Os05g0145600
| Gene Name |
Os05g0145600 |
|---|---|
| Description |
Pentatricopeptide repeat containing protein |
| Version |
NM_001061168.1 GI:115462066 GeneID:4337794 |
| Length |
6124 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0145600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:2596222..2602345 |
| Sequence Coding Region |
2596680..2596787,2597048..2597149,2597310..2597387,2597467..2597532,2598328..2598418 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:2596222..2602345 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008398:2596222..2602345 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgagcctcctcagcaactccctcctgctccaagggcggttgcggcatgcggcggcttcagcggtggcggcggcggcgatggggcggcgcggggtggcgacgtcgacggaggagtacaatcgccggaactacgccaacaacatctccgagtacaataccgtcttcgggtccctcaccgcgcagcgcaggcactacctattgcgtgatgcttatgatgacatgatgcttgatggggttcagcctgtgcgggacacattccacaatctcatagtcggtgccatgaaaggcagccggctacaagatgcattctactttcgtgatcagatgaaagaaatgggtttgcagcctgatgttaacctttacaacttcttgatctccacttgtgggaaaagcaaaaactcagatgcagcgatcatgcttttagaagaaatgaaggcacatggcgttaagttgaaaggtgaaacatacacttgtcttttgaatgcacttgcagcaacagggcgtacagatcaagtgtatgctatagttcgtgatatgaccgctgctgggcttggattaaacaagttttgttatgctggactaataaccgcattcaagaacaaggcaccaaccactgaggagactatgacaaaaattgtcgagtttgttcagcagtcaaaaggttggaaaaatgttgaaagagtatcaaaagatagctccgaaaatataatgatgaatgtgtcagaggaagagctttataacctgccaacagctgaatatgtacatagacaagcatttgtctataaacagatgacaatttatcatgttgctatccatgcttgtgcagacctgaagagcaaagagacacttgaagtacttcttgacatgcttattaaagatggatttacttatgatgccttcattgcgatgcaagctatgaggtgttatcttcaatgtggagatattgattccgccgttaagatttttgaagagtacacaagctcaaaatccccgcctgcagagttgtatgtgacacttgctgagggagctatgattgggcatacaccaagaggaatgcaacttgctcaagaaaccatagagaagatgacttcgagaaatttcttcttaaacgcaaggatgggaactgatcttctacttgcagcttcaggtgaaaagactggtggatatacaatagcaaattatgtctgggatctcatgcaaaaccgcagaatcactccatcacttcctgctgttgaagcatactacaagggtttgaaggaacgtgaaattccttctgatgatccacggctcatgaatgttagccgtgtcttggacaatctgagcattcgttttggaccaaggagaaacagtaacgcacaggcataa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSLLSNSLLLQGRLRHAAASAVAAAAMGRRGVATSTEEYNRRNY ANNISEYNTVFGSLTAQRRHYLLRDAYDDMMLDGVQPVRDTFHNLIVGAMKGSRLQDA FYFRDQMKEMGLQPDVNLYNFLISTCGKSKNSDAAIMLLEEMKAHGVKLKGETYTCLL NALAATGRTDQVYAIVRDMTAAGLGLNKFCYAGLITAFKNKAPTTEETMTKIVEFVQQ SKGWKNVERVSKDSSENIMMNVSEEELYNLPTAEYVHRQAFVYKQMTIYHVAIHACAD LKSKETLEVLLDMLIKDGFTYDAFIAMQAMRCYLQCGDIDSAVKIFEEYTSSKSPPAE LYVTLAEGAMIGHTPRGMQLAQETIEKMTSRNFFLNARMGTDLLLAASGEKTGGYTIA NYVWDLMQNRRITPSLPAVEAYYKGLKEREIPSDDPRLMNVSRVLDNLSIRFGPRRNS NAQA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>5559..5666#5197..5298#4959..5036#4814..4879#3928..4018#3413..3489#2789..2998#2584..2701#1982..2079#1801..1866#1555..1714#229..385#110..143#acgagttaaaaccctcttcctctctctctctcgcttcgtcttcctcctccacacgaagcggcagcgccaccaccacctccgccgctctctccactgcgccgccggcgccatgagcctcctcagcaactccctcctgctccaaggtacacccgccctccatttctcctagggccgagcccctatgcgtggtccaagatctccttgacctttttggatctggctgtgcagggcggttgcggcatgcggcggcttcagcggtggcggcggcggcgatggggcggcgcggggtggcgacgtcgacggaggagtacaatcgccggaactacgccaacaacatctccgagtacaataccgtcttcgggtccctcaccgcgcagcgcaggcatgtctctcggttcttgcatgccaactgttcgacgcaatgccgagcgctggcatgcttgttgagatggcttagttgtgattattttttcctgcttcctcgatgatttagtttgtacaagagcacaacgctcgctagcctaaatgtggccattctgcaaccgggcatgctaccggccagaatgccagatgaacacaattatacatggtgtcgattgtagaccattgtactattttgcacacaaggatttttagtgctgtacaggaagcattcttgtttctggtggctgtctttgtgctgaatgtaggttgattcactcgtctgtatttcctccagtctgtctcaatacaatacgccagtgagcatgggcagctctagtgccacagtttgaccctaagtacttatcactgagcctaggaagctagagtgccttagtttcacctgaattacttgcaaaccatctaagttcagaagttagtacacatgtttggtttgtcaagtttgtagctttcttgaccaaaatatgcacattttataatgtcaacttccatcttgattttataagatatatcatatatgctcaatgcttttttcttatacaatactccctccttcccaaattgattattatataatggaattcaaaatttctcaaattgatcatcatataactacatgaacacagatttcatcagaatacatttaatgcaacatgggagaatgtgtgcatgctaaggagtaattgacatggtgttttaatcgatgcatgcattgtgggagaatgtgtgcatgatgtcttcattgatgtgttttaaattataaattatccttggttttggtgcataaacatatatgatgatcaatttgggaaggagggagtatttatcagtacatttatgcaaatggtgtatttggcaaacactttttcaccttatgtttgccacattaagctatatcttttggttgatagccattcttgagaatttatttatgtagcttggactaccaaccatttgatgccctatgttgatacgtccatgtgttttgttctgcatgattgtgccattgtgagtctttgttttgtcggtagcagttccatggtagtaacctctgtttgcttaggctctattctttatcaagtctgaacagaacttttgcattgtttttaggcactacctattgcgtgatgcttatgatgacatgatgcttgatggggttcagcctgtgcgggacacattccacaatctcatagtcggtgccatgaaaggcagccggctacaagatgcattctactttcgtgatcagatgaaagaaatgggtttgcagcctgatgttagaccgtgtcttctttgaattaatttcatctcttgtttagggttttgtgagattggttgggctaaaggcattatattttgtaggttaacctttacaacttcttgatctccacttgtgggaaaagcaaaaactcagatgcagcgatcatggttagacaataattgagtttttgttattgtggtcatgtggtgctgttctcctatttggaatgtattatctttgttcctatgctcactaatgctttcatcttgctacctgtaaaagcttttagaagaaatgaaggcacatggcgttaagttgaaaggtgaaacatacacttgtcttttgaatgcacttgcagcaacagggcgtacagatcaagtgtaagggttcctcaacattcttttgctcaaacagtagatcacggcaacaactgaggctgaaatataaaatcgtttggtctatacacattgtggttcactatgcatagcatgatttcatgaagtactgaataccatctagcaatgaataagccaaggcctaattgacattaataactcattacctttgttatttctgttcacttcatccgaactgctaatcactctattgaatctgcatggatctgcctgattgagcatgtgaggaaaaaatgtagaaagatattacaaaatgtaaaatcatatataacttatgttttgaatttaagaatattggaattgttagtaccaatgtaaccgatctggaggttgcagtacaattaacttgctgttacttccatgccaatacatccatattaatagaaatgttacttaacgtactgcagtttctactttaaccatttacccttttgtgagaaacttctcataaatattttgttttgacaggtatgctatagttcgtgatatgaccgctgctgggcttggattaaacaagttttgttatgctggactaataaccgcattcaagaacaaggcaccaaccactgaggagactatgacaaaagtatgttttgcatacatgggcagttattagatggatgtatttaacatgttcaaacagttaatttgaactacaatttttttctatcagattgtcgagtttgttcagcagtcaaaaggttggaaaaatgttgaaagagtatcaaaagatagctccgaaaatataatgatgaatgtgtcagaggaagagctttataacctgccaacagctgaatatgtacatagacaagcatttgtctataaacagatgacaatttatcatgttgctatccatgcttgtgcagacctgaagagcaaagaggtgtgcttattttgcctttgtgttaccttttttgcattaactaatactccctccatccaacaatacaagcatttgaattttgtcctagaatataagcattcctacactacttgtcacatgaatcacctctcagttctcaatctctaatacaaatttcttcctatattacacccccccccaaccatctcccatcaaatgaggggcactaaaatcttttctcctcaaccttatttgctaaacaacctagaaatgcttatattgttggacggagtgagttcgtggttgctgttcagcagcctcgacagttgacataaatgtatgctttcgcgtaccctactgttgcccaaaatcttcaacattgagttatatgtcctagttccatgaagaagttcaatttactttgctattctgcagacacttgaagtacttcttgacatgcttattaaagatggatttacttatgatgccttcattgcgatgcaagctatgaggtaatctattctatggatgtttaccatttcctgatataagttttagtgcctgaacaatatgatgtagtgatctaattgcattgttagttgttccagaggtgtacagtatagaagtatgtcccactatgccctcattattattgttaaagtatgaaagaacattcatctttaaaaaatatctggtgtttctctgctctctaaattttcagtcttgagtattatatttgctgaaaaccttcttgagtacacatatattataactgttcatatcaaaggatcattgctttttttaatggattccttttgggaatggtatattttctattttttgggcatgtctgtccttgttttgctaccccttcatgtgtcctgttttattgtactaccaactagtttctgattctagctgctattttgttattcttttaactgaaaaaggtgttatcttcaatgtggagatattgattccgccgttaagatttttgaagagtacacaagctcaaaatccccgcctgcagagttgtatgtggtgagtaaaacccttagtaagaagggaaacttttgttgaggaagtgattttttttttggcagggaaaaaagttaagtacaaaaaaaatgaaacaagtttgagatcattaatcattaaccataagtgctaactgtattctgaaagtacaaaaattatgtttagtacctaatccctctacagagtaaaaaaaagaccgagtcgataagatagtgtagtttgcacgattctactattcttatgtcataaaaaaaaaacaagtttgagatcaatcactgttaagttcacacgattagcttacctcttgtgttcactacatcagttcctagtggtttcatgaaatttaaaaatcagtttgatcattgtcttgtcaaaagtgatactgttacttttttggttgacaagcaacataggtttggaactttggattcctctacataatttacaattctagtgaataacaggtttactatacagtatacactgctgaacctactctggttttgtgccgtttctaagcttttgaactgaaacacaaattaaggcactataccatttcttacattttagttactatataggatttatactatctgctttcttgcttattagtcacagtagcattgtcttttacagcactgctaaataaataaataacttttaccatggtggagctcattgaggatctacatggaaatcataaaaaagtagtccatttcagttgacactctatctcttgtttcgaactttgtgctctcatatatatttgtgtgtattctatgcataattggcatgcagacacttgctgagggagctatgattgggcatacaccaagaggaatgcaacttgctcaagaaaccatagtaatttttccttctgttttggttttctagtttctccaacttagaaattcaattttttacatctcagaatatttttcaggagaagatgacttcgagaaatttcttcttaaacgcaaggatgggaactgatcttctacttgcagcttcaggtgaaaaggtaagtatcacagctaccaccctcctgtacttgcaagtcctacaaatgctaatgcatctatttgaagaaaacacaattattttacttatgtcatattcttgaaatgaatccaaatagcttcccaaatcacttacggttgaaactctgtggattctttcagactggtggatatacaatagcaaattatgtctgggatctcatgcaaaaccgcagaatcactccatcacttcctgctgttgaagcatactacaagggtttgaaggtaagctcagattttgcaatattgtggctagtatgtttaattcaccctagaatcacccatgatattgtttccttatattgcattgagtaaattcattagctgcgtaccgtcctgatttttttttttgaaatcattggatatttacatatcatagtatgctgacctaaagtcactgttataaactactagtatatggagttttattcatgtttctctctttttattctaattacatttcatctcccttcttttcaaatcaggaacgtgaaattccttctgatgatccacggctcatgaatgttagccgtgtcttggacaatctgagcattcgttttggaccaaggagaaacagtaacgcacaggcataatgtcgtcgtcactaatccaatgcgagttagattttgtgttaataaaactgctggatacatcatcaatatgttagcacttgagaagatcaacgaactgaaattaggatagcacaaagcgaatatgaaaccatcaagagatgaaaccatcaagcatgatgacaaggatcagggtacccaagtccaacctgaaggattttcatccgcatcgcggaaaatctgattctcaagtttcttttaacttttgtaaacttactgttgtcggaatgttacttatcacactggtttagagagtttattctgctgagtaatttgacattagatgtccattccattgctacctttcaggcttcagctgcgagtgtatctgaatggtcatttctcagtttgacaaataattgttgtgagtttaacttcaaagaatcactggaagaattttatgcaaaggaatattatgactc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |