Os03g0719100
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Structured Information
| Gene Name |
Os03g0719100 |
|---|---|
| Description |
DNA-binding SAP domain containing protein |
| Version |
NM_001057627.1 GI:115454982 GeneID:4333925 |
| Length |
8026 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os03g0719100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:29888631..29896656 |
| Sequence Coding Region |
29888925..29888969,29890016..29890096,29890498..29890546,29890633..29890711,29890796..29890955 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008396:29888631..29896656 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgctcgaccccgccgacgatccgctgctcgccgattgcaagtacaagttgaatcactttagaataaaagagctaaaggatgtcctgcatcagcttggacttccaaagcaaggaaggaaacaggaacttgtggacaaaattatagcagtattgtctgatcaacaagaacaagactccagattgaatggcttgccaaacaaaaagatggttgggaaagaaactgtggctaaaatagttgatgacacttttgcaaaaatgaatggctccacaaatgctgttccagcctctagaaatcagactgactcggggcacattgtaaagcctaaaaggaagtcagatgattctgctcagttggatgtcaaagtccgttgtccctgtggttattccatggccaatgattccatgattaagtgtgaaggtccacaatgcaatacacagcaacatgtaggctgcgttatcatatctgagaagcctgcagacagtgttcctccagaattaccaccacacttttattgtgatatgtgccgaatcactcgagctgaccctttctgggttactgttaatcatcctgtacttccagtctcaataactccctgtaaagtagcatctgatgggtcatatgctgtacagtatttcgagaagacctttccgctatcaagagctaattgggagatgcttcagaaagatgaatatgacctccaggtttggtgtatcctattcaatgatagcgtacctttcaggatgcagtggcctttacattctgatattcaaattaatggtattcctattagggttgtcaacaggcaacccacacaacagttaggggtgaatggtagagacgatggtccagttttaacagcatatgtgagagaagggtctaataagattgtcctatctagaagtgactctcgcacattctgtttgggagtcaggattgccaagaggagatctgtagaacaggtcctatctttggtgccaaaggaacaagatggtgagaactttgataatgcccttgctcgtgtgcgtcgctgtgttggtggtggaaccgaggcagataatgctgacagtgacagtgatattgaagttgtagctgattctgtctctgtgaatctccgatgccctatgactggttcaaggatcaagatagctggccggttcaaaccctgcgttcacatgggttgttttgatttagaagcttttgtggaacttaatcaacgttcaagaaagtggcagtgcccaatttgcctgaaaaactactctttggacaacataatcattgatccttacttcaaccgcataactgctttggtccaaagttgtggagatgatgtatctgaaattgatgtcaagcctgacggttcctggagagtcaagggtggagcagaactgaagggtcttgcacagtggcatttacctgatggcactctctgtatgcctacagatacaaggtccaagcccaacataagaattgtaaagcaagagattaaagaagaaccgttgtctgaagaaacaggtggccgtcttaagttgggaatcagaagaaacaacaatggccagtgggaaattaacaagagattggattctaacaatggtcagaatggatatattgaagatgaaaactgtgttgtttcagcaagcaacactgatgatgagaacagcaaaaatggaatctataatccagaaccagggcaattcgatcaactaaccagcaatatctatgatcttgattcttctcctatggatgcacattttcctccagcaccaacagagcaggatgtaatagttctgagtgactcagatgatgataatgttatggtgttatcacctggtgatgttaatttcagttcagcacatgacaatgggaatgcattcccacccaacccacctgaagcttcaggaatttgtggggaacaacctagaggagccggcccagatgtgacttcatttcttgacggtttcgatgatctggaactgccattttgggaatcttcgagctctcaagatgctgcaggcacacaggtgacagacaatcaatgcgaaatgcaaaatttcattgtcaaccatcaatttttgcacgagccaattttaggggttaacttgggtggaacagcagcatcaaacacactggaatgtgagcatgatggtgcgttacaagcttgtcagtcgagtgatcaagatggtgatcagaatcaaacatgccatgatgggcactccggggatttgacaaatcttagtatcattagcactcaagatagtttaactaatggcaaaaatgcttctcagaaaaggacaaactgtgaagatggcacggcaggtttagacggctcagttgtcaggagcgcgaatggcttgagaggagagatgccaccacttgggcaggagcaggatcgtacagttagacaaaagttgatattaacaatcgagtcagactctgattag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MALDPADDPLLADCKYKLNHFRIKELKDVLHQLGLPKQGRKQEL