Os04g0223000
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Structured Information
| Gene Name |
Os04g0223000 |
|---|---|
| Description |
Sec1-like protein family protein |
| Version |
NM_001058805.1 GI:115457339 GeneID:4335201 |
| Length |
16772 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0223000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:8208905..8225676 |
| Sequence Coding Region |
8209186..8209287,8209894..8209981,8211278..8211345,8211422..8211479,8212386..8212466 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008397:8208905..8225676 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>MAQIPNLDNAPLNLAALREQSQKDLLNILKSIRGKKCVVIDPKL AGTLSLILQTSLLKEYGAELRLLSAEPLQTECAKILYLVRSELKFMKLIASQIKNDEP KGLQREFFLYFVPRRTVACEKILEEEKVHQKLTLGEYPLYLVPLDEDVICFELDHSLQ ECLIEGDTSSVWHVAKAIHKLEFAFGVIPNVRAKGVASTKAAELLNSMQQEDPVNMDD MGTPEINTVILLDREVDLVTPMCSQLTYEGLLDEMLQINNGSVEVDATIMGAQQDGKK VKVPLNSSDKLYKEIRDLNFEVVVQVLRQKATSIQQDYAEVKSTNTQSVSELKDFVKR LHSLPEIARHVHLAQHLQSFTGKPSFHARLDIEQTILEVQNFEICFEYIEEMIHKQEP IENVLRLLVLLSLTNAGLPKKNFDYLRREILHSYGFEHMPLLYNLEKAGLFKRQESRS NWIGITRALQLIVDVNDTANPSDISYIFSGYAPLSIRLVQHAVRSGWRSIEELLKLLP GPHLDLKRGSSAINSSLDVHQGLGLQQSIDRVGHRSLVLVVFIGGVTFAEIAALRFLS SQEGMGYDFLVATTKVVNGNTILRPIITNSKEVMI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>16390..16491#15696..15783#14332..14399#14198..14255#13211..13291#12115..12185#11928..12009#9704..9826#9024..9130#8890..8952#8217..8276#8002..8053#6125..6219#5404..5460#5147..5191#4963..5070#3941..4006#3661..3771#1118..1312#654..734#523..562#337..389#gttctctcttctctagtagactcgttctctctccccctttccttcccctcggcctcgactcccccgtctctccgcgccagctcgttccccgccggcgccgcccagcgccgatctccgtcccgggggcagcagcgggcgccgccgacctgctgcttccgcccgcatcctcgtcgccggtgagcacccgtacgcagcatcctctcttccatcccctctctaccccgcaccttttctcttcgccttaacccttagctgaaaccgcatgccgcaggtttggcccggctctgaagtaagcaggattctgaatctgagaacgaggagttggattgggggactatggctcagatccccaatctcgacaatgctcctctcaatctcgcggccctcaggtatctcgtgatgatccccactcatctgcttacccttgtgtttgttcctgtgaattttaacctgtatgtttgatgtgcttcgactgtgaatttcaacatgtatgtttgatgtgcttcgactggtggcatgcagggagcagtcgcagaaggacctgctaaacatcctcaagagtgtgcgtttctcaacatcccattttcaatttttcatactcgtgttattgacggtggaaactgaaaagtttgtattcttttcctgtgtatcagattagggggaagaagtgtgtagttattgatcccaagctcgcgggtaccctgtctctgattctgcagacctcactgctaaaggtgcgatgagctgatcatacagtatggaaatgttaacagtcaattgttttcatcttaaatgacttagcagcttctgtgaaatttagcattgtatcaatagtatgcttacattgcatttcatgtatggacaattaagctactctcacagttaacatatatggtctactaaaggtgcgatgagctgatcatacagtatgtatatgttaacagtcaactgttttcatcttaaataataacttagtagcttctgtaaaatttagcattgtatcaatagtatgcttacactgcatttcatgtatggacaattaagcgactgttgcagttaacatatatagatttttggacatgcacacagctcatgcatggttttttgtgcttgtcaggaatatggtgcagagttgcggcttctctctgctgaacccctccaaactgagtgcgctaagatcctatatctcgtacgctctgagctgaagttcatgaaattaattgcaagccagattaagaacgatgagcctaaagggcttcagagggaattctttctttactttgtgccacggcgcacagttgcctgcgaaaaggtgactattgttttcgtactttgctggttctattgttctatctgtggcttaggattcaattatattagaataatttgctagcctcagacacaattcaattattcttagtctgattgtagtaagaatgacaacttatgcaatcatcgctcccaacatggatacatgtaaatttgtgtagtataatgtattgttacttatatgttactgagataccatatagaaagaaagtccaccttacaggccttaaatcaggataattaagattgaatgagtcgtataggccataccgcataatgtatgcttagatagtgacctattttggaagataaagaaggcttgcaatataaccattgttatttgttcatccgattaatcgcgattaattgtcctgatcgctcccctacctccgatcaggcacaggtaagtcgatcagacgatcagagagctgatcgtccgattaatcgatgattagtcgcaattaatcgtccgatcagggtggaaaacgagcagttttcgttcatgggctgcctccctgagaaaatataattttgggcctgccagcccagcccatgttccattttgggcagatgatgggcagcaaatgatgcttcttctttgaccagatgatgcttgctttttaccatatactacagattatatattattgagtacatactacctccgtcctagaatatagcaacctaggatgggtcccatcctaggacaatgtatgtcatgtccacatacattgtcctaggatgggtctcatcccatcctaggttgctatattcatgacatacattgtcctaggatgggtctcatcccatcctaggttgctatattctgggacggagagagtaatatatagcatatatggccagctggacactcctgctatatactaatcgaccaccctcgattaatcgtcctgatcatcctgatcggtgcctaggagagcagggctgatcgcctgatcagagaacattgaatgcaactatttaagatcctttcatcccaatgatgctttccaattttagtacaattatcttatagtccatgtaccatctttgtaaatgccttcgtttatatgcttatttacatgtaaatacaattttgcccaaaactggtatgtgttgtagttagtgtaggttgaatcatgtctcagataattcatagtctactaatatgttcttcatatcgtgaacaaccctttctaggatatgtcaccttccagtaattcctgtcactcacctcccaaaaaaggaaaacagaaagaaaagcccttttcagtaattcaacttgggaagcatgagccatatgcacagtatttataaaagcccttttcaggaattcagtcttcttttattagtatttcctgggacttaacgccacatatcagatattggtattaataaagaaaaatatgtgacaagacaattgaggatccaagaatgcttttactagtttttgcctaatctacaaaatatatgtagttaaagtgcgaatagccaaatactctagaaatgttttattattgcttcaattatattgtcataaaatttctgatttgattgatgggtacaaaactccctacaaaaatgatcatatgtattagtttttgaatggaatgcggtaaaatcagctcacctgagatccaccagtacgcagagtagattaatctactggcaaacaggccatacgcaatgttcatgctcatgtgccaaaattagcgaagctgttttccttattctgacagttggaggaatgaattagggatcaatatcagttgccgtgtcgtgccgttatggagaacttaattgttttgttatcagtagagcgactagagcctgattgtagtgtgtttttcttgctgacctatcttgatgcttggttcttctatacaggcttagctattgcaacagtactttatgagtaatcacatcctctttgaacccttgaattatagctgtaagacttcgtcaaatgcccttcataaattcctatttgtatgttacttagtggtccacattttgctactgatcataaaaatatacaaaataaaaaaaataataattacctcaaactttatgtacgtgacaacatgagaaaattagccacctacagatgtgcatttgcaaggaataaaattcttttttttttttttaaaaaagccatcaaaagacacctatgtatgtatatgcaaccacagatcatcctttggagtgagatttgttgtacctgaattcctccttttacgactaaacataaagatgaatgtcagtgaggcatctccaaagttgaactatgacaagaagaattgtgatctgtattttattctgcacctgcagattctggaggaggaaaaagttcatcagaaattgacactcggagagtaccccttgtatctagttccattggatgaagatgtgatttgttttgaacttgatcattctctgcaggtactaatccatactagtgcatattccctccgtcccaaaatataagcattttttgctatgaatctagagaactatgtgtccagattcatagctaaaagttgttatattttgggacggaggtagtatattcataatattgatataaatcttactggagcatgattttcaggaatgccttattgaaggggatactagttctgtttggcatgttgcaaaagctatccataagttagaggtatgtgtcttcctttcatgtattttggcatttaccttttccattctttttacttgtttttactaaggttgtaatggtactctcgcaagtcgtagcaagtctgggtgccaggcctccaaggcacctatgcaagattatatgtatgcaatacatgtttgtacaggagtgaccacttaagctgcacaatgtccacctgcgctacctccctccttcacgatttcttaacttatcccttcccagttctaacctccctactaggatgctcttatttctcagtaaacataagattctcagttttctctcctgttctgcatttcacatcttcctcctcacatcactgatcctaaactcgcactagaagcaaagaggtaagaaataaacaggaatctggtgaagctggtgatggtgaaaagcttgtcagacactggagggctgtacacttttctaatcctggtcatctcggcattgatctctgttttctgcctctggctgatgcgctgtcctagagttgactaggcgacccctcgtgctgtcgtaacaactagtgtttgaccatcaccatcaccttttctagtaacataatcatatcaaatttcccatcaaaaagcataatcatatcaaagtattataatgaaaaatctagctgtaccgttttcatgtgaatacctaactttcttgtggtaaaagattcacataatttgtggcccatactctaggatgacaaatgcaa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