Os03g0858100

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Structured Information

Gene Name	Os03g0858100
Description	Similar to CRM1 protein (Fragment)
Version	NM_001058494.1 GI:115456716 GeneID:4334849
Length	10358 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os03g0858100, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 3
Location	Chromosome 3:37063564..37073921
Sequence Coding Region	37063995..37064117,37064560..37064664,37064736..37064867,37064945..37065082,37065163..37065270 ,37065399..37065509,37065596..37065662,37065825..37066007,37066104..37066184 ,37066719..37066804,37067401..37067490,37067573..37067653,37067745..37067843 ,37068019..37068084,37068341..37068449,37068526..37068623,37068760..37068870 ,37069259..37069318,37069450..37069650,37069819..37069914,37069997..37070104 ,37070383..37070427,37070539..37070598,37070709..37070786,37071015..37071083 ,37071173..37071311,37071452..37071534,37071602..37071709,37071821..37071892 ,37071994..37072086,37073041..37073157,37073591..37073686
Expression	GEO Profiles:Os03g0858100
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008396:37063564..37073921 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008396:37063564..37073921 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atggcggagaagctgagggatctgagccagcccatagacgtcccgctgctggacgccactgtcgccgccttctacggcaccggatctaaggaagagaggaatgccgctgatcagatactacgggatctacagaataatccagatatgtggctgcaggtggtccacattctgcagaattctcacaacttgaacaccaagttctttgccctccaagtacttgaaagtgttataaagtataggtggaatgcattgccaactgaacaacgtgatggcatcaagaattacatatctgatgttattgtccagctctccagtaatgaggcttcttttcggcaagagagactttatgttaataaactcaacattatactggtgcaggttctgaagcatgagtggccagctaggtggtcatctttcgttcctgaccttgttgctgctgcaaagagtagtgaaaccatatgcgaaaattgcatggctatattgaagcttttaagcgaagaaatttttgatttttcaagaggtgaaatgacacaacagaagattaaagaactgaagtcatcacttaacagtgaatttcgtcttattcatgagctatgtttatatgtcctatctgcaacacaaagacctgagctcatccgtgctacactggctacacttcatgctttcttatcatggataccagtgggcttcatatttgagtcacctttgctggagacattactgaagttctttcctatggctgcttatcggaaccttacactccagtgccttacagaggtcgctgctcttcagtttggtgatttttataatgtgcagtatgtgaagatgtatacgattttcatgatgcagttgcaggctattcttcctcctggaacaattcctgatgcttatgctaatggctccagtgaagaacaggcattcatacaaaatctagctctttttttcacttctttcttcaagaatcacatgcgcatattggaggcatctccagaaaatagagctgcattacttctgggccttgagtacctcattggaatttcatatgttgatgacacagaggtttttaaggtgtgtttggattactggaatgtgtttgttttagagctatttgaagcacacaatcaaatggagcctgcagcatctgtaaacatgatgggacttcaggctcagatgctccctggagttgatggcaccatcacagctgttcagcagaggcgtcagctttactcaggcccactatcaaaattacgaatgttgatgatttgtcggatggcaaaaccagaggaggtactgattgtggaagatgaaaatgggaatattgtacgtgaaacaatgaaagacaacgatgttcttgtccagtataagattatgagggaaacactgatctacttgtctcatcttgatcatgaggatacagagcagcaaatgctgaagaaattgagtaagcaattaaatggagaagactggagttggaataacctcaatactctctgctgggcaatcggatcaatatctggttctatggtggaggaacaggaaaataggttcttggtaatggttattcgcgatttattaaatctctgtgaaatcacaaaggggaaggataataaagctgtgattgccagtaacatcatgtatgttgttggtcagtacccaagatttctcagggctcattggaagttcttgaaaacggtggttaacaaactatttgagttcatgcatgagatgcatcctggagttcaggatatggcgtgtgatacttttctgaaaattgttcagaaatgcaagcgcaaatttgtcacacaacaggtgggcgagaacgaaccatttgtttctgaactgttgtccagccttgccacgacaattggtgatcttgagccgcaccagattcatacgttttatgaatcggttggccacatgattcaagctgaatctgataacactaagagagatgaatacctcaaaagactgatgagcctccctaatcagaaatgggccgagataattggacaggcaagccaaagcattgatatcctgaagaaccaggatgttattagatctgttcttaacatcctgcagacaaacacaagtgttgctagctcacttggaccacactttttcccgcaaatttccctaatctttcttgacatgttgacagtttacagaatgtacagtgagcttgtatcaagcaccattgctgaagggggaccttttgcctcaaggacctcctttgtaaaactccttagatctgtcaagagggaaacattgaaattgattgagacttttgtggacaaagctgaagatctaccacacattgggaaacagtttgttcctcctatgatggatcctattcttgctgactatgctagaaatgttcccgatgctagggaatctgaagttctgtccctgtttgcgacgatcataaacaaatacaaaggtgaaatgcttgaagacgtgcctcgcatatttgaggctgttttccagtgcactcttgagatgatcactaaaaactttgaagattacccggagcatcgcctcaaatttttctctttgcttcgtgcgattggcacccattgcttccaagcattaattcagctttcaagtcagcaattgaaacttgtgattgactctatcaactgggcatttagacatacagagagaaacatcgcagagactggtctcagtctattgctggaaattttaaagaactttcaggcctcaggattccaaaatcaattctacaaaacttattttttgaatattgaacaagagatctttgcagttctgacagacacattccacaagcctggtttcaagcttcatgttttggtgctgcagcacttattttgtgtggttgatggtctgacggagcctctctgggatgcatcctcagtaccataccaatatactgacaacgctatgtttgtccgagattacacaataaaacttttaggttcatcatttcccaacatgacacctactgaggttacaaaatttgttgatgggcttcttagttcaaaacatgaccttccaagcttcaaaaaccatattagggatttcctggtgcaatcaaaggagttctcggctcaggataataaggatttgtatgctgaagaggctgctgcacaaagagagagggagcgtcaacgaatgcttgccattccagggcttattgccccaagcgaattacaagatgagatggttgattcataa</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MAEKLRDLSQPIDVPLLDATVAAFYGTGSKEERNAADQILRDLQ NNPDMWLQVVHILQNSHNLNTKFFALQVLESVIKYRWNALPTEQRDGIKNYISDVIVQ LSSNEASFRQERLYVNKLNIILVQVLKHEWPARWSSFVPDLVAAAKSSETICENCMAI LKLLSEEIFDFSRGEMTQQKIKELKSSLNSEFRLIHELCLYVLSATQRPELIRATLAT LHAFLSWIPVGFIFESPLLETLLKFFPMAAYRNLTLQCLTEVAALQFGDFYNVQYVKM YTIFMMQLQAILPPGTIPDAYANGSSEEQAFIQNLALFFTSFFKNHMRILEASPENRA ALLLGLEYLIGISYVDDTEVFKVCLDYWNVFVLELFEAHNQMEPAASVNMMGLQAQML PGVDGTITAVQQRRQLYSGPLSKLRMLMICRMAKPEEVLIVEDENGNIVRETMKDNDV LVQYKIMRETLIYLSHLDHEDTEQQMLKKLSKQLNGEDWSWNNLNTLCWAIGSISGSM VEEQENRFLVMVIRDLLNLCEITKGKDNKAVIASNIMYVVGQYPRFLRAHWKFLKTVV NKLFEFMHEMHPGVQDMACDTFLKIVQKCKRKFVTQQVGENEPFVSELLSSLATTIGD LEPHQIHTFYESVGHMIQAESDNTKRDEYLKRLMSLPNQKWAEIIGQASQSIDILKNQ DVIRSVLNILQTNTSVASSLGPHFFPQISLIFLDMLTVYRMYSELVSSTIAEGGPFAS RTSFVKLLRSVKRETLKLIETFVDKAEDLPHIGKQFVPPMMDPILADYARNVPDARES EVLSLFATIINKYKGEMLEDVPRIFEAVFQCTLEMITKNFEDYPEHRLKFFSLLRAIG THCFQALIQLSSQQLKLVIDSINWAFRHTERNIAETGLSLLLEILKNFQASGFQNQFY KTYFLNIEQEIFAVLTDTFHKPGFKLHVLVLQHLFCVVDGLTEPLWDASSVPYQYTDN AMFVRDYTIKLLGSSFPNMTPTEVTKFVDGLLSSKHDLPSFKNHIRDFLVQSKEFSAQ DNKDLYAEEAAAQRERERQRMLAIPGLIAPSELQDEMVDS</aaseq>
Gene Sequence	<dnaseqindica>9805..9927#9258..9362#9055..9186#8840..8977#8652..8759#8413..8523#8260..8326#7915..8097#7738..7818#7118..7203#6432..6521#6269..6349#6079..6177#5838..5903#5473..5581#5299..5396#5052..5162#4604..4663#4272..4472#4008..4103#3818..3925#3495..3539#3324..3383#3136..3213#2839..2907#2611..2749#2388..2470#2213..2320#2030..2101#1836..1928#765..881#236..331#gtactttccccgcaaccccaaacaacaaggaaggaagacgctcctcccctcccatctcttaaaccccaaaaaaaccaaaataaaaatcctcctcctcctccgcctccgcttcccttcccttccccgatagaaatccatccctcccgccgccgccgccgccgccgctcctagggttccggcacctccccgaatccccccctcacttcgacccctgttcgcttcacccgccgccgccatggcggagaagctgagggatctgagccagcccatagacgtcccgctgctggacgccactgtcgccgccttctacggcaccggatctaaggaagaggtattctacttctccgcccgctcgctcgcccgcgccttgcgtgcttcttccccgccaccgccgccggacagcttccgagacttagggtttacgcgctttcttctcctatgcgttcccaaccctatccgctctcaccgcccgccaatgccctctcaaccttactctttttcatccttagggtttcgtatttactggagtatgcgtcaagctgggcgttgctgctgctattatagcaccgtttatgaccccccccttcacgctctgtgtttgctgttgctgccctgctgcatattcgtttatccttttattttaacctcctgccaatatacaatgtcattatcacctttaatgtgtttcttcctaccatttttttgattaagcaatgtcatgcatgcatccatattatccttatgtgccttttttcttctttcagaggaatgccgctgatcagatactacgggatctacagaataatccagatatgtggctgcaggtggtccacattctgcagaattctcacaacttgaacaccaagttctttgccctccaagtaagtttccgcacctcactagttagccatgttaggtttctttgcaactcaataaagatggctgccatttctcttaatgattagcattgtagtaagatattttttcatcccgtaatacctgcactttacattacacgtttgcttatatgattgtagtgtaactgtgttaggagaggttctcatagtcaccatatcctatatttgagcattcagattgttcaacagtgttgagtgttttatcacttatgtactaccacattatagagacgaatcaaccctaggagaaacacatgttgcttatttgccttcgcaggcctagcgcataggctagattgaatacatacataggccatgcttaaaaaatttaaatgcaggatggtagcatgaagtttgtacagaaccctgtttacagtaaaagtggatgcttccttttttacagaaatagatggagacctaagtttctaaatatcagtttgcagtttttgtgctatgcttattttttaacatgctggagaaacatggtttataatggcctctatttagagcagtgaaaggtgacatgttggttctattgtttcaccaacagaataaaaagagcttctcttttgccacttcagaatctctaatctctttcactattcaaataaggctcatctctttttttgccatgactccatcatcacccttctctttttggcagaaccacagaaattgtttaggggccatatggtatgatcatgcaacccatagttatgtgcatcagccataaataaaacctgggttttctgcatctacaagctagtttcaacatgatgctgatgcttgctccatgttcattttaaattaggagatcccaacctgggatgtctctgtgcatgcatgctagtgctacatcttcacttgtagctgcgaagttcattctgtgtcatttcctgattttgctacacattttaggtacttgaaagtgttataaagtataggtggaatgcattgccaactgaacaacgtgatggcatcaagaattacatatctgatgttattgtccaggtaaggaccaatacatttgacaaatcttttatttcatctggcccatgaaaacaaatctcattcgtgtatgccttttatgttctctttcgtcactctatcagctctccagtaatgaggcttcttttcggcaagagagactttatgttaataaactcaacattatactggtgcaggtaagctgtactgtttcagtcaccttttaagtcatagcactgcttgttattatctatttgttcatctggcaagtcaactgacttgtattattaattgttgcaatataataggttctgaagcatgagtggccagctaggtggtcatctttcgttcctgaccttgttgctgctgcaaagagtagtgaaaccatatgcgaaaattgcatggctatattgaaggcaagttgagttatcacctgtttctgtttaacaacatggaaccaactactgactctgcgatttgcagcttttaagcgaagaaatttttgatttttcaagaggtgaaatgacacaacagaagattaaagaactgaagtcatcacttaacaggttggttcttgttaccatctttgtccttttagggtgttctgtatctatatatattagaccacagtcaattattttgacatatactttattgcgactgccttttgaactgatgcaacattattttccttattgttgaacagtgaatttcgtcttattcatgagctatgtttatatgtcctatctgcaacacaaagacctgagctcatccgtgctacactggctacacttcatgctttcttatcatggataccagtgggcttcatatttgagtcacctttggtatgtagcttatttctaaacttatcaggaaagatcctacatagaatttatcaaatcatgtcttatttttcttcatatatgtttgttagctggagacattactgaagttctttcctatggctgcttatcggaaccttacactccagtgccttacagaggtaaattggtgatgtatttcctgctgtgtctaattagcaatgtttctaactgcgtatgttcctaatggagtaataaaaaatggaccatatccattagtttggttcagttttttttttctatatatcctttttgaatgggggcagtaaaccagccctattgcatttgagaaacatgtaaccttgttggtttaataccctatttatcttttgtatatatggatcttgcaggtcgctgctcttcagtttggtgatttttataatgtgcagtatgtgaagatgtatacgattttcatgatgcagttgcaggtaaagaatgtcttcaggaatctgttgcttccttctttctaaagtatcctcgccctttccccctccttttaaatatgtacttatgaacgacccttccataacatgtataggctattcttcctcctggaacaattcctgatgcttatgctaatggctccagtgaagaacaggtatggcagtgattacttcaataacagtcagtcataggagtctggttgatttctcattttttaaataccattgaggtactgtattaataaaatgtattttccttggtgcaggcattcatacaaaatctagctctttttttcacttctttcttcaaggtaggatttctcacattctctgtatgcctaactatcttattttttgagataataaaattgcacacttaaaatatatgaaactttctttgagatgctgtaactaattaacctactcttttgatgtcatattcccagttgtgacaaaaaaagctgatttgttcttgtattggccttgtcaatttatacactgaaaaaataacataaatgttagttacgccgtacgaaatcatgatttagtttcaatatgctctgatctctttatttggtgatacatttagaatcacatgcgcatattggaggcatctccagaaaatagagctgcattacttctgggccttgagtacctcattggaatttcatatgttgatgacacagaggtttttaaggtaagtaatttatagctagattcggtacatatatgaatggttcaagagagatgcatatcttataattttggccgatttgcaggtgtgtttggattactggaatgtgtttgttttagagctatttgaagcacacaatcaaatggagcctgcagcatctgtaaacatgatgggacttcaggtgttcctctatgaattttttacatgaattcaatggctttgatatattcacctttgcaattcatgcactttttgcaaacttttccttctatttcacttgttatttcttgttttgaagtgctgcactcttctacatcgtcgactcatcgcacatatgaataatctgtaggctcagatgctccctggagttgatggcaccatcacagctgttcagcagaggcgtcagctttactcaggcccactatcaaaattacgaatgttgatgatttgtcggatggcaaaaccagaggaggtactgattgtggaagatgaaaatgggaatattgtacgtgaaacaatgaaagacaacgatgttcttgtccagtataaggttagtaacagaatgtgtagctattttccacccctgtacacaaattgtgtcacatactctgtgcttcacctgtttaatttaattgtcaaacttatgtgttgcctcctttctttaattaattgttttggcagattatgagggaaacactgatctacttgtctcatcttgatcatgaggatacagagcagcaagtatgtcctgtctacagatattttcattaaaaaaacacatgctataaatattatgctttgttcatgctatgtgatatccattgaatttgttccatttctatgttgagatagcgcaagttgtggcttaaacctgacttcaaatgatgacaacacatggctttagtttgaaagtgcctactgtaatattagtagttagtaagctacttgttggtcaaagctcaattctgtgtaacctaggaaagttatgtgagcaagctcactatgtgtagcccaagagcaattaaaaatgtctactttttcgatataattgttgcacaatttctccatctggtttagtgctttgtacgaagttaaaccagaaaactacaaatttgttttgggatcccagatgctgaagaaattgagtaagcaattaaatggagaagactggagttggaataacctcaatactctctgctgggcaatcggatcaatatctggttctatggtggaggaacaggtttgaataatcatacactgttccattctttttgtctttggcaaacgttaaggaggactaatatttagctttgtgataattttgaccatttcatgcagtgctgaaattcttaatggtttctgtggatctttttcaggaaaataggttcttggtaatggttattcgcgatttattaaatctctgtgaaatcacaaaggggaaggataataaagctgtgattgccagtaacatcatgtaagcattcatctcaactacccatgtttatactaacaaaattaaggtttgactgatctgatgattgctttgttaggtatgttgttggtcagtacccaagatttctcagggctcattggaagttcttgaaaacggtggttaacaaactatttgagttcatgcatgagatgcatcctggagttcaggtcagtgtgcattcacatgtagtctgttgtgttggtgcagaatcactgttttgcagcccttgtagtgtggaacttagattggaactgcttgcagccatctttccttccatgatcttaataacaagttactcatgtatctgttgtttgatcatcacacacgctgtttgctgctatctccagtttgtgcaaatagtttaatgcctcaacacttctgttagtgttgtatgtaatgtatgccttgctctgctgattgcaggatatggcgtgtgatacttttctgaaaattgttcagaaatgcaagcgcaaatttgtcacacaacaggtaaattcaatcacattgcttgatatctcaaactcttatgtggatactttgctgctatttcattacaaattatgttttacttaaagcatgtgctgaatttaatttaagcacatgcatctaatttatgctaatatgcaccggtgacacaccaacttcatgtttctttgttatctaggtgggcgagaacgaaccatttgtttctgaactgttgtccagccttgccacgacaattggtgatcttgagccgcaccagattcatacgttttatgaatcggtatgcttaaaaaccaaataagtaaaacacaatttcaatcagaatagtttatcattaatattattttgtgctatctgattttgctgctcaggttggccacatgattcaagctgaatctgataacactaagagagatgaatacctcaaaagactgatgagcctccctaatcaggttccttattctacattcttagtatgcctttatactttttctggaaaatgtagttttgacaggttttcctatcattgaacagaaatgggccgagataattggacaggcaagccaaagcattgatatcctgaagaaccaggatgttattagatctgttcttaacatcctgcaggtaatttaatggagcctgagaatttcatttgtctattgttttgaaattcgctgtgtgaactgcggtattatttcctttctttcgttgtttttgttttttcttgatgttctttttatttatttattttataatttgtaaagcttcaaagttagatcgtccacctagtaggaactgaactgcgtagccaggtatatgctaagtcacgaactggtagggacatttttgttcattatagctcactgaaccaatttatagagcatgctttttcttgtgagattgtgcttgggaactttgaaaatatttagggtcaatttgctgtgtaaaactgtagatatcatacattctagaaaatattttgcaattgttgtttgtgtgttacctctaggtagttagccagcaattgcacttgcttgcttttggttcctctgtgtgcttcgctgtctgttgaattaaaacattttctttgtgtacaatgtgctgtttttagtgtaattttcagtttcatttaccttttgcacaaccctccttggtcttagatactgttggttttttgttatttctcctggtgtaataaatgttgttatatgtgcttgcagacaaacacaagtgttgctagctcacttggaccacactttttcccgcaaatttccctaatctttcttgacatgttgacagtttacaggtattttgttcaccgcttactgtattttattgctgtattatgttaactcttagataatggtacagcattttcttggaagtacaaagctaatcaagtattacaaatctggggcactcggcggggtaaataaattgaagcaactgactaaaacaattgatggaaaatcaaatctcgatacactatattgctaaatctcagtattgtactacataacaccttccgaagttagatcaaggtctcagatgaactgttctttgggattgtcctgcctggtgcctgcccatgtaaaacttggtctctcttgtatggcaatatgcaaacaaccacaactttctggggcctgcagaatttggcccagaaagcaagcgatcatgctaaatttgctccaatctactagttagaattttcttttttgccattgtgcctgccatgttctgattattcttgtggtcaaggttgatttcatcttgttatgcctttaatacttcattagctaataccatcttttttgttcgtgcattgttttcacatcagaatgtacagtgagcttgtatcaagcaccattgctgaagggggaccttttgcctcaaggacctcctttgtaaaactccttaggtatgaattgatggtttctctttatcaaggacctcctttgtaaatctccttaggtatgaattgttgttttactaaattatgctctatatgtgacagatctgtcaagagggaaacattgaaattgattgagacttttgtggacaaagctgaagatctaccacacattgggaaacagtttgttcctcctatgatggatcctattcttgctgactatgctagaaatgttcccgatgctagggaatctgaagttctgtccctgtttgcgacgatcataaacaagtatatgcctccaacctgataatgtctttgtttttgtagatgtaaattaaaatgtgtttttattatttcagttcgtaggaaatttcttccaactgtacatcttgttgcactgtctgttctgatattcctttccagtaatcatcattttaatgtttattgtagatacaaaggtgaaatgcttgaagacgtgcctcgcatatttgaggctgttttccagtgcactcttgaggtaggaatacctattaagcttcctttttcattctatccataggtaatatttttagattggattaataatttgttctgtcctgtcagatgatcactaaaaactttgaagattacccggagcatcgcctcaaatttttctctttgcttcgtgcgattggcacccattgcttccaagcattaattcagctttcaagtcaggttagtaccaactatttaaaacatcattcttccttgttgatttaaatttactattgagttcagatacatcaacatattatcttctattcttctgttttatctgattattggattgttatcttattcagcaattgaaacttgtgattgactctatcaactgggcatttagacatacagagagaaacatcgcagagactggtctcagtctattgctggaaattttaaagaactttcaggtagaaaatacaatccacaatttgctaccattgcataatattctgtttgcttatgttttttttacatgattcacttgcaggcctcaggattccaaaatcaattctacaaaacttattttttgaatattgaacaagagatctttgcagttctgacagacacattccacaagcctggtttcaagcttcatgttttggtgctgcagcacttattttgtgtggtatgtcaatattcatttttatctgttctcttttgtttgtatggatacacttaattattaattttcctaatttgtaggttgatggtctgacggagcctctctgggatgcatcctcagtaccataccaatatactgacaacgctatgtttgtccgagattacacaataaaacttttaggttcatcatttcccaacatgacacctactgaggtatgatccttcttttgcagctatcctgtgcttctgtggccatcatagacctaacaacttttcccgcacaggttacaaaatttgttgatgggcttcttagttcaaaacatgaccttccaagcttcaaaaaccatattagggatttcctggtgcaatcaaaggagttctcggctcaggtaatttgctcctaccccttgacactggcatggacctgatttttcacaattcaaaggaattagaggaaccaatacttcactataccagaaatagtaagaacatagtttatcagaaaccaacagttgctaattaccagagagtggatgttgccacgtggtagtatggtgccaacttgagaaaacgatagatatggaatcatgtgccaagtatagcgttaatgttagggcctttacaatgcataagtgcccattttttatttgttttca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External Link(s)	NCBI Gene:Os03g0858100, RefSeq:Os03g0858100