VDKIIAVLSDQQEQDSRLNGLPNKKMVGKETVAKIVDDTFAKMNGSTNAVPASRNQTD SGHIVKPKRKSDDSAQLDVKVRCPCGYSMANDSMIKCEGPQCNTQQHVGCVIISEKPA DSVPPELPPHFYCDMCRITRADPFWVTVNHPVLPVSITPCKVASDGSYAVQYFEKTFP LSRANWEMLQKDEYDLQVWCILFNDSVPFRMQWPLHSDIQINGIPIRVVNRQPTQQLG VNGRDDGPVLTAYVREGSNKIVLSRSDSRTFCLGVRIAKRRSVEQVLSLVPKEQDGEN FDNALARVRRCVGGGTEADNADSDSDIEVVADSVSVNLRCPMTGSRIKIAGRFKPCVH MGCFDLEAFVELNQRSRKWQCPICLKNYSLDNIIIDPYFNRITALVQSCGDDVSEIDV KPDGSWRVKGGAELKGLAQWHLPDGTLCMPTDTRSKPNIRIVKQEIKEEPLSEETGGR LKLGIRRNNNGQWEINKRLDSNNGQNGYIEDENCVVSASNTDDENSKNGIYNPEPGQF DQLTSNIYDLDSSPMDAHFPPAPTEQDVIVLSDSDDDNVMVLSPGDVNFSSAHDNGNA FPPNPPEASGICGEQPRGAGPDVTSFLDGFDDLELPFWESSSSQDAAGTQVTDNQCEM QNFIVNHQFLHEPILGVNLGGTAASNTLECEHDGALQACQSSDQDGDQNQTCHDGHSG DLTNLSIISTQDSLTNGKNASQKRTNCEDGTAGLDGSVVRSANGLRGEMPPLGQEQDR TVRQKLILTIESDSD</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>295..339#1386..1466#1868..1916#2003..2081#2166..2325#2711..2844#3218..3286#3468..3555#3800..3875#4671..4744#4882..4989#5403..5564#5887..5991#6074..6154#6242..7256#7490..7605#actccagccgcccccctggctggctctgcctctggctccggttcttgccgctcgcgatccccaaagcgcggcaatccgccgcacgcgcgcgcgcgcgctcgcactccctccgccccgccgcgccgtccctcctgacgcggcgtctcgccgccgccgccgccgccgccaggttggtggtcgtcgcttcaggttcgcggaagccagcgcgtgggcaagcgtcctggcctccagggacgagccagggttcgccgggaaggaggacggtgagttcattccccatcggattttccagccatggcgctcgaccccgccgacgatccgctgctcgccgattgcaaggtaaccgtaatccatctaatcttttttgagtaaatttcacaaaactacaggtattttgcataatttatcacgaaactacaaatttaagagcttgtttcacaaacctacagattcagtgtctccgtttatcacaaagctacaggtattttgtacaatctattacaaaactacagatttaagaacttgtttcacaaaactatagatttagtgtattcgtttatcacagagctacacatttagtgtctttatttatcacaaaactacatatttagtgtctccattatcacaaaactacattttttaataatgctaaaacctgtagatttgtgataatgaagatactaaacttgtagttttgtgataaatgaagatattaaatctgtagttttgtaaaacaagttcctaaatctgtagttttgtgatatattgtgcaaagtacctgcagttttgtgataaacgaagacattgaatctatagttttgtgaaacaagttcttaaatctgtagttttgtgatagatcgtgcaaagtatatgtagttttatgaaatttactcaccttttttttttggggtggggggggggggggttgcggttggtctggatggatggtgccatgtctcttgcttctacctaaagccctcctcttccatccgtcccgattcattaagattttccaactcgatctgcgtataccgctcctttctttacaattcatcagtttcatgttgccttagattacccccatttttcatgttaccactatctttcttttatcaagaacccatcttttttgcatttccggctggaatgcaaggcactggggcagccacttgacagcatgcttaatttcttgttcaaaaggttgctcacaaatctattgtcaatgctacattaatcttttttcacttgtgctgtttcccatagcttggcaactttgtcttactaacgttgctatatggaacacatttggtggatggattatttatgttggtgagcccaaatagcttatgcctcctttttatgtttaaacatcattttgcatgcagtacaagttgaatcactttagaataaaagagctaaaggatgtcctgcatcagcttggacttccaaagcaaggaaggaaacaggtttgttcactgcatcttccttcatctttttcattacacaattactttctagtcatcgcttaattaacaccaatggcgctagttaccattcttccttttccttttcttaactacgtaaaatcgctccctctcttaaaagaacttcctaaaaaaactggtccacccttaaaaagacatcgtctaaaaaaaaatctggtgatcctgtaatcccgttaccatgtatggacatgtaactagtattgtgggaaaatgtgagattcagttgggtttaatggcctccatggcaatagcccagacatattttgcaattaaattaacttgtatgtgacttctagtattgcacatatgggatttgttcacttatggaccatttgggtcttgtgctttcgcttcatttacaggaacttgtggacaaaattatagcagtattgtctgatcaacaagaacaaggtacattacactgttgcttttgaaattttgatattttttactggtgtcgactactaaaaggtcatgatttcattttgttcttgcagactccagattgaatggcttgccaaacaaaaagatggttgggaaagaaactgtggctaaaatagttgatgacacttttgcgtgagcttactttctttatatacctttttcaatgatccaattagctatttacaaggcattataaactttgtgtactgcttccagaaaaatgaatggctccacaaatgctgttccagcctctagaaatcagactgactcggggcacattgtaaagcctaaaaggaagtcagatgattctgctcagttggatgtcaaagtccgttgtccctgtggttattccatggccaatgattccatgattaaggtactgttcagaaattcatattacagttacaagtataatcatgcaatatctaattgtcctccaccagccaatccaacagaacctgtaaaatttcttctaaaccttgtactgatcatgctgaattatttgggttactattcatttatgatttatccatcatgagtcttatgtgctgaaacttgaatacagctaattgttttgggttacacatttattcatcgtgagtcttatgtaaaacagaaatgttataccaaatgtagcacctaagtgttgtgttatttcattatttcaaaaattggtagcatctcgtaatctttttcgtgacagttcctgttgcttgcttctgtttagtgttattatccacaatttgtttgccccttttcagtgtgaaggtccacaatgcaatacacagcaacatgtaggctgcgttatcatatctgagaagcctgcagacagtgttcctccagaattaccaccacacttttattgtgatatgtgccgaatcactcgagctgacccgtaagttcttctatactctctgatgtagcaactcatccttactgaaccacccaattgtcctgcgatcacatgcttaatttcttccttgtgccataatgatgtggtatatcaagttcttcatggtagttcaagctcaaacatcttattcttttagttctgtggcattatttatttatttatttatagaactattttttttctgagcaaaaccattttttctgtgaactttaaaactctatgatttctctttattcccgttatgtgcgttttcttgtacgacattgttaggctgagtacataatttaccaaattcctatttggtcttgatatcatagcatattgttctaacatgatttccttctttaacttgcagtttctgggttactgttaatcatcctgtacttccagtctcaataactccctgtaaagtagcatctgatgggtgagttatctattattttgtcaccaaagaacattatttaatgttggttcccaaaatgttggtattgtcacatgtggaatagaagggtcgatctgggggcaagtgggcaggatggatcctacattgttctccacttccttttttcccctcttttttgtttgtgattcatgcttatgtccaggtcatatgctgtacagtatttcgagaagacctttccgctatcaagagctaattgggagatgcttcagaaagatgaatatgacctccaggttaactccctgttccaatgaaccatcattaattttgttcacgatgaccattcctaatcattttgagccataacttattaagatctgtaaaatcgaacctttgcaaagacatctcagtatagagtataaactatggttattatgctttcttattgattttatgctagagaatatttgagttgtttgaccaatatgtatccaattatggccttgattttctgttgcattctttattttcatgcaggtttggtgtatcctattcaatgatagcgtacctttcaggatgcagtggcctttacattctgatattcaaattaatggtatatgcctgagttttctgtgcagcaatgcatattctataacagggttaatagaaaacggtttattcagttaaagaatcatgtcctcaaactcattgcaaatggtatatgcctgagcttactgtacgtaacaatgtatattctataatagggttcatagagaacggtttattcagttagagaatcacgtcctcaaactcattgcactagttttgtttgtataatccatgctagactaacagaacagtgtcgtggaacatacattgtttaatacgctgctttgttatcagcagttcttttacagcttgttgaatttttggacggtgtgttttctgccttgaacttggttgaagggcctcataatctcttggctaatcagtgtttgctgttaggatgtcttgagcttatgttttctgtggtacaattgagcctatttgcccaagctaggtggatgatggtgcctgttactgcattaaaaaccaaacttcatcttcagctcatattttgttgcattaccagttgttttgctcctcgttttactttattgtgggtgatttgtgcatgcacatctttttgcatctatgttttcatgcacttgcatattcctttatttcggcaatttagaaatgtagcaccttgcaagtttacatccttttagctatatctgatctcttgtcacttcatacgttatcttaaacatgccgtgataaatggtcatctgtaccgaatagtagttgaaatgttcaatcataaatctgaactgttcatgttggcaattggttttcttttcttcaggtattcctattagggttgtcaacaggcaacccacacaacagttaggggtgaatggtagagacgatggtccagttgtaagcatcttattctcataaagcatgctattctcttattcaattattcatctgagatattatataca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|
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