Os03g0701000

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os03g0701000

Description

Armadillo-like helical domain containing protein

Version

NM_001057532.1 GI:115454792 GeneID:4333825

Length

8396 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os03g0701000, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:28889149..28897544

Sequence Coding Region

28890684..28890699,28891468..28891577,28891663..28891728,28891803..28891967,28892137..28892211
,28892295..28892449,28892700..28892835,28892920..28892989,28893068..28893195
,28893304..28893360,28893792..28893977,28894497..28894589,28894954..28895039
,28895134..28895200,28895339..28895405,28895482..28895618,28896084..28896175
,28896315..28896381,28897056..28897220

Expression

GEO Profiles:Os03g0701000

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008396:28889149..28897544 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>tttccagaacccgcgcttcaggcacacgcagcttctgcgattctaaacttcagcgaaaactgcaggcctgatattttgacaccatacttggatgggatagttgggaaactactgtcattgcttcagactggaaaccaaatggtgcaagaaggtgctttaactgctttagcatcagctgcagattcttctcaggaacacttccaaaaatattatgatgcagtcatgccatatctcaagtctatactcatgaatgcaactgacaaatcaaatagaatgttgcgggccaaatcgatggaatgcattagcttagttggtatggctgttggaaagcaaaaatttaaggatgatgctaagcaggtgatggaagttttgatgacattgcaaggatctcagatggaggctgatgaccctataacaagttacatgctgcaagcatgggcgagattgtgtaaatgccttggtcaggacttcttaccatacatgaatgttgttatgcctcctctgctccagtctgctcagcttaaaccagatgtgagtgtcacatctgctgggccagaagatgaaaatggtgaatctgatgatgagggtgttgagactattacgctaggagacaagagaattggcatccgaaccagtctgctggaggaaaaagcaacggcatgtaatatgctatgttgttatgctgatgagctcaaggaagggtttttcccatggattgatcaggttgcaactactctggttcctctcctcaaattctattttcatgaagaagttaggaaggcagccgtttcagcaatgcctgagcttctacgttcagcgaagttggcaatagagaagagccaatcgcaaggtcgggatgaatcttatcttaagcaactgtctgattacatagttccagctcttgtagaggctatacataaagaacctgacacacaaatatgtgcaagcatgctggaatcgctgaatgaatcaatacagttatctggaacacttcttgaggaaggccaggtcagatctatagtagatggaattaaagaagtaataactgcgagtgctctcagaaggagagaacgaacagacagggcaaaagctgaagattttgattcagaagaagaggatctactcagagaagaaaatgaacaggaggatgaaatcttcgatcaaattggtgattgtttgggcactcttgttaagacgttcaagacttatttccttccattctttgatgaactttccgtctatttgacacctatgttggccaaggacaaaacagtagaggaacgaaggattgccatatgcatttttgatgatgttgcagagcactgtcgcgaagcagctgtcagatattatgatacatatcttccttctttattagaagcctgcacaagtgaaaatccagatattagacaggctgcagtttatggtattggcatttgcgctgagtttggtggctctgcatttaggcctcacactggtgaggccctgtccagactatacaatgtaatcaaacatcccaatgcgttggacttggataatgcgatggcatatgacaatgctgtttctgctcttgggaaaatatgtcagtttcatcgtgatggcattgatgcatctcaggttgttcctgcttggttaagttgtttgccaataaaaaatgacttaatcgaggccaagatagttcatgaacaactctgtacgatgcttgagaagtcagatagggagcttttgggtcataacaaccagtatcttccaaagattgtctctatttttgcggagatattatgtgcgggtaaggatctggcaacagaacaaacttttagtaagatggttaatttgctaagacagcttcagactacattgcctccttcagtactggcgtcaacatggtcttctttgcagccgcagcaacagcttgccctacagtctgtgttgtcatcatag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>FPEPALQAHAASAILNFSENCRPDILTPYLDGIVGKLLSLLQTG NQMVQEGALTALASAADSSQEHFQKYYDAVMPYLKSILMNATDKSNRMLRAKSMECIS LVGMAVGKQKFKDDAKQVMEVLMTLQGSQMEADDPITSYMLQAWARLCKCLGQDFLPY