Os03g0786900

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Structured Information

Gene Name	Os03g0786900
Description	Tetratricopeptide-like helical domain containing protein
Version	NM_001058028.1 GI:115455784 GeneID:4334355
Length	11235 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os03g0786900, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 3
Location	Chromosome 3:33530530..33541764
Sequence Coding Region	33530548..33530647,33530756..33530850,33530958..33531057,33531552..33531656,33531736..33531898 ,33532104..33532224,33532323..33532385,33532734..33532814,33532922..33533013 ,33533096..33533246,33533586..33533672,33534399..33534518,33534623..33534754 ,33534852..33534949,33535028..33535151,33535235..33535342,33535931..33536066 ,33536860..33536970,33537072..33537135,33537242..33537314,33537871..33538047 ,33538121..33538231,33538920..33539090,33539182..33539337,33539699..33539932 ,33540045..33540212,33540425..33540534,33540622..33541150
Expression	GEO Profiles:Os03g0786900
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008396:33530530..33541764 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008396:33530530..33541764 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atggtgctcaccaccccgctcgccgaggccgcctgccgcaagagcggcctcagcgtcgtcgacatgctctcgccgttctccctcttcaaaaaaatcgacgtgcccgtgcggacggcgagtgaccagccttacaggctgcagatgtttaagattcggatggtctacgcttccgacgtccggaagcaggactacgaggtggcggatcagaggatcaagccagtagtttctgaggccaatgagagtgctcttccagatctgctttcagacccaccacagctagaagatgtacttagcaagcctgaagctgaactgtgccctttgtggattaagaaattcaacagagctctgatgcgtacactctcattttcagagcatgaaacattcgaccaccctgtggcatgtctgttagttgtatcatcaaaggacaatgaaccaatcagcaagtttgttgatctcttcaacacaaatcagttaccttctcttttaaatgaaggcataatggatccccagattcttaagcactatcttatacttcatgatcaacaagatggaccacaagagatagctatgaacattttagcggaaatgaagagcactcttggtttgaatgattgtaaattgttgtgtattaattcttctacagaagcagatggtgcagatgctgagaattcatggttaccttataaatctcatggtttgcacaaccaagacggagcttgttggcttaacacggatgatttgaatgagataaaggacttcatgcaagatttggcttctaatcatataattccctacatggagcaaaagatccgtgtcctcaatcagcaggtagccacaacaaggaagggctttaggaatcaaataaagaacttgtggtggagaaaaagagatgatgttccagaagctgcaaatggcccaatgtatacgttcacctccatagagtcacagattagagttctaggtgactatgctttcatgttacgggactatgagcttgctttgtccaattatagattactctcaacagattataagcttgacaaagcttggaagcgctttgctggtgtgcaggaaatgagtggactgtgctatttcatgttggaccagtcaaggaaggatgctgaatattgcctggacagtgcctttagtacatatctgagaattggatcttctgggaagagaaatgctactagatgtggcatttggtgggcagaaatgcttaaaacaagaggacagtatagggaggcatcaagtgtatactaccgcgtttctaatgaggaaccttcattgcattctgctgtactgcttgagcaagccgcttgttgctatgtgttatctaaaccacctatgcttcggaagtatggatttcacctagtgttagctggaaatagttattacatatccgatcagaagcaacatgctgttcgggcatacagaaatgctctgtttgtttacaaacaacatccttggagttatatcaatgatcatgtacattttaatgttggaaggtggtatggagtccttgggatatttgatgtagccataaagcacttgctggaggtcattgcttgcagccatcagtccctgacaacgcaaagcatgttcctcaatgattttttccattttgttcagagtatggggaagaaatttgatgtctacaagcttcaacttcctgttatcaacatgccatcactcagagttatatatgaagatcatcgtacttatgcatcagatgcagatgttaatgttagtgaaagcatttggcaggagctggaggaagaaatgatcccatcatcatctattgttagaactaactggcttgaaaaatctcctgacttgagaaaatacaaggattcctgtgtttgtgttgtgggagaagcagtaaaagtgaggattgagcttaggaatcctctacaaattcctgttgttgtttcttgcatctctctaatatgtcagctttccaccagtttggatgcttcaagtgctgtcaatagtgtgctgaccacaggtgctggggaagatatagctaacacaaagcctgcgatatcaacatttgaggatgatggaaataatttcacagtttcaaagctggacattgtgttaggaggaagtgaaactaaaagtgtacaacttgaagttactccaaaagttgaaggtattctgaagttacatgggataaggtggacgctctcagatttattagttggctatcaatactttgaatttgacacaaaaaggaaaactaagaaagggaaaaagggacctcgtcgtactttgagcaacaccctgattgtaatcaagggtttacctaaacttacggggtgtattgatcacttgccaacaaatgcgtttgctggagatttacggctactcaagctgaatctgaggaaccagtcagaatatgctgtgaagaatattaagatgaagcttagccatccaagatttgtaattcctggtgatttatcagaagttgatttcgagtttccccaatgcttaagaaagcatgtacaatcagaaattagtactgtatcgacaaaacgtactcagggagatgccaagggtttgctctttacattttctcaagatattaaaattcaagaaggagccacgttctcctggcctatttggttccatgctgcaactcctgggaacttttctctttatatatctctgtattatgaaatggagagcccaagtgagataacttatagaacattgcgcatgcactacaatattgaggtttttccatcacttaatgtgtcctttgctataagaatgtgctcatcaagattgaaagagtatattgtgcgcatggacatcctgaacaggactccctcagagtcatttattcttcatcagttgtcatgcaatgacagtaaatgggcaatttcatcgttgcctttgtgcgattctatccgctctattgaaacagtatcagcaaatcagtctgtgtcgtgcttcttcaagataaaggatttaggtacaaattcttgtaaagaagctgaaaacagttcttgtagaagtgatatgctttttttatctcgtgagggcaacagcaatactgaggagtttgatgtttcccaatctcctattaccaatttccactatcaagagagataccaacagggaaggttggctaagggaccacgggaccttcttgattttattctgatctcgaaagcagtaggtggtaactattccaagtcagatccagacgttcaactactctctcatcatgtgtgccattgcagtgctatcgaccagagtcctatatggtggtttatggaagggcctagaacagttactcatgatttctcaaagtcttactgtgaagcaaacatccagttggtaattcataatactgtgcaacataatatttcagcgagagtagttacctatgacagcgtgccagataaaagccaaactgtcaatttgcaagattctaatagtaatcagggtggatggtatgatgtatcgctggaaaatgacattaaagctatctctactgccaaggggacacattatcagaaacagccatcagagagcatttcaccttttgtttggtgttcattgagttctgctcaagttgacctgaaacctgacacttccactaaagttcctctaaaagtgtgcatatttatgcctggaacatacaatctttcgaattatcagctacaatggaaagtgcattcatccgaggtaggacaggtggatgaaaatcaaagatccggtggtggccaagggcatcctttttatgtcactgttcttcaggatgcttga</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MVLTTPLAEAACRKSGLSVVDMLSPFSLFKKIDVPVRTASDQPY RLQMFKIRMVYASDVRKQDYEVADQRIKPVVSEANESALPDLLSDPPQLEDVLSKPEA ELCPLWIKKFNRALMRTLSFSEHETFDHPVACLLVVSSKDNEPISKFVDLFNTNQLPS LLNEGIMDPQILKHYLILHDQQDGPQEIAMNILAEMKSTLGLNDCKLLCINSSTEADG ADAENSWLPYKSHGLHNQDGACWLNTDDLNEIKDFMQDLASNHIIPYMEQKIRVLNQQ VATTRKGFRNQIKNLWWRKRDDVPEAANGPMYTFTSIESQIRVLGDYAFMLRDYELAL SNYRLLSTDYKLDKAWKRFAGVQEMSGLCYFMLDQSRKDAEYCLDSAFSTYLRIGSSG KRNATRCGIWWAEMLKTRGQYREASSVYYRVSNEEPSLHSAVLLEQAACCYVLSKPPM LRKYGFHLVLAGNSYYISDQKQHAVRAYRNALFVYKQHPWSYINDHVHFNVGRWYGVL GIFDVAIKHLLEVIACSHQSLTTQSMFLNDFFHFVQSMGKKFDVYKLQLPVINMPSLR VIYEDHRTYASDADVNVSESIWQELEEEMIPSSSIVRTNWLEKSPDLRKYKDSCVCVV GEAVKVRIELRNPLQIPVVVSCISLICQLSTSLDASSAVNSVLTTGAGEDIANTKPAI