Os03g0698900
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Structured Information
| Gene Name |
Os03g0698900 |
|---|---|
| Description |
Alkaline phytoceramidase family protein |
| Version |
NM_001057518.1 GI:115454764 GeneID:4333811 |
| Length |
3840 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os03g0698900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:28775445..28779284 |
| Sequence Coding Region |
28775788..28776304,28778015..28778271 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008396:28775445..28779284 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcggattctatggtgtcaagtttctgggggcctgttacttcaacaactgagctctgcgaggaaaattatgcacactcgtcatatattgcagaattctacaatactgtttctaatgttccatgtgttcttctggcacttgttggacttgtgaatgctcttcgccaaggttttgagaaacgattcagtgtcctgcacatatccaatatgatacttgctatcggcagtatgatcttccatgccaccttacagcacgttttacagcagagcgatgagactccaatggtgtgggagattctcctatatctttatgtactttattcaccagactggcattaccggagcactatgcctactttccttttcctatacggtgctgcttttgcagtagtccatttcctggtgcgattccaagtggtattcaagttgcattacgttggcctctgtctcctatgcatcccacggatgtacaagtactacatacaaactaaagacatggctgccaagcgtctagcaaagctgtgggttcttacgttgagcttggcgactctttgctggctatttgatcgaatgttctgtaagaagctttcacattggtacgtcaacccacaagggcacgcatggtggcatattctcatgggatttaactcatactttgcaaacacattcttaatgttttgccgagctcaacagcgtgggtgggagcccaaaattacccaccttttcgggttcttgccttatgtcaagattcagaaaccccaaaagagggaatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MADSMVSSFWGPVTSTTELCEENYAHSSYIAEFYNTVSNVPCVL LALVGLVNALRQGFEKRFSVLHISNMILAIGSMIFHATLQHVLQQSDETPMVWEILLY LYVLYSPDWHYRSTMPTFLFLYGAAFAVVHFLVRFQVVFKLHYVGLCLLCIPRMYKYY IQTKDMAAKRLAKLWVLTLSLATLCWLFDRMFCKKLSHWYVNPQGHAWWHILMGFNSY FANTFLMFCRAQQRGWEPKITHLFGFLPYVKIQKPQKRE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>2981..3497#1014..1270#gagcgagccgagccgagagcgcaacaaaaggaaagcagggaaacctcgccgtcctctctctccatccatgccctagcacgcgccgcgcagcctacgagcgggagccacacctcgaggtaaccaccaccaccatcgccaccctcctcctcctcctcctcctcttctcccctcgatcccgtccgatcaaaaccctagcaccctccgcgcggcgctggcggcggcggcggccgatccgtacggttgcggcgcccgcgtcggtgggagggcgatctgaattctgggtcggcgagtcgggcggtttttgcgtgtgtggtgtgttgtgttggtagggaggggatcgtccggtgccgtgatcgttgggtttgctcgttccgctgtggggagggcgtcttttggtttgaccatcggcggcgcggggcggggtgcgtgtacagatctgttcggaagtgcgtgggaggtggggggattgggaatcgcggccggattttgctggtattttggaggagttgtgatgggatctgtatgtgcgggcagattcagttgtaaaggctgccgttgagtttcatttcataggttgttttttttttccttttgtggggattgttaggtgttattccaagccgttaagtgatctgtttgtgctttttgggtttggggttggtcattggcgatgttgacttgggttaggcctctgaaagagcgcggttatattgttgcgatacattatgaactattatgctgttgcgatacaggatgaaccacgtttctattgttagacgaattgtcccgatgaacccctgttcatctctaaatggctgccatgtctttaatacactgaaaatgccttcagaagctttgaacacagcttagatttactactactggtgttgcctgacatatcatttttacaggtcttcatctgttgcactcatgatttagcaccagctgaagtgacctctgagactgcgcggtgacgtagcctgttgctaggataaaaatctcagtagttaagcatggcggattctatggtgtcaagtttctgggggcctgttacttcaacaactgagctctgcgaggaaaattatgcacactcgtcatatattgcagaattctacaatactgtttctaatgttccatgtgttcttctggcacttgttggacttgtgaatgctcttcgccaaggttttgagaaacgattcagtgtcctgcacatatccaatatgatacttgctatcggcagtatgatcttccatgccaccttacagcacgtgtaagtttttctccccctaaactcatcagtattgatattgcaataacatcactgaccttcaatgctattaatggtgctgctctccaagaatactattttttctcttatgtgcttcaatatgatggaacaatatgttacatttgtgtgttaacatgcaagccatttgatgaaaacaccatgacctttttttgttattttctatggttttgcacataaacattatggttaactttggtgctatatgtttcctataaaaaaatattcatttgcatagggcccttttttccctacttctagtcgttttgtatagagaacttaacaaaaatgagtgatgtccttttcttgtaagaacaaatttggcatcaagttatggggatcagataactcttgatttgcccctttaccaagggcatattcttttgtaccctttgttattttttttgtctacagtgggcatttgttaacttctcaaaggatttagctcttgttcaatgaccattagcaactaagtgaacagattaagatttttgggctaactaattccgcagaggctaatggctgattaatcaccacataatatatgcattctgattaataacctatgtaaacttgtacacttccagattagaaagttaaaaacatgaggtctattggccactataatattattgaaattggcaacaccttgtttattattcgacacttttgaagctgtgcacttgaacaccgaacttgtaacactaacatgtttcacattattaacgttatatgaaaattaattcattactctataaaaaaggaatacttctataatatgaaaaaaatatttatatccaccagggtcatatctgggattgtgaaaggtcaaatgcttaactaaaagtgaatggatcagcagagggagtacgtattaataacttaatgtattgtgtttttcataaatattacttaggaggcttgcttttcctttagataacaagtcaatgtggtgctccttgagccagtaaatatggaatctgtttcatgtttagaagaaagagtaagactgtggattgcactctgctagtaagaatcctatgatataaatttatccttttgatttacagcataagcataccctagttactgttgcttaaaaatttgaacggttagtactcaacgactcactgcacaaattgtgccacaaattgtccagttattgcacatgataacagttagcttccaatgcctcatgcttctatgtgtcagtgtatcttaaagtagcattgttctgtaatacgactgcggactgccacattttggttctttgacatattgaataccatgaaatccacttgatattttgcaactgtttgttatgcaaatcttttgcagaagtaattcccacagttctgttttagttatctgtggcgatccagtttatatgccttagtgtcaaataaagcacattccttttagttgccattttgcagattagaggattgcgggctgtaaatcatctcccaataaattaggtcagccatttattgatgtgctgccaattgcatcacattgttagcttgctcaaaagctatagcctattttataccagcaacatgtagcccttttgactaattgggggcagctagtattcatcttctaattccagcatgtttccttagtatgcacaatatgcagtgctaattcttttggtcatgtattgttttccagtttacagcagagcgatgagactccaatggtgtgggagattctcctatatctttatgtactttattcaccagactggcattaccggagcactatgcctactttccttttcctatacggtgctgcttttgcagtagtccatttcctggtgcgattccaagtggtattcaagttgcattacgttggcctctgtctcctatgcatcccacggatgtacaagtactacatacaaactaaagacatggctgccaagcgtctagcaaagctgtgggttcttacgttgagcttggcgactctttgctggctatttgatcgaatgttctgtaagaagctttcacattggtacgtcaacccacaagggcacgcatggtggcatattctcatgggatttaactcatactttgcaaacacattcttaatgttttgccgagctcaacagcgtgggtgggagcccaaaattacccaccttttcgggttcttgccttatgtcaagattcagaaaccccaaaagagggaatgagttctctatttgtcagtgctgttctccaggaccttaaagccaacgccctcatgtgcttagacaagaagcagaggcattttttttgtatatgggcttccaagtgattacggactacagtgttatgatgcctcactagattttgttaacttttaactaacgcctgttttgtaccatacttaattgttgctcagagattagttggagtgttgtctcatagttttggtcattattttttgtttctctacatttgattttccgttctaataggactgaattttatttgttttttgtttgtcttgaatgttgtcgaacagttttagtcaagttactgcttcatatggcc</dnaseqindica> |
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