Os04g0271000
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Structured Information
| Gene Name |
Os04g0271000 |
|---|---|
| Description |
Similar to NAD-dependent deacetylase sirtuin-7 (EC 3.5.1.-) (SIR2-like protein 7). Splice isoform 2 |
| Version |
NM_001058878.1 GI:115457485 GeneID:4335342 |
| Length |
12342 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0271000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:11363057..11375398 |
| Sequence Coding Region |
11363359..11363700,11364627..11364729,11364813..11364880,11366048..11366127,11366519..11366612 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008397:11363057..11375398 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>MSLGYAEKLSYREDVGNVGMPEIFDSPELLHKKIEELAVMVRES KHLVVFTGAGISTSSGIPDFRGPKGVWTLQRSGKGVPGASLPFHRAVPTLTHMALVEL EKTGRLKFVISQNVDSLHLRSGLPREKLAELHGNSFKEICPSCKKEYLRDFEIETIGL KDTPRRCSDKNCGARLKDTVLDWEDALPPEEMDAAKEQCQKADLVLCLGTSLQITPAC NMPLLSLKNGGRVAIVNLQATPKDKKASLVIHGLVDKVIAGVMYMMNLRIPPYIRTDF VQISLRNSVKKKCVRWTLRVTSIHGLRAPLPFLRSVEVSFPERPDMKPVVLKEQPFSL QRETSMNRPFVMLLTFNFSDGCGCSSSSIEWPVDFLKQKDSFVRDRSLVLQELQHAAE HRSRAGQHAILEREGVPRAETSIHALVTNIVRYDTEDSKAAVPMATWMNSNGSLSKRH MDAIGCNPASSKKQKLVATRHRRKGLNPATQKV</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>11699..12040#10670..10772#10519..10586#9272..9351#8787..8880#8660..8713#6802..6880#4920..4999#4361..4469#4140..4240#2527..2646#1773..1865#1411..1440#364..462#ccgatccccatctatcccgcgagcgagcacggggcgccgtcgttcgccctgccgcatcaggtgagcacatcctccgccacagccgaatccccatccatcgcgcgagcgaacgagcagggtcgccgtcgctcgtcctgctgcttccgccgcttccgtcctctttcccatctctctctctctctctctacccacgccctttttgtcgaatttgcgttaaccctagcttctgttctagaaatttgccttaaactcaatactaataactgtttgatggttccccaaaaagtttgggggttcaactgaaccaccatgtcctatgttagatccgcctgaattttcgggagaagcttacttgattgagagatgtcacttggctatgccgagaagctatcctaccgagaggatgtgggaaatgtcggcatgcctgagatcttcgactctcctgaactcctccacaagaaggttggtttcacatgccattaaacttttacctccagtttgtggattctttgcttcagggtggcaagttacgagggaatcatccatgggttttgtattttttttgagctaaattatgtggtcaaattgattcttttaatgggttttaagcatattttactttagatttttggacaaagtgagattagcttgaaatgtagtcactcaattcttttttattcatcagtttgggcattgacatggtccataaccttttccattttatgattgtgaaaacttttaaaagtataatcatgttgaagtacttttggtaagaaatacgctaataccattttcatatgacaaatctaaatagctttactggtaaaaaatatctttgaatgttgattacatgcattctggtatgatgagtagaacataatggagagtatactaaacatgagtgaacttagaagagagaaaacatttagcctttgctgttttttacccttagagctgtatgtgggtataatgcagagcatgtgtgtgatctttgaaagaagagagttctttattgtctactcaaagttgatccctttaatgtcatttcctggtggcaaataagttgacacctactgtctttgtttggtgcctgagttctatcctcatcttataatttgatcatgaacatgttagcataagttatgctcggctccatgacagtactgaagcaaaattgatatcaataatggttatggcatggctccagcgctcaaaatatcctatcgcgctggaaaatatactaaaatgaactaatggctgtgaaatatctggcaggcatttgatctatcctcttgtggctttgtacactccatgttgtagtcaatatttctatatactgataggggtgcgccagtgaatttatttcacattttagacatgttttaatttttttactgggttgttgtccagatagaagagcttgcagtcatggtgcgagaggtttgtttttcactgtgaatctcaataaattttgtaattatgatttatatatatactcctccgttttttaaaatatgacactgttgactttttgagatacgtttgaccaatcgtattatttaaaaaattcatgtaattctcatttattttattgtgacatgatttatcatcaaatgttttttaagcatgacttaaatatttttatatttgcacaaaaaaaattgaataagacgaatggccaaacgtttataaaaaagtcaacaacatcatatattaaaaaaaaacggaggtagtatatagaaatttcaatgaattggtcctgattgctgcagagtaagcatttggtggtgtttactggagcaggcatatcaacttcatcaggcatacctgacttccgagggcccaaaggcgtgtggacactgcaggtggtactgctgtttgtgcagctatatctcacaataggtcaatagctctcttttaatggactagcaaaatgcccatgctttgctatgggtaaaacaaaatatatgatattgtcatagataattttttttaatcaaatatggtactattacttgcttgcttatttgaatactattactttagtatattcacctgattcaaacaaatattactaggcataatatcagaaaaaatcagggactaatttgtaaaaggtgtaaaagtagtggtgttggcagagccaccaccactactagtgtctgttacagtagtatagatgaatttattcttttgagatggttttatgatgcttgattgcaaagatgtgtctgcacatactgaagtagttaagtaaatgcagtctattttcaagtgcatgatagctgagtcttcgcttggttatcttttaattttggtaccttaaatttatgctttattattatttttggattttttatatgccacggaacaggtttaggaaaaaggttattgaatggtatttgaatgttataattaaattttaaatatttgcaattcctatggattatagtatattttgtgatcttttacatttgaattaatattatgacacagtcatttacacatgttgcatatgttgtctagcgttcaggaaaaggtgttcctggtgcatcactgccgtttcaccgagctgttccaaccttgactcatatggcactggttgaattggaaaaaacaggacgattaaagtttgtcataagccaggttcatatacctaactcaagttgtatatactgcactttgaattggtacctatgtacaaaaccagtctctacaactactagtatagttaaatcagttcgtaggagttgcagatattgactgctcacttattgtagtggtaaggtgttaggatattgaaatcaacacgcaatacaactgttacagacttggggctgcgtgtcccatgggcatgccacgcatcatgccagcagtagtgatttgtaggaaaggcaccccacaactaggaagcccttacaattaaaggacattcagtcttgtaaatattgagcgcaatcacagcggaggaggccctgcagttaaattttattgaaaaaaatatttgtaaatagtacaaaggaaaattacaaggatctaagccaagattctaaaagatctctctctggtctttttagttttaaaagaagatcctctttaaaaagactttgccaacatgaaaaatgagggaacgctgcttccaaagattagatcatttcactgcttccatatattctatgctgtataaagcaccttttcaatgaagcacacttgctggtgttgtgccttagctgtgaattgtgatcattatgttattgaaactcagggatgtatcccaggttatccctatcttgccccaacattctcaaaaaaaatgcaaacaaatttctcttactccaatgttgcacaagacacaaagaaactcactttaatcttgtaatttgccaagtgaacgtgaaaacccttccatctatctcattcccaggcttagccttagggtgcattcgtttctgaggttggggggaggttttcagctacatgcgaaacgagagctcattagcaaatgattaattaagtattaactattataaacttgaaaaattgatttatttgatttatttaaagaaaatcctatatagaaactttttgctcaaaacacaccgtttagtagttcaggaagcatgctaacggaaaatgaggaagttgtttgcagttgccgcttaggactcagcattagttcttttctgattattcacctgattattgaaacagattatttgctccacgcttcgaaaaatacattttctcaaaaaattcttttactgaatttcttagaccacttattttaagctatttattaagttaatttatcaatatttactttatccctaaaattaattagataatcggcagcaacaatccactcaataatctgtttcaaactaagccttagccttgtaatgaccatcggcatggaagagcagctagcaccgaagaccgagtatgtttctatctctccggtcactaataccaataactccattttccatgtttgacaaacttcagtactaactttgttgtgttttaaatttaattacaatgttctgtcgtgtgatgaacaaattgattttatcacgatcaagcttatggtatttatgaaacttaagctttcacggagctgatggagttgtctttgccagaatgttgatagcttacatctccgctctggcctcccaagggagaagctggctgaattgcatggaaattctttcaaggagatctgcccaagctgtaaaaaggagtatgctttagcctgctttacttgactatactttatctgggactataaacaccaaaatatttccttttttactgtggtggtttatttaattggcttattccagatcccacttgtttgaaggtaccttcgtgattttgaaattgagacgataggactgaaggatactccaaggcgttgttctgataagaactgtggagctagattaaaagacacagttcttgattgggaggtacgtttcaaatgtgctggacttaagttatatttatatttctttgttagtgggccatacttgcttagccctttagcccatctgcaacagattcttgcttttgtgttttttccaaaaattgccaaggtgggtggttcatttgttggcaatttggccataaaagctggctttctccatttcaacacaaatcaaatttacaaacaatgcatgcttagggtattcactgtgaaaagctttaagctgttttacagactattatgtttttcttacgactagtattcaacatgatatcctctgtacgttcactataacaagaaaataaatagagaagttggttagtgatgtgtttgccttgttat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