STFEDDGNNFTVSKLDIVLGGSETKSVQLEVTPKVEGILKLHGIRWTLSDLLVGYQYF EFDTKRKTKKGKKGPRRTLSNTLIVIKGLPKLTGCIDHLPTNAFAGDLRLLKLNLRNQ SEYAVKNIKMKLSHPRFVIPGDLSEVDFEFPQCLRKHVQSEISTVSTKRTQGDAKGLL FTFSQDIKIQEGATFSWPIWFHAATPGNFSLYISLYYEMESPSEITYRTLRMHYNIEV FPSLNVSFAIRMCSSRLKEYIVRMDILNRTPSESFILHQLSCNDSKWAISSLPLCDSI RSIETVSANQSVSCFFKIKDLGTNSCKEAENSSCRSDMLFLSREGNSNTEEFDVSQSP ITNFHYQERYQQGRLAKGPRDLLDFILISKAVGGNYSKSDPDVQLLSHHVCHCSAIDQ SPIWWFMEGPRTVTHDFSKSYCEANIQLVIHNTVQHNISARVVTYDSVPDKSQTVNLQ DSNSNQGGWYDVSLENDIKAISTAKGTHYQKQPSESISPFVWCSLSSAQVDLKPDTST KVPLKVCIFMPGTYNLSNYQLQWKVHSSEVGQVDENQRSGGGQGHPFYVTVLQDA</aaseq>
Gene Sequence	<dnaseqindica>19..118#227..321#429..528#1023..1127#1207..1369#1575..1695#1794..1856#2205..2285#2393..2484#2567..2717#3057..3143#3870..3989#4094..4225#4323..4420#4499..4622#4706..4813#5402..5537#6331..6441#6543..6606#6713..6785#7342..7518#7592..7702#8391..8561#8653..8808#9170..9403#9516..9683#9896..10005#10093..10621#gagatcaccccggtggtgatggtgctcaccaccccgctcgccgaggccgcctgccgcaagagcggcctcagcgtcgtcgacatgctctcgccgttctccctcttcaaaaaaatcgacggtgattcacctccccgatgctctccgcttccgataattgtgtgtatgacgcttgtcgcatttcattcgattgggttctgtgacctcatggggaatcccctgtatgcagtgcccgtgcggacggcgagtgaccagccttacaggctgcagatgtttaagattcggatggtctacgcttccgacgtccggaagcaggactacgaggtgattctcgaactttctggaagcttctgggttgtgctgtgggcttgttcagtatggatgcctatggtttatgaatctcttgatggacattggctgttttggagcaggtggcggatcagaggatcaagccagtagtttctgaggccaatgagagtgctcttccagatctgctttcagacccaccacagctagaagatgtacttagcagtgagatcccttactgcttcattttgttatgttctcacctgtgggcatatttactttgagcaaaattatggagccgtagttggaattctatggatcacttaaagtagcgtaatccgatcaccttgacattagaagcaaactgtgacttactatgagcagcaataatcttctattcagattgtttaatttgcagaataattttaggttataattttgcgctggtagtggaagtatctttacaaagtgatcataccaaacgagcgtgtgcattatattttggatagctcaaagttcctgtaaatggtgtgaatatgcgatgtgtttctcagtggctgtgagtgtaaataacaagggatatttgggtggttacaaacatagtgtttctttgccttcgtcatgtcttagagttgatatgaaactgaaataatagtattattgtttgctgtttgttcggtgcatcttacatatggttctttctttgctcttgattccagagcctgaagctgaactgtgccctttgtggattaagaaattcaacagagctctgatgcgtacactctcattttcagagcatgaaacattcgaccaccctgtggcatgtgagatttggaactttcgtcttatttggtgttttttttaaggatatgttcttgctcatgctttgactattgttaacaggtctgttagttgtatcatcaaaggacaatgaaccaatcagcaagtttgttgatctcttcaacacaaatcagttaccttctcttttaaatgaaggcataatggatccccagattcttaagcactatcttatacttcatgatcaacaagatggaccacaagagatgtatattcttcactcagttattatgtttacattagttcttgcatagcctagcaacctgttactaatgaacatgttctctcagttttatagtgttctctagccaaacaatgatataatgtcatatgccaaatgccaacattttacagtgtcatgtatgcaattttccccttcttttttgctgaccttcttttttcttttggtgaagagctatgaacattttagcggaaatgaagagcactcttggtttgaatgattgtaaattgttgtgtattaattcttctacagaagcagatggtgcagatgctgagaattcatggttaccttatgtaagtacagagaactacttcagattaaattgcattagtgtttacgtagtgcagccgatatgcaatctagttacagtattttcttgactaaactacagaaatctcatggtttgcacaaccaagacggagcttgttggcttaacacggatgatttgaatgaggtattgccccatttgatgaatatcatgtcatctgcttatccgtcttcttgggcatattgaatgtcatgaaaccattgtccaacattttgtagcacctaatgattcatctgttccctggtaggtattgttgggaagattagtagcctacttggtagtttttactcagtgtatgcaaggttttcatgggtatcgatgctaagaatacaaaatgaatatttctcgcagatgtatggtattagatcaatgaactttagttattcctctgtagtatccagtgtcacatgcaattattgatttctgagagccaacccatacaagatacttactagataagccgttttttttcagataaaggacttcatgcaagatttggcttctaatcatataattccctacatggagcaaaagatccgtgtcctcaatcagcaggtattttctttattccattactttttttttacctctctcaacaagattaaccattctgtttttgaaaataataataataataataataatattaagcatttttctaggtagccacaacaaggaagggctttaggaatcaaataaagaacttgtggtggagaaaaagagatgatgttccagaagctgcaaatggcccaatgcaagtggttacttacatcttgcccttttccctatataaaaattctgtagtttgctgtaacacttttttttttcttcaacaggtatacgttcacctccatagagtcacagattagagttctaggtgactatgctttcatgttacgggactatgagcttgctttgtccaattatagattactctcaacagattataagcttgacaaagcttggaagcgctttgctggtgtgcaggtgctttatacttgttttaacttcttgccttgatttacatatgacattacttatgtagtgttgttgagtttgaaataaagtagcaatcaaggtggcgattcttaaggaatatcctgggaccagctacgttaacagcctaacatacttttcacctcaaacacgagtttagaccttcttacttgtacaccatatcagaatcatactgtatgcttccaaatttaaagcacatggttcctgaatttgttttgatgattgattgagtactgaatcaagcttgagtgcagtggccaaatattcaagtaggtagtcacttcatgataatgtctgtgtcttttgcaggaaatgagtggactgtgctatttcatgttggaccagtcaaggaaggatgctgaatattgcctggacagtgcctttagtacatatctggtattcatctctatgtccacttctagtttctcagactaaattaaatggttctctttctaaattgtaacctaacatgctagctccatcgatataaatttgtgttctgtgtactgtccaatatgtcatacacaaagagaaaaggagttcctatttagttttgtatgaagcagttttccatgtctattaaatacagttgcatctgattttcaggactattgatattaacattgacttagcaaggagtgatcatatgtcattgatcttactgcgcaaatgctagtctgttgcattgttttatagtcattcatatgatatcaacagtagactcagttaattttatggagttccccagtcattaaattcctgtgtgctctgttcttacccgaattagtgccatgcttcacctagcactgttctaatccaagttgtcattggtggcatctctaggatagatgacttcctttattcccattatttttgggagctgatagttgggtgtgctttgtggcatataataaagaatgcgtgaaactagatatcaagaattgaagaattcataatttgcgattaagggctataaaggggcaggatgattccaaataattaatgctactcttatgtgtaatttcaacttttgaagttaattaaatttggaatgattgatatccttcgtgcttctctgttctttcttgatattgctctcgtttattctattcatatttgtagagaattggatcttctgggaagagaaatgctactagatgtggcatttggtgggcagaaatgcttaaaacaagaggacagtatagggaggcatcaagtgtatactaccgcgtttctaatgaggtagatctagcatcaagcatacattgataaaattttactcatattttttgcaggaagaatttttagtttattacacaacattgatggaattttctaatgttcaggaaccttcattgcattctgctgtactgcttgagcaagccgcttgttgctatgtgttatctaaaccacctatgcttcggaagtatggatttcacctagtgttagctggaaatagttattacatatccgatcaggtgtactataattatatttactgctgtgatatttaattaatgctttagaagtatattatatctttgttgagtctgaaaattcaatctttgagtgcagaagcaacatgctgttcgggcatacagaaatgctctgtttgtttacaaacaacatccttggagttatatcaatgatcatgtacattttaatgttggaaggtagttgtgtgttttagctcctatccatatatttttcttgtctataaactattattaactctggtgactgtaaactaggtggtatggagtccttgggatatttgatgtagccataaagcacttgctggaggtcattgcttgcagccatcagtccctgacaacgcaaagcatgttcctcaatgattttttccattttgttcaggttcttgaccagctccatttgtgctctcattttggtgaaccaaacttctat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External Link(s)	NCBI Gene:Os03g0786900, RefSeq:Os03g0786900