Os03g0659900
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Structured Information
| Gene Name |
Os03g0659900 |
|---|---|
| Description |
Similar to S3 self-incompatibility locus-linked pollen 3.15 protein |
| Version |
NM_001057357.1 GI:115454442 GeneID:4333629 |
| Length |
7502 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os03g0659900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:26611056..26618557 |
| Sequence Coding Region |
26611534..26611995,26612340..26612416,26612512..26612603,26612901..26613007,26613116..26613201 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008396:26611056..26618557 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggatccggagcagacgttcctgcgggtgcacgcgcggctgtccgggatgctgtcgcagctgctcacgccgcggatccgcctcgcgctcgagtacctctacctcgccggcgccgtcgcgctcttctgcctgctcgtcgtcatgcacaccaacttcgtgcagcagcctggctgttcaagcgagttttctgggattgaatttggtgaagcgcaacttgtccaaatcaagataatcagtggtggactatgggtcagcaaaggtgcatcctacattatggatcttcagaacctggggcgttcagctgagaaaattctagaggttaatggtgataggttcaatattttggcatctaagttttggtcaacttgggttggtcctggagctagaaggagcaaaattatgttcagaacttggaagggagacaaggaatttgaaccacaaccagagaatgcagctgacacagctattaccgcaaccacttcaggagtatcggattcgaagacaactgtggagggttctgcataccatccattatccgcaaaagaatcatttaaagcagcagttatgtatttattcagaaagtggtactttcgtgttgtctcgttctggaggaatataaaacaactttcagataatacttttcaattaatgttcagatcaaactggaatgacttcctccataccatcaagggtattcaattaccaagcgtggatcatcttgtttcaacaatagtacagtggtttgagagacgaagcaaagcatttgaacctacctatttatatggtgtggagaagggatatttcttgctttcagaaggggccaaagttcgtcatggtgttcggactataaatatcacaatttctgctcgaaatccttgctttggaaataggtggcaacagcttttaataaacagcattgttggctatgacactatacttacaaacagcttagtgaactcccctggtcatggctatttatacaactttcaaacaaaggagctttatgatctcagttacggacatgaaccaccagcaggtccaacaagatttggagattattttgtgacgaaatgtggtgtacttttaatgtcactctttgtttttttcacaaccaccatgtctgtttcatttaccctgagagagacgcaatcccgcatgcttaggttcacagtgcagcttcaacatcatgcacgccaccaactccccacatttcaactgatatttgtccatgttatcgaatcattggtttttgttccgataatgattgggatcctcttttttctatttgagttctatgatgatcagttgcttgcatttctagttttgactcttgtatggttgtgtgagctatttacgatgatcagtgtgaggacatctatatcaatgcagttcttcccgcgctttttcttgctgtatttcttggttttccacatttacttcttctcgtacacatatggcttctcctacctggccttttctgccaccgcggcgttcatgcaacatctaattttatatttttggaaccgcttcgaggtgccagcccttcagagattcattagaagccgagctcaccttcaccaacaaacgggtgttcagatcacatcctcaaccatctatacatcaacattacatatagcaagggtaaatatgagggaccctggcgcaatgaatgagggccttggtgctgctcgtgaagcagatgccctgctggttccggatgagcctaacaggaaccaacaagagggtcaaccaattgaaaatgcagagttagtggccaacaatcctctgcactatcaagatcaaaaccctcagcaacctggcaatgctccggcaggctctggctccttgaatccatttggttcccttttattgtggttgctaggaggcggagcttctgatggcatagtatctttcttctctatgtttagagatgtccgtgatcatggtcaagattacactgatccacctcgaaatgaaaatggtcaggtaacatag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDPEQTFLRVHARLSGMLSQLLTPRIRLALEYLYLAGAVALFCL LVVMHTNFVQQPGCSSEFSGIEFGEAQLVQIKIISGGLWVSKGASYIMDLQNLGRSAE KILEVNGDRFNILASKFWSTWVGPGARRSKIMFRTWKGDKEFEPQPENAADTAITATT SGVSDSKTTVEGSAYHPLSAKESFKAAVMYLFRKWYFRVVSFWRNIKQLSDNTFQLMF RSNWNDFLHTIKGIQLPSVDHLVSTIVQWFERRSKAFEPTYLYGVEKGYFLLSEGAKV RHGVRTINITISARNPCFGNRWQQLLINSIVGYDTILTNSLVNSPGHGYLYNFQTKEL YDLSYGHEPPAGPTRFGDYFVTKCGVLLMSLFVFFTTTMSVSFTLRETQSRMLRFTVQ LQHHARHQLPTFQLIFVHVIESLVFVPIMIGILFFLFEFYDDQLLAFLVLTLVWLCEL FTMISVRTSISMQFFPRFFLLYFLVFHIYFFSYTYGFSYLAFSATAAFMQHLILYFWN RFEVPALQRFIRSRAHLHQQTGVQITSSTIYTSTLHIARVNMRDPGAMNEGLGAAREA DALLVPDEPNRNQQEGQPIENAELVANNPLHYQDQNPQQPGNAPAGSGSLNPFGSLLL WLLGGGASDGIVSFFSMFRDVRDHGQDYTDPPRNENGQVT</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6563..7024#6142..6218#5955..6046#5551..5657#5357..5442#5127..5243#4816..4899#4625..4704#3124..3218#2868..2929#2654..2735#1792..2214#1528..1590#267..431#gagataatcgcaggctcgcagtgctcgtgcgacgacagagaggcgaggaacagagagaggggggaaagcgaaacgtacaaattcaaaatcactccccaatttcccccgaataattccaccgtcgcctaaagccagtttcatcgggaacgcctcgaattttccgatccctaggcgggcgggcgggggaggtggagtgcccgcggcgcggcgcggcggtggttagggtttggggctcgtcggcgtcggcgagggcggaggggggggggatggatccggagcagacgttcctgcgggtgcacgcgcggctgtccgggatgctgtcgcagctgctcacgccgcggatccgcctcgcgctcgagtacctctacctcgccggcgccgtcgcgctcttctgcctgctcgtcgtcatgcacaccaacttcgtgcagcaggtgagcatcccgcccctcctcgcccttcttcgtcttctgcccgtgcttgtactgcgcgcgttcgtgctagcctgggtgttgcgaattttgtgcgaactgccctggcctgggttcgccaatgttgtcaattcgacgccctggtaaaaaattgagcaagcctgaggctagtatcaaagttacctgtgtgcgcactgcgcagtagttgctggatttctctagtttggctactgaataggaaacacttataattttagcaactttttaagttgtaatgtaacagtaatttcgattagtgatcccctgaccatcctggcttctggcttagtcctgcagaggtacttacaataccgcattgtttcagatttggtgtatgctagttttttgttcttctctgcaactgcttgttctggaatagtcccacgctactgtaaaactatgatatgccagctattcctctattcattgctcccccagaaacagcatgccaaatttgcatttggtttgcctaatatgaaatctttaagatgatttttttttcttcgaatgtgtatgaatatgcttatggtttctgttatagtgtgaacatatcgagatgaaaaagcatgagggtattgctacgtaagctaactttgtagtagtgatcccctcctattctggtaaatactactgcacttcaaatgaacgagattatatactctctaggaatgtgttagtgttaacgtagattgcatccagtttgacgtgtttgttgatccttatgcaattgatttagtaccacgtggaaactagaacaaaatagaagtttgataaaccattccgttccatgtcttaagtatactgcgttgtgcacacatcataacttacttgtaagtgcatgcaactacaacccttaaatctcctaaaaagtatcattcatatatatttacatgctgaaagctatctcctgttcaacttagaaacacaatatcctggatttgaaataaagaaaaatgccaaacctttttatctggttgtttctttttcctttaccttgttccataatagtctagtgtgcatatgtagcctcacaactttgagttacctttttcatgtgaagcctggctgttcaagcgagttttctgggattgaatttggtgaagcgcaacttgtccaaatcaaggtacacattgctgcttgtcactattttgcatttcttgctgttagactctttgctattctgtgaagtgtgtcgagcattttctcctttttgcacttgggactcaagtgtgataatattccttatgttttttcccttgcttgcaatactagctcatgtttcctattggtatgacttgtttgttccctgcctttaaatttgtagataatcagtggtggactatgggtcagcaaaggtgcatcctacattatggatcttcagaacctggggcgttcagctgagaaaattctagaggttaatggtgataggttcaatattttggcatctaagttttggtcaacttgggttggtcctggagctagaaggagcaaaattatgttcagaacttggaagggagacaaggaatttgaaccacaaccagagaatgcagctgacacagctattaccgcaaccacttcaggagtatcggattcgaagacaactgtggagggttctgcataccatccattatccgcaaaagaatcatttaaagcagcagttatgtatttattcagaaagtggtactttcgtgttgtctcgttctggaggaatataaaacaactttcagataatacttttcaattaatggtaagaagttgattgttatcatttcagcattcatgttccctttatgttactctggtattacaaaagattcttgtatagttggacctgggagaatcatttatgcgggtaatggagtagtagttagtccatgtggttgcttggcgcatgtcaccttgatatctaacttgctgtgtgaggaacacttggagaattgtggactagtagtattgatttgtcaacatatgtcttactcatataaatgatattcatcaagttttggattaaggaatgtttgaatgccatgcagtgaaataacatttattttgatcaagttactctttcatgattcgtgtgatgctgatttttgtgctttttattatctgtatcacttaattagttaaacaaagtaacatgcactcatttaccgagggttattttttcttgattattttaacaacagttcagatcaaactggaatgacttcctccataccatcaagggtattcaattaccaagcgtggatcatcttgtttcaacaataggtatgttgtctggcagtaaactggtcatatgatctagtggtgcctatatgacttttcttatctttgccctttgctgtcaactcacaagggtctcattttctctaacttctcgtggtatgttgtttattacagtacagtggtttgagagacgaagcaaagcatttgaacctacctatttatatggtgtggagaaggtaaggttcattttggcatattgttatcacctattcaacttaattatgtttgttctagtatgttgttaagttgcttgattacttctttatgaactccctagcaaagtaagaatcaacttttgccagaaatgactggagaattcaactatcactcacttcaagaactctcttatatgttgccttctttcctgcagggatatttcttgctttcagaaggggccaaagttcgtcatggtgttcggactataaatatcacaatttctgctcgaaatccttgctttggaaataggtcattatcgagtacttgctcctcataatgggcatatcacactagatgtgtctccaaaagtttccacttgacatctttctacttcatgctacttagattagattctaacttttatgtcctgattctgcccaaaagttcatgtttgtgtaattcattgctctggcaagtctacttgtttgatgccattcaaagttcatgagttcctttaaatgcattggaagctgtcattccaccatatgccatcgaaccaaatttttttgccctcttttgccatccacgtcgctcttccgttagctagcaacaatcacagctaggaacattatcattttcttgtgataatggtgaaattactctttgcgcatagattcagagagttcctcccaaattggatgcgaaagctggggcctcaacatcactgctcccttcacctagtgaggctaggttatgatggcgtgaaccgcatggtggattggcagctcacttcccacctctgttgaactggcagcttagcaaggccattctatgtgtggtatggctagataccagtgcttgctttgttttgttatgtctaaagagaggagagagagagagagagtttgttgggggggggggaggggggttgccaggaggagcacgggcaccgtatgtacgcctgctgcagactggggttcatttccgtgcccatgaagaaaaaaaatggattcagattgctgcataccacacatgcttgcatctgctgtgatgccatgacagatggtatggtggtgctgtcctcgccttccatgcctggttgtgtgctgtggggcaatgagatcgagaaagcatgtgcaaccgggggagcagttgcatgggaggtaggcgcagtgaagtggcgtgaaagaatggaagaggaaggagacaagttgaagaagatatggagggcccaatggtcatcttaccgcccatgtaacagtttgctaacattaggatgatgagaatggcaaaaaaaaaaaaggcaagagaagtttaggcattggtgaatggaacaataatttcgacatggcatattaggaaacaaactcataaactttggatggcgtgtaaggactttggatggcatgcaaggaattttctcattttgtttattgatctttgttttatattgctcttgtacccaaatagttggaacatttactgagtttcaaagagctgcataaaaattctagcgttacaaatatggaatatctaattgctacttaaaaatctgtcatttatattgagaacttaaacaagattttgcattcgttctgtcttctttcattttgcttctgtagtgggtatctgcagaatgtgataatgctccactgttctttcatgcccaccgctatgttcttatgctatccaatctctcttttttaacctttcaggtggcaacagcttttaataaacagcattgttggctatgacactatacttacaaacagcttagtgaactcccctggtcatggtatgcttctgatgtgattttgcttttggtacttttaactatcaggatgttctatgcaactgtcgcaaacttagttagctcacatattttgtactttggtttgatatgcaggctatttatacaactttca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