MNVVMPPLLQSAQLKPDVSVTSAGPEDENGESDDEGVETITLGDKRIGIRTSLLEEKA TACNMLCCYADELKEGFFPWIDQVATTLVPLLKFYFHEEVRKAAVSAMPELLRSAKLA IEKSQSQGRDESYLKQLSDYIVPALVEAIHKEPDTQICASMLESLNESIQLSGTLLEE GQVRSIVDGIKEVITASALRRRERTDRAKAEDFDSEEEDLLREENEQEDEIFDQIGDC LGTLVKTFKTYFLPFFDELSVYLTPMLAKDKTVEERRIAICIFDDVAEHCREAAVRYY DTYLPSLLEACTSENPDIRQAAVYGIGICAEFGGSAFRPHTGEALSRLYNVIKHPNAL DLDNAMAYDNAVSALGKICQFHRDGIDASQVVPAWLSCLPIKNDLIEAKIVHEQLCTM LEKSDRELLGHNNQYLPKIVSIFAEILCAGKDLATEQTFSKMVNLLRQLQTTLPPSVL ASTWSSLQPQQQLALQSVLSS</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1536..1551#2320..2429#2515..2580#2655..2819#2989..3063#3147..3301#3552..3687#3772..3841#3920..4047#4156..4212#4644..4829#5349..5441#5806..5891#5986..6052#6191..6257#6334..6470#6936..7027#7167..7233#7908..8072#gctctaatcttcttcccctcaacccgctccaaaattcccccgcctcccactccaaaacccaaaaaaatcccgcgcggccgcgtgaagccgtgaatctactcctcccttcctccgcgcccgcgcgtcgccatgaatccgcaggcggagggcgatgcggcggcggcggcggcggtgctgggggcggacccggcggggctgacggcgctgctgggggacctgacgtcgccggcgaacgaggcgaggtcgagggcggaggggatgttccacgcgctcagggcgtcccacccggacgcgctcgcgctccgcctcgcgcacctgctgctctccccggcgcacccctccgcgcccatggcggccgtgctcctgcgccgcctcatctccccggggtcgcaggcgttcgtctacccggggctctcccccgccacgcagtcctcgctccgcgcgctcctcctctccgcggcgtccgcgacggggctctccaagtccatctcgaagaagctctccgacgccgtcgccgagctcgcgtccttcctgctgccgtccaacgcgtggcccgacctcctcaccttcctctacaagtccatcgcctccccatcctcgcctccggcgctgcaggagtcggcgctcaacatcctagcccggctggcctcccatctcgccgcgggcttccccaacctccacgccctcctcctctccgcgctctcgcacccgtcgtccgcagatgtccgcgtcgcggggctcaacgccgctatcagcctcatacagtctctcccctctgccgccgaccgtgaccagtttcaggatctcctcccagccatgatgcgcgccctcgctgaatcgctcaactgtgggaacgagggctctgcacaggaggcgcttgagatgatgatcgagcttgcaggtgcagaaccacggtttctccgccgccagctgcctgacgtggttggttctatgttgcaaattgctgaagcccctggattagaggatggtacgcgacaccttgctgtcgagtttgttgttacccttgctgaggcaagggagcgcgcgcccgggatgatgagaaagctgccacggtatgtgggccggctatttgcggtgctcatgacaatgctgctcgatgtccaggatgaacctgcgtggcatgcagcggtgtcggaagaagaggatgctggggagactgggagctatgttttcgcacaggaatgtcttgatcggcttgcgattgctgttggtgggaatacgattttacctgtggcagctgagttgctcccatcattttttgcttctgaagagtggaagagacgacatgcggcactggttacgatagcgcagattgcagagggctgtgctagagtaatgattaagaatctggagcaggtagttggtatggtgctgaattccttccgggatccttatcctcgggtgagatgggcagctatcaatgcaattgggcagctttcgacggacctggggcctgagttgcaaaataaactgcaccatgttgtcctgcctgcattggcttcatccatggatgatttccagaacccgcgcgtacaggcaagttattattgaggatttacacttaagtcatctgctgcacttctttcaatattcgttatcgtattttatagtgtaaactataaagcattggtggccctgtaacccacaagtatcaggctcagaggaacttggaagttaaaaagatattatcttgacatatatgcattctaaggaatgagtagaaattgctggaaactaaaaattatatttaaagagaagttcgtagactgattaaggtctaatgctcaaagctgtcgtacttttaatagaatagtacatggaaattttctcaattatattacatatgtatcagtaaggaatgggtctatttaacccctcaactatcgtgttggtctaatttcaactctccagttatgcaagtatgcaaccttgtaaaacacaattcttgaatatcaatacccaacaatctacaaccctcaacctcaccctagttgtttgatgtttgaagtaccatacaatgtgagtgattatgctagcctatgtgcacaggttattgtcgtgatcaagtttcatgatgcaatgatttagagaggtttgatgagactgctattaatgcctaaattgtttgtagtgtgtcctcatctgagatcacaactggttacacgtttttttagttagtggccattagtttgtgccacttgctttttctttgacatatacttacaattgacttgtcattaatacccatcaagttatcagctagacatgctctaatcattgttttatattccgaatgagttcaggcacacgcagcttctgcgattctaaacttcagcgaaaactgcaggcctgatattttgacaccatacttggatgggatagttgggaaactactgtcattgcttcaggtaatccttgcatttgatcatggagccttcattttgtgcagcataaacatgaaccttttcggaaattttgtttgttttctgatagactggaaaccaaatggtgcaagaaggtgctttaactgctttagcatcagctgcagattcttctcaggtacaagaggaaatatttttgaaggttttcgggccagcattcttgctcaaagttttgcaatcttattgtttcaggaacacttccaaaaatattatgatgcagtcatgccatatctcaagtctatactcatgaatgcaactgacaaatcaaatagaatgttgcgggccaaatcgatggaatgcattagcttagttggtatggctgttggaaagcaaaaatttaaggatgatgctaagcaggtaataatttgctagttgctctgatacattgtaatacgtttgaagaaaatgtcaaagcacactgtataaatgttatttatgacttgttctgattgtattgctgatgggcttatttgaatgctgtttgctgaattcgttgtttctttggctaacatatttctcttgctaggtgatggaagttttgatgacattgcaaggatctcagatggaggctgatgaccctataacaagttacatgctgcaagtatgttgtagcttaaatactattgccattttatgccatcactagtttgcttcagttttgcttattctaattgcattttctaggcatgggcgagattgtgtaaatgccttggtcaggacttcttaccatacatgaatgttgttatgcctcctctgctccagtctgctcagcttaaaccagatgtgagtgtcacatctgctgggccagaagatgaaaatggtgaatctgatgatgaggggtacgtttttgttacgctggcaacttaccataatgttgtcacattcccatgatagaatattgaaattgatgaattgttatcattgtaggcatgatattagtttgttgccctgtttcaaatttgcatgtatttgtcagatccataacagagcatttaatttgaatgttgatatcctgttgttgtctgattctatgatcttatgatatctgtaaaattttgtgttttacctggctgcctgcataaaatgcagtgttgagactattacgctaggagacaagagaattggcatccgaaccagtctgctggaggaaaaagcaacggcatgtaatatgctatgttgttatgctgatgagctcaaggaagggtttttcccatggattgatcaggttatgttacgattttttgtgaactctatgtgtacacgcacgcgcctatgtgaagagctccagctgaaccttgaatctgtacaggttgcaactactctggttcctctcctcaaattctattttcatgaagaagttaggaaggcagccgtttcaggtctgcaactacccttttcagtgtattctccattatttttagcatttttctcaaagtgacattgtgttatctccctagcaatgcctgagcttctacgttcagcgaagttggcaatagagaagagccaatcgcaaggtcgggatgaatcttatcttaagcaactgtctgattacatagttccagctcttgtagaggctatacataaagtaagcatagcatgctaactgaaactccttacttttccttagtacttgttttgttgatcactgttgttctgtttaagcatgttattgaaagtttgaaactttatgcaggaacctgacacacaaatatgtgcaagcatgctggaatcgctgaatgaatcaatacaggtcttgtattgctgtaccctaagtttttgtgatattacactgagcttaatttaggtgataagcttcatatagcttcaactcttgtttgtgcaacctatatgatttttagtacttaaaaacctctgtgaaatgtgcgacacttatggcttaaactatgctccatccaatggtaaaacacaaataaattgtggtttgaggtactacctgggtttgaatgaatttagtattaactactttgtactgtattgctaacaaaactgacatgtttacatttatagcatcgtgttgattgcctctttctggaaaatctgacctttagtgatgaaatctgtgacaaataatttttatttgctcctttttatttccatgctgtatccatgtttactccatacaggacaccataataatctgaactctgtttcttcacttagttatctggaacacttcttgaggaaggccaggtcagatctatagtagatggaattaaagaagtaataactgcgagtgctctcagaaggagagaacgaacagacagggcaaaagctgaagattttgattcagaagaagaggatctactcagagaagaaaatgaacaggaggatgaaatcttcgatcaagtaagctattgaaaactagactgctaatatttctggaaaaaaatagtatatttagatgtacctgtttataatttttttcctgatacaagaattgacaagtgtatgcagttctgtgcactactgaaattgaaagatttacacatgctaattaactattccattcaaatttataaggcgagcagttatttctactttcaaactttgcaagttatgatcaacaattaggtttagtgatccaaattgatgcagctactcaaatgtattttgctttcacacgatcgtgattttctagttagtaagaacatattcaaatgaaatttatggtcaaagtccaatctagaagaccatgctaagttaaatcttgccttgtaaagttgaacgcggtagtaccttagacaccaaaaggagcaagcatgattattgtacttccaacttaaactgtagacacagctgtgacttctactttccaagctttattggaaataacttatacagatttatcttttgtgattttcacagattggtgattgtttgggcactcttgttaagacgttcaagacttatttccttccattctttgatgaactttccgtctatttgacacctatgttggtaagtggatccatctgatttgattggaacttctgttttcttagtgatagaagggcaacatactgaatgctgaactttacaccaaaagtgatttttctagcaatgtgaaaccttggaccctatatcttttgggggtcattttcagatattccctttacccagaatttttcttggcttgccatagaaatcttttgcttaaatgttccaaagagtaaacataaagctactagaaactattccagttcattttcagatcttgtagcctgtgataaacatagaacatcttattacaaaaaaaatactctgtcaaggacaaaaaagaaccttctgcgattataagtattttttttgttaataatattaggccaaggacaaaacagtagaggaacgaaggattgccatatgcatttttgatgatgttgcagagcactgtcgcgaagcagctgtcaggtaacagtttaatgacccttttaacctttttattggatgaaatgattcttctaacttttgatgaaacgtaatttgtatgatctgtggttctcagatattatgatacatatcttccttctttattagaagcctgcacaagtgaaaatccagatattagacaggtttgaaatattttatgttctacttgatgacttgatgcatgaagtttcatgtttcaacagtatgcaatatttcatttatcaagttcttttatttttttgaaaaaaacaatgagagtatgtgtttcatgctgctttcaggctgcagtttatggtattggcatttgcgctgagtttggtggctctgcatttaggcctcacactggtggtatgtgttgcatttacggtgagctaggctagttcatagctgaatatgttttgatgttgttaattcatatctgcagaggccctgtccagactatacaatgtaatcaaacatcccaatgcgttggacttggataatgcgatggcatatgacaatgctgtttctgctcttgggaaaatatgtcagtttcatcgtgatggcattgatgcatctcaggtgtcttacaagccatatgaattaatatacttactctgaagtgtattcttactcatttgaaatcatggtgttgctacctgtcctgctgattaattaaactcttgtctacagagacaaagaataccaagtttcttcagttgcccttgataaattttgacatcaacgtcaataacataaagcatgtaacagcctaaagagcctcagccgcatacagtatgctacatgcaaaaacattgaatgaacgggttgaaagccttaagtgactgctcagtactattgaattaattttctactaaaacatacagttaaatgacatgagaactcttctttactagagtagtgtccattttggacttacattaggtctgccaagtcgtcgtagatttattatactatgtgtagtatttccttaaccatgcaatgcttctaagttctaaccgtgtatcattttttaaatattaacaggttgttcctgcttggttaagttgtttgccaataaaaaatgacttaatcgaggccaagatagttcatgaacaactctgtacgatgcttgagaagtaagtaatgatctcagtatttttgtacagttacgcagcttggcttatatatggtgtagaaacatcaatcttgttcattgcttccttattataatgtttatttttcatttcattgaagatctcatttcaatttttgcaggtcagatagggagcttttgggtcataacaaccagtatcttccaaagattgtctctatttttgcggaggtacctatttatttttttccttaatttttccttttttgttctgattaactatatagaaagaactgcaacacaactagttgcagagcagtattggaatgtttatgttgaaatggggttgagttgattgtgtttggctggtcagttggaattcatcaccaactgaggccattaggttaactaccttttgatcctgaactgggttgctacaagcttaacatagctttataggggctaaataattttcagtagaggagtacatagcaccagggtactgccaatttagatctcaaacgaatatgaataaacaagacattttatggcttatctggtctataatgtagccccccccccccccccacacacacacacacacaaaaaaaaaaggaacatatttcaccactgatttttcacaatgcaatgtctttatctttaatttagataatttaaaaagatagcatttgcttgtctcatgtactgctgtgtagtatcgttggtagaagcccctgaaataagatatttgggagacattccaaaatggtgatttgttttctctgagttttgagaaagaaagtagttatactttaatgagagtatgagacttaggcgattaaccaccatggcttttagaacattgtttggtttgtaacaccacatctatttccttatggatgcagatattatgtgcgggtaaggatctggcaacagaacaaacttttagtaagatggttaatttgctaagacagcttcagactacattgcctccttcagtactggcgtcaacatggtcttctttgcagccgcagcaacagcttgccctacagtctgtgttgtcatcatagctgaacagtaacctcagcaatgttgagcatgtggccttcacatattgccttcttttttgggttttcatgtggttttgtgcttgggttcctggagtttgtgcagcatacaaatgccctgagcttttgtatgaagggcatggtttgcatcagaagtgtatactgtcacagaacatcatggatgtgtatggggctgagcaatctctgcttcacagcaagtgaagttgtaaagcaatatgttcattttactaggaattagttgggttgaagaaaatgtaaattaacaattttgatcgttgatgttttgatatcatattatttcaaacc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os03g0701000, RefSeq:Os03g0701000