Os05g0163400
| Gene Name |
Os05g0163400 |
|---|---|
| Description |
Zinc finger, RING-type domain containing protein |
| Version |
NM_001061271.1 GI:115462272 GeneID:4337902 |
| Length |
7086 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0163400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:3696376..3703461 |
| Sequence Coding Region |
3696595..3696732,3696836..3696982,3697064..3697162,3697244..3697695,3698039..3698722 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:3696376..3703461 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008398:3696376..3703461 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggctggacatcagtataataattcccagatgtcccggatggatcatatggacaggctaaacaatgaacctccaccttttggccaaaagttatttatgcatcctaggagtgatccagctaacggagctggatcgtctggctatgtgggtaacacaatgagatcgaatgatcttccgtcttcaagttatgctggccaagcttatggtcagcagaatagagcccccatccatgcttcatattctggtcatgcacctgctggaagctctagtggtagctatgcaccatacaatactcaacatatgcctgcttcaagctatccacacggatccgaggataatttcattccaagttcccatgtggatggcagaagggttgcattgaagagaagaaatcccatcattcatcctacagatggattcggtgttggaaattattatgctggcagttcttccaatactcagttctctcggcccatgcctccaaatcctattccacctcctgaatcctgtgttcgaatgccctcacacttgggttcgaaccactggaatgatcaccgctatgttaatcatgaaggatctcagaggaatgtgaggggaagacatgatcatagtactatccatttggaacaaagtccagctgcagcttgcccgtcaagcagcatcaatgtgccaccataccatccaaatgcaaatggtccttttggaagtgcaccagtacaacgtgacagagctcctttatctgtgcatccaagaattcttcctccagggcctgatggtagtagcatagcattcagagagaggccatactatcctgctccacagagcaccaacataagtgcacctgtgccaacgcttcctatttcttgtgacagtgcaccatttgctcatggtgggtacgcccctagatcagctcatcgtaacaacttacgcacttatcctcctccagcttttgcatcttcttccaaccctggagcagtctcccatgagccagctattcctagctatccacctgctgcccctagctatccacctgcaacctctgcagcatcatcaagtgtccagccatttcatgctgaagctgctgcacatttgaggcatccaaggcatgtatctgtagggggcagtggtagtgcaaggagtagaaggatgagggattcctatcatggttttcatcatttgatgattgaagacaataacttgggaagatcagcagctgagcggtttatgatgctggatcagttagttatccatgaatcaagagaagcattcgatcctcactgggacatgagactggacattgatgacatgagctatgaggagctgctggctttggaagaacgcataggccatgtgaacactggcctcgctgatgagaaaatttctggctgtgtgatggaggtagcctgctgcagcagtagtcatttgcaggatgatcaggacaatgaaagatgtgtaatctgcctggaggaatacaagcatgaggacacacttgggaggctgaaatgcggccacgggtttcactgcaattgcatcaagaagtggctgcaggtgaagaacacctgcccagtttgcaaagctgctgccgcagatgaaggcagctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAGHQYNNSQMSRMDHMDRLNNEPPPFGQKLFMHPRSDPANGAG SSGYVGNTMRSNDLPSSSYAGQAYGQQNRAPIHASYSGHAPAGSSSGSYAPYNTQHMP ASSYPHGSEDNFIPSSHVDGRRVALKRRNPIIHPTDGFGVGNYYAGSSSNTQFSRPMP PNPIPPPESCVRMPSHLGSNHWNDHRYVNHEGSQRNVRGRHDHSTIHLEQSPAAACPS SSINVPPYHPNANGPFGSAPVQRDRAPLSVHPRILPPGPDGSSIAFRERPYYPAPQST NISAPVPTLPISCDSAPFAHGGYAPRSAHRNNLRTYPPPAFASSSNPGAVSHEPAIPS YPPAAPSYPPATSAASSSVQPFHAEAAAHLRHPRHVSVGGSGSARSRRMRDSYHGFHH LMIEDNNLGRSAAERFMMLDQLVIHESREAFDPHWDMRLDIDDMSYEELLALEERIGH VNTGLADEKISGCVMEVACCSSSHLQDDQDNERCVICLEEYKHEDTLGRLKCGHGFHC NCIKKWLQVKNTCPVCKAAAADEGS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6730..6867#6480..6626#6300..6398#5767..6218#4740..5423#4562..4643#tttcttttttatttttttcttcgaggaggaagcaaacagcgtcgctccacgaaaccatcgctgcggttgcgtgctcgcgcgaagaagaggagagagaggaccaaaccctcgtctcctcctcctccggtggtggggggagaggaggcggcggcggagaggacgagccgtctactggatcggccgcccacgaggaggtattgcccccgttcccctccgattcgctccccccaaattccccccgcgtaataatccaagggtttgtgttgatcgggtggggttttctcgccgggtagaccatttcctgcggttgattgttggtgcgtgacgggagcggagcgtgatcgggtatcggacgtggtcggattgatgggggaatttctgggattactcgtcgtcggcttaataatcgatgaggcgggtgtgatgtacagcggcgcgattggtcgattcaggtttcagagtgcttgagatcatgtgatttccgctgcgaaggaagttttcatctcctgtgactggaatcacgcgctaatccgtaccgaactctctctattggggcgtcctgttggtgtcaaacaagccgttcacagcgatcctgtctgttcataactattgtttgcctagttgcaattaactgtttatctttgtcagtctaatcttttggccataggttgttctcgccccctaatcagttgttggaacttatctttgtgctttagcttctatggatgagtcgtaggtgtgattgtttagtagtaaaattatttgagtttttgtcttgttcaaatcacgcatttaattggaaaatgttcctcaccaccactgagtctttcagttctatcaaggagtcagcatcttctggcccagccttttttgcgttgctacactttagttcgagagtctcatacatacttgagccaccaactatatacctttggagatttttcttattttccctcttaggcacaatattgacatagtaaaagtacatcataaatttaacttcaagagctaagctctactaattaaagtggtcctttattcttcttattgtccatgtaagaatagttcagtgagaagagttatttgacccgtgtaacttttaagtcagcaaacatttttgtttgactccttgtcctgtctattagcagcctagcatggcatctttagttgaactcttctacaagggactacactatctaatgtgttatcacagtttcttatgtaatagaaatgcaattcatgtcatttcttagcatctaaatgatcaacggatagaaaaaaaattatatgacgtgtataactcatgctatatctgaaccttcaagtgtaccttcttctcatgatgcttctcccaatggaaagcatccctttaacccttccatccatattggttcttaaatttccatgtcttccatcagacagagaacatataagttctacaacctcggtttatccttagaagcagaaatgttcaatatgtcaaaggtacaactccgtgtcctttgctttgaaattcaacatcacttgcacaacatgtcttctgcatcttcaggtactccttattaacatttcaagactatctatatagtattttattttattagaaatgccacgaaaccaccatttattatgcaaatgcaggctatagtgagattcggcttccacaataacccacgaccttgaaagctgttattaagatctattagagttggacacaatctttggaacatgattcagttatgttgtgtgtttgactccacatttgggacacgcgggaattaggttgggtaagcaattgccatttcttccaataatctgatggtcaggtattcaggttagtgaatggttccagacatattagttgcatatatataatgagtaaattggaagttatcacttttaatcatcttaatcctttgtgtcattctcacctttacaaaaggacatataccttctcattcttctcccttttctcaaactgttataaacttataatagtttcctttgttttctctagcccttatagtttgttgctgttctaactctaaaaatgaaaactaaaacaaggggaatttatatctttgggaatactacctagctttttatcatacaaatgttgtgtaatacctttaccagggtattataactgttaatactttgaactgagctactaatgacattgcaggtactaattgattcttccctgtaatggagagttttattttccttgatttaccaaaatcaagcttacattaaggtgtaacaaatgggtgttttgggctccataatcattttgttgatgctaaatgctgactactggtgcagcaaatggaagagctcttccagttgatatatgccatttgaggacatgtgctttgtcctcagtataagaacattggcctaacatcattgttggagttgcattgcccttagagtggggaaagcgacacctcttgcaagatagtaacagcaattatatcataaattacaagtcaggccttccaatgtggttttggatgaggcaattgatacattgtcatttgatgctgaattttttgttcgtctgacgactggaaagggggcacctacgacgattagcttagtacttagtgatggtgtatgaagagcattgatagtctcatggcccattgctaacatgtagagaaggattttgagttccttggaagtattgactggaggagtgtgaactacttcgcaaatagatgggtgtaaaatctgggaaagaaaacttaaagagctaaatgttttctaccatattagttgatctgaaggtgctttccaagtcaaaatcagcttagcatatagaattgacttggtgatggcggtacctggacccttgaagcagcagttcagaactgattgcactgagtattttctctggagatatccatttgatggaggtggaaggaaagagaggctagtcaatagtaggtcaactgatggtgtttgaaacaagatgcacttactcataagcagaataaacaagcacaacaatgccatgaagggaaccttagcaatgccgtacatctggcatcatttaaaacggggcttgttccactgttatactatgaccatccgccttgatggttttgcctggctattctgaagctattagttagcgttacaccttttaagttttacacatccagtgttgttcttttgtttttctaatattatgtacagatatctctcccacatgtcatagctcaatatgacaagggctttatccttttccatgtaaatatttgagattcagtcagattcttatacttgctacttgctagaatgtgaatgataactgtactgttggaagagtgttgtcatacatacaaattagttataaatttgtttctacttttgctacttgtattgtcattgttacataagattgcaatgcatttgatgttccttgatgttctgatgttgtcttgttatcggccatactataattggggaaaaaaagaaatataaagctattttagtatccacaaacacatttttatgttttttgtgaaacatggtattcatatgctgttgtaacatgtatgccaatattatgttggtttgtcctttggagaaaagatgaatgtagtcttgatatttggacctattttgtctcaaatcatgcctgaagatgtaaatataaccatattaataggtgaatagtgttgaaatgttgtatgtttttgagcttgaagtcaaaacatattaaaacaaccagaatgcttcttagaatctacacatgcagcacaaccaatgttttgagctatcacttttactgagactgctgcaatctatcaactctgccttttcttgattatatcttttcccccatgaaatataaccaacatcatgtatgaaaaggtgcaaataattttatgtgtacaacacaaacatggatttgggcacaatatatttttggtactgtttagactttaagttgtcatggggaaatgtaatcggtgtcatagttatcctgcaaagtagtcatgaaattttggtggatttcgaattgttcaacagctgcacctttatcaaagccatgtctttatgcattggttcttaaattaagtgtcgaactgttgcttcctgcaacagattggtatgcaattccatttctggtttatatctggaactgctattctgcggccaaaacagcctttgttttggcttattttttgtctgaatacaatgctcagatttccttcgaagtgttcctggatatgtatgacaggaactttcatatgtgtagaatgctttgtgttaaattaagtaagacactggacatgatgaatcatttggcccatggcatctcagatctgtgtgactcaggtctcaaatataacgcttctaaggttgaaatgctttgttcctgaagtttatgaatttgtgattatgcatatattatcttgcccttctttttctagtttaaaacttcatgtttacagtccatttgcagctgcaatagatttgctggaaaactaatagagcaacttgttttcccagattaagccaagtttgatcagattgttcacgtgttatggctggacatcagtataataattcccagatgtcccggatggatcatatggacaggctaaacaatgaacctccaccttttggtacatggactaaactgaattacttcctaagtgttcataatcctctcattatctcaagtatggtaaatttacttcactcgtgccttattatgccaggccaaaagttatttatgcatcctaggagtgatccagctaacggagctggatcgtctggctatgtgggtaacacaatgagatcgaatgatcttccgtcttcaagttatgctggccaagcttatggtcagcagaatagagcccccatccatgcttcatattctggtcatgcacctgctggaagctctagtggtagctatgcaccatacaatactcaacatatgcctgcttcaagctatccacacggatccgaggataatttcattccaagttcccatgtggatggcagaagggttgcattgaagagaagaaatcccatcattcatcctacagatggattcggtgttggaaattattatgctggcagttcttccaatactcagttctctcggcccatgcctccaaatcctattccacctcctgaatcctgtgttcgaatgccctcacacttgggttcgaaccactggaatgatcaccgctatgttaatcatgaaggatctcagaggaatgtgaggggaagacatgatcatagtactatccatttggaacaaagtccagctgcagcttgcccgtcaagcagcatcaatgtgccaccataccatccaaatgcaaatggtccttttggaagtgcaccagtacaacgtgacagagctcctttatctgtgcatccaagaattcttcctccaggttagttttgacttcttctcttctatttgcagcttctgttctaatctgatgcgtactttagtctgaactgtaggtacgtaatcatatctcatatgtcaactactacttttttttcttctgtttgttgagataaacccaactcttatgaattatgactatatcagcattcatgattcatctagtagactaatgcaactacttcctttcaagcatagctttttcccactcaattttaatctagtccagtttcaaatgaaatgtgtgcttcctgataaggtggtatgcccattctctgaatttggtattatttaagaagctaagacctttctctgtttttgtctagggcctgatggtagtagcatagcattcagagagaggccatactatcctgctccacagagcaccaacataagtgcacctgtgccaacgcttcctatttcttgtgacagtgcaccatttgctcatggtgggtacgcccctagatcagctcatcgtaacaacttacgcacttatcctcctccagcttttgcatcttcttccaaccctggagcagtctcccatgagccagctattcctagctatccacctgctgcccctagctatccacctgcaacctctgcagcatcatcaagtgtccagccatttcatgctgaagctgctgcacatttgaggcatccaaggcatgtatctgtagggggcagtggtagtgcaaggagtagaaggatgagggattcctatcatggttttcatcatttgatgattgaagacaataacttgggaagatcagcagctgaggtagatattattctctcctcttgatatcagtacaatgttaaaattttgaacacgcatctaatctattttcactctttgtagcggtttatgatgctggatcagttagttatccatgaatcaagagaagcattcgatcctcactgggacatgagactggacattgatgacatgagctatgaggtagaaagaatcaattttctctttaataccacagcagctttagaatgctatttaaacaaatgcaactttttctatacacaggagctgctggctttggaagaacgcataggccatgtgaacactggcctcgctgatgagaaaatttctggctgtgtgatggaggtagcctgctgcagcagtagtcatttgcaggatgatcaggacaatgaaagatgtgtaatctgcctggtaagatagtggatggtaccaatctacctactatgatagcgattcccgcagcgcattttacgcaatacaagttacttaatccacaacctctttttcactgcaggaggaatacaagcatgaggacacacttgggaggctgaaatgcggccacgggtttcactgcaattgcatcaagaagtggctgcaggtgaagaacacctgcccagtttgcaaagctgctgccgcagatgaaggcagctgatgaggggaccaattgatcttcccctccatttatataatgatgcagttcaaggtcaggccaaattatgcctgtctccattgctccgcaatctgtgggctcttgtgaataagttatctcggtcgatatggaattattttgtgagctattagactattataaactcaagcaaaacctatgtgcaatgtaaatctcccaagttagttaatttcgctcaaaagc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |