaagctactatatgtgcaaaagcataatataaattacaattattattttttgtctacatatggaattgtatatctttattttcatctatgcatggtaggcctgcttgtttacttatttagcatatgcatgtgataccattatgcacaatataattgaatatctattttcagtagttaacacataattttgtgatccctcgcttcttgttgcatgaacaatggaatctattatgttacatgcgtgtttgtttacattgtgccacctaatgtaatgagttaaaactggattacaggtatcaatcttcctgctggtagcaattgtcttgactggcgctggttttggttattggatggtcagaagattcatcctttcaaaagatggtagtgttgatgctgggatagcacagtttgtgaagtgggctatgcgtgttgttgctatatgctttgttatgcaggtgtggtttatttttacatatctttggcattttcttggtttctgagccgtggttactaaatctgccagattttattatcttgtttagttccctaagaacatgtctggtatgtatttattttgcagagcacacttgatcctcttctagcgttattcgcgctggccgctagttggtggatttgttctgtgttcacagcatatagagctccaaagtcaatgacactgtgagtcccttcagctatctctggtctgtgtgcacgttcactgtcattgaagtcctcaacatgctgattctgctgcaggaagcaaaagcaatcaaaggcttctactcagccaatgtataataaaggatcacctaaccctcgccaaatccaattcttaagcccatccaagagggatattggaagaaccacatcaaacagttcagccacacagtatggctggagcaatttagccaatggaggtaacataactgctactgttgtatgccttcctggaaatgattttttggggctggtctgtaccccctatagtgaactgtcagtaagaatattaacacatttgaacttttgaagtgctgttttaatttttgtctgtgtgttgtactagaatggtgctcttttaagcatgattaacttgagtatctttaaaagcatcgtatttgtagcatttgaaattggctttctactggtttttgcaggactggtgtctccaacacttacaaagagggtggtacccgataatcaagatgaagaccactactccaccttccacaatatccaaccaaggaaatattcaaaggaagaatgggatgacttcacccagaaatccaccagaaaggcacttatggagtgcacggcaaccccagagtttgctagatgggttgctgataatgctcaccggctacgagtagagcagcaagatgacgcctcggaggacgagctcatcgagagttcctcaaattcatccgaagaaacagcacaggaagctgataccgggctgttcaggtggtattgatcttggcatgctaagaggctatgccgaattgctgatgctgtgcacgctctgtagaagtaggaggcagtaagaaagctagttagcagtagggttagcatttctattatttccactattgttcccacggttcatgcttcttggtgactgtagttagttagcgatctcaagttaactaatggtagatttagcttagttcgtaacgggccatggatcggtagttagctagttgcctagagttgatcgacttaccagagggctcgaacttgtgtaaatgcagtctattcgatccatcataattgataaatcaatcctgttggaacg</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os03g0654500, RefSeq:Os03g